MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_003198	TCTT	2	8	299197	299204	0 %	75 %	0 %	25 %	16759247
5502	NC_003198	GTT	2	6	299234	299239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759247
5503	NC_003198	ATTA	2	8	299265	299272	50 %	50 %	0 %	0 %	16759247
5504	NC_003198	A	7	7	299293	299299	100 %	0 %	0 %	0 %	16759247
5505	NC_003198	T	7	7	299346	299352	0 %	100 %	0 %	0 %	16759247
5506	NC_003198	ATA	2	6	299376	299381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759247
5507	NC_003198	GT	3	6	299465	299470	0 %	50 %	50 %	0 %	16759247
5508	NC_003198	AG	3	6	299479	299484	50 %	0 %	50 %	0 %	16759247
5509	NC_003198	GCC	2	6	299544	299549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759247
5510	NC_003198	CGC	2	6	299564	299569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759247
5511	NC_003198	ATCGCC	2	12	299664	299675	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16759247
5512	NC_003198	CCG	2	6	299708	299713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759247
5513	NC_003198	GCA	2	6	299821	299826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759247
5514	NC_003198	CAA	2	6	299861	299866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759247
5515	NC_003198	CA	3	6	299868	299873	50 %	0 %	0 %	50 %	16759247
5516	NC_003198	TCA	2	6	299881	299886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759247
5517	NC_003198	AT	3	6	299941	299946	50 %	50 %	0 %	0 %	16759247
5518	NC_003198	CT	3	6	299992	299997	0 %	50 %	0 %	50 %	16759248
5519	NC_003198	TAC	2	6	300046	300051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759248
5520	NC_003198	CAG	2	6	300067	300072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759248
5521	NC_003198	CTG	2	6	300259	300264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759248
5522	NC_003198	GTG	2	6	300279	300284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759248
5523	NC_003198	ATTG	2	8	300324	300331	25 %	50 %	25 %	0 %	16759248
5524	NC_003198	TCA	2	6	300347	300352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759248
5525	NC_003198	ACTGG	2	10	300453	300462	20 %	20 %	40 %	20 %	16759248
5526	NC_003198	AGGG	2	8	300527	300534	25 %	0 %	75 %	0 %	16759248
5527	NC_003198	CGCTTA	2	12	300605	300616	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16759248
5528	NC_003198	ATA	2	6	300629	300634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759248
5529	NC_003198	GC	4	8	300748	300755	0 %	0 %	50 %	50 %	16759249
5530	NC_003198	TCA	2	6	300760	300765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759249
5531	NC_003198	ACCCAT	2	12	300802	300813	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	16759249
5532	NC_003198	GCA	2	6	300835	300840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759249
5533	NC_003198	T	6	6	300865	300870	0 %	100 %	0 %	0 %	16759249
5534	NC_003198	TTC	2	6	300904	300909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759249
5535	NC_003198	CGA	2	6	301001	301006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759249
5536	NC_003198	CGC	2	6	301008	301013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759249
5537	NC_003198	TGG	2	6	301034	301039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759249
5538	NC_003198	T	6	6	301064	301069	0 %	100 %	0 %	0 %	16759249
5539	NC_003198	ACC	2	6	301101	301106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759249
5540	NC_003198	ACC	2	6	301269	301274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759250
5541	NC_003198	GC	3	6	301291	301296	0 %	0 %	50 %	50 %	16759250
5542	NC_003198	ATT	2	6	301314	301319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759250
5543	NC_003198	CGT	2	6	301347	301352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759250
5544	NC_003198	CAA	2	6	301361	301366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759250
5545	NC_003198	TGG	2	6	301396	301401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759250
5546	NC_003198	CTG	2	6	301443	301448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759250
5547	NC_003198	CGCGG	2	10	301497	301506	0 %	0 %	60 %	40 %	16759250
5548	NC_003198	GATA	2	8	301685	301692	50 %	25 %	25 %	0 %	16759250
5549	NC_003198	GA	3	6	301798	301803	50 %	0 %	50 %	0 %	16759250
5550	NC_003198	GCA	2	6	301811	301816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759250
5551	NC_003198	GCCAG	2	10	301846	301855	20 %	0 %	40 %	40 %	16759250
5552	NC_003198	GCTG	2	8	301889	301896	0 %	25 %	50 %	25 %	16759250
5553	NC_003198	CAT	2	6	302483	302488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759251
5554	NC_003198	CCA	2	6	302559	302564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759251
5555	NC_003198	GCT	2	6	302599	302604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759251
5556	NC_003198	CGA	2	6	302627	302632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759251
5557	NC_003198	CAT	2	6	302655	302660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759251
5558	NC_003198	TG	3	6	302691	302696	0 %	50 %	50 %	0 %	16759251
5559	NC_003198	GATA	2	8	302698	302705	50 %	25 %	25 %	0 %	16759251
5560	NC_003198	GGC	2	6	302726	302731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759251
5561	NC_003198	GCTGGC	3	18	302783	302800	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16759251
5562	NC_003198	GCA	2	6	302841	302846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759251
5563	NC_003198	AAC	2	6	302852	302857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759251
5564	NC_003198	CGC	2	6	302950	302955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759251
5565	NC_003198	CGGA	2	8	302999	303006	25 %	0 %	50 %	25 %	16759251
5566	NC_003198	CG	3	6	303046	303051	0 %	0 %	50 %	50 %	16759251
5567	NC_003198	TGCAGG	2	12	303068	303079	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16759251
5568	NC_003198	GC	3	6	303138	303143	0 %	0 %	50 %	50 %	16759252
5569	NC_003198	GC	3	6	303159	303164	0 %	0 %	50 %	50 %	16759252
5570	NC_003198	AGC	2	6	303211	303216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759252
5571	NC_003198	TGGA	2	8	303219	303226	25 %	25 %	50 %	0 %	16759252
5572	NC_003198	TG	3	6	303262	303267	0 %	50 %	50 %	0 %	16759252
5573	NC_003198	CTG	2	6	303297	303302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759252
5574	NC_003198	GCA	3	9	303314	303322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759252
5575	NC_003198	GC	3	6	303363	303368	0 %	0 %	50 %	50 %	16759252
5576	NC_003198	G	6	6	303440	303445	0 %	0 %	100 %	0 %	16759252
5577	NC_003198	CAG	3	9	303459	303467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759252
5578	NC_003198	GTT	2	6	303503	303508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759252
5579	NC_003198	CATG	2	8	303606	303613	25 %	25 %	25 %	25 %	16759253
5580	NC_003198	GC	3	6	303648	303653	0 %	0 %	50 %	50 %	16759253
5581	NC_003198	TTG	2	6	303761	303766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759253
5582	NC_003198	CCG	2	6	303767	303772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759253
5583	NC_003198	TCC	2	6	303791	303796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16759253
5584	NC_003198	GGC	2	6	303991	303996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759253
5585	NC_003198	GCC	2	6	304040	304045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759253
5586	NC_003198	CCA	2	6	304154	304159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759253
5587	NC_003198	TGCC	2	8	304180	304187	0 %	25 %	25 %	50 %	16759253
5588	NC_003198	CAGC	2	8	304198	304205	25 %	0 %	25 %	50 %	16759253
5589	NC_003198	GAC	2	6	304248	304253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759253
5590	NC_003198	GTG	2	6	304380	304385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759253
5591	NC_003198	TCG	2	6	304395	304400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759253
5592	NC_003198	CTGC	2	8	304445	304452	0 %	25 %	25 %	50 %	16759253
5593	NC_003198	CTT	2	6	304706	304711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759254
5594	NC_003198	GGC	2	6	304772	304777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
5595	NC_003198	GGT	2	6	304788	304793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759254
5596	NC_003198	CAG	2	6	304860	304865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759254
5597	NC_003198	GCC	2	6	304881	304886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759254
5598	NC_003198	GCC	2	6	304943	304948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759254
5599	NC_003198	CAGC	2	8	304964	304971	25 %	0 %	25 %	50 %	16759254
5600	NC_003198	GGC	2	6	304972	304977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
5601	NC_003198	GCG	2	6	304979	304984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
5602	NC_003198	GCG	2	6	304988	304993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
5603	NC_003198	CGCC	2	8	305009	305016	0 %	0 %	25 %	75 %	16759254
5604	NC_003198	CGC	2	6	305025	305030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759254
5605	NC_003198	ATC	2	6	305043	305048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759254
5606	NC_003198	GGCAG	2	10	305069	305078	20 %	0 %	60 %	20 %	16759254
5607	NC_003198	GCG	2	6	305202	305207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
5608	NC_003198	ACG	2	6	305235	305240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759254
5609	NC_003198	ATT	2	6	305274	305279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759254
5610	NC_003198	ATC	2	6	305305	305310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759254
5611	NC_003198	CCA	3	9	305387	305395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759254
5612	NC_003198	GTG	3	9	305434	305442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759254
5613	NC_003198	GCG	2	6	305488	305493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
5614	NC_003198	TGA	2	6	305500	305505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759254
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5619	NC_003198	CCCTG	2	10	305686	305695	0 %	20 %	20 %	60 %	16759254
5620	NC_003198	AGC	2	6	305797	305802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759254
5621	NC_003198	TTC	2	6	305826	305831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759254
5622	NC_003198	GGC	2	6	305938	305943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
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5624	NC_003198	CGG	2	6	305970	305975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759254
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