MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 plasmid pSLT

Total Repeats: 1588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003277	GAC	2	6	65019	65024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233447
1002	NC_003277	TCC	2	6	65127	65132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233447
1003	NC_003277	GTGCCG	2	12	65194	65205	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17233447
1004	NC_003277	GAA	2	6	65247	65252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233447
1005	NC_003277	TCCC	2	8	65256	65263	0 %	25 %	0 %	75 %	17233447
1006	NC_003277	G	6	6	65444	65449	0 %	0 %	100 %	0 %	17233447
1007	NC_003277	CG	3	6	65464	65469	0 %	0 %	50 %	50 %	17233447
1008	NC_003277	GTAC	2	8	65473	65480	25 %	25 %	25 %	25 %	17233447
1009	NC_003277	GTG	2	6	65575	65580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233447
1010	NC_003277	CAG	2	6	65662	65667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233447
1011	NC_003277	TGG	3	9	65727	65735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233447
1012	NC_003277	ATT	2	6	65765	65770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233447
1013	NC_003277	GTG	2	6	65833	65838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233447
1014	NC_003277	GAA	2	6	65869	65874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233447
1015	NC_003277	AGG	2	6	65903	65908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233447
1016	NC_003277	AGC	2	6	65990	65995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233447
1017	NC_003277	CAG	2	6	66013	66018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233447
1018	NC_003277	GGA	2	6	66037	66042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233447
1019	NC_003277	AAC	2	6	66068	66073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233448
1020	NC_003277	TCT	2	6	66109	66114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233448
1021	NC_003277	GCTG	2	8	66117	66124	0 %	25 %	50 %	25 %	17233448
1022	NC_003277	TTG	2	6	66174	66179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233448
1023	NC_003277	ACA	2	6	66217	66222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233448
1024	NC_003277	TCCGG	2	10	66274	66283	0 %	20 %	40 %	40 %	17233448
1025	NC_003277	GTC	2	6	66310	66315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233448
1026	NC_003277	GAA	2	6	66368	66373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233448
1027	NC_003277	TGT	2	6	66438	66443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233448
1028	NC_003277	ACAA	2	8	66518	66525	75 %	0 %	0 %	25 %	17233448
1029	NC_003277	TAA	2	6	66601	66606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233448
1030	NC_003277	A	6	6	66614	66619	100 %	0 %	0 %	0 %	17233448
1031	NC_003277	TGA	2	6	66662	66667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233449
1032	NC_003277	GAT	2	6	66678	66683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233449
1033	NC_003277	ATA	2	6	66720	66725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233449
1034	NC_003277	TCTG	2	8	66812	66819	0 %	50 %	25 %	25 %	17233449
1035	NC_003277	GCT	2	6	66833	66838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233449
1036	NC_003277	GC	3	6	66900	66905	0 %	0 %	50 %	50 %	17233450
1037	NC_003277	CTG	2	6	66908	66913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233450
1038	NC_003277	GAAC	2	8	66927	66934	50 %	0 %	25 %	25 %	17233450
1039	NC_003277	CCA	2	6	66954	66959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233450
1040	NC_003277	ACG	2	6	67079	67084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233450
1041	NC_003277	GCC	2	6	67133	67138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233450
1042	NC_003277	CCG	2	6	67157	67162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233450
1043	NC_003277	CAC	2	6	67164	67169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233450
1044	NC_003277	GGC	2	6	67207	67212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233450
1045	NC_003277	TC	3	6	67224	67229	0 %	50 %	0 %	50 %	17233450
1046	NC_003277	GCC	2	6	67237	67242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233450
1047	NC_003277	CGG	2	6	67269	67274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233450
1048	NC_003277	T	6	6	67334	67339	0 %	100 %	0 %	0 %	17233450
1049	NC_003277	CCGT	2	8	67349	67356	0 %	25 %	25 %	50 %	17233450
1050	NC_003277	ATTA	2	8	67373	67380	50 %	50 %	0 %	0 %	17233450
1051	NC_003277	AAC	2	6	67553	67558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233451
1052	NC_003277	GCG	2	6	67656	67661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233451
1053	NC_003277	TG	3	6	67685	67690	0 %	50 %	50 %	0 %	17233451
1054	NC_003277	GGCA	2	8	67720	67727	25 %	0 %	50 %	25 %	17233451
1055	NC_003277	A	6	6	67749	67754	100 %	0 %	0 %	0 %	17233452
1056	NC_003277	ATT	2	6	67763	67768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233452
1057	NC_003277	CGA	2	6	67790	67795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233452
1058	NC_003277	AAT	2	6	67831	67836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233452
1059	NC_003277	CCG	2	6	67839	67844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233452
1060	NC_003277	TG	3	6	67899	67904	0 %	50 %	50 %	0 %	17233452
1061	NC_003277	TTC	2	6	67943	67948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233452
1062	NC_003277	GTC	2	6	67974	67979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233452
1063	NC_003277	CTG	2	6	67985	67990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233452
1064	NC_003277	GCT	2	6	68035	68040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233452
1065	NC_003277	CCG	2	6	68041	68046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233452
1066	NC_003277	CTG	2	6	68048	68053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233452
1067	NC_003277	GAC	2	6	68084	68089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233452
1068	NC_003277	TGG	2	6	68102	68107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233452
1069	NC_003277	GGA	2	6	68125	68130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17233452
1070	NC_003277	CGG	2	6	68176	68181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233452
1071	NC_003277	GAA	2	6	68595	68600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233453
1072	NC_003277	GGC	2	6	68622	68627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233453
1073	NC_003277	GCT	2	6	68634	68639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233453
1074	NC_003277	CTG	2	6	68719	68724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233453
1075	NC_003277	ATGA	2	8	68761	68768	50 %	25 %	25 %	0 %	17233453
1076	NC_003277	CTG	2	6	68845	68850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233453
1077	NC_003277	CG	3	6	68864	68869	0 %	0 %	50 %	50 %	17233453
1078	NC_003277	TG	3	6	68879	68884	0 %	50 %	50 %	0 %	17233453
1079	NC_003277	CCAG	2	8	68897	68904	25 %	0 %	25 %	50 %	17233453
1080	NC_003277	CTA	2	6	68991	68996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233453
1081	NC_003277	GGAA	2	8	69030	69037	50 %	0 %	50 %	0 %	17233453
1082	NC_003277	GC	3	6	69086	69091	0 %	0 %	50 %	50 %	17233453
1083	NC_003277	A	8	8	69099	69106	100 %	0 %	0 %	0 %	17233453
1084	NC_003277	CA	3	6	69180	69185	50 %	0 %	0 %	50 %	17233453
1085	NC_003277	TTA	2	6	69206	69211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233453
1086	NC_003277	GAT	2	6	69225	69230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233453
1087	NC_003277	ATCC	3	12	69246	69257	25 %	25 %	0 %	50 %	17233453
1088	NC_003277	GAC	2	6	69307	69312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233453
1089	NC_003277	CAGG	2	8	69330	69337	25 %	0 %	50 %	25 %	17233453
1090	NC_003277	CG	3	6	69381	69386	0 %	0 %	50 %	50 %	17233453
1091	NC_003277	CAT	2	6	69387	69392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233453
1092	NC_003277	CGG	2	6	69440	69445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233453
1093	NC_003277	CTG	2	6	69460	69465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233453
1094	NC_003277	TGG	3	9	69512	69520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233453
1095	NC_003277	AGCGA	2	10	69541	69550	40 %	0 %	40 %	20 %	17233453
1096	NC_003277	GAA	2	6	69573	69578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233453
1097	NC_003277	CCT	2	6	69587	69592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233453
1098	NC_003277	GAAG	2	8	69618	69625	50 %	0 %	50 %	0 %	17233453
1099	NC_003277	GGT	2	6	69675	69680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233453
1100	NC_003277	ACA	2	6	69716	69721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233453
1101	NC_003277	CGC	2	6	69791	69796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233453
1102	NC_003277	GCCT	2	8	69823	69830	0 %	25 %	25 %	50 %	17233453
1103	NC_003277	AGC	2	6	69860	69865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233453
1104	NC_003277	GAAG	2	8	69867	69874	50 %	0 %	50 %	0 %	17233453
1105	NC_003277	GTG	2	6	69880	69885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233453
1106	NC_003277	GCGG	2	8	69888	69895	0 %	0 %	75 %	25 %	17233453
1107	NC_003277	TGG	2	6	69926	69931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233453
1108	NC_003277	CGCC	2	8	69947	69954	0 %	0 %	25 %	75 %	17233453
1109	NC_003277	GCT	2	6	69957	69962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233453
1110	NC_003277	TTC	2	6	70003	70008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233453
1111	NC_003277	AAC	2	6	70018	70023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233453
1112	NC_003277	ACA	2	6	70031	70036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233453
1113	NC_003277	GGGC	2	8	70058	70065	0 %	0 %	75 %	25 %	17233453
1114	NC_003277	CGG	2	6	70110	70115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233453
1115	NC_003277	GTG	2	6	70123	70128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233453
1116	NC_003277	TGC	2	6	70319	70324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233453
1117	NC_003277	A	6	6	70350	70355	100 %	0 %	0 %	0 %	17233453
1118	NC_003277	TGA	2	6	70371	70376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233453
1119	NC_003277	GTG	2	6	70378	70383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233453
1120	NC_003277	GCC	2	6	70442	70447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233453
1121	NC_003277	CTG	2	6	70465	70470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233453
1122	NC_003277	GCA	2	6	70483	70488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233453
1123	NC_003277	CCCT	2	8	70522	70529	0 %	25 %	0 %	75 %	17233453
1124	NC_003277	GAT	2	6	70534	70539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233453
1125	NC_003277	TGG	2	6	70547	70552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233453
1126	NC_003277	CTG	2	6	70588	70593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233453
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1128	NC_003277	CGA	2	6	70677	70682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233453
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