MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. CT18

Total Repeats: 84125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_003198	ATTC	2	8	238868	238875	25 %	50 %	0 %	25 %	16759197
4502	NC_003198	T	6	6	238900	238905	0 %	100 %	0 %	0 %	16759197
4503	NC_003198	CGGG	2	8	238912	238919	0 %	0 %	75 %	25 %	16759197
4504	NC_003198	GCT	2	6	238931	238936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759197
4505	NC_003198	CGG	2	6	238957	238962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759197
4506	NC_003198	AAGC	2	8	238966	238973	50 %	0 %	25 %	25 %	16759197
4507	NC_003198	GA	3	6	238987	238992	50 %	0 %	50 %	0 %	16759197
4508	NC_003198	CG	3	6	239002	239007	0 %	0 %	50 %	50 %	16759197
4509	NC_003198	AGC	2	6	239037	239042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759197
4510	NC_003198	CGC	2	6	239124	239129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759198
4511	NC_003198	ACC	2	6	239194	239199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759198
4512	NC_003198	TAA	2	6	239312	239317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759198
4513	NC_003198	CGC	2	6	239324	239329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759198
4514	NC_003198	CGG	2	6	239384	239389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759198
4515	NC_003198	ATC	2	6	239400	239405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759198
4516	NC_003198	CCGG	2	8	239416	239423	0 %	0 %	50 %	50 %	16759198
4517	NC_003198	CGT	2	6	239471	239476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759198
4518	NC_003198	GAC	2	6	239496	239501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759198
4519	NC_003198	TGA	2	6	239552	239557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759198
4520	NC_003198	GCC	2	6	239602	239607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759198
4521	NC_003198	GCC	2	6	239679	239684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759198
4522	NC_003198	GCA	2	6	239720	239725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759198
4523	NC_003198	CTT	3	9	239732	239740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759198
4524	NC_003198	ATG	2	6	239752	239757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759198
4525	NC_003198	ATCG	2	8	239858	239865	25 %	25 %	25 %	25 %	16759199
4526	NC_003198	TCG	2	6	239891	239896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759199
4527	NC_003198	GCA	2	6	239996	240001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759199
4528	NC_003198	A	6	6	240001	240006	100 %	0 %	0 %	0 %	16759199
4529	NC_003198	GCA	2	6	240071	240076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759199
4530	NC_003198	GCC	2	6	240109	240114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759199
4531	NC_003198	GGA	2	6	240134	240139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16759199
4532	NC_003198	CCG	2	6	240216	240221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759199
4533	NC_003198	GGC	2	6	240239	240244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759199
4534	NC_003198	AGCC	2	8	240291	240298	25 %	0 %	25 %	50 %	16759199
4535	NC_003198	TG	3	6	240315	240320	0 %	50 %	50 %	0 %	16759199
4536	NC_003198	GAA	2	6	240348	240353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759199
4537	NC_003198	CGC	2	6	240369	240374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759199
4538	NC_003198	TGG	2	6	240501	240506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759199
4539	NC_003198	GAA	2	6	240542	240547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16759199
4540	NC_003198	TAT	2	6	240555	240560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759199
4541	NC_003198	GAT	2	6	240654	240659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759199
4542	NC_003198	AGC	2	6	240718	240723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759199
4543	NC_003198	CCA	2	6	240752	240757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759199
4544	NC_003198	TGG	2	6	240781	240786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759199
4545	NC_003198	T	6	6	240846	240851	0 %	100 %	0 %	0 %	16759199
4546	NC_003198	TAAA	2	8	240874	240881	75 %	25 %	0 %	0 %	16759199
4547	NC_003198	GCC	2	6	240979	240984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759199
4548	NC_003198	TTA	2	6	241080	241085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759199
4549	NC_003198	TGG	2	6	241135	241140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759199
4550	NC_003198	GTC	2	6	241224	241229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759199
4551	NC_003198	CGG	2	6	241249	241254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759199
4552	NC_003198	ATT	2	6	241273	241278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759199
4553	NC_003198	TGAC	2	8	241315	241322	25 %	25 %	25 %	25 %	16759199
4554	NC_003198	A	7	7	241503	241509	100 %	0 %	0 %	0 %	16759200
4555	NC_003198	CGG	2	6	241573	241578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759200
4556	NC_003198	CAG	2	6	241608	241613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759200
4557	NC_003198	GGT	2	6	241655	241660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759200
4558	NC_003198	CAC	2	6	241682	241687	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759200
4559	NC_003198	CGC	2	6	241696	241701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759200
4560	NC_003198	GCG	2	6	241792	241797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759200
4561	NC_003198	CGG	2	6	241802	241807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759200
4562	NC_003198	CGG	2	6	241811	241816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759200
4563	NC_003198	CAA	2	6	241818	241823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759200
4564	NC_003198	ATT	2	6	241854	241859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759200
4565	NC_003198	CGC	2	6	241862	241867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759200
4566	NC_003198	CGT	2	6	241877	241882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759200
4567	NC_003198	CAA	2	6	241886	241891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759200
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4570	NC_003198	CGC	2	6	242186	242191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759200
4571	NC_003198	CGG	2	6	242210	242215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759200
4572	NC_003198	CGG	2	6	242276	242281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759200
4573	NC_003198	TGG	2	6	242341	242346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759200
4574	NC_003198	CTGAG	2	10	242389	242398	20 %	20 %	40 %	20 %	16759200
4575	NC_003198	CAG	2	6	242534	242539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759200
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4577	NC_003198	GC	3	6	242552	242557	0 %	0 %	50 %	50 %	16759200
4578	NC_003198	GCA	2	6	242581	242586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759200
4579	NC_003198	CTG	2	6	242601	242606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16759200
4580	NC_003198	GCA	2	6	242642	242647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759200
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4582	NC_003198	TAA	2	6	242711	242716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16759200
4583	NC_003198	AGC	2	6	242742	242747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759200
4584	NC_003198	CGC	2	6	242765	242770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16759200
4585	NC_003198	A	6	6	242784	242789	100 %	0 %	0 %	0 %	16759200
4586	NC_003198	CAG	2	6	242814	242819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759200
4587	NC_003198	GTG	2	6	242893	242898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759200
4588	NC_003198	TATT	2	8	242906	242913	25 %	75 %	0 %	0 %	16759200
4589	NC_003198	TGGC	3	12	243081	243092	0 %	25 %	50 %	25 %	16759201
4590	NC_003198	GC	3	6	243125	243130	0 %	0 %	50 %	50 %	16759201
4591	NC_003198	CAT	2	6	243139	243144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759201
4592	NC_003198	TAT	2	6	243181	243186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759201
4593	NC_003198	GCG	2	6	243192	243197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759201
4594	NC_003198	GTT	2	6	243232	243237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759201
4595	NC_003198	TTG	2	6	243342	243347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16759201
4596	NC_003198	GT	3	6	243401	243406	0 %	50 %	50 %	0 %	16759201
4597	NC_003198	ATG	2	6	243419	243424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759201
4598	NC_003198	TGA	2	6	243486	243491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759201
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4600	NC_003198	TGG	2	6	243525	243530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759201
4601	NC_003198	GGC	2	6	243574	243579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759201
4602	NC_003198	GGT	2	6	243580	243585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759201
4603	NC_003198	CAG	2	6	243635	243640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759201
4604	NC_003198	AAC	2	6	243671	243676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759201
4605	NC_003198	TGG	2	6	243705	243710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759201
4606	NC_003198	ATC	2	6	243756	243761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16759201
4607	NC_003198	AGC	2	6	243774	243779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759201
4608	NC_003198	ACCGG	2	10	243842	243851	20 %	0 %	40 %	40 %	16759201
4609	NC_003198	GC	3	6	243878	243883	0 %	0 %	50 %	50 %	16759201
4610	NC_003198	GAT	2	6	243889	243894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759201
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4613	NC_003198	GC	3	6	244001	244006	0 %	0 %	50 %	50 %	16759201
4614	NC_003198	AAC	2	6	244034	244039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16759201
4615	NC_003198	TTA	2	6	244043	244048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16759201
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4617	NC_003198	CGA	2	6	244379	244384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16759202
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4620	NC_003198	CCA	2	6	244538	244543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759202
4621	NC_003198	CTT	2	6	244640	244645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16759202
4622	NC_003198	CGAT	2	8	244660	244667	25 %	25 %	25 %	25 %	16759202
4623	NC_003198	CATA	2	8	244706	244713	50 %	25 %	0 %	25 %	16759202
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4994	NC_003198	TGA	2	6	266043	266048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16759220
4995	NC_003198	CCA	2	6	266066	266071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16759220
4996	NC_003198	GC	3	6	266085	266090	0 %	0 %	50 %	50 %	16759220
4997	NC_003198	GTG	2	6	266173	266178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16759220
4998	NC_003198	GCG	2	6	266209	266214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759220
4999	NC_003198	GGC	2	6	266250	266255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16759220
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