MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003198	CG	3	6	56086	56091	0 %	0 %	50 %	50 %	16759040
1002	NC_003198	TGA	2	6	56170	56175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759040
1003	NC_003198	ACG	2	6	56232	56237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759040
1004	NC_003198	GTT	2	6	56239	56244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759040
1005	NC_003198	GAA	2	6	56261	56266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759040
1006	NC_003198	CAA	2	6	56314	56319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759040
1007	NC_003198	AAG	2	6	56411	56416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759040
1008	NC_003198	G	6	6	56485	56490	0 %	0 %	100 %	0 %	16759040
1009	NC_003198	TGA	3	9	56494	56502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759040
1010	NC_003198	GCT	2	6	56577	56582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759040
1011	NC_003198	CACTA	2	10	56585	56594	40 %	20 %	0 %	40 %	16759040
1012	NC_003198	AAC	2	6	56667	56672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759040
1013	NC_003198	TGA	2	6	56684	56689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759040
1014	NC_003198	GTA	2	6	56731	56736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759041
1015	NC_003198	GCA	2	6	56759	56764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759041
1016	NC_003198	TCC	2	6	56774	56779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759041
1017	NC_003198	TGA	2	6	56939	56944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759041
1018	NC_003198	ATT	2	6	56995	57000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759041
1019	NC_003198	GGC	2	6	57001	57006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759041
1020	NC_003198	GC	3	6	57005	57010	0 %	0 %	50 %	50 %	16759041
1021	NC_003198	TGC	2	6	57126	57131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759041
1022	NC_003198	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	16759042
1023	NC_003198	GAT	2	6	57398	57403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759042
1024	NC_003198	CGG	2	6	57411	57416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759042
1025	NC_003198	AGCC	2	8	57438	57445	25 %	0 %	25 %	50 %	16759042
1026	NC_003198	AGC	3	9	57486	57494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759042
1027	NC_003198	AAG	2	6	57507	57512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759042
1028	NC_003198	AAAG	2	8	57517	57524	75 %	0 %	25 %	0 %	16759042
1029	NC_003198	CGC	2	6	57544	57549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759042
1030	NC_003198	GGC	2	6	57604	57609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759042
1031	NC_003198	ATGG	2	8	57650	57657	25 %	25 %	50 %	0 %	16759042
1032	NC_003198	TTG	2	6	57854	57859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759043
1033	NC_003198	GC	3	6	57881	57886	0 %	0 %	50 %	50 %	16759043
1034	NC_003198	TCT	2	6	58001	58006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759043
1035	NC_003198	GC	4	8	58111	58118	0 %	0 %	50 %	50 %	16759043
1036	NC_003198	GAA	2	6	58132	58137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759043
1037	NC_003198	G	6	6	58207	58212	0 %	0 %	100 %	0 %	16759043
1038	NC_003198	TGG	2	6	58220	58225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759043
1039	NC_003198	TGAT	2	8	58322	58329	25 %	50 %	25 %	0 %	16759043
1040	NC_003198	TCG	2	6	58355	58360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759043
1041	NC_003198	ACT	2	6	58390	58395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759043
1042	NC_003198	GCTG	2	8	58419	58426	0 %	25 %	50 %	25 %	16759043
1043	NC_003198	TGG	2	6	58445	58450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759043
1044	NC_003198	TCTAAC	2	12	58468	58479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759043
1045	NC_003198	GAA	2	6	58508	58513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759043
1046	NC_003198	CGA	2	6	58527	58532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759043
1047	NC_003198	GCG	2	6	58534	58539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759043
1048	NC_003198	AGG	2	6	58547	58552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759043
1049	NC_003198	CGC	2	6	58566	58571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759043
1050	NC_003198	GGC	3	9	58648	58656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759043
1051	NC_003198	GAA	2	6	58681	58686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759043
1052	NC_003198	AAAAT	2	10	58949	58958	80 %	20 %	0 %	0 %	16759044
1053	NC_003198	TGGA	2	8	58991	58998	25 %	25 %	50 %	0 %	16759044
1054	NC_003198	GAA	2	6	59195	59200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759044
1055	NC_003198	CAG	2	6	59242	59247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759044
1056	NC_003198	A	6	6	59279	59284	100 %	0 %	0 %	0 %	16759044
1057	NC_003198	CACGAA	2	12	59347	59358	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	16759044
1058	NC_003198	GATT	2	8	59389	59396	25 %	50 %	25 %	0 %	16759044
1059	NC_003198	G	6	6	59505	59510	0 %	0 %	100 %	0 %	16759044
1060	NC_003198	AGC	2	6	59607	59612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759044
1061	NC_003198	GCG	2	6	59697	59702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759044
1062	NC_003198	TGC	2	6	59705	59710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759044
1063	NC_003198	GGAAA	2	10	59736	59745	60 %	0 %	40 %	0 %	16759044
1064	NC_003198	GATC	2	8	59758	59765	25 %	25 %	25 %	25 %	16759044
1065	NC_003198	TAT	2	6	59848	59853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759044
1066	NC_003198	CGC	2	6	59886	59891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759044
1067	NC_003198	ATT	2	6	60179	60184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759045
1068	NC_003198	TGA	2	6	60205	60210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759045
1069	NC_003198	CGCTG	2	10	60226	60235	0 %	20 %	40 %	40 %	16759045
1070	NC_003198	C	6	6	60240	60245	0 %	0 %	0 %	100 %	16759045
1071	NC_003198	TAA	2	6	60261	60266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759045
1072	NC_003198	A	6	6	60294	60299	100 %	0 %	0 %	0 %	16759045
1073	NC_003198	CGC	2	6	60369	60374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759045
1074	NC_003198	TGC	2	6	60375	60380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759045
1075	NC_003198	TGA	2	6	60498	60503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759045
1076	NC_003198	TGG	2	6	60525	60530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759045
1077	NC_003198	TG	3	6	60720	60725	0 %	50 %	50 %	0 %	16759045
1078	NC_003198	CTGC	2	8	60776	60783	0 %	25 %	25 %	50 %	16759045
1079	NC_003198	GTA	2	6	60837	60842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759045
1080	NC_003198	CTGG	2	8	60883	60890	0 %	25 %	50 %	25 %	16759045
1081	NC_003198	ACG	2	6	60962	60967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759045
1082	NC_003198	TGGCGC	2	12	61014	61025	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16759045
1083	NC_003198	GTGG	2	8	61048	61055	0 %	25 %	75 %	0 %	16759045
1084	NC_003198	TC	3	6	61124	61129	0 %	50 %	0 %	50 %	16759046
1085	NC_003198	CTG	2	6	61218	61223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759046
1086	NC_003198	CTG	2	6	61246	61251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759046
1087	NC_003198	CTGC	2	8	61258	61265	0 %	25 %	25 %	50 %	16759046
1088	NC_003198	TCA	2	6	61305	61310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759046
1089	NC_003198	TGC	2	6	61446	61451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759046
1090	NC_003198	CGG	2	6	61534	61539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759046
1091	NC_003198	AAT	2	6	61547	61552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759046
1092	NC_003198	A	6	6	61614	61619	100 %	0 %	0 %	0 %	16759046
1093	NC_003198	CTT	2	6	61661	61666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759046
1094	NC_003198	CGA	2	6	61693	61698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759046
1095	NC_003198	CCA	2	6	61729	61734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759046
1096	NC_003198	TTC	2	6	61794	61799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759047
1097	NC_003198	ATT	2	6	61842	61847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759047
1098	NC_003198	CGA	2	6	61853	61858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759047
1099	NC_003198	ACCA	2	8	61894	61901	50 %	0 %	0 %	50 %	16759047
1100	NC_003198	GTT	2	6	61923	61928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759047
1101	NC_003198	GTGG	2	8	61929	61936	0 %	25 %	75 %	0 %	16759047
1102	NC_003198	AAT	2	6	62004	62009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759047
1103	NC_003198	CAA	2	6	62105	62110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759047
1104	NC_003198	CATT	2	8	62119	62126	25 %	50 %	0 %	25 %	16759047
1105	NC_003198	CAA	2	6	62153	62158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759047
1106	NC_003198	ATA	2	6	62205	62210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759047
1107	NC_003198	GGT	3	9	62234	62242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759047
1108	NC_003198	TGG	2	6	62278	62283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759047
1109	NC_003198	CTG	3	9	62292	62300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759047
1110	NC_003198	CAGCGC	2	12	62304	62315	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16759047
1111	NC_003198	CAG	2	6	62337	62342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759047
1112	NC_003198	TGG	2	6	62351	62356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759047
1113	NC_003198	TGC	2	6	62377	62382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759047
1114	NC_003198	GC	3	6	62386	62391	0 %	0 %	50 %	50 %	16759047
1115	NC_003198	TTG	2	6	62452	62457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759047
1116	NC_003198	TAA	2	6	62465	62470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759047
1117	NC_003198	AAT	2	6	62493	62498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759047
1118	NC_003198	T	6	6	62553	62558	0 %	100 %	0 %	0 %	16759047
1119	NC_003198	T	7	7	62560	62566	0 %	100 %	0 %	0 %	16759047
1120	NC_003198	GCG	2	6	62567	62572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759047
1121	NC_003198	AAG	2	6	62581	62586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759047
1122	NC_003198	TGG	2	6	62605	62610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759047
1123	NC_003198	GCG	2	6	62658	62663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759047
1124	NC_003198	GCT	2	6	62768	62773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759047
1125	NC_003198	GCG	2	6	62817	62822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759047
1126	NC_003198	ACA	2	6	62831	62836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759047
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1128	NC_003198	CGC	2	6	63050	63055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759047
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