MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

< Previous12...678910111213141516...168169Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003198	CAC	2	6	266353	266358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759220
5002	NC_003198	ACT	2	6	266470	266475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759221
5003	NC_003198	GGC	2	6	266519	266524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759221
5004	NC_003198	TCG	2	6	266623	266628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759221
5005	NC_003198	CTG	2	6	266655	266660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759221
5006	NC_003198	GGC	2	6	266690	266695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759221
5007	NC_003198	AAT	2	6	266697	266702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759221
5008	NC_003198	CTGG	2	8	266786	266793	0 %	25 %	50 %	25 %	16759221
5009	NC_003198	AAG	2	6	266803	266808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759221
5010	NC_003198	CGG	2	6	266825	266830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759221
5011	NC_003198	TGG	2	6	266878	266883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759221
5012	NC_003198	TGC	2	6	266978	266983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759221
5013	NC_003198	GCTG	2	8	266990	266997	0 %	25 %	50 %	25 %	16759221
5014	NC_003198	GAT	2	6	267051	267056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759221
5015	NC_003198	ACG	2	6	267088	267093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759221
5016	NC_003198	CGA	2	6	267104	267109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759221
5017	NC_003198	ATT	2	6	267127	267132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759221
5018	NC_003198	GCA	2	6	267137	267142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759221
5019	NC_003198	GAA	3	9	267156	267164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759221
5020	NC_003198	ACC	2	6	267288	267293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759221
5021	NC_003198	A	6	6	267309	267314	100 %	0 %	0 %	0 %	16759221
5022	NC_003198	GAA	2	6	267360	267365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759221
5023	NC_003198	TGG	2	6	267535	267540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759221
5024	NC_003198	CTG	2	6	267585	267590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759221
5025	NC_003198	GGC	2	6	267737	267742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759221
5026	NC_003198	GCC	2	6	267818	267823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759221
5027	NC_003198	GGC	2	6	267966	267971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759221
5028	NC_003198	ATC	2	6	268119	268124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759221
5029	NC_003198	GAT	2	6	268139	268144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759221
5030	NC_003198	CAA	2	6	268145	268150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759221
5031	NC_003198	GCG	2	6	268151	268156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759221
5032	NC_003198	GAA	2	6	268160	268165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759221
5033	NC_003198	CGC	2	6	268187	268192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759221
5034	NC_003198	A	7	7	268209	268215	100 %	0 %	0 %	0 %	16759221
5035	NC_003198	TGC	2	6	268225	268230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759221
5036	NC_003198	CGG	2	6	268246	268251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759221
5037	NC_003198	CG	3	6	268267	268272	0 %	0 %	50 %	50 %	16759221
5038	NC_003198	TGG	2	6	268330	268335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759221
5039	NC_003198	ATCG	2	8	268383	268390	25 %	25 %	25 %	25 %	16759221
5040	NC_003198	GAA	2	6	268404	268409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759221
5041	NC_003198	CT	3	6	268410	268415	0 %	50 %	0 %	50 %	16759221
5042	NC_003198	GCA	2	6	268433	268438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759221
5043	NC_003198	CAT	2	6	268475	268480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759221
5044	NC_003198	TGC	2	6	268549	268554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759221
5045	NC_003198	GGA	2	6	268580	268585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759221
5046	NC_003198	TGG	2	6	268669	268674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759221
5047	NC_003198	CCG	2	6	268711	268716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759221
5048	NC_003198	GGC	2	6	268778	268783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759221
5049	NC_003198	TGA	2	6	268786	268791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759221
5050	NC_003198	ACA	2	6	268804	268809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759221
5051	NC_003198	GTC	2	6	268818	268823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759221
5052	NC_003198	GCC	2	6	268865	268870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759221
5053	NC_003198	ATG	2	6	268906	268911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759221
5054	NC_003198	ATC	2	6	268974	268979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759221
5055	NC_003198	CG	3	6	268982	268987	0 %	0 %	50 %	50 %	16759221
5056	NC_003198	GGC	2	6	268995	269000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759221
5057	NC_003198	GC	3	6	269026	269031	0 %	0 %	50 %	50 %	16759221
5058	NC_003198	CCG	2	6	269054	269059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759221
5059	NC_003198	CCGCG	2	10	269111	269120	0 %	0 %	40 %	60 %	16759221
5060	NC_003198	TGA	2	6	269122	269127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759221
5061	NC_003198	GCC	2	6	269151	269156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759221
5062	NC_003198	GGT	2	6	269270	269275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759221
5063	NC_003198	ATCA	2	8	269325	269332	50 %	25 %	0 %	25 %	16759221
5064	NC_003198	CGG	2	6	269360	269365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759221
5065	NC_003198	CAC	2	6	269408	269413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759221
5066	NC_003198	CAG	2	6	269544	269549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759221
5067	NC_003198	TGA	2	6	269597	269602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759221
5068	NC_003198	G	6	6	269610	269615	0 %	0 %	100 %	0 %	16759221
5069	NC_003198	CCGC	2	8	269626	269633	0 %	0 %	25 %	75 %	16759221
5070	NC_003198	TGA	2	6	269708	269713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759221
5071	NC_003198	CTA	2	6	269780	269785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759221
5072	NC_003198	TGCGCG	2	12	269798	269809	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	16759221
5073	NC_003198	TC	3	6	269836	269841	0 %	50 %	0 %	50 %	16759221
5074	NC_003198	GCC	2	6	270001	270006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759222
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5077	NC_003198	GC	3	6	270123	270128	0 %	0 %	50 %	50 %	16759222
5078	NC_003198	TGA	2	6	270173	270178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759222
5079	NC_003198	TGA	2	6	270182	270187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759222
5080	NC_003198	GGCG	2	8	270191	270198	0 %	0 %	75 %	25 %	16759222
5081	NC_003198	TGA	2	6	270212	270217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759222
5082	NC_003198	TCG	2	6	270226	270231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759222
5083	NC_003198	CG	3	6	270239	270244	0 %	0 %	50 %	50 %	16759222
5084	NC_003198	TGA	2	6	270262	270267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759222
5085	NC_003198	TCA	2	6	270275	270280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759222
5086	NC_003198	A	6	6	270301	270306	100 %	0 %	0 %	0 %	16759222
5087	NC_003198	TCG	2	6	270308	270313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759222
5088	NC_003198	GGC	2	6	270531	270536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759222
5089	NC_003198	CGG	2	6	270539	270544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759222
5090	NC_003198	TGC	2	6	270580	270585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759222
5091	NC_003198	GCT	2	6	270663	270668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759222
5092	NC_003198	CAT	2	6	270680	270685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759222
5093	NC_003198	CGC	2	6	270688	270693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759222
5094	NC_003198	CAT	2	6	270722	270727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759222
5095	NC_003198	GCG	2	6	270742	270747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759222
5096	NC_003198	GGC	2	6	270770	270775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759222
5097	NC_003198	GCT	2	6	270791	270796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759222
5098	NC_003198	GAT	2	6	270831	270836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759222
5099	NC_003198	A	6	6	270839	270844	100 %	0 %	0 %	0 %	16759222
5100	NC_003198	CGT	2	6	270846	270851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759222
5101	NC_003198	TGA	2	6	270862	270867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759222
5102	NC_003198	GA	3	6	271167	271172	50 %	0 %	50 %	0 %	16759223
5103	NC_003198	GCA	2	6	271188	271193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759223
5104	NC_003198	TG	3	6	271206	271211	0 %	50 %	50 %	0 %	16759223
5105	NC_003198	TGT	2	6	271244	271249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759223
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5107	NC_003198	GT	3	6	271293	271298	0 %	50 %	50 %	0 %	16759223
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5109	NC_003198	GTAA	2	8	271527	271534	50 %	25 %	25 %	0 %	16759223
5110	NC_003198	A	6	6	271784	271789	100 %	0 %	0 %	0 %	16759224
5111	NC_003198	GCCGC	2	10	271846	271855	0 %	0 %	40 %	60 %	16759224
5112	NC_003198	AGT	2	6	271864	271869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759224
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5115	NC_003198	GC	4	8	272079	272086	0 %	0 %	50 %	50 %	16759224
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5118	NC_003198	GGC	2	6	272314	272319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759224
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5121	NC_003198	TCT	3	9	272540	272548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759224
5122	NC_003198	GCC	2	6	272562	272567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759224
5123	NC_003198	ATC	2	6	272665	272670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759224
5124	NC_003198	GGC	2	6	272674	272679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759224
5125	NC_003198	GCG	3	9	272687	272695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759224
5126	NC_003198	CTA	2	6	272730	272735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759224
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5134	NC_003198	GCCGG	2	10	273076	273085	0 %	0 %	60 %	40 %	16759224
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5153	NC_003198	T	6	6	274120	274125	0 %	100 %	0 %	0 %	16759225
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5246	NC_003198	GCG	2	6	279415	279420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759232
5247	NC_003198	TGC	2	6	279421	279426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759232
5248	NC_003198	TGA	2	6	279487	279492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759232
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5251	NC_003198	TAT	2	6	279603	279608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759232
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5253	NC_003198	GTAT	3	12	279730	279741	25 %	50 %	25 %	0 %	16759232
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5351	NC_003198	AG	3	6	285158	285163	50 %	0 %	50 %	0 %	16759238
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5356	NC_003198	CCGC	2	8	285436	285443	0 %	0 %	25 %	75 %	16759239
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5366	NC_003198	GC	3	6	285842	285847	0 %	0 %	50 %	50 %	16759239
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5368	NC_003198	CG	3	6	285891	285896	0 %	0 %	50 %	50 %	16759239
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5493	NC_003198	CG	3	6	298619	298624	0 %	0 %	50 %	50 %	16759246
5494	NC_003198	GTA	3	9	298743	298751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759246
5495	NC_003198	TTCTGT	2	12	298859	298870	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	16759246
5496	NC_003198	TCG	2	6	298910	298915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759246
5497	NC_003198	CGT	2	6	298959	298964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759246
5498	NC_003198	CCAT	2	8	298965	298972	25 %	25 %	0 %	50 %	16759246
5499	NC_003198	GTGC	2	8	299028	299035	0 %	25 %	50 %	25 %	16759246
5500	NC_003198	TG	4	8	299115	299122	0 %	50 %	50 %	0 %	16759246

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