MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_003198	TGG	2	6	213093	213098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759178
4003	NC_003198	CGC	2	6	213127	213132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759178
4004	NC_003198	TGC	2	6	213141	213146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759178
4005	NC_003198	GCT	2	6	213233	213238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759178
4006	NC_003198	TATT	2	8	213245	213252	25 %	75 %	0 %	0 %	16759178
4007	NC_003198	TTA	2	6	213285	213290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759179
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4009	NC_003198	GTTGC	2	10	213343	213352	0 %	40 %	40 %	20 %	16759179
4010	NC_003198	GCTG	2	8	213381	213388	0 %	25 %	50 %	25 %	16759179
4011	NC_003198	TTC	2	6	213392	213397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759179
4012	NC_003198	TGT	2	6	213466	213471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759179
4013	NC_003198	TCG	2	6	213700	213705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759179
4014	NC_003198	CGAT	2	8	213720	213727	25 %	25 %	25 %	25 %	16759179
4015	NC_003198	GCC	2	6	213737	213742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759179
4016	NC_003198	GC	4	8	213749	213756	0 %	0 %	50 %	50 %	16759179
4017	NC_003198	GCGA	2	8	213861	213868	25 %	0 %	50 %	25 %	16759179
4018	NC_003198	GCT	2	6	213878	213883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759179
4019	NC_003198	ATT	2	6	213887	213892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759179
4020	NC_003198	CTG	2	6	214026	214031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759179
4021	NC_003198	CCG	2	6	214059	214064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759179
4022	NC_003198	CCG	2	6	214119	214124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759179
4023	NC_003198	CAG	2	6	214127	214132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759179
4024	NC_003198	ATC	2	6	214169	214174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759179
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4031	NC_003198	TTA	2	6	214710	214715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759179
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4034	NC_003198	CTGCAT	2	12	214817	214828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16759179
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4037	NC_003198	CCT	2	6	214873	214878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759179
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4044	NC_003198	TCT	2	6	215511	215516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759179
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4053	NC_003198	GAGTT	2	10	216108	216117	20 %	40 %	40 %	0 %	16759180
4054	NC_003198	GTA	2	6	216126	216131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759180
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4056	NC_003198	GTT	2	6	216168	216173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759180
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4058	NC_003198	TCT	2	6	216266	216271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759180
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4060	NC_003198	GC	3	6	216342	216347	0 %	0 %	50 %	50 %	16759180
4061	NC_003198	G	7	7	216407	216413	0 %	0 %	100 %	0 %	16759180
4062	NC_003198	TCG	2	6	216446	216451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759180
4063	NC_003198	TAA	2	6	216484	216489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759180
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4066	NC_003198	T	8	8	216630	216637	0 %	100 %	0 %	0 %	16759180
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4072	NC_003198	GAT	2	6	217160	217165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759181
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4074	NC_003198	AGC	2	6	217199	217204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759181
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4085	NC_003198	GAA	2	6	218170	218175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759182
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4089	NC_003198	CG	3	6	218306	218311	0 %	0 %	50 %	50 %	16759183
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4092	NC_003198	TCG	2	6	218349	218354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759183
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4096	NC_003198	GC	3	6	218457	218462	0 %	0 %	50 %	50 %	16759183
4097	NC_003198	CGCGG	2	10	218480	218489	0 %	0 %	60 %	40 %	16759183
4098	NC_003198	TCAT	2	8	218628	218635	25 %	50 %	0 %	25 %	16759183
4099	NC_003198	T	6	6	218683	218688	0 %	100 %	0 %	0 %	16759183
4100	NC_003198	CAG	2	6	218699	218704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759183
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4103	NC_003198	ATG	2	6	218796	218801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759183
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4105	NC_003198	GGT	2	6	218869	218874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759183
4106	NC_003198	GTT	2	6	218884	218889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759183
4107	NC_003198	TTC	2	6	218933	218938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759183
4108	NC_003198	GC	3	6	218945	218950	0 %	0 %	50 %	50 %	16759183
4109	NC_003198	GGA	2	6	218952	218957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759183
4110	NC_003198	GC	3	6	219045	219050	0 %	0 %	50 %	50 %	16759183
4111	NC_003198	CTT	2	6	219112	219117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759183
4112	NC_003198	CCG	2	6	219132	219137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759183
4113	NC_003198	GTA	2	6	219170	219175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759183
4114	NC_003198	TCT	2	6	219210	219215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759183
4115	NC_003198	TGT	2	6	219232	219237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759183
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4119	NC_003198	AAT	2	6	219393	219398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759183
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4123	NC_003198	GCA	2	6	219924	219929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759184
4124	NC_003198	CTC	2	6	219931	219936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759184
4125	NC_003198	ACG	2	6	219959	219964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759184
4126	NC_003198	GCCA	2	8	220107	220114	25 %	0 %	25 %	50 %	16759184
4127	NC_003198	TCG	2	6	220199	220204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759184
4128	NC_003198	ACC	2	6	220205	220210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759184
4129	NC_003198	CGG	2	6	220241	220246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759184
4130	NC_003198	ATA	2	6	220250	220255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759184
4131	NC_003198	CGC	2	6	220293	220298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759184
4132	NC_003198	CAT	2	6	220305	220310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759184
4133	NC_003198	TGC	2	6	220328	220333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759184
4134	NC_003198	CGG	2	6	220347	220352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759184
4135	NC_003198	AGT	2	6	220437	220442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759184
4136	NC_003198	GCCAG	2	10	220464	220473	20 %	0 %	40 %	40 %	16759184
4137	NC_003198	G	6	6	220589	220594	0 %	0 %	100 %	0 %	16759184
4138	NC_003198	GCG	2	6	220661	220666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759184
4139	NC_003198	AGTC	2	8	220728	220735	25 %	25 %	25 %	25 %	16759184
4140	NC_003198	TGC	2	6	220737	220742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759184
4141	NC_003198	CAGC	2	8	220835	220842	25 %	0 %	25 %	50 %	16759185
4142	NC_003198	GGC	2	6	220886	220891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759185
4143	NC_003198	TTC	2	6	220948	220953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759185
4144	NC_003198	CTC	2	6	221019	221024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759185
4145	NC_003198	GCGCG	2	10	221030	221039	0 %	0 %	60 %	40 %	16759185
4146	NC_003198	GGC	2	6	221061	221066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759185
4147	NC_003198	CTT	2	6	221252	221257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759185
4148	NC_003198	GTTC	2	8	221458	221465	0 %	50 %	25 %	25 %	16759186
4149	NC_003198	GCA	2	6	221599	221604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759186
4150	NC_003198	ACC	3	9	221613	221621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759186
4151	NC_003198	GCC	2	6	221634	221639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759186
4152	NC_003198	CTT	2	6	221869	221874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759186
4153	NC_003198	AATG	2	8	221909	221916	50 %	25 %	25 %	0 %	16759186
4154	NC_003198	CGT	2	6	222053	222058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759186
4155	NC_003198	TGA	2	6	222070	222075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759186
4156	NC_003198	A	6	6	222084	222089	100 %	0 %	0 %	0 %	16759186
4157	NC_003198	ATT	3	9	222155	222163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759187
4158	NC_003198	CGG	3	9	222267	222275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759187
4159	NC_003198	TGGC	2	8	222289	222296	0 %	25 %	50 %	25 %	16759187
4160	NC_003198	GCA	2	6	222302	222307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759187
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4162	NC_003198	GCGG	2	8	222354	222361	0 %	0 %	75 %	25 %	16759187
4163	NC_003198	GC	4	8	222365	222372	0 %	0 %	50 %	50 %	16759187
4164	NC_003198	CAA	2	6	222390	222395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759187
4165	NC_003198	CG	3	6	222398	222403	0 %	0 %	50 %	50 %	16759187
4166	NC_003198	CA	3	6	222424	222429	50 %	0 %	0 %	50 %	16759187
4167	NC_003198	CG	3	6	222431	222436	0 %	0 %	50 %	50 %	16759187
4168	NC_003198	GC	4	8	222512	222519	0 %	0 %	50 %	50 %	16759187
4169	NC_003198	CGC	2	6	222570	222575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759187
4170	NC_003198	CGTC	2	8	222586	222593	0 %	25 %	25 %	50 %	16759187
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4172	NC_003198	GC	5	10	222632	222641	0 %	0 %	50 %	50 %	16759187
4173	NC_003198	GTC	2	6	222642	222647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759187
4174	NC_003198	A	6	6	222663	222668	100 %	0 %	0 %	0 %	16759187
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4179	NC_003198	CGGGG	2	10	222848	222857	0 %	0 %	80 %	20 %	541470380
4180	NC_003198	CGT	2	6	222930	222935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541470380
4181	NC_003198	GGC	2	6	222938	222943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541470380
4182	NC_003198	TGAA	2	8	222976	222983	50 %	25 %	25 %	0 %	541470380
4183	NC_003198	GC	4	8	223013	223020	0 %	0 %	50 %	50 %	541470380
4184	NC_003198	GTG	2	6	223053	223058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541470380
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4192	NC_003198	GTC	2	6	223620	223625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541470380
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4194	NC_003198	TCAG	2	8	223696	223703	25 %	25 %	25 %	25 %	541470380
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4197	NC_003198	GAC	2	6	223735	223740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541470380
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4200	NC_003198	TTG	2	6	223839	223844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	541470380
4201	NC_003198	CTGG	2	8	223889	223896	0 %	25 %	50 %	25 %	541470380
4202	NC_003198	GCC	2	6	223901	223906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541470380
4203	NC_003198	GCC	2	6	223923	223928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	541470380
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4206	NC_003198	GCGA	2	8	223963	223970	25 %	0 %	50 %	25 %	541470380
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4224	NC_003198	CGTCTG	2	12	224661	224672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541470380
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4228	NC_003198	TGC	2	6	224845	224850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541470380
4229	NC_003198	CCCG	2	8	224930	224937	0 %	0 %	25 %	75 %	541470380
4230	NC_003198	CAGCG	2	10	225031	225040	20 %	0 %	40 %	40 %	541470380
4231	NC_003198	CG	3	6	225055	225060	0 %	0 %	50 %	50 %	541470380
4232	NC_003198	GAA	2	6	225176	225181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541470380
4233	NC_003198	CGT	2	6	225404	225409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759189
4234	NC_003198	GCA	2	6	225412	225417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759189
4235	NC_003198	GAC	2	6	225419	225424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759189
4236	NC_003198	ATG	3	9	225429	225437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759189
4237	NC_003198	GAA	2	6	225449	225454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759189
4238	NC_003198	GGCT	2	8	225506	225513	0 %	25 %	50 %	25 %	16759189
4239	NC_003198	A	6	6	225582	225587	100 %	0 %	0 %	0 %	16759189
4240	NC_003198	CGG	3	9	225624	225632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759189
4241	NC_003198	GAT	2	6	225775	225780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759189
4242	NC_003198	CGT	2	6	225782	225787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759189
4243	NC_003198	AAG	2	6	225810	225815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759189
4244	NC_003198	GC	4	8	225823	225830	0 %	0 %	50 %	50 %	16759189
4245	NC_003198	AAC	2	6	225878	225883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759189
4246	NC_003198	CTT	2	6	225895	225900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759189
4247	NC_003198	TTC	2	6	225931	225936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759189
4248	NC_003198	AGC	2	6	225948	225953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759189
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4352	NC_003198	GGCGT	2	10	232545	232554	0 %	20 %	60 %	20 %	16759192
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4363	NC_003198	ATGG	2	8	233048	233055	25 %	25 %	50 %	0 %	16759192
4364	NC_003198	GC	3	6	233089	233094	0 %	0 %	50 %	50 %	16759192
4365	NC_003198	GCT	2	6	233096	233101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
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4368	NC_003198	GGC	2	6	233165	233170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
4369	NC_003198	GC	3	6	233209	233214	0 %	0 %	50 %	50 %	16759192
4370	NC_003198	CTG	3	9	233217	233225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
4371	NC_003198	CT	3	6	233241	233246	0 %	50 %	0 %	50 %	16759192
4372	NC_003198	GCT	2	6	233288	233293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759192
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4374	NC_003198	GGC	2	6	233330	233335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759192
4375	NC_003198	GGCG	2	8	233342	233349	0 %	0 %	75 %	25 %	16759192
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4491	NC_003198	ATA	2	6	238323	238328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759197
4492	NC_003198	CCG	2	6	238524	238529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759197
4493	NC_003198	GTC	2	6	238533	238538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759197
4494	NC_003198	GAA	2	6	238597	238602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759197
4495	NC_003198	GCG	2	6	238644	238649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759197
4496	NC_003198	CTGC	2	8	238672	238679	0 %	25 %	25 %	50 %	16759197
4497	NC_003198	GGC	2	6	238706	238711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759197
4498	NC_003198	CCAC	2	8	238756	238763	25 %	0 %	0 %	75 %	16759197
4499	NC_003198	CCG	2	6	238815	238820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759197
4500	NC_003198	CGA	2	6	238828	238833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759197

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