MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18 plasmid pHCM1

Total Repeats: 3210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_003384	AAC	2	6	137853	137858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466581
2002	NC_003384	CAG	2	6	137988	137993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466581
2003	NC_003384	CGT	2	6	138010	138015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466581
2004	NC_003384	CAT	2	6	138053	138058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466581
2005	NC_003384	CCAA	2	8	138082	138089	50 %	0 %	0 %	50 %	18466581
2006	NC_003384	ATT	2	6	138133	138138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466581
2007	NC_003384	TCA	2	6	138190	138195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466581
2008	NC_003384	ATG	3	9	138205	138213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466581
2009	NC_003384	T	6	6	138247	138252	0 %	100 %	0 %	0 %	18466581
2010	NC_003384	GAT	2	6	138291	138296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466581
2011	NC_003384	A	8	8	138309	138316	100 %	0 %	0 %	0 %	18466581
2012	NC_003384	CAT	2	6	138422	138427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466581
2013	NC_003384	GATG	2	8	138435	138442	25 %	25 %	50 %	0 %	18466581
2014	NC_003384	CGG	2	6	138565	138570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466581
2015	NC_003384	CTG	2	6	138689	138694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466581
2016	NC_003384	TTC	2	6	138729	138734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466581
2017	NC_003384	CATT	2	8	138748	138755	25 %	50 %	0 %	25 %	18466581
2018	NC_003384	GCA	2	6	138811	138816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466581
2019	NC_003384	TCA	2	6	138895	138900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466581
2020	NC_003384	CGG	2	6	139217	139222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466582
2021	NC_003384	TGC	2	6	139401	139406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466582
2022	NC_003384	GA	3	6	139762	139767	50 %	0 %	50 %	0 %	18466583
2023	NC_003384	TAC	2	6	139799	139804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466583
2024	NC_003384	GGA	2	6	139835	139840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466583
2025	NC_003384	GGC	2	6	139842	139847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466583
2026	NC_003384	TGT	2	6	139871	139876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466583
2027	NC_003384	ATT	2	6	139890	139895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466583
2028	NC_003384	CAGC	2	8	140022	140029	25 %	0 %	25 %	50 %	18466583
2029	NC_003384	ATGA	2	8	140079	140086	50 %	25 %	25 %	0 %	18466583
2030	NC_003384	TAA	2	6	140102	140107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466583
2031	NC_003384	TCAG	2	8	140150	140157	25 %	25 %	25 %	25 %	18466583
2032	NC_003384	GTG	2	6	140179	140184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466583
2033	NC_003384	TGA	2	6	140189	140194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466583
2034	NC_003384	A	6	6	140264	140269	100 %	0 %	0 %	0 %	18466583
2035	NC_003384	GAAA	2	8	140282	140289	75 %	0 %	25 %	0 %	18466583
2036	NC_003384	TAT	2	6	140316	140321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466583
2037	NC_003384	CAG	2	6	140340	140345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466583
2038	NC_003384	GCT	2	6	140346	140351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466583
2039	NC_003384	ATA	2	6	140482	140487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466583
2040	NC_003384	ATC	2	6	140529	140534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466583
2041	NC_003384	GCAT	2	8	140538	140545	25 %	25 %	25 %	25 %	18466583
2042	NC_003384	TTC	2	6	140566	140571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466583
2043	NC_003384	A	6	6	140711	140716	100 %	0 %	0 %	0 %	18466584
2044	NC_003384	TG	3	6	140952	140957	0 %	50 %	50 %	0 %	18466584
2045	NC_003384	TAA	2	6	140988	140993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466584
2046	NC_003384	ATT	2	6	141013	141018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466584
2047	NC_003384	AAC	2	6	141105	141110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466584
2048	NC_003384	ACA	2	6	141121	141126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466584
2049	NC_003384	A	6	6	141143	141148	100 %	0 %	0 %	0 %	18466584
2050	NC_003384	TAA	2	6	141150	141155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466584
2051	NC_003384	ACTTC	2	10	141167	141176	20 %	40 %	0 %	40 %	18466584
2052	NC_003384	GAA	2	6	141187	141192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466584
2053	NC_003384	GATT	2	8	141212	141219	25 %	50 %	25 %	0 %	18466584
2054	NC_003384	A	6	6	141264	141269	100 %	0 %	0 %	0 %	18466584
2055	NC_003384	TA	3	6	141293	141298	50 %	50 %	0 %	0 %	18466584
2056	NC_003384	A	6	6	141298	141303	100 %	0 %	0 %	0 %	18466584
2057	NC_003384	AAGCC	2	10	141380	141389	40 %	0 %	20 %	40 %	18466584
2058	NC_003384	A	6	6	141400	141405	100 %	0 %	0 %	0 %	18466584
2059	NC_003384	TGT	2	6	141809	141814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466586
2060	NC_003384	TATT	2	8	141849	141856	25 %	75 %	0 %	0 %	18466586
2061	NC_003384	ATGGC	2	10	141876	141885	20 %	20 %	40 %	20 %	18466586
2062	NC_003384	CGG	2	6	141990	141995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466586
2063	NC_003384	TG	3	6	142032	142037	0 %	50 %	50 %	0 %	18466586
2064	NC_003384	TATT	2	8	142068	142075	25 %	75 %	0 %	0 %	18466586
2065	NC_003384	TCT	2	6	142079	142084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466586
2066	NC_003384	T	7	7	142339	142345	0 %	100 %	0 %	0 %	18466587
2067	NC_003384	CTC	2	6	142389	142394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18466587
2068	NC_003384	T	6	6	142416	142421	0 %	100 %	0 %	0 %	18466587
2069	NC_003384	TTGA	2	8	142494	142501	25 %	50 %	25 %	0 %	18466587
2070	NC_003384	CA	3	6	142559	142564	50 %	0 %	0 %	50 %	18466587
2071	NC_003384	CTTT	2	8	142579	142586	0 %	75 %	0 %	25 %	18466587
2072	NC_003384	T	6	6	142605	142610	0 %	100 %	0 %	0 %	18466587
2073	NC_003384	TCCT	2	8	142659	142666	0 %	50 %	0 %	50 %	18466587
2074	NC_003384	CAT	2	6	142755	142760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466587
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2080	NC_003384	T	6	6	142940	142945	0 %	100 %	0 %	0 %	18466587
2081	NC_003384	CT	3	6	143111	143116	0 %	50 %	0 %	50 %	18466588
2082	NC_003384	CCAA	2	8	143229	143236	50 %	0 %	0 %	50 %	18466588
2083	NC_003384	AACAT	2	10	143248	143257	60 %	20 %	0 %	20 %	18466588
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2086	NC_003384	ACACC	2	10	143542	143551	40 %	0 %	0 %	60 %	18466588
2087	NC_003384	CAATC	2	10	143750	143759	40 %	20 %	0 %	40 %	18466588
2088	NC_003384	A	6	6	143801	143806	100 %	0 %	0 %	0 %	18466588
2089	NC_003384	CAC	2	6	143832	143837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466588
2090	NC_003384	AACT	2	8	143888	143895	50 %	25 %	0 %	25 %	18466588
2091	NC_003384	AAC	2	6	143920	143925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466588
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2094	NC_003384	TGC	2	6	144046	144051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466588
2095	NC_003384	ACTC	2	8	144223	144230	25 %	25 %	0 %	50 %	18466588
2096	NC_003384	CA	3	6	144263	144268	50 %	0 %	0 %	50 %	18466588
2097	NC_003384	ATA	2	6	144654	144659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466589
2098	NC_003384	CTG	2	6	144686	144691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466589
2099	NC_003384	TCG	2	6	144714	144719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466589
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2101	NC_003384	TCG	2	6	144852	144857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466589
2102	NC_003384	GTT	2	6	144931	144936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18466589
2103	NC_003384	CGAAGA	2	12	145075	145086	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	18466589
2104	NC_003384	G	8	8	145099	145106	0 %	0 %	100 %	0 %	18466589
2105	NC_003384	AGA	2	6	145144	145149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466589
2106	NC_003384	ATT	2	6	145277	145282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466589
2107	NC_003384	TAT	2	6	145331	145336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466589
2108	NC_003384	AGG	2	6	145371	145376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466589
2109	NC_003384	CAGG	2	8	145400	145407	25 %	0 %	50 %	25 %	18466589
2110	NC_003384	ATT	2	6	145423	145428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466589
2111	NC_003384	CAG	2	6	145473	145478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466589
2112	NC_003384	CAG	2	6	145480	145485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466589
2113	NC_003384	AGA	2	6	145506	145511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18466589
2114	NC_003384	TCG	2	6	145515	145520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466589
2115	NC_003384	GAG	2	6	145526	145531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466589
2116	NC_003384	CGA	2	6	145552	145557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466589
2117	NC_003384	TGG	2	6	145617	145622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18466589
2118	NC_003384	AAC	2	6	145712	145717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466589
2119	NC_003384	AGC	2	6	145830	145835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466589
2120	NC_003384	ACC	2	6	145862	145867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466589
2121	NC_003384	CT	3	6	145977	145982	0 %	50 %	0 %	50 %	18466589
2122	NC_003384	GCT	2	6	146080	146085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466589
2123	NC_003384	TTA	2	6	146118	146123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18466589
2124	NC_003384	A	7	7	146127	146133	100 %	0 %	0 %	0 %	18466589
2125	NC_003384	GCT	2	6	146158	146163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466589
2126	NC_003384	CTG	2	6	146271	146276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466589
2127	NC_003384	GGC	2	6	146385	146390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466589
2128	NC_003384	GGA	2	6	146437	146442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466589
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2131	NC_003384	T	6	6	146501	146506	0 %	100 %	0 %	0 %	18466589
2132	NC_003384	CTG	2	6	146567	146572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466589
2133	NC_003384	CTG	2	6	146711	146716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466589
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2135	NC_003384	CTT	2	6	146798	146803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466589
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2149	NC_003384	GAT	3	9	147608	147616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466589
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2228	NC_003384	A	8	8	153312	153319	100 %	0 %	0 %	0 %	18466595
2229	NC_003384	TGA	2	6	153353	153358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466595
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2231	NC_003384	TA	3	6	153407	153412	50 %	50 %	0 %	0 %	18466595
2232	NC_003384	TGA	2	6	153413	153418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466595
2233	NC_003384	TA	3	6	153450	153455	50 %	50 %	0 %	0 %	18466595
2234	NC_003384	AAT	2	6	153509	153514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18466595
2235	NC_003384	TGC	2	6	153651	153656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466596
2236	NC_003384	GCCA	2	8	153745	153752	25 %	0 %	25 %	50 %	18466596
2237	NC_003384	CAC	2	6	153767	153772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466596
2238	NC_003384	CAG	2	6	153785	153790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466596
2239	NC_003384	CAA	2	6	153841	153846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18466596
2240	NC_003384	CAGC	2	8	153878	153885	25 %	0 %	25 %	50 %	18466596
2241	NC_003384	T	6	6	153992	153997	0 %	100 %	0 %	0 %	18466596
2242	NC_003384	GCGG	2	8	154036	154043	0 %	0 %	75 %	25 %	18466596
2243	NC_003384	CGG	2	6	154173	154178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466597
2244	NC_003384	CAC	2	6	154195	154200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466597
2245	NC_003384	AGG	2	6	154218	154223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18466597
2246	NC_003384	A	7	7	154533	154539	100 %	0 %	0 %	0 %	18466598
2247	NC_003384	ACC	2	6	154551	154556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18466598
2248	NC_003384	AT	3	6	154561	154566	50 %	50 %	0 %	0 %	18466598
2249	NC_003384	TCAG	2	8	154601	154608	25 %	25 %	25 %	25 %	18466598
2250	NC_003384	TGA	2	6	154723	154728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18466598
2251	NC_003384	ACG	2	6	154855	154860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18466598
2252	NC_003384	AT	3	6	154881	154886	50 %	50 %	0 %	0 %	18466598
2253	NC_003384	CTT	2	6	155021	155026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18466598
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2362	NC_003384	ATC	2	6	166347	166352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18466606
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2368	NC_003384	T	6	6	166522	166527	0 %	100 %	0 %	0 %	18466606
2369	NC_003384	GCT	2	6	166534	166539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466606
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2371	NC_003384	GC	4	8	166635	166642	0 %	0 %	50 %	50 %	18466606
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2373	NC_003384	CA	3	6	166728	166733	50 %	0 %	0 %	50 %	18466606
2374	NC_003384	GGC	2	6	166770	166775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466606
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2496	NC_003384	GCG	2	6	173221	173226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18466613
2497	NC_003384	CA	3	6	173247	173252	50 %	0 %	0 %	50 %	18466613
2498	NC_003384	GCC	2	6	173271	173276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466613
2499	NC_003384	CGC	2	6	173351	173356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18466613
2500	NC_003384	GCT	2	6	173385	173390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18466613

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