MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_003198	TCTA	2	8	161313	161320	25 %	50 %	0 %	25 %	16759131
3002	NC_003198	CGT	2	6	161333	161338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759131
3003	NC_003198	GAT	2	6	161357	161362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759131
3004	NC_003198	A	6	6	161404	161409	100 %	0 %	0 %	0 %	16759131
3005	NC_003198	AG	3	6	161505	161510	50 %	0 %	50 %	0 %	16759131
3006	NC_003198	GCG	2	6	161598	161603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759131
3007	NC_003198	CGCTG	2	10	161675	161684	0 %	20 %	40 %	40 %	16759131
3008	NC_003198	GAA	2	6	161697	161702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759131
3009	NC_003198	CGG	2	6	161759	161764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759131
3010	NC_003198	CCG	2	6	161798	161803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759131
3011	NC_003198	TTC	2	6	161852	161857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759131
3012	NC_003198	ATG	2	6	161922	161927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759131
3013	NC_003198	CTG	2	6	162039	162044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759131
3014	NC_003198	ATG	3	9	162049	162057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759131
3015	NC_003198	CTG	2	6	162102	162107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759131
3016	NC_003198	CCG	2	6	162183	162188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759131
3017	NC_003198	GAG	2	6	162300	162305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759131
3018	NC_003198	AGA	2	6	162356	162361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759131
3019	NC_003198	GGT	2	6	162362	162367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759131
3020	NC_003198	ATG	2	6	162378	162383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759131
3021	NC_003198	TGC	2	6	162406	162411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759131
3022	NC_003198	GGC	2	6	162443	162448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759131
3023	NC_003198	CGC	2	6	162539	162544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759131
3024	NC_003198	GCA	2	6	162668	162673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759131
3025	NC_003198	GCC	2	6	162696	162701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759131
3026	NC_003198	GCC	2	6	162717	162722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759131
3027	NC_003198	A	6	6	162971	162976	100 %	0 %	0 %	0 %	16759132
3028	NC_003198	ACG	2	6	163011	163016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759132
3029	NC_003198	TTA	2	6	163023	163028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759132
3030	NC_003198	CGC	2	6	163036	163041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759132
3031	NC_003198	CGG	2	6	163075	163080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759132
3032	NC_003198	ATT	2	6	163165	163170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759132
3033	NC_003198	AAG	2	6	163257	163262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759132
3034	NC_003198	CCG	2	6	163313	163318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759132
3035	NC_003198	ATT	2	6	163331	163336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759132
3036	NC_003198	TTA	2	6	163394	163399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759133
3037	NC_003198	GCG	2	6	163446	163451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759133
3038	NC_003198	GCC	2	6	163476	163481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759133
3039	NC_003198	CAG	2	6	163583	163588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759133
3040	NC_003198	GCA	2	6	163719	163724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759133
3041	NC_003198	TCT	2	6	163728	163733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759133
3042	NC_003198	CGA	2	6	163783	163788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759133
3043	NC_003198	TCT	2	6	163983	163988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759133
3044	NC_003198	TCG	2	6	164146	164151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759133
3045	NC_003198	CGA	2	6	164169	164174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759133
3046	NC_003198	CATA	2	8	164218	164225	50 %	25 %	0 %	25 %	16759133
3047	NC_003198	GTC	2	6	164291	164296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759133
3048	NC_003198	GGCT	2	8	164477	164484	0 %	25 %	50 %	25 %	16759134
3049	NC_003198	TAA	2	6	164485	164490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759134
3050	NC_003198	ATG	2	6	164497	164502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759134
3051	NC_003198	GCG	2	6	164562	164567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759134
3052	NC_003198	GGA	2	6	164615	164620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759134
3053	NC_003198	ATT	2	6	164636	164641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759134
3054	NC_003198	GAACC	2	10	164642	164651	40 %	0 %	20 %	40 %	16759134
3055	NC_003198	TGA	2	6	164723	164728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759134
3056	NC_003198	TGCC	2	8	164741	164748	0 %	25 %	25 %	50 %	16759134
3057	NC_003198	CGG	2	6	164797	164802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759134
3058	NC_003198	AACG	2	8	164901	164908	50 %	0 %	25 %	25 %	16759134
3059	NC_003198	CGC	2	6	165028	165033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759134
3060	NC_003198	TCA	2	6	165049	165054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759134
3061	NC_003198	TC	3	6	165182	165187	0 %	50 %	0 %	50 %	16759134
3062	NC_003198	CGC	2	6	165188	165193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759134
3063	NC_003198	GAG	2	6	165276	165281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759134
3064	NC_003198	CTGC	2	8	165285	165292	0 %	25 %	25 %	50 %	16759134
3065	NC_003198	TAT	2	6	165312	165317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759134
3066	NC_003198	CG	3	6	165324	165329	0 %	0 %	50 %	50 %	16759134
3067	NC_003198	TATT	2	8	165352	165359	25 %	75 %	0 %	0 %	16759134
3068	NC_003198	ATT	2	6	165361	165366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759134
3069	NC_003198	GTC	2	6	165428	165433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759135
3070	NC_003198	CGC	2	6	165448	165453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759135
3071	NC_003198	CGG	2	6	165475	165480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759135
3072	NC_003198	C	6	6	165544	165549	0 %	0 %	0 %	100 %	16759135
3073	NC_003198	GAC	2	6	165551	165556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759135
3074	NC_003198	ACG	2	6	165582	165587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759135
3075	NC_003198	GCA	2	6	165751	165756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759136
3076	NC_003198	CGT	2	6	165763	165768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759136
3077	NC_003198	GATCA	2	10	165830	165839	40 %	20 %	20 %	20 %	16759136
3078	NC_003198	TGT	2	6	165915	165920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759136
3079	NC_003198	GCC	2	6	165965	165970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759136
3080	NC_003198	GCT	2	6	166021	166026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759136
3081	NC_003198	CCG	2	6	166060	166065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759136
3082	NC_003198	CTG	2	6	166073	166078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759136
3083	NC_003198	GCT	2	6	166141	166146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759136
3084	NC_003198	CAG	2	6	166163	166168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759136
3085	NC_003198	A	6	6	166224	166229	100 %	0 %	0 %	0 %	16759136
3086	NC_003198	TCT	2	6	166312	166317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759136
3087	NC_003198	TTA	2	6	166448	166453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759137
3088	NC_003198	GC	3	6	166480	166485	0 %	0 %	50 %	50 %	16759137
3089	NC_003198	CG	3	6	166527	166532	0 %	0 %	50 %	50 %	16759137
3090	NC_003198	CAT	2	6	166536	166541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759137
3091	NC_003198	ACC	2	6	166586	166591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759137
3092	NC_003198	CAG	2	6	166630	166635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759137
3093	NC_003198	CTG	2	6	166693	166698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759137
3094	NC_003198	TTC	2	6	166735	166740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759137
3095	NC_003198	A	6	6	166749	166754	100 %	0 %	0 %	0 %	16759137
3096	NC_003198	CGG	2	6	166791	166796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759137
3097	NC_003198	GGGC	2	8	166836	166843	0 %	0 %	75 %	25 %	16759137
3098	NC_003198	GC	3	6	166864	166869	0 %	0 %	50 %	50 %	16759137
3099	NC_003198	ATA	2	6	166871	166876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759137
3100	NC_003198	CCG	2	6	166946	166951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759137
3101	NC_003198	GAA	2	6	167209	167214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759138
3102	NC_003198	A	6	6	167531	167536	100 %	0 %	0 %	0 %	16759138
3103	NC_003198	TCG	2	6	167621	167626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759138
3104	NC_003198	ACG	2	6	167758	167763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759138
3105	NC_003198	CGG	2	6	167798	167803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759138
3106	NC_003198	GGC	2	6	167836	167841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759138
3107	NC_003198	GGC	2	6	167857	167862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759138
3108	NC_003198	CGG	3	9	167895	167903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759138
3109	NC_003198	AG	3	6	167946	167951	50 %	0 %	50 %	0 %	16759138
3110	NC_003198	CGG	2	6	167952	167957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759138
3111	NC_003198	AGA	2	6	167967	167972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759138
3112	NC_003198	CGG	2	6	168036	168041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759138
3113	NC_003198	CG	3	6	168055	168060	0 %	0 %	50 %	50 %	16759138
3114	NC_003198	CCGC	2	8	168110	168117	0 %	0 %	25 %	75 %	16759138
3115	NC_003198	CAC	2	6	168189	168194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759138
3116	NC_003198	ATCCC	2	10	168276	168285	20 %	20 %	0 %	60 %	16759139
3117	NC_003198	CCA	3	9	168327	168335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759139
3118	NC_003198	TGA	2	6	168357	168362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759139
3119	NC_003198	GCCAGC	2	12	168401	168412	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16759139
3120	NC_003198	GCA	2	6	168444	168449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759139
3121	NC_003198	T	6	6	168521	168526	0 %	100 %	0 %	0 %	16759139
3122	NC_003198	GAA	2	6	168633	168638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759139
3123	NC_003198	AGA	2	6	168734	168739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759139
3124	NC_003198	CGCTGC	2	12	168740	168751	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16759139
3125	NC_003198	ATA	2	6	168857	168862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759139
3126	NC_003198	AGA	2	6	168872	168877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759139
3127	NC_003198	GGC	2	6	168907	168912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759139
3128	NC_003198	GCA	2	6	168933	168938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759139
3129	NC_003198	GGC	2	6	168955	168960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759139
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3132	NC_003198	AGC	2	6	169050	169055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759139
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3136	NC_003198	TGA	2	6	169280	169285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759139
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3138	NC_003198	GCG	2	6	169319	169324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759139
3139	NC_003198	TGA	2	6	169377	169382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759139
3140	NC_003198	CTG	2	6	169571	169576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759140
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3145	NC_003198	ATC	2	6	169839	169844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759140
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3152	NC_003198	GC	3	6	170146	170151	0 %	0 %	50 %	50 %	16759140
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3159	NC_003198	ACC	2	6	170763	170768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759140
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3229	NC_003198	AGT	2	6	174882	174887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759145
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3232	NC_003198	T	7	7	175049	175055	0 %	100 %	0 %	0 %	16759146
3233	NC_003198	CAG	2	6	175077	175082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759146
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3240	NC_003198	ATC	2	6	175525	175530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759146
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3243	NC_003198	CA	3	6	175687	175692	50 %	0 %	0 %	50 %	16759146
3244	NC_003198	TTC	2	6	175705	175710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759146
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3369	NC_003198	TGA	2	6	181761	181766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759149
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3473	NC_003198	CGTTT	2	10	186854	186863	0 %	60 %	20 %	20 %	16759153
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3478	NC_003198	ATG	2	6	187013	187018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759154
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3480	NC_003198	GCG	3	9	187038	187046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759154
3481	NC_003198	GCT	2	6	187177	187182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3482	NC_003198	GGCG	2	8	187207	187214	0 %	0 %	75 %	25 %	16759154
3483	NC_003198	TC	3	6	187218	187223	0 %	50 %	0 %	50 %	16759154
3484	NC_003198	TGT	2	6	187227	187232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759154
3485	NC_003198	TGC	2	6	187242	187247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
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3488	NC_003198	CTG	2	6	187304	187309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3489	NC_003198	CGC	2	6	187310	187315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759154
3490	NC_003198	CGA	2	6	187320	187325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3491	NC_003198	CTG	2	6	187326	187331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3492	NC_003198	ATT	2	6	187358	187363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759154
3493	NC_003198	CTG	2	6	187385	187390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3494	NC_003198	CTGT	2	8	187406	187413	0 %	50 %	25 %	25 %	16759154
3495	NC_003198	TGC	2	6	187515	187520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3496	NC_003198	CGC	2	6	187534	187539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759154
3497	NC_003198	TGG	2	6	187546	187551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759154
3498	NC_003198	TAT	2	6	187573	187578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759154
3499	NC_003198	TGC	2	6	187614	187619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759154
3500	NC_003198	ATT	2	6	187667	187672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759154

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