MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003198	ACC	2	6	187715	187720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759154
3502	NC_003198	ATG	2	6	187721	187726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759154
3503	NC_003198	ATC	3	9	187730	187738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759154
3504	NC_003198	ATG	2	6	187739	187744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759154
3505	NC_003198	GTC	3	9	187745	187753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3506	NC_003198	TGG	2	6	187755	187760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759154
3507	NC_003198	TGA	2	6	187761	187766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759154
3508	NC_003198	TCG	2	6	187767	187772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3509	NC_003198	TGC	2	6	187786	187791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3510	NC_003198	AAC	2	6	187794	187799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759154
3511	NC_003198	GGT	2	6	187805	187810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759154
3512	NC_003198	CTG	2	6	187859	187864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3513	NC_003198	CGG	2	6	187889	187894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759154
3514	NC_003198	CGT	2	6	187925	187930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3515	NC_003198	ACC	2	6	187953	187958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759154
3516	NC_003198	TGA	2	6	187981	187986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759154
3517	NC_003198	TGG	2	6	188020	188025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759154
3518	NC_003198	GTC	2	6	188028	188033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3519	NC_003198	CGG	2	6	188038	188043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759154
3520	NC_003198	GAGC	2	8	188113	188120	25 %	0 %	50 %	25 %	16759154
3521	NC_003198	CATC	2	8	188140	188147	25 %	25 %	0 %	50 %	16759154
3522	NC_003198	TGGC	2	8	188268	188275	0 %	25 %	50 %	25 %	16759154
3523	NC_003198	GCC	2	6	188502	188507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759154
3524	NC_003198	CA	3	6	188577	188582	50 %	0 %	0 %	50 %	16759154
3525	NC_003198	TCG	2	6	189001	189006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
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3527	NC_003198	TGC	2	6	189041	189046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3528	NC_003198	GCT	2	6	189101	189106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3529	NC_003198	GAA	3	9	189126	189134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759155
3530	NC_003198	TCC	2	6	189164	189169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759155
3531	NC_003198	GCT	2	6	189210	189215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3532	NC_003198	ACC	2	6	189231	189236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759155
3533	NC_003198	CTG	2	6	189270	189275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3534	NC_003198	ACA	2	6	189295	189300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759155
3535	NC_003198	CTG	2	6	189372	189377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3536	NC_003198	ACG	2	6	189394	189399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3537	NC_003198	AGA	2	6	189401	189406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759155
3538	NC_003198	CCG	2	6	189483	189488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759155
3539	NC_003198	A	6	6	189496	189501	100 %	0 %	0 %	0 %	16759155
3540	NC_003198	TCACCG	2	12	189502	189513	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16759155
3541	NC_003198	CGA	2	6	189542	189547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3542	NC_003198	TC	4	8	189548	189555	0 %	50 %	0 %	50 %	16759155
3543	NC_003198	CAAA	2	8	189665	189672	75 %	0 %	0 %	25 %	16759155
3544	NC_003198	A	6	6	189687	189692	100 %	0 %	0 %	0 %	16759155
3545	NC_003198	GTG	2	6	189720	189725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759155
3546	NC_003198	TTC	2	6	189734	189739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759155
3547	NC_003198	GCG	3	9	189808	189816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
3548	NC_003198	CGG	2	6	189827	189832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
3549	NC_003198	TCT	2	6	189847	189852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759155
3550	NC_003198	GC	3	6	189874	189879	0 %	0 %	50 %	50 %	16759155
3551	NC_003198	CTG	2	6	189975	189980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3552	NC_003198	CGA	2	6	190013	190018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3553	NC_003198	ACC	2	6	190065	190070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759155
3554	NC_003198	AGC	2	6	190137	190142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3555	NC_003198	TC	3	6	190150	190155	0 %	50 %	0 %	50 %	16759155
3556	NC_003198	GGTC	2	8	190169	190176	0 %	25 %	50 %	25 %	16759155
3557	NC_003198	GCG	2	6	190183	190188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
3558	NC_003198	TAC	2	6	190250	190255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759155
3559	NC_003198	TGA	2	6	190271	190276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759155
3560	NC_003198	CCG	2	6	190306	190311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759155
3561	NC_003198	CAC	2	6	190367	190372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759155
3562	NC_003198	CAC	2	6	190374	190379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759155
3563	NC_003198	CGG	2	6	190406	190411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
3564	NC_003198	TGC	3	9	190462	190470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3565	NC_003198	CGG	2	6	190487	190492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
3566	NC_003198	CGG	2	6	190531	190536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
3567	NC_003198	TCTGG	2	10	190539	190548	0 %	40 %	40 %	20 %	16759155
3568	NC_003198	GCC	2	6	190557	190562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759155
3569	NC_003198	CTG	2	6	190689	190694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3570	NC_003198	GAA	2	6	190703	190708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759155
3571	NC_003198	TCT	2	6	190723	190728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759155
3572	NC_003198	CTG	2	6	190881	190886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3573	NC_003198	GAT	2	6	190892	190897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759155
3574	NC_003198	CGT	2	6	190917	190922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3575	NC_003198	CGT	2	6	190932	190937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3576	NC_003198	TGGC	2	8	190956	190963	0 %	25 %	50 %	25 %	16759155
3577	NC_003198	GCT	2	6	190973	190978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3578	NC_003198	GAC	2	6	191070	191075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759155
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3580	NC_003198	CGA	2	6	191111	191116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3581	NC_003198	CG	3	6	191157	191162	0 %	0 %	50 %	50 %	16759155
3582	NC_003198	GCT	2	6	191171	191176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759155
3583	NC_003198	GCC	2	6	191219	191224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759155
3584	NC_003198	GAA	2	6	191253	191258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759155
3585	NC_003198	TAC	2	6	191262	191267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759155
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3587	NC_003198	GGT	2	6	191357	191362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759155
3588	NC_003198	GGC	2	6	191435	191440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
3589	NC_003198	CGG	2	6	191512	191517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759155
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3591	NC_003198	CT	3	6	191550	191555	0 %	50 %	0 %	50 %	16759155
3592	NC_003198	GGT	2	6	191856	191861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759156
3593	NC_003198	CG	3	6	191925	191930	0 %	0 %	50 %	50 %	16759156
3594	NC_003198	TGGA	2	8	191986	191993	25 %	25 %	50 %	0 %	16759156
3595	NC_003198	GAA	2	6	191998	192003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759156
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3598	NC_003198	AG	3	6	192075	192080	50 %	0 %	50 %	0 %	16759156
3599	NC_003198	GGA	2	6	192099	192104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759156
3600	NC_003198	GTC	2	6	192115	192120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759156
3601	NC_003198	A	6	6	192397	192402	100 %	0 %	0 %	0 %	16759157
3602	NC_003198	CGG	2	6	192420	192425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759157
3603	NC_003198	ATG	2	6	192427	192432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759157
3604	NC_003198	CGGCG	2	10	192522	192531	0 %	0 %	60 %	40 %	16759157
3605	NC_003198	CTG	2	6	192550	192555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759157
3606	NC_003198	GCG	2	6	192701	192706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759157
3607	NC_003198	TGC	2	6	192750	192755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759157
3608	NC_003198	ATG	2	6	192815	192820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759157
3609	NC_003198	CTTT	2	8	192824	192831	0 %	75 %	0 %	25 %	16759157
3610	NC_003198	GAT	2	6	192834	192839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759157
3611	NC_003198	TGG	2	6	192884	192889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759157
3612	NC_003198	T	6	6	192951	192956	0 %	100 %	0 %	0 %	16759157
3613	NC_003198	GGC	2	6	192964	192969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759157
3614	NC_003198	GCT	2	6	192972	192977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759157
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3616	NC_003198	GGGC	2	8	193004	193011	0 %	0 %	75 %	25 %	16759157
3617	NC_003198	CGTT	2	8	193073	193080	0 %	50 %	25 %	25 %	16759157
3618	NC_003198	GCG	2	6	193138	193143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759157
3619	NC_003198	CGC	2	6	193175	193180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759157
3620	NC_003198	TCGC	2	8	193204	193211	0 %	25 %	25 %	50 %	16759157
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3622	NC_003198	CCGCT	2	10	193229	193238	0 %	20 %	20 %	60 %	16759157
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3990	NC_003198	ATT	2	6	212375	212380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759177
3991	NC_003198	T	6	6	212402	212407	0 %	100 %	0 %	0 %	16759177
3992	NC_003198	TTTTA	2	10	212450	212459	20 %	80 %	0 %	0 %	16759177
3993	NC_003198	ACG	2	6	212655	212660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759177
3994	NC_003198	ATC	2	6	212682	212687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759177
3995	NC_003198	TGC	2	6	212797	212802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759178
3996	NC_003198	GC	3	6	212801	212806	0 %	0 %	50 %	50 %	16759178
3997	NC_003198	TCG	2	6	212807	212812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759178
3998	NC_003198	TGAGCC	2	12	212827	212838	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16759178
3999	NC_003198	TGG	2	6	212895	212900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759178
4000	NC_003198	GTG	3	9	212966	212974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759178

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