MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 plasmid pSLT

Total Repeats: 1097

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003277	CAG	2	6	121	126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233404
2	NC_003277	CCA	2	6	221	226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233404
3	NC_003277	AGT	2	6	262	267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233404
4	NC_003277	GCG	2	6	268	273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233404
5	NC_003277	GCC	3	9	274	282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233404
6	NC_003277	CTG	2	6	722	727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233405
7	NC_003277	AGC	2	6	791	796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233405
8	NC_003277	ATA	2	6	827	832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233405
9	NC_003277	TTA	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233405
10	NC_003277	CAG	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233405
11	NC_003277	CTG	2	6	982	987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233405
12	NC_003277	TTC	2	6	1031	1036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233405
13	NC_003277	ATT	2	6	1088	1093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233405
14	NC_003277	GCA	2	6	1099	1104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233405
15	NC_003277	GTC	2	6	1131	1136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233405
16	NC_003277	GAG	2	6	1343	1348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233406
17	NC_003277	GAA	2	6	1432	1437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233406
18	NC_003277	GAC	2	6	1462	1467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233406
19	NC_003277	GCA	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233406
20	NC_003277	ACT	2	6	1541	1546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233406
21	NC_003277	CTA	2	6	1565	1570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233406
22	NC_003277	TCT	2	6	1761	1766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233407
23	NC_003277	CCA	2	6	1817	1822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233407
24	NC_003277	GCC	2	6	2114	2119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	228960845
25	NC_003277	TGC	2	6	2122	2127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228960845
26	NC_003277	CGT	2	6	2130	2135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228960845
27	NC_003277	GCT	2	6	2147	2152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228960845
28	NC_003277	GCC	2	6	2424	2429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	228960845
29	NC_003277	CGC	2	6	2430	2435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	228960845
30	NC_003277	CAG	2	6	2457	2462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	228960845
31	NC_003277	GCG	2	6	2591	2596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	228960845
32	NC_003277	CAG	2	6	2640	2645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	228960845
33	NC_003277	CGG	2	6	2678	2683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	228960845
34	NC_003277	GCG	2	6	2711	2716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	228960845
35	NC_003277	ATG	3	9	2730	2738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	228960845
36	NC_003277	ACT	2	6	4066	4071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233473
37	NC_003277	CCT	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233473
38	NC_003277	CAG	2	6	4153	4158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233473
39	NC_003277	CAC	2	6	4570	4575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233473
40	NC_003277	ATG	2	6	4576	4581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233473
41	NC_003277	ACC	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233473
42	NC_003277	TCC	2	6	4684	4689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233473
43	NC_003277	ATT	2	6	4724	4729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233473
44	NC_003277	CAT	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233474
45	NC_003277	ACG	2	6	5357	5362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233474
46	NC_003277	GCG	2	6	5375	5380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233474
47	NC_003277	CAG	3	9	5517	5525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233474
48	NC_003277	TCC	2	6	5785	5790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233475
49	NC_003277	GTT	2	6	5852	5857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233475
50	NC_003277	CCA	2	6	5992	5997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233475
51	NC_003277	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233475
52	NC_003277	TGC	2	6	6106	6111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233475
53	NC_003277	CCG	2	6	6171	6176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233475
54	NC_003277	GCA	2	6	6226	6231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233475
55	NC_003277	CCA	2	6	6253	6258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233475
56	NC_003277	GAG	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233475
57	NC_003277	CTG	2	6	6294	6299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233475
58	NC_003277	GCC	2	6	6326	6331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233475
59	NC_003277	CAG	2	6	6446	6451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233475
60	NC_003277	TGC	2	6	6452	6457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233475
61	NC_003277	GTG	3	9	6486	6494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233475
62	NC_003277	CAT	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233475
63	NC_003277	ATC	2	6	6667	6672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233476
64	NC_003277	CAG	2	6	6695	6700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233476
65	NC_003277	ACC	2	6	6708	6713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233476
66	NC_003277	GCA	2	6	6714	6719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233476
67	NC_003277	GGC	2	6	6758	6763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233476
68	NC_003277	TTG	2	6	6765	6770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233476
69	NC_003277	CCA	2	6	6847	6852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233476
70	NC_003277	CGG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233476
71	NC_003277	CGG	2	6	6927	6932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233476
72	NC_003277	CCA	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233476
73	NC_003277	GAA	2	6	6977	6982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233476
74	NC_003277	TCA	2	6	7009	7014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233476
75	NC_003277	CAG	2	6	7061	7066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233476
76	NC_003277	CCA	2	6	7183	7188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233476
77	NC_003277	ACC	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233476
78	NC_003277	ATA	2	6	7276	7281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233476
79	NC_003277	CTT	2	6	7601	7606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233477
80	NC_003277	CAT	2	6	7682	7687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233477
81	NC_003277	GCA	2	6	7759	7764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233477
82	NC_003277	GCA	3	9	7787	7795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233477
83	NC_003277	CCG	2	6	7828	7833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233477
84	NC_003277	GCA	2	6	8016	8021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233478
85	NC_003277	AAT	2	6	8087	8092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233478
86	NC_003277	TTA	2	6	8565	8570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233479
87	NC_003277	AGT	2	6	8668	8673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233479
88	NC_003277	CCT	2	6	8846	8851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233479
89	NC_003277	GAA	2	6	8906	8911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233479
90	NC_003277	TCA	2	6	8981	8986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233479
91	NC_003277	CAA	2	6	9075	9080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233479
92	NC_003277	GCT	2	6	9266	9271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233479
93	NC_003277	TGA	2	6	9372	9377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233479
94	NC_003277	ATG	3	9	9389	9397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233479
95	NC_003277	ACC	2	6	9701	9706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233480
96	NC_003277	GTT	2	6	9769	9774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233480
97	NC_003277	CAT	2	6	9798	9803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233480
98	NC_003277	TAC	2	6	9831	9836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233480
99	NC_003277	ATT	2	6	9862	9867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233480
100	NC_003277	GCT	2	6	9901	9906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233480
101	NC_003277	GTG	2	6	9932	9937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233480
102	NC_003277	CAC	2	6	9961	9966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233480
103	NC_003277	CCG	2	6	10061	10066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233480
104	NC_003277	CAG	2	6	10162	10167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233480
105	NC_003277	TCA	2	6	10227	10232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233480
106	NC_003277	GCC	2	6	10272	10277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233481
107	NC_003277	AGT	2	6	10430	10435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233481
108	NC_003277	TTC	2	6	10447	10452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233481
109	NC_003277	CCG	2	6	10465	10470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233481
110	NC_003277	CAA	2	6	10514	10519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233481
111	NC_003277	CGG	2	6	10599	10604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233481
112	NC_003277	ATG	2	6	10669	10674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233481
113	NC_003277	CGG	2	6	10713	10718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233481
114	NC_003277	CTG	2	6	10741	10746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233481
115	NC_003277	GTG	2	6	10753	10758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233481
116	NC_003277	GCC	2	6	10776	10781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233481
117	NC_003277	CAG	2	6	10902	10907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233481
118	NC_003277	TCA	2	6	10925	10930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233481
119	NC_003277	CCT	2	6	10947	10952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233482
120	NC_003277	TCA	2	6	11052	11057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233482
121	NC_003277	GCA	2	6	11166	11171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233482
122	NC_003277	CAC	2	6	11218	11223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233482
123	NC_003277	AGG	2	6	11229	11234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233482
124	NC_003277	CAC	2	6	11311	11316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233482
125	NC_003277	TGG	2	6	11334	11339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233482
126	NC_003277	TCA	3	9	11415	11423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233482
127	NC_003277	GGT	2	6	11473	11478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233482
128	NC_003277	CAT	2	6	11500	11505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233482
129	NC_003277	GCT	3	9	11647	11655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233482
130	NC_003277	CTG	2	6	11672	11677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233482
131	NC_003277	TGG	2	6	11802	11807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233482
132	NC_003277	CCA	2	6	11848	11853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233482
133	NC_003277	TCC	2	6	11858	11863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233482
134	NC_003277	TGT	2	6	11934	11939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233482
135	NC_003277	TGT	2	6	12078	12083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233482
136	NC_003277	CGG	2	6	12120	12125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233482
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139	NC_003277	GTG	2	6	12212	12217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233482
140	NC_003277	GCA	2	6	12345	12350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233482
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143	NC_003277	TCC	2	6	12404	12409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233482
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151	NC_003277	GCA	2	6	13013	13018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233482
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153	NC_003277	ATA	2	6	13171	13176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233482
154	NC_003277	TGA	2	6	13328	13333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233482
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157	NC_003277	CAC	2	6	13622	13627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233483
158	NC_003277	GGT	2	6	13659	13664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233483
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162	NC_003277	GCG	2	6	13951	13956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233483
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172	NC_003277	ATA	2	6	14632	14637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233484
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242	NC_003277	GTT	2	6	23006	23011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32441710
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244	NC_003277	CCG	2	6	23180	23185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32441710
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248	NC_003277	GCT	2	6	23399	23404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32441710
249	NC_003277	CGG	2	6	23417	23422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32441710
250	NC_003277	GCC	2	6	23439	23444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32441710
251	NC_003277	CAT	2	6	23473	23478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32441710
252	NC_003277	GGT	2	6	23568	23573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233419
253	NC_003277	CGC	2	6	23583	23588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233419
254	NC_003277	TGC	2	6	23604	23609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233419
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