MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003198	AT	3	6	25384	25389	50 %	50 %	0 %	0 %	16759016
502	NC_003198	TAT	2	6	25394	25399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759016
503	NC_003198	ACCG	2	8	25418	25425	25 %	0 %	25 %	50 %	16759016
504	NC_003198	TTTA	2	8	25441	25448	25 %	75 %	0 %	0 %	16759016
505	NC_003198	TAC	2	6	25635	25640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759016
506	NC_003198	A	6	6	25671	25676	100 %	0 %	0 %	0 %	16759016
507	NC_003198	CCG	2	6	25695	25700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759016
508	NC_003198	ACG	2	6	25770	25775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759016
509	NC_003198	ATG	2	6	25799	25804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759016
510	NC_003198	CTG	2	6	28453	28458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759017
511	NC_003198	GT	3	6	28495	28500	0 %	50 %	50 %	0 %	16759017
512	NC_003198	ATTA	2	8	28528	28535	50 %	50 %	0 %	0 %	16759017
513	NC_003198	A	6	6	28595	28600	100 %	0 %	0 %	0 %	16759017
514	NC_003198	GT	3	6	28624	28629	0 %	50 %	50 %	0 %	16759017
515	NC_003198	CCG	2	6	28631	28636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759017
516	NC_003198	TTC	2	6	28764	28769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759017
517	NC_003198	GGCG	2	8	28770	28777	0 %	0 %	75 %	25 %	16759017
518	NC_003198	ATG	2	6	28814	28819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759017
519	NC_003198	TCG	2	6	28895	28900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759017
520	NC_003198	CCG	2	6	28949	28954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759017
521	NC_003198	A	6	6	29122	29127	100 %	0 %	0 %	0 %	16759017
522	NC_003198	ATG	2	6	29288	29293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759017
523	NC_003198	ACA	2	6	29368	29373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759017
524	NC_003198	GAC	2	6	29506	29511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759018
525	NC_003198	AAC	2	6	29634	29639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759018
526	NC_003198	ATG	2	6	29816	29821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759018
527	NC_003198	AAT	2	6	29842	29847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759018
528	NC_003198	CGG	2	6	29948	29953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759018
529	NC_003198	ATGA	2	8	29975	29982	50 %	25 %	25 %	0 %	16759018
530	NC_003198	TGC	2	6	30029	30034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759019
531	NC_003198	GGC	2	6	30036	30041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759019
532	NC_003198	CT	3	6	30109	30114	0 %	50 %	0 %	50 %	16759019
533	NC_003198	CG	3	6	30172	30177	0 %	0 %	50 %	50 %	16759019
534	NC_003198	GCG	2	6	30239	30244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759019
535	NC_003198	CG	3	6	30435	30440	0 %	0 %	50 %	50 %	16759019
536	NC_003198	GGC	2	6	30454	30459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759019
537	NC_003198	AT	3	6	30536	30541	50 %	50 %	0 %	0 %	16759020
538	NC_003198	TGCT	2	8	30545	30552	0 %	50 %	25 %	25 %	16759020
539	NC_003198	TATC	2	8	30601	30608	25 %	50 %	0 %	25 %	16759020
540	NC_003198	GTAA	2	8	30638	30645	50 %	25 %	25 %	0 %	16759020
541	NC_003198	TGG	2	6	30688	30693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759020
542	NC_003198	CGC	2	6	30744	30749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759020
543	NC_003198	ATT	2	6	30751	30756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759020
544	NC_003198	GC	3	6	30767	30772	0 %	0 %	50 %	50 %	16759020
545	NC_003198	GGT	2	6	30790	30795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759020
546	NC_003198	CGG	2	6	30802	30807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759020
547	NC_003198	CCG	2	6	30816	30821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759020
548	NC_003198	CGC	2	6	30850	30855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759020
549	NC_003198	TTCG	2	8	30900	30907	0 %	50 %	25 %	25 %	16759020
550	NC_003198	GCA	2	6	30952	30957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759020
551	NC_003198	ATCTG	2	10	30969	30978	20 %	40 %	20 %	20 %	16759020
552	NC_003198	TTACG	2	10	31024	31033	20 %	40 %	20 %	20 %	16759020
553	NC_003198	TTA	2	6	31040	31045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759020
554	NC_003198	GC	3	6	31057	31062	0 %	0 %	50 %	50 %	16759020
555	NC_003198	TAT	2	6	31274	31279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759021
556	NC_003198	TAT	2	6	31281	31286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759021
557	NC_003198	CGC	2	6	31355	31360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759021
558	NC_003198	CGG	2	6	31393	31398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759021
559	NC_003198	GTCA	2	8	31410	31417	25 %	25 %	25 %	25 %	16759021
560	NC_003198	GGT	2	6	31436	31441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759021
561	NC_003198	CGC	2	6	31478	31483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759021
562	NC_003198	CAG	2	6	31506	31511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759021
563	NC_003198	CAA	2	6	31518	31523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759021
564	NC_003198	AGC	2	6	31572	31577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759021
565	NC_003198	GCG	2	6	31608	31613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759021
566	NC_003198	GTG	2	6	31643	31648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759021
567	NC_003198	T	6	6	31726	31731	0 %	100 %	0 %	0 %	16759021
568	NC_003198	GGC	2	6	31757	31762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759021
569	NC_003198	GGGCG	2	10	31793	31802	0 %	0 %	80 %	20 %	16759021
570	NC_003198	GCC	2	6	31914	31919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759021
571	NC_003198	AAG	2	6	31924	31929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759021
572	NC_003198	AGC	2	6	31935	31940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759021
573	NC_003198	ATG	2	6	31951	31956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759021
574	NC_003198	CTC	2	6	31959	31964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759021
575	NC_003198	GCA	2	6	31982	31987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759021
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577	NC_003198	TGCGT	2	10	32172	32181	0 %	40 %	40 %	20 %	16759022
578	NC_003198	ACCG	2	8	32230	32237	25 %	0 %	25 %	50 %	16759022
579	NC_003198	GTT	2	6	32261	32266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759022
580	NC_003198	AGGC	2	8	32268	32275	25 %	0 %	50 %	25 %	16759022
581	NC_003198	TAA	2	6	32314	32319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759022
582	NC_003198	TAT	2	6	32338	32343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759022
583	NC_003198	ATT	2	6	32397	32402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759022
584	NC_003198	AAAAG	2	10	32566	32575	80 %	0 %	20 %	0 %	16759023
585	NC_003198	A	7	7	32586	32592	100 %	0 %	0 %	0 %	16759023
586	NC_003198	TTA	2	6	32619	32624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759023
587	NC_003198	CAG	2	6	32665	32670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759023
588	NC_003198	CCTG	2	8	32704	32711	0 %	25 %	25 %	50 %	16759023
589	NC_003198	TGT	2	6	32745	32750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759023
590	NC_003198	TCG	2	6	32756	32761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759023
591	NC_003198	CAG	2	6	32762	32767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759023
592	NC_003198	AAG	2	6	32771	32776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759023
593	NC_003198	ATC	2	6	32835	32840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759023
594	NC_003198	CGCA	2	8	32894	32901	25 %	0 %	25 %	50 %	16759023
595	NC_003198	T	6	6	32921	32926	0 %	100 %	0 %	0 %	16759023
596	NC_003198	ATT	2	6	32940	32945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759023
597	NC_003198	TAAA	2	8	32964	32971	75 %	25 %	0 %	0 %	16759023
598	NC_003198	TTA	2	6	32976	32981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759023
599	NC_003198	A	6	6	33379	33384	100 %	0 %	0 %	0 %	16759024
600	NC_003198	A	7	7	33389	33395	100 %	0 %	0 %	0 %	16759024
601	NC_003198	TTA	2	6	33429	33434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759024
602	NC_003198	GCG	2	6	33482	33487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759024
603	NC_003198	TC	3	6	33489	33494	0 %	50 %	0 %	50 %	16759024
604	NC_003198	CTT	2	6	33500	33505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759024
605	NC_003198	TTAT	2	8	33533	33540	25 %	75 %	0 %	0 %	16759024
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607	NC_003198	AT	3	6	33739	33744	50 %	50 %	0 %	0 %	16759024
608	NC_003198	A	7	7	33764	33770	100 %	0 %	0 %	0 %	16759024
609	NC_003198	ATC	2	6	33818	33823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759024
610	NC_003198	GAT	2	6	33850	33855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759024
611	NC_003198	TGTTTG	2	12	33889	33900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759024
612	NC_003198	A	6	6	33906	33911	100 %	0 %	0 %	0 %	16759024
613	NC_003198	TTGG	2	8	33917	33924	0 %	50 %	50 %	0 %	16759024
614	NC_003198	A	6	6	33930	33935	100 %	0 %	0 %	0 %	16759024
615	NC_003198	TA	3	6	33942	33947	50 %	50 %	0 %	0 %	16759024
616	NC_003198	TGC	2	6	33955	33960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759024
617	NC_003198	TCT	2	6	33992	33997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759024
618	NC_003198	TTA	2	6	34063	34068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759024
619	NC_003198	GTT	2	6	34097	34102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759024
620	NC_003198	A	6	6	34104	34109	100 %	0 %	0 %	0 %	16759024
621	NC_003198	GCG	2	6	34162	34167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759024
622	NC_003198	TATAA	2	10	34169	34178	60 %	40 %	0 %	0 %	16759024
623	NC_003198	TAC	2	6	34182	34187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759024
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625	NC_003198	AAT	2	6	34201	34206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759024
626	NC_003198	A	6	6	34268	34273	100 %	0 %	0 %	0 %	16759024
627	NC_003198	CTTT	2	8	34297	34304	0 %	75 %	0 %	25 %	16759024
628	NC_003198	GAAG	2	8	34337	34344	50 %	0 %	50 %	0 %	16759024
629	NC_003198	A	6	6	34541	34546	100 %	0 %	0 %	0 %	16759025
630	NC_003198	CGC	2	6	34575	34580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759025
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632	NC_003198	C	6	6	34633	34638	0 %	0 %	0 %	100 %	16759025
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