MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 89214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003197	GCC	2	6	208048	208053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763566
4002	NC_003197	GTA	2	6	208068	208073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763566
4003	NC_003197	GCG	2	6	208104	208109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763566
4004	NC_003197	CAA	2	6	208301	208306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763566
4005	NC_003197	GCGG	2	8	208458	208465	0 %	0 %	75 %	25 %	16763567
4006	NC_003197	CTG	2	6	208496	208501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763567
4007	NC_003197	CAT	2	6	208595	208600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763567
4008	NC_003197	GC	3	6	208650	208655	0 %	0 %	50 %	50 %	16763567
4009	NC_003197	CTG	2	6	208663	208668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763567
4010	NC_003197	AG	3	6	208744	208749	50 %	0 %	50 %	0 %	16763567
4011	NC_003197	TTC	2	6	208755	208760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763567
4012	NC_003197	GCG	2	6	208861	208866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763567
4013	NC_003197	GGC	2	6	208881	208886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763567
4014	NC_003197	AGTG	2	8	208896	208903	25 %	25 %	50 %	0 %	16763567
4015	NC_003197	AAG	2	6	209356	209361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763568
4016	NC_003197	ATG	2	6	209431	209436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763568
4017	NC_003197	TG	3	6	209435	209440	0 %	50 %	50 %	0 %	16763568
4018	NC_003197	CGGCG	2	10	209496	209505	0 %	0 %	60 %	40 %	16763568
4019	NC_003197	TGA	2	6	209525	209530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763568
4020	NC_003197	GGA	2	6	209583	209588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763568
4021	NC_003197	GC	3	6	209651	209656	0 %	0 %	50 %	50 %	16763568
4022	NC_003197	CAG	3	9	209680	209688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763568
4023	NC_003197	TGC	2	6	209708	209713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763568
4024	NC_003197	AT	3	6	209791	209796	50 %	50 %	0 %	0 %	16763569
4025	NC_003197	GTT	2	6	209807	209812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763569
4026	NC_003197	ACG	2	6	209876	209881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763569
4027	NC_003197	GCC	2	6	209888	209893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763569
4028	NC_003197	ATT	2	6	209979	209984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763569
4029	NC_003197	TGG	2	6	210174	210179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763569
4030	NC_003197	ATT	2	6	210197	210202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763569
4031	NC_003197	GGCT	2	8	210258	210265	0 %	25 %	50 %	25 %	16763569
4032	NC_003197	ATC	2	6	210318	210323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763569
4033	NC_003197	TGA	2	6	210334	210339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763569
4034	NC_003197	CCA	2	6	210366	210371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763569
4035	NC_003197	TTCGG	2	10	210376	210385	0 %	40 %	40 %	20 %	16763569
4036	NC_003197	GGA	2	6	210451	210456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763569
4037	NC_003197	GC	4	8	210485	210492	0 %	0 %	50 %	50 %	16763569
4038	NC_003197	TGA	2	6	210508	210513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763569
4039	NC_003197	TAT	2	6	210583	210588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763569
4040	NC_003197	T	6	6	210703	210708	0 %	100 %	0 %	0 %	16763569
4041	NC_003197	CGC	2	6	210728	210733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763569
4042	NC_003197	TA	3	6	210741	210746	50 %	50 %	0 %	0 %	16763569
4043	NC_003197	ATA	2	6	210759	210764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763569
4044	NC_003197	CGG	2	6	210788	210793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763569
4045	NC_003197	TCTT	2	8	210826	210833	0 %	75 %	0 %	25 %	16763569
4046	NC_003197	AGC	2	6	210868	210873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763569
4047	NC_003197	TGC	2	6	210942	210947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763569
4048	NC_003197	CTT	2	6	211120	211125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763570
4049	NC_003197	GCC	2	6	211185	211190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763570
4050	NC_003197	GAT	2	6	211205	211210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763570
4051	NC_003197	CTTGC	2	10	211385	211394	0 %	40 %	20 %	40 %	16763570
4052	NC_003197	GGC	2	6	211560	211565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763571
4053	NC_003197	CAG	2	6	211605	211610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4054	NC_003197	GTC	2	6	211635	211640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4055	NC_003197	TTCA	2	8	211656	211663	25 %	50 %	0 %	25 %	16763571
4056	NC_003197	GGCAAT	2	12	211674	211685	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16763571
4057	NC_003197	TCA	2	6	211736	211741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763571
4058	NC_003197	GCT	2	6	211769	211774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4059	NC_003197	TGAGC	2	10	211797	211806	20 %	20 %	40 %	20 %	16763571
4060	NC_003197	AAT	2	6	211827	211832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763571
4061	NC_003197	CGA	2	6	211841	211846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4062	NC_003197	CCA	2	6	211871	211876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763571
4063	NC_003197	CGC	2	6	211973	211978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763571
4064	NC_003197	AG	3	6	212016	212021	50 %	0 %	50 %	0 %	16763571
4065	NC_003197	ACGT	2	8	212035	212042	25 %	25 %	25 %	25 %	16763571
4066	NC_003197	CAC	2	6	212208	212213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763571
4067	NC_003197	CGT	2	6	212255	212260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4068	NC_003197	TGG	2	6	212273	212278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763571
4069	NC_003197	GAC	2	6	212312	212317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4070	NC_003197	GCA	2	6	212330	212335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763571
4071	NC_003197	CAA	2	6	212360	212365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763571
4072	NC_003197	TTC	2	6	212501	212506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763572
4073	NC_003197	CTG	2	6	212543	212548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763572
4074	NC_003197	CGG	2	6	212551	212556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763572
4075	NC_003197	CCG	2	6	212610	212615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763572
4076	NC_003197	GCCGAT	2	12	212672	212683	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16763572
4077	NC_003197	GCAC	2	8	212731	212738	25 %	0 %	25 %	50 %	16763572
4078	NC_003197	CCAGCA	2	12	212740	212751	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	16763572
4079	NC_003197	CAG	2	6	212789	212794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763572
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4081	NC_003197	CCAG	2	8	212920	212927	25 %	0 %	25 %	50 %	16763572
4082	NC_003197	GCC	2	6	212930	212935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763572
4083	NC_003197	CGCA	2	8	212960	212967	25 %	0 %	25 %	50 %	16763572
4084	NC_003197	GC	3	6	213049	213054	0 %	0 %	50 %	50 %	16763572
4085	NC_003197	CG	3	6	213065	213070	0 %	0 %	50 %	50 %	16763572
4086	NC_003197	CAGG	2	8	213100	213107	25 %	0 %	50 %	25 %	16763572
4087	NC_003197	AG	3	6	213138	213143	50 %	0 %	50 %	0 %	16763572
4088	NC_003197	TCG	2	6	213171	213176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763572
4089	NC_003197	T	6	6	213227	213232	0 %	100 %	0 %	0 %	16763572
4090	NC_003197	CTTG	2	8	213235	213242	0 %	50 %	25 %	25 %	16763572
4091	NC_003197	GCA	2	6	213250	213255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763572
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4093	NC_003197	GCA	2	6	213417	213422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763573
4094	NC_003197	AGATC	2	10	213466	213475	40 %	20 %	20 %	20 %	16763573
4095	NC_003197	CGGT	2	8	213546	213553	0 %	25 %	50 %	25 %	16763573
4096	NC_003197	TTC	2	6	213671	213676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763573
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4099	NC_003197	CGA	2	6	213772	213777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763573
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4101	NC_003197	CGCGG	2	10	213888	213897	0 %	0 %	60 %	40 %	16763574
4102	NC_003197	CG	3	6	213898	213903	0 %	0 %	50 %	50 %	16763574
4103	NC_003197	ACG	2	6	213919	213924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763574
4104	NC_003197	GCG	2	6	213925	213930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763574
4105	NC_003197	TCG	2	6	213941	213946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763574
4106	NC_003197	CGG	2	6	213976	213981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763574
4107	NC_003197	CAC	2	6	214004	214009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763574
4108	NC_003197	TAT	2	6	214032	214037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763574
4109	NC_003197	GC	3	6	214049	214054	0 %	0 %	50 %	50 %	16763574
4110	NC_003197	CGCGG	2	10	214072	214081	0 %	0 %	60 %	40 %	16763574
4111	NC_003197	CAT	2	6	214218	214223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763574
4112	NC_003197	CGT	2	6	214242	214247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763574
4113	NC_003197	T	6	6	214275	214280	0 %	100 %	0 %	0 %	16763574
4114	NC_003197	CAG	2	6	214291	214296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763574
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4120	NC_003197	GTT	2	6	214476	214481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763574
4121	NC_003197	GC	3	6	214537	214542	0 %	0 %	50 %	50 %	16763574
4122	NC_003197	GGA	2	6	214544	214549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763574
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4124	NC_003197	CTT	2	6	214704	214709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763574
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4128	NC_003197	TGT	2	6	214824	214829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763574
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4243	NC_003197	CGTCTG	2	12	220253	220264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763579
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4248	NC_003197	CCCG	2	8	220522	220529	0 %	0 %	25 %	75 %	16763579
4249	NC_003197	GCGAA	2	10	220560	220569	40 %	0 %	40 %	20 %	16763579
4250	NC_003197	CAGCG	2	10	220623	220632	20 %	0 %	40 %	40 %	16763579
4251	NC_003197	CG	3	6	220647	220652	0 %	0 %	50 %	50 %	16763579
4252	NC_003197	GAA	2	6	220768	220773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763579
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4355	NC_003197	AAAC	2	8	225049	225056	75 %	0 %	0 %	25 %	16763581
4356	NC_003197	GGAAT	2	10	225081	225090	40 %	20 %	40 %	0 %	16763581
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4366	NC_003197	GATG	2	8	225753	225760	25 %	25 %	50 %	0 %	16763581
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4374	NC_003197	AGC	2	6	226210	226215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763582
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4492	NC_003197	GC	3	6	231932	231937	0 %	0 %	50 %	50 %	16763586
4493	NC_003197	GGCG	2	8	232039	232046	0 %	0 %	75 %	25 %	16763586
4494	NC_003197	GGC	2	6	232125	232130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763586
4495	NC_003197	CGA	2	6	232142	232147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763586
4496	NC_003197	AT	3	6	232186	232191	50 %	50 %	0 %	0 %	16763586
4497	NC_003197	GC	3	6	232200	232205	0 %	0 %	50 %	50 %	16763586
4498	NC_003197	GCGG	2	8	232234	232241	0 %	0 %	75 %	25 %	16763586
4499	NC_003197	GAA	2	6	232329	232334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763586
4500	NC_003197	GGC	2	6	232458	232463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763586

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