MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 plasmid pSLT

Total Repeats: 1588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003277	ATTT	2	8	33638	33645	25 %	75 %	0 %	0 %	17233422
502	NC_003277	TACA	2	8	33672	33679	50 %	25 %	0 %	25 %	17233422
503	NC_003277	GGCG	2	8	33680	33687	0 %	0 %	75 %	25 %	17233422
504	NC_003277	TGG	2	6	33701	33706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233422
505	NC_003277	CAT	2	6	33717	33722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233422
506	NC_003277	GCTG	2	8	33746	33753	0 %	25 %	50 %	25 %	17233422
507	NC_003277	GAA	2	6	33754	33759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233422
508	NC_003277	ATC	2	6	33857	33862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233422
509	NC_003277	GACC	2	8	34166	34173	25 %	0 %	25 %	50 %	17233494
510	NC_003277	ATT	2	6	34221	34226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233494
511	NC_003277	AAT	2	6	34228	34233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233494
512	NC_003277	CCA	2	6	34268	34273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233494
513	NC_003277	CAG	2	6	34449	34454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233494
514	NC_003277	CTTACC	2	12	34488	34499	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	17233494
515	NC_003277	CAG	2	6	34512	34517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233494
516	NC_003277	AT	3	6	34525	34530	50 %	50 %	0 %	0 %	17233494
517	NC_003277	TCC	2	6	34588	34593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233494
518	NC_003277	TCG	2	6	34595	34600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233494
519	NC_003277	GAC	2	6	34601	34606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233494
520	NC_003277	ACG	2	6	34642	34647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233494
521	NC_003277	ACC	2	6	34656	34661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233494
522	NC_003277	TCA	2	6	34729	34734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233494
523	NC_003277	T	6	6	34761	34766	0 %	100 %	0 %	0 %	17233494
524	NC_003277	TTGT	2	8	34803	34810	0 %	75 %	25 %	0 %	17233494
525	NC_003277	ATTTT	2	10	34915	34924	20 %	80 %	0 %	0 %	17233494
526	NC_003277	CAG	2	6	34929	34934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233494
527	NC_003277	TGC	3	9	34936	34944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233494
528	NC_003277	CAC	2	6	34977	34982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17233494
529	NC_003277	GTC	2	6	35000	35005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233494
530	NC_003277	TCA	2	6	35033	35038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233494
531	NC_003277	GCT	2	6	35039	35044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233494
532	NC_003277	TGG	2	6	35047	35052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233494
533	NC_003277	ATA	2	6	35061	35066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233494
534	NC_003277	TCAG	2	8	35195	35202	25 %	25 %	25 %	25 %	17233495
535	NC_003277	TCG	2	6	35261	35266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233495
536	NC_003277	GCT	2	6	35355	35360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233495
537	NC_003277	TCA	2	6	35366	35371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233495
538	NC_003277	ATA	2	6	35518	35523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233495
539	NC_003277	CAG	2	6	35581	35586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233495
540	NC_003277	GCCA	2	8	35747	35754	25 %	0 %	25 %	50 %	17233495
541	NC_003277	TCC	2	6	35756	35761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233495
542	NC_003277	CCT	2	6	35883	35888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233495
543	NC_003277	CGT	2	6	35932	35937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233495
544	NC_003277	TGCC	2	8	35952	35959	0 %	25 %	25 %	50 %	17233495
545	NC_003277	GGC	2	6	36057	36062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233495
546	NC_003277	CGCAG	2	10	36116	36125	20 %	0 %	40 %	40 %	17233495
547	NC_003277	AC	4	8	36144	36151	50 %	0 %	0 %	50 %	17233495
548	NC_003277	CCG	2	6	36321	36326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233495
549	NC_003277	AATC	2	8	36418	36425	50 %	25 %	0 %	25 %	17233495
550	NC_003277	CAG	2	6	36454	36459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233495
551	NC_003277	GGC	2	6	36486	36491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233495
552	NC_003277	ATTT	2	8	36495	36502	25 %	75 %	0 %	0 %	17233495
553	NC_003277	GCA	2	6	36521	36526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233495
554	NC_003277	CGT	2	6	36637	36642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233495
555	NC_003277	GGC	2	6	36704	36709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233495
556	NC_003277	GCT	2	6	36769	36774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233495
557	NC_003277	GGCG	2	8	36823	36830	0 %	0 %	75 %	25 %	17233496
558	NC_003277	TCT	2	6	36847	36852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233496
559	NC_003277	CAG	2	6	36877	36882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233496
560	NC_003277	TTCC	2	8	36897	36904	0 %	50 %	0 %	50 %	17233496
561	NC_003277	CGC	2	6	36926	36931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233496
562	NC_003277	CTGTT	2	10	37040	37049	0 %	60 %	20 %	20 %	17233496
563	NC_003277	TGC	2	6	37108	37113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233496
564	NC_003277	CAG	3	9	37169	37177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233496
565	NC_003277	TCCGG	2	10	37193	37202	0 %	20 %	40 %	40 %	17233496
566	NC_003277	AAT	2	6	37229	37234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	17233496
567	NC_003277	CAG	2	6	37243	37248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233496
568	NC_003277	ATAC	2	8	37567	37574	50 %	25 %	0 %	25 %	17233497
569	NC_003277	TCT	2	6	37593	37598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233497
570	NC_003277	GTT	2	6	37608	37613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	17233497
571	NC_003277	T	6	6	37661	37666	0 %	100 %	0 %	0 %	17233497
572	NC_003277	CAG	2	6	37753	37758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233497
573	NC_003277	GT	3	6	37817	37822	0 %	50 %	50 %	0 %	17233497
574	NC_003277	ACT	2	6	37835	37840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233497
575	NC_003277	TGC	2	6	37872	37877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233497
576	NC_003277	CCG	2	6	37956	37961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233497
577	NC_003277	GCA	2	6	37994	37999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233497
578	NC_003277	GCG	2	6	38147	38152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233497
579	NC_003277	GCC	2	6	38177	38182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233497
580	NC_003277	GACA	2	8	38191	38198	50 %	0 %	25 %	25 %	17233497
581	NC_003277	GTTT	2	8	38216	38223	0 %	75 %	25 %	0 %	17233497
582	NC_003277	CGT	2	6	38234	38239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233497
583	NC_003277	TGGT	2	8	38251	38258	0 %	50 %	50 %	0 %	17233497
584	NC_003277	ATT	2	6	38267	38272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233497
585	NC_003277	TCTG	2	8	38940	38947	0 %	50 %	25 %	25 %	17233498
586	NC_003277	TTC	2	6	38987	38992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17233498
587	NC_003277	CTGC	2	8	39015	39022	0 %	25 %	25 %	50 %	17233498
588	NC_003277	GCA	2	6	39044	39049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233498
589	NC_003277	CAA	2	6	39108	39113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17233498
590	NC_003277	CTGCC	2	10	39125	39134	0 %	20 %	20 %	60 %	17233498
591	NC_003277	TCA	2	6	39194	39199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17233498
592	NC_003277	GAA	3	9	39208	39216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233498
593	NC_003277	GGT	2	6	39354	39359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233498
594	NC_003277	GAC	2	6	39388	39393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233498
595	NC_003277	TGTC	2	8	39411	39418	0 %	50 %	25 %	25 %	17233498
596	NC_003277	ATT	2	6	39700	39705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	17233423
597	NC_003277	GGTG	2	8	39768	39775	0 %	25 %	75 %	0 %	17233423
598	NC_003277	GTC	2	6	39835	39840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233423
599	NC_003277	GAA	2	6	39877	39882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233423
600	NC_003277	CCG	2	6	39896	39901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233423
601	NC_003277	TGC	2	6	39990	39995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233423
602	NC_003277	CGC	2	6	40035	40040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17233423
603	NC_003277	CGA	2	6	40050	40055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233423
604	NC_003277	GAA	2	6	40060	40065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233423
605	NC_003277	CGCTGG	2	12	40103	40114	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17233423
606	NC_003277	CAG	2	6	40135	40140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233423
607	NC_003277	ATG	2	6	40142	40147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233423
608	NC_003277	AGA	2	6	40226	40231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233423
609	NC_003277	TGC	2	6	40235	40240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17233423
610	NC_003277	GCACA	2	10	40264	40273	40 %	0 %	20 %	40 %	17233423
611	NC_003277	AGA	2	6	40338	40343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17233423
612	NC_003277	CAG	2	6	40423	40428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233423
613	NC_003277	GCA	2	6	40452	40457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233423
614	NC_003277	GC	4	8	40489	40496	0 %	0 %	50 %	50 %	17233423
615	NC_003277	CAG	2	6	40527	40532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17233423
616	NC_003277	CCT	2	6	40565	40570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	17233423
617	NC_003277	CA	3	6	40623	40628	50 %	0 %	0 %	50 %	17233423
618	NC_003277	TGA	2	6	40644	40649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233423
619	NC_003277	GAAA	2	8	40674	40681	75 %	0 %	25 %	0 %	17233423
620	NC_003277	GTG	2	6	40697	40702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17233423
621	NC_003277	GGC	2	6	40740	40745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17233423
622	NC_003277	TGA	3	9	40783	40791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17233423
623	NC_003277	ATGA	2	8	41386	41393	50 %	25 %	25 %	0 %	32441711
624	NC_003277	GCT	2	6	41420	41425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32441711
625	NC_003277	CT	3	6	41424	41429	0 %	50 %	0 %	50 %	32441711
626	NC_003277	GTG	2	6	41519	41524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32441711
627	NC_003277	GGACG	2	10	41566	41575	20 %	0 %	60 %	20 %	32441711
628	NC_003277	GGC	2	6	41635	41640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32441711
629	NC_003277	TGGC	2	8	41644	41651	0 %	25 %	50 %	25 %	32441711
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