MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS8232 chromosome

Total Repeats: 33541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003485	TGG	2	6	38358	38363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745220
502	NC_003485	GTT	2	6	38491	38496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745220
503	NC_003485	CAA	2	6	38532	38537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745220
504	NC_003485	GCAC	2	8	38707	38714	25 %	0 %	25 %	50 %	19745220
505	NC_003485	CAG	2	6	38720	38725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745220
506	NC_003485	ACC	2	6	38831	38836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	19745220
507	NC_003485	GGT	2	6	38842	38847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745220
508	NC_003485	TGC	2	6	38976	38981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745220
509	NC_003485	CTT	2	6	39115	39120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19745220
510	NC_003485	CGG	2	6	39162	39167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	19745220
511	NC_003485	ACC	2	6	39207	39212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	19745220
512	NC_003485	ACA	2	6	39235	39240	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745220
513	NC_003485	TC	4	8	39258	39265	0 %	50 %	0 %	50 %	19745220
514	NC_003485	AGA	2	6	39321	39326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745220
515	NC_003485	GGT	2	6	39418	39423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745220
516	NC_003485	CAG	2	6	39495	39500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745220
517	NC_003485	AGC	2	6	39633	39638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745220
518	NC_003485	GAA	2	6	39697	39702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745220
519	NC_003485	CTG	2	6	39707	39712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745220
520	NC_003485	ATTGCT	2	12	39871	39882	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	19745220
521	NC_003485	ATC	2	6	39925	39930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745220
522	NC_003485	CAG	2	6	39950	39955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745220
523	NC_003485	TCT	2	6	40098	40103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19745220
524	NC_003485	CT	3	6	40145	40150	0 %	50 %	0 %	50 %	19745220
525	NC_003485	TTGG	2	8	40218	40225	0 %	50 %	50 %	0 %	19745220
526	NC_003485	TGT	2	6	40284	40289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745220
527	NC_003485	ATC	2	6	40438	40443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745220
528	NC_003485	GAA	2	6	40742	40747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745221
529	NC_003485	ACTT	2	8	40793	40800	25 %	50 %	0 %	25 %	19745221
530	NC_003485	AAG	2	6	40830	40835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745221
531	NC_003485	CTT	2	6	40892	40897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19745221
532	NC_003485	AATC	2	8	40913	40920	50 %	25 %	0 %	25 %	19745221
533	NC_003485	CCT	2	6	41118	41123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	19745221
534	NC_003485	TCG	2	6	41152	41157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745221
535	NC_003485	AAG	2	6	41190	41195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745221
536	NC_003485	TGA	2	6	41232	41237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745221
537	NC_003485	AAAT	2	8	41242	41249	75 %	25 %	0 %	0 %	19745221
538	NC_003485	TGC	2	6	41254	41259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745221
539	NC_003485	GGT	2	6	41347	41352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745221
540	NC_003485	TGA	2	6	41434	41439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745221
541	NC_003485	A	6	6	41527	41532	100 %	0 %	0 %	0 %	19745221
542	NC_003485	GCT	2	6	41609	41614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745221
543	NC_003485	GAA	2	6	41627	41632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745221
544	NC_003485	A	6	6	41662	41667	100 %	0 %	0 %	0 %	19745221
545	NC_003485	GTT	2	6	41771	41776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745221
546	NC_003485	TGAT	2	8	41778	41785	25 %	50 %	25 %	0 %	19745221
547	NC_003485	ATT	2	6	41827	41832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745221
548	NC_003485	AATT	2	8	41928	41935	50 %	50 %	0 %	0 %	19745221
549	NC_003485	GT	3	6	41960	41965	0 %	50 %	50 %	0 %	19745221
550	NC_003485	ATT	2	6	41969	41974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745221
551	NC_003485	TC	3	6	41995	42000	0 %	50 %	0 %	50 %	19745221
552	NC_003485	TTGA	2	8	42011	42018	25 %	50 %	25 %	0 %	19745221
553	NC_003485	TGG	2	6	42049	42054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745221
554	NC_003485	GAA	3	9	42107	42115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745221
555	NC_003485	AGA	2	6	42130	42135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745221
556	NC_003485	A	7	7	42204	42210	100 %	0 %	0 %	0 %	19745222
557	NC_003485	A	7	7	42268	42274	100 %	0 %	0 %	0 %	19745222
558	NC_003485	TGG	2	6	42325	42330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745222
559	NC_003485	TGCT	2	8	42408	42415	0 %	50 %	25 %	25 %	19745222
560	NC_003485	TG	3	6	42462	42467	0 %	50 %	50 %	0 %	19745222
561	NC_003485	ATT	2	6	42476	42481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745222
562	NC_003485	GCA	2	6	42482	42487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745222
563	NC_003485	A	6	6	42529	42534	100 %	0 %	0 %	0 %	19745222
564	NC_003485	GAA	2	6	42551	42556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745222
565	NC_003485	GTT	2	6	42557	42562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745222
566	NC_003485	AGC	2	6	42595	42600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745222
567	NC_003485	GAT	2	6	42647	42652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745222
568	NC_003485	ATC	2	6	42698	42703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745222
569	NC_003485	AAG	2	6	42720	42725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745222
570	NC_003485	CGT	2	6	42785	42790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745222
571	NC_003485	GCT	2	6	42817	42822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745222
572	NC_003485	AAC	2	6	42840	42845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745222
573	NC_003485	TCC	2	6	42855	42860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	19745222
574	NC_003485	AGC	2	6	42886	42891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745222
575	NC_003485	GAA	2	6	42908	42913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745222
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577	NC_003485	GAT	2	6	42980	42985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745222
578	NC_003485	GAA	2	6	43067	43072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745222
579	NC_003485	ATC	2	6	43181	43186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745222
580	NC_003485	GTG	2	6	43205	43210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745222
581	NC_003485	AGCAG	2	10	43437	43446	40 %	0 %	40 %	20 %	19745223
582	NC_003485	AGTT	2	8	43452	43459	25 %	50 %	25 %	0 %	19745223
583	NC_003485	ATC	2	6	43472	43477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745223
584	NC_003485	GGC	2	6	43557	43562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	19745223
585	NC_003485	TTG	2	6	43585	43590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745223
586	NC_003485	GTCT	2	8	43612	43619	0 %	50 %	25 %	25 %	19745223
587	NC_003485	TTG	2	6	43637	43642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	19745223
588	NC_003485	ATC	2	6	43675	43680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745223
589	NC_003485	CCTG	2	8	43698	43705	0 %	25 %	25 %	50 %	19745223
590	NC_003485	GGTCA	2	10	43801	43810	20 %	20 %	40 %	20 %	19745223
591	NC_003485	CAA	2	6	43813	43818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745223
592	NC_003485	ATT	2	6	44167	44172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745224
593	NC_003485	TTGGG	2	10	44197	44206	0 %	40 %	60 %	0 %	19745224
594	NC_003485	TGG	2	6	44220	44225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745224
595	NC_003485	CGA	2	6	44271	44276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745224
596	NC_003485	ATG	2	6	44296	44301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745224
597	NC_003485	TCCA	2	8	44321	44328	25 %	25 %	0 %	50 %	19745224
598	NC_003485	GCT	2	6	44380	44385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745224
599	NC_003485	ATATCG	2	12	44489	44500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	19745224
600	NC_003485	A	6	6	44529	44534	100 %	0 %	0 %	0 %	19745224
601	NC_003485	GAC	2	6	44610	44615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745224
602	NC_003485	CA	3	6	44656	44661	50 %	0 %	0 %	50 %	19745224
603	NC_003485	ACG	2	6	44669	44674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745224
604	NC_003485	CAA	2	6	44779	44784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745224
605	NC_003485	ACT	2	6	44819	44824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745224
606	NC_003485	AAT	2	6	44869	44874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	19745224
607	NC_003485	GCA	2	6	44890	44895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	19745224
608	NC_003485	TAT	2	6	44901	44906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745224
609	NC_003485	TGA	2	6	44976	44981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	19745224
610	NC_003485	TGG	2	6	45033	45038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745224
611	NC_003485	GTC	2	6	45043	45048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	19745224
612	NC_003485	AAG	2	6	45079	45084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745224
613	NC_003485	TCT	2	6	45095	45100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19745224
614	NC_003485	ATC	3	9	45106	45114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745224
615	NC_003485	CAT	2	6	45119	45124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745224
616	NC_003485	AGA	2	6	45129	45134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745224
617	NC_003485	GCTA	2	8	45138	45145	25 %	25 %	25 %	25 %	19745224
618	NC_003485	TGG	2	6	45240	45245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745224
619	NC_003485	GTG	2	6	45298	45303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	19745224
620	NC_003485	CCAA	2	8	45312	45319	50 %	0 %	0 %	50 %	19745224
621	NC_003485	ATT	3	9	45385	45393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	19745224
622	NC_003485	AACC	2	8	45432	45439	50 %	0 %	0 %	50 %	19745224
623	NC_003485	ACC	2	6	45479	45484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	19745224
624	NC_003485	CTT	2	6	45513	45518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	19745224
625	NC_003485	ACA	2	6	45530	45535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	19745224
626	NC_003485	GAA	2	6	45538	45543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	19745224
627	NC_003485	ATC	2	6	45568	45573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	19745224
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