MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 89214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003197	TTG	2	6	52290	52295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763433
1002	NC_003197	AGC	2	6	52355	52360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763433
1003	NC_003197	GCA	2	6	52404	52409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763433
1004	NC_003197	TGA	2	6	52447	52452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763433
1005	NC_003197	CAT	2	6	52460	52465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763433
1006	NC_003197	GC	3	6	52512	52517	0 %	0 %	50 %	50 %	16763433
1007	NC_003197	GCA	2	6	52651	52656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763434
1008	NC_003197	GCG	2	6	52737	52742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763434
1009	NC_003197	TCT	2	6	52782	52787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763434
1010	NC_003197	TCA	2	6	52795	52800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763434
1011	NC_003197	TTAACC	2	12	52814	52825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763434
1012	NC_003197	CATA	2	8	52889	52896	50 %	25 %	0 %	25 %	16763435
1013	NC_003197	TCAG	2	8	52900	52907	25 %	25 %	25 %	25 %	16763435
1014	NC_003197	GT	3	6	52919	52924	0 %	50 %	50 %	0 %	16763435
1015	NC_003197	GAA	2	6	52989	52994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763435
1016	NC_003197	GGT	3	9	53015	53023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763435
1017	NC_003197	GCG	2	6	53122	53127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763435
1018	NC_003197	TGTGC	2	10	53135	53144	0 %	40 %	40 %	20 %	16763435
1019	NC_003197	CGC	2	6	53157	53162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763435
1020	NC_003197	CTG	2	6	53199	53204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763435
1021	NC_003197	GAT	2	6	53241	53246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763435
1022	NC_003197	CG	3	6	53265	53270	0 %	0 %	50 %	50 %	16763435
1023	NC_003197	TTA	2	6	53283	53288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763435
1024	NC_003197	GGC	2	6	53346	53351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763435
1025	NC_003197	AGT	2	6	53361	53366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763435
1026	NC_003197	CTG	2	6	53418	53423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763435
1027	NC_003197	CGA	2	6	53462	53467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763435
1028	NC_003197	TGGC	2	8	53614	53621	0 %	25 %	50 %	25 %	16763435
1029	NC_003197	CAA	2	6	53628	53633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763435
1030	NC_003197	CTG	2	6	53646	53651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763435
1031	NC_003197	AGC	2	6	53716	53721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763435
1032	NC_003197	TGA	2	6	53735	53740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763435
1033	NC_003197	T	6	6	53784	53789	0 %	100 %	0 %	0 %	16763435
1034	NC_003197	TGA	2	6	53853	53858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763436
1035	NC_003197	GCG	2	6	53907	53912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763436
1036	NC_003197	GAT	3	9	53954	53962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763436
1037	NC_003197	CAT	2	6	53971	53976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763436
1038	NC_003197	A	6	6	53987	53992	100 %	0 %	0 %	0 %	16763436
1039	NC_003197	A	7	7	53996	54002	100 %	0 %	0 %	0 %	16763436
1040	NC_003197	ATG	2	6	54015	54020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763436
1041	NC_003197	GCA	2	6	54039	54044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763436
1042	NC_003197	CAT	2	6	54346	54351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763436
1043	NC_003197	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	16763436
1044	NC_003197	GCGGAA	2	12	54440	54451	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	16763436
1045	NC_003197	ACC	2	6	54575	54580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763436
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1047	NC_003197	CTG	2	6	55010	55015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763436
1048	NC_003197	GC	3	6	55026	55031	0 %	0 %	50 %	50 %	16763436
1049	NC_003197	A	6	6	55044	55049	100 %	0 %	0 %	0 %	16763436
1050	NC_003197	GCA	2	6	55051	55056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763436
1051	NC_003197	CG	3	6	55100	55105	0 %	0 %	50 %	50 %	16763436
1052	NC_003197	AAG	2	6	55134	55139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763436
1053	NC_003197	GCT	2	6	55306	55311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763436
1054	NC_003197	GGC	2	6	55330	55335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763436
1055	NC_003197	GTG	2	6	55381	55386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763436
1056	NC_003197	GTTTG	2	10	55457	55466	0 %	60 %	40 %	0 %	16763436
1057	NC_003197	CCA	2	6	55476	55481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16763436
1058	NC_003197	TGC	2	6	55522	55527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763436
1059	NC_003197	TCC	2	6	55574	55579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763436
1060	NC_003197	TGA	2	6	55581	55586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763436
1061	NC_003197	TGA	2	6	55707	55712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763436
1062	NC_003197	TGC	2	6	55801	55806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763436
1063	NC_003197	TCG	2	6	55816	55821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763436
1064	NC_003197	CG	3	6	55834	55839	0 %	0 %	50 %	50 %	16763436
1065	NC_003197	CTG	2	6	55844	55849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763436
1066	NC_003197	TGG	2	6	55902	55907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763436
1067	NC_003197	GCA	2	6	55945	55950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763436
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1069	NC_003197	CAT	2	6	56047	56052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763436
1070	NC_003197	CG	3	6	56089	56094	0 %	0 %	50 %	50 %	16763436
1071	NC_003197	TGA	2	6	56173	56178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763436
1072	NC_003197	ACG	2	6	56235	56240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763436
1073	NC_003197	GTT	2	6	56242	56247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763436
1074	NC_003197	GAA	2	6	56264	56269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763436
1075	NC_003197	CAA	2	6	56317	56322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763436
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1078	NC_003197	TGA	3	9	56497	56505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763436
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1081	NC_003197	AAC	2	6	56670	56675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763436
1082	NC_003197	TGA	2	6	56687	56692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763436
1083	NC_003197	GTA	2	6	56734	56739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763437
1084	NC_003197	GCA	2	6	56762	56767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763437
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1086	NC_003197	GCG	2	6	56879	56884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763437
1087	NC_003197	TGA	2	6	56942	56947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763437
1088	NC_003197	ATC	2	6	56998	57003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763437
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1090	NC_003197	GC	3	6	57008	57013	0 %	0 %	50 %	50 %	16763437
1091	NC_003197	TGT	2	6	57048	57053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763437
1092	NC_003197	CGGCG	2	10	57126	57135	0 %	0 %	60 %	40 %	16763437
1093	NC_003197	TTCAC	2	10	57381	57390	20 %	40 %	0 %	40 %	16763438
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1095	NC_003197	CGG	2	6	57414	57419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763438
1096	NC_003197	AGCC	2	8	57441	57448	25 %	0 %	25 %	50 %	16763438
1097	NC_003197	AGC	3	9	57489	57497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763438
1098	NC_003197	AAG	2	6	57510	57515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763438
1099	NC_003197	AAAG	2	8	57520	57527	75 %	0 %	25 %	0 %	16763438
1100	NC_003197	CGC	2	6	57547	57552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763438
1101	NC_003197	GGC	2	6	57607	57612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763438
1102	NC_003197	ATGG	2	8	57653	57660	25 %	25 %	50 %	0 %	16763438
1103	NC_003197	TTG	2	6	57857	57862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763439
1104	NC_003197	GC	3	6	57884	57889	0 %	0 %	50 %	50 %	16763439
1105	NC_003197	GC	4	8	58114	58121	0 %	0 %	50 %	50 %	16763439
1106	NC_003197	G	6	6	58210	58215	0 %	0 %	100 %	0 %	16763439
1107	NC_003197	TGG	2	6	58223	58228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763439
1108	NC_003197	TGAT	2	8	58325	58332	25 %	50 %	25 %	0 %	16763439
1109	NC_003197	TCG	2	6	58358	58363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763439
1110	NC_003197	TGG	2	6	58448	58453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763439
1111	NC_003197	TCTAAC	2	12	58471	58482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763439
1112	NC_003197	GAA	2	6	58511	58516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763439
1113	NC_003197	CGA	2	6	58530	58535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763439
1114	NC_003197	GCG	2	6	58537	58542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763439
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1121	NC_003197	CAA	2	6	59004	59009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763440
1122	NC_003197	CCTG	2	8	59030	59037	0 %	25 %	25 %	50 %	16763440
1123	NC_003197	CT	3	6	59104	59109	0 %	50 %	0 %	50 %	16763440
1124	NC_003197	GAA	2	6	59198	59203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763440
1125	NC_003197	CAG	2	6	59245	59250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763440
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