MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_003198	GCC	2	6	135252	135257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759109
2503	NC_003198	AGT	3	9	135289	135297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759109
2504	NC_003198	ACGA	2	8	135309	135316	50 %	0 %	25 %	25 %	16759109
2505	NC_003198	CG	3	6	136101	136106	0 %	0 %	50 %	50 %	16759110
2506	NC_003198	CAG	2	6	136306	136311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759110
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2509	NC_003198	CGT	2	6	136422	136427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759110
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2512	NC_003198	CGT	2	6	136496	136501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759110
2513	NC_003198	AAC	2	6	136608	136613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759110
2514	NC_003198	GTT	2	6	136619	136624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759110
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2521	NC_003198	ATG	2	6	137349	137354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759111
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2525	NC_003198	ATTG	2	8	137566	137573	25 %	50 %	25 %	0 %	16759111
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2544	NC_003198	GC	3	6	138319	138324	0 %	0 %	50 %	50 %	16759111
2545	NC_003198	GAAAGC	2	12	138350	138361	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	16759111
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2554	NC_003198	TCG	2	6	138873	138878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759111
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2557	NC_003198	TGC	2	6	139184	139189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759112
2558	NC_003198	ACGG	2	8	139262	139269	25 %	0 %	50 %	25 %	16759112
2559	NC_003198	ATT	2	6	139309	139314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759112
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2561	NC_003198	CGT	2	6	139428	139433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759112
2562	NC_003198	CG	3	6	139442	139447	0 %	0 %	50 %	50 %	16759112
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2571	NC_003198	CCGCA	2	10	140353	140362	20 %	0 %	20 %	60 %	16759113
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2580	NC_003198	CTG	2	6	141493	141498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759114
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2592	NC_003198	TCT	2	6	142133	142138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759115
2593	NC_003198	CG	3	6	142212	142217	0 %	0 %	50 %	50 %	16759115
2594	NC_003198	GCC	2	6	142226	142231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759115
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2598	NC_003198	TTG	2	6	142323	142328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759115
2599	NC_003198	GCG	3	9	142382	142390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759115
2600	NC_003198	GGA	2	6	142468	142473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759115
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2602	NC_003198	GGCG	2	8	142517	142524	0 %	0 %	75 %	25 %	16759115
2603	NC_003198	ATC	2	6	142532	142537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759115
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2605	NC_003198	A	6	6	142640	142645	100 %	0 %	0 %	0 %	16759115
2606	NC_003198	AGTTC	2	10	142724	142733	20 %	40 %	20 %	20 %	16759115
2607	NC_003198	AG	3	6	142744	142749	50 %	0 %	50 %	0 %	16759115
2608	NC_003198	CAG	2	6	142764	142769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759116
2609	NC_003198	TGCCT	2	10	142824	142833	0 %	40 %	20 %	40 %	16759116
2610	NC_003198	CAT	2	6	142893	142898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759116
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2612	NC_003198	GGT	2	6	142914	142919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759116
2613	NC_003198	ACG	2	6	142921	142926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759116
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2620	NC_003198	T	7	7	143246	143252	0 %	100 %	0 %	0 %	16759117
2621	NC_003198	CG	3	6	143260	143265	0 %	0 %	50 %	50 %	16759117
2622	NC_003198	ACCG	2	8	143362	143369	25 %	0 %	25 %	50 %	16759117
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2995	NC_003198	GC	4	8	161048	161055	0 %	0 %	50 %	50 %	16759131
2996	NC_003198	TCA	2	6	161104	161109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759131
2997	NC_003198	TTG	2	6	161110	161115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759131
2998	NC_003198	AAG	2	6	161185	161190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759131
2999	NC_003198	ACT	2	6	161242	161247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759131
3000	NC_003198	CGG	2	6	161284	161289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759131

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