MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 2670

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003198	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	16758995
2	NC_003198	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	16758996
3	NC_003198	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	16758997
4	NC_003198	CCGCG	2	10	7184	7193	0 %	0 %	40 %	60 %	16758999
5	NC_003198	GCGTG	2	10	13991	14000	0 %	20 %	60 %	20 %	16759006
6	NC_003198	AATCA	2	10	15512	15521	60 %	20 %	0 %	20 %	16759007
7	NC_003198	GGCTG	2	10	18857	18866	0 %	20 %	60 %	20 %	16759011
8	NC_003198	CCTGA	2	10	19919	19928	20 %	20 %	20 %	40 %	16759011
9	NC_003198	GGCCG	2	10	21680	21689	0 %	0 %	60 %	40 %	16759013
10	NC_003198	CTTTT	2	10	23399	23408	0 %	80 %	0 %	20 %	16759014
11	NC_003198	CGGTA	2	10	24565	24574	20 %	20 %	40 %	20 %	16759015
12	NC_003198	CTGTT	2	10	24604	24613	0 %	60 %	20 %	20 %	16759015
13	NC_003198	ATCTG	2	10	30969	30978	20 %	40 %	20 %	20 %	16759020
14	NC_003198	TTACG	2	10	31024	31033	20 %	40 %	20 %	20 %	16759020
15	NC_003198	GGGCG	2	10	31793	31802	0 %	0 %	80 %	20 %	16759021
16	NC_003198	TGCGT	2	10	32172	32181	0 %	40 %	40 %	20 %	16759022
17	NC_003198	AAAAG	2	10	32566	32575	80 %	0 %	20 %	0 %	16759023
18	NC_003198	TATAA	2	10	34169	34178	60 %	40 %	0 %	0 %	16759024
19	NC_003198	AGCGA	2	10	35591	35600	40 %	0 %	40 %	20 %	16759026
20	NC_003198	TCCTG	2	10	35801	35810	0 %	40 %	20 %	40 %	16759026
21	NC_003198	GGTCA	2	10	38036	38045	20 %	20 %	40 %	20 %	16759027
22	NC_003198	TTCAT	2	10	39308	39317	20 %	60 %	0 %	20 %	16759028
23	NC_003198	TGAAA	2	10	40124	40133	60 %	20 %	20 %	0 %	16759029
24	NC_003198	ACGGC	2	10	44483	44492	20 %	0 %	40 %	40 %	16759032
25	NC_003198	GGGCT	2	10	46557	46566	0 %	20 %	60 %	20 %	16759033
26	NC_003198	GCGTA	2	10	48433	48442	20 %	20 %	40 %	20 %	16759035
27	NC_003198	GACCA	2	10	49038	49047	40 %	0 %	20 %	40 %	16759035
28	NC_003198	CAGAC	2	10	50370	50379	40 %	0 %	20 %	40 %	16759035
29	NC_003198	GTTTG	2	10	54526	54535	0 %	60 %	40 %	0 %	16759040
30	NC_003198	GTTTG	2	10	55454	55463	0 %	60 %	40 %	0 %	16759040
31	NC_003198	CACTA	2	10	56585	56594	40 %	20 %	0 %	40 %	16759040
32	NC_003198	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	16759042
33	NC_003198	AAAAT	2	10	58949	58958	80 %	20 %	0 %	0 %	16759044
34	NC_003198	GGAAA	2	10	59736	59745	60 %	0 %	40 %	0 %	16759044
35	NC_003198	CGCTG	2	10	60226	60235	0 %	20 %	40 %	40 %	16759045
36	NC_003198	CGGCG	2	10	63992	64001	0 %	0 %	60 %	40 %	16759048
37	NC_003198	GCGCG	2	10	64939	64948	0 %	0 %	60 %	40 %	16759049
38	NC_003198	ACGGC	2	10	69540	69549	20 %	0 %	40 %	40 %	16759052
39	NC_003198	CGTGC	2	10	71361	71370	0 %	20 %	40 %	40 %	16759055
40	NC_003198	TTGAT	2	10	71531	71540	20 %	60 %	20 %	0 %	16759055
41	NC_003198	ACCGC	2	10	72091	72100	20 %	0 %	20 %	60 %	16759055
42	NC_003198	CGATG	2	10	77570	77579	20 %	20 %	40 %	20 %	16759060
43	NC_003198	GCGAA	2	10	78511	78520	40 %	0 %	40 %	20 %	16759060
44	NC_003198	TTGCC	2	10	81038	81047	0 %	40 %	20 %	40 %	16759062
45	NC_003198	TGGCG	2	10	83086	83095	0 %	20 %	60 %	20 %	16759064
46	NC_003198	TCAGC	2	10	84269	84278	20 %	20 %	20 %	40 %	16759065
47	NC_003198	GTACG	2	10	86988	86997	20 %	20 %	40 %	20 %	16759067
48	NC_003198	CAGAA	2	10	87701	87710	60 %	0 %	20 %	20 %	16759067
49	NC_003198	CCGCA	2	10	89820	89829	20 %	0 %	20 %	60 %	16759069
50	NC_003198	CGGTT	2	10	90325	90334	0 %	40 %	40 %	20 %	16759070
51	NC_003198	TGGCG	2	10	92106	92115	0 %	20 %	60 %	20 %	16759072
52	NC_003198	GTGGC	2	10	96586	96595	0 %	20 %	60 %	20 %	16759078
53	NC_003198	TGCAC	2	10	98502	98511	20 %	20 %	20 %	40 %	16759080
54	NC_003198	TGGCA	2	10	98571	98580	20 %	20 %	40 %	20 %	16759080
55	NC_003198	TCTGT	2	10	98897	98906	0 %	60 %	20 %	20 %	16759081
56	NC_003198	GCGCT	2	10	99207	99216	0 %	20 %	40 %	40 %	16759081
57	NC_003198	GGCGC	2	10	99621	99630	0 %	0 %	60 %	40 %	16759081
58	NC_003198	GCGAC	2	10	99934	99943	20 %	0 %	40 %	40 %	16759081
59	NC_003198	TCTGT	2	10	100226	100235	0 %	60 %	20 %	20 %	16759081
60	NC_003198	AACGT	2	10	102381	102390	40 %	20 %	20 %	20 %	16759084
61	NC_003198	CCCAA	2	10	104531	104540	40 %	0 %	0 %	60 %	16759087
62	NC_003198	TTGTT	2	10	105238	105247	0 %	80 %	20 %	0 %	16759087
63	NC_003198	GCTTC	2	10	106612	106621	0 %	40 %	20 %	40 %	16759088
64	NC_003198	TGCGT	2	10	106899	106908	0 %	40 %	40 %	20 %	16759088
65	NC_003198	TGATC	2	10	108599	108608	20 %	40 %	20 %	20 %	16759089
66	NC_003198	TGGCG	2	10	111759	111768	0 %	20 %	60 %	20 %	16759091
67	NC_003198	AGCGC	2	10	112319	112328	20 %	0 %	40 %	40 %	16759091
68	NC_003198	CCGCG	2	10	113404	113413	0 %	0 %	40 %	60 %	16759092
69	NC_003198	GGGGT	2	10	114800	114809	0 %	20 %	80 %	0 %	16759092
70	NC_003198	ACGGT	2	10	116629	116638	20 %	20 %	40 %	20 %	16759094
71	NC_003198	TGGCG	2	10	116997	117006	0 %	20 %	60 %	20 %	16759094
72	NC_003198	ACAGA	2	10	118348	118357	60 %	0 %	20 %	20 %	16759095
73	NC_003198	CAGCG	2	10	119523	119532	20 %	0 %	40 %	40 %	16759097
74	NC_003198	GCCGG	2	10	119823	119832	0 %	0 %	60 %	40 %	16759097
75	NC_003198	CGAGC	2	10	119948	119957	20 %	0 %	40 %	40 %	16759097
76	NC_003198	ATTTG	2	10	120391	120400	20 %	60 %	20 %	0 %	16759097
77	NC_003198	TTGCC	2	10	124895	124904	0 %	40 %	20 %	40 %	16759101
78	NC_003198	AGTTT	2	10	127802	127811	20 %	60 %	20 %	0 %	16759103
79	NC_003198	TCGAT	2	10	129650	129659	20 %	40 %	20 %	20 %	16759104
80	NC_003198	CGTTT	2	10	132422	132431	0 %	60 %	20 %	20 %	16759106
81	NC_003198	ATTCC	2	10	137523	137532	20 %	40 %	0 %	40 %	16759111
82	NC_003198	AAAGC	2	10	139820	139829	60 %	0 %	20 %	20 %	16759113
83	NC_003198	CCGCA	2	10	140353	140362	20 %	0 %	20 %	60 %	16759113
84	NC_003198	AGTTC	2	10	142724	142733	20 %	40 %	20 %	20 %	16759115
85	NC_003198	TGCCT	2	10	142824	142833	0 %	40 %	20 %	40 %	16759116
86	NC_003198	AAGCG	2	10	147477	147486	40 %	0 %	40 %	20 %	16759119
87	NC_003198	GTTTG	2	10	149380	149389	0 %	60 %	40 %	0 %	16759121
88	NC_003198	CGTAT	2	10	150851	150860	20 %	40 %	20 %	20 %	16759122
89	NC_003198	ATGGC	2	10	152104	152113	20 %	20 %	40 %	20 %	16759123
90	NC_003198	ATCAG	2	10	152687	152696	40 %	20 %	20 %	20 %	16759124
91	NC_003198	CTGCC	2	10	154696	154705	0 %	20 %	20 %	60 %	16759125
92	NC_003198	CGGCG	2	10	157426	157435	0 %	0 %	60 %	40 %	16759128
93	NC_003198	CCGGC	2	10	160783	160792	0 %	0 %	40 %	60 %	16759131
94	NC_003198	CGCTG	2	10	161675	161684	0 %	20 %	40 %	40 %	16759131
95	NC_003198	GAACC	2	10	164642	164651	40 %	0 %	20 %	40 %	16759134
96	NC_003198	GATCA	2	10	165830	165839	40 %	20 %	20 %	20 %	16759136
97	NC_003198	ATCCC	2	10	168276	168285	20 %	20 %	0 %	60 %	16759139
98	NC_003198	AGCGC	2	10	168984	168993	20 %	0 %	40 %	40 %	16759139
99	NC_003198	TGAGC	2	10	170833	170842	20 %	20 %	40 %	20 %	16759140
100	NC_003198	CGCAT	2	10	171095	171104	20 %	20 %	20 %	40 %	16759141
101	NC_003198	CGAAC	2	10	171824	171833	40 %	0 %	20 %	40 %	16759142
102	NC_003198	GTTCA	2	10	172090	172099	20 %	40 %	20 %	20 %	16759142
103	NC_003198	ATGAC	2	10	173056	173065	40 %	20 %	20 %	20 %	16759143
104	NC_003198	ACTGG	2	10	173645	173654	20 %	20 %	40 %	20 %	16759144
105	NC_003198	CAGAA	2	10	175765	175774	60 %	0 %	20 %	20 %	16759146
106	NC_003198	CGAAG	2	10	178636	178645	40 %	0 %	40 %	20 %	16759148
107	NC_003198	GACTG	2	10	180437	180446	20 %	20 %	40 %	20 %	16759149
108	NC_003198	GGCAT	2	10	185917	185926	20 %	20 %	40 %	20 %	16759152
109	NC_003198	GGCCA	2	10	186339	186348	20 %	0 %	40 %	40 %	16759153
110	NC_003198	CGTTT	2	10	186854	186863	0 %	60 %	20 %	20 %	16759153
111	NC_003198	GGGGA	2	10	186906	186915	20 %	0 %	80 %	0 %	16759153
112	NC_003198	TCTGG	2	10	190539	190548	0 %	40 %	40 %	20 %	16759155
113	NC_003198	CGGCG	2	10	192522	192531	0 %	0 %	60 %	40 %	16759157
114	NC_003198	CCGCT	2	10	193229	193238	0 %	20 %	20 %	60 %	16759157
115	NC_003198	GCCCA	2	10	195781	195790	20 %	0 %	20 %	60 %	16759160
116	NC_003198	GCGCA	2	10	196186	196195	20 %	0 %	40 %	40 %	16759160
117	NC_003198	ATCGG	2	10	197577	197586	20 %	20 %	40 %	20 %	16759162
118	NC_003198	GCCGC	2	10	198787	198796	0 %	0 %	40 %	60 %	16759164
119	NC_003198	CAAAC	2	10	200813	200822	60 %	0 %	0 %	40 %	16759165
120	NC_003198	ATCCA	2	10	204137	204146	40 %	20 %	0 %	40 %	16759167
121	NC_003198	CGGCG	2	10	206370	206379	0 %	0 %	60 %	40 %	16759170
122	NC_003198	TGGGC	2	10	206941	206950	0 %	20 %	60 %	20 %	16759171
123	NC_003198	TTCGG	2	10	207250	207259	0 %	40 %	40 %	20 %	16759171
124	NC_003198	CTTGC	2	10	208259	208268	0 %	40 %	20 %	40 %	16759172
125	NC_003198	TGAGC	2	10	208671	208680	20 %	20 %	40 %	20 %	16759173
126	NC_003198	GGCGT	2	10	209874	209883	0 %	20 %	60 %	20 %	16759174
127	NC_003198	TTTTA	2	10	212450	212459	20 %	80 %	0 %	0 %	16759177
128	NC_003198	GTTGC	2	10	213343	213352	0 %	40 %	40 %	20 %	16759179
129	NC_003198	TTCAC	2	10	214773	214782	20 %	40 %	0 %	40 %	16759179
130	NC_003198	GAGTT	2	10	216108	216117	20 %	40 %	40 %	0 %	16759180
131	NC_003198	CGCGG	2	10	218296	218305	0 %	0 %	60 %	40 %	16759183
132	NC_003198	CGCGG	2	10	218480	218489	0 %	0 %	60 %	40 %	16759183
133	NC_003198	GCCAG	2	10	220464	220473	20 %	0 %	40 %	40 %	16759184
134	NC_003198	GCGCG	2	10	221030	221039	0 %	0 %	60 %	40 %	16759185
135	NC_003198	CGGGG	2	10	222848	222857	0 %	0 %	80 %	20 %	541470380
136	NC_003198	CAGCG	2	10	225031	225040	20 %	0 %	40 %	40 %	541470380
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