MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium str. LT2 chromosome

Total Repeats: 89214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003197	TCTG	2	8	25931	25938	0 %	50 %	25 %	25 %	16763413
502	NC_003197	GGC	2	6	25988	25993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
503	NC_003197	ACG	2	6	26070	26075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763413
504	NC_003197	GC	3	6	26083	26088	0 %	0 %	50 %	50 %	16763413
505	NC_003197	GCCT	2	8	26112	26119	0 %	25 %	25 %	50 %	16763413
506	NC_003197	GGC	3	9	26180	26188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
507	NC_003197	GCC	2	6	26223	26228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763413
508	NC_003197	GCA	2	6	26249	26254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763413
509	NC_003197	GGC	2	6	26279	26284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
510	NC_003197	GGC	2	6	26397	26402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
511	NC_003197	ACT	2	6	26470	26475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763413
512	NC_003197	GCG	2	6	26494	26499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
513	NC_003197	AGCGAC	2	12	26508	26519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763413
514	NC_003197	GCA	2	6	26522	26527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763413
515	NC_003197	ATT	2	6	26606	26611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763413
516	NC_003197	CCTT	2	8	26618	26625	0 %	50 %	0 %	50 %	16763413
517	NC_003197	GAC	2	6	26649	26654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763413
518	NC_003197	CAT	2	6	26747	26752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763413
519	NC_003197	GCC	2	6	26768	26773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763413
520	NC_003197	CCG	2	6	26806	26811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763413
521	NC_003197	GCG	2	6	26815	26820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
522	NC_003197	CCG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763413
523	NC_003197	GGC	2	6	26908	26913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
524	NC_003197	GCG	2	6	26922	26927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
525	NC_003197	TAG	2	6	26951	26956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763413
526	NC_003197	TCAG	2	8	26977	26984	25 %	25 %	25 %	25 %	16763413
527	NC_003197	GCG	2	6	27073	27078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
528	NC_003197	ATA	2	6	27142	27147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763413
529	NC_003197	GAT	2	6	27261	27266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763413
530	NC_003197	ATT	2	6	27343	27348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763413
531	NC_003197	TTA	2	6	27356	27361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763413
532	NC_003197	AGG	2	6	27366	27371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16763413
533	NC_003197	ATCA	2	8	27390	27397	50 %	25 %	0 %	25 %	16763413
534	NC_003197	TTA	2	6	27424	27429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763413
535	NC_003197	CAGC	2	8	27434	27441	25 %	0 %	25 %	50 %	16763413
536	NC_003197	TGA	2	6	27458	27463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763413
537	NC_003197	TTG	2	6	27474	27479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763413
538	NC_003197	ACA	2	6	27529	27534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763413
539	NC_003197	TGA	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763413
540	NC_003197	CTG	2	6	27717	27722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763413
541	NC_003197	ACA	2	6	27742	27747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763413
542	NC_003197	GCG	2	6	27784	27789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
543	NC_003197	CAG	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763413
544	NC_003197	GGC	2	6	27888	27893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763413
545	NC_003197	TGG	2	6	27895	27900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763413
546	NC_003197	AGCC	2	8	27924	27931	25 %	0 %	25 %	50 %	16763413
547	NC_003197	CG	3	6	28013	28018	0 %	0 %	50 %	50 %	16763413
548	NC_003197	GGT	2	6	28028	28033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763413
549	NC_003197	ACA	2	6	28044	28049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763413
550	NC_003197	GAT	2	6	28092	28097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763413
551	NC_003197	TGA	2	6	28106	28111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763413
552	NC_003197	CCGA	2	8	28131	28138	25 %	0 %	25 %	50 %	16763413
553	NC_003197	GC	3	6	28141	28146	0 %	0 %	50 %	50 %	16763413
554	NC_003197	GC	3	6	28177	28182	0 %	0 %	50 %	50 %	16763413
555	NC_003197	ACGGTG	2	12	28233	28244	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	16763413
556	NC_003197	TTG	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16763413
557	NC_003197	GCGTC	2	10	28357	28366	0 %	20 %	40 %	40 %	16763413
558	NC_003197	ATC	2	6	28369	28374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16763413
559	NC_003197	TC	3	6	28373	28378	0 %	50 %	0 %	50 %	16763413
560	NC_003197	TCC	2	6	28380	28385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763413
561	NC_003197	ACA	2	6	28403	28408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763413
562	NC_003197	CTG	2	6	28449	28454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763414
563	NC_003197	GT	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	16763414
564	NC_003197	ATTA	2	8	28524	28531	50 %	50 %	0 %	0 %	16763414
565	NC_003197	A	6	6	28591	28596	100 %	0 %	0 %	0 %	16763414
566	NC_003197	GT	3	6	28620	28625	0 %	50 %	50 %	0 %	16763414
567	NC_003197	CCG	2	6	28627	28632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763414
568	NC_003197	TTC	2	6	28760	28765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16763414
569	NC_003197	GGCG	2	8	28766	28773	0 %	0 %	75 %	25 %	16763414
570	NC_003197	ATG	2	6	28810	28815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763414
571	NC_003197	TCG	2	6	28891	28896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763414
572	NC_003197	CCG	2	6	28945	28950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763414
573	NC_003197	A	6	6	29118	29123	100 %	0 %	0 %	0 %	16763414
574	NC_003197	ATG	2	6	29284	29289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763414
575	NC_003197	ACA	2	6	29364	29369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763414
576	NC_003197	GAC	2	6	29502	29507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763415
577	NC_003197	AAC	2	6	29630	29635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763415
578	NC_003197	ATG	2	6	29812	29817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16763415
579	NC_003197	AAT	2	6	29838	29843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16763415
580	NC_003197	GGT	2	6	29852	29857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763415
581	NC_003197	CGG	2	6	29944	29949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763415
582	NC_003197	ATGA	2	8	29971	29978	50 %	25 %	25 %	0 %	16763415
583	NC_003197	TGC	2	6	30025	30030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763416
584	NC_003197	GGC	2	6	30032	30037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763416
585	NC_003197	CT	3	6	30105	30110	0 %	50 %	0 %	50 %	16763416
586	NC_003197	GCA	2	6	30223	30228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763416
587	NC_003197	GCG	2	6	30235	30240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763416
588	NC_003197	GCG	2	6	30261	30266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763416
589	NC_003197	AG	3	6	30374	30379	50 %	0 %	50 %	0 %	16763416
590	NC_003197	CG	3	6	30431	30436	0 %	0 %	50 %	50 %	16763416
591	NC_003197	GGC	2	6	30450	30455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763416
592	NC_003197	AT	3	6	30532	30537	50 %	50 %	0 %	0 %	16763417
593	NC_003197	TGCT	2	8	30541	30548	0 %	50 %	25 %	25 %	16763417
594	NC_003197	TATC	2	8	30597	30604	25 %	50 %	0 %	25 %	16763417
595	NC_003197	GTAA	2	8	30634	30641	50 %	25 %	25 %	0 %	16763417
596	NC_003197	TGG	2	6	30684	30689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763417
597	NC_003197	CGC	2	6	30740	30745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763417
598	NC_003197	ATT	2	6	30747	30752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763417
599	NC_003197	GC	3	6	30763	30768	0 %	0 %	50 %	50 %	16763417
600	NC_003197	GGT	2	6	30786	30791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763417
601	NC_003197	CCG	2	6	30812	30817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763417
602	NC_003197	CGC	2	6	30846	30851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763417
603	NC_003197	TTCG	2	8	30896	30903	0 %	50 %	25 %	25 %	16763417
604	NC_003197	GCA	2	6	30948	30953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763417
605	NC_003197	ATCTG	2	10	30965	30974	20 %	40 %	20 %	20 %	16763417
606	NC_003197	TTACG	2	10	31020	31029	20 %	40 %	20 %	20 %	16763417
607	NC_003197	TTA	2	6	31036	31041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763417
608	NC_003197	GC	3	6	31053	31058	0 %	0 %	50 %	50 %	16763417
609	NC_003197	TAT	2	6	31270	31275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763418
610	NC_003197	TAT	2	6	31277	31282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16763418
611	NC_003197	CGC	2	6	31351	31356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763418
612	NC_003197	CGG	2	6	31389	31394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763418
613	NC_003197	GTCA	2	8	31406	31413	25 %	25 %	25 %	25 %	16763418
614	NC_003197	CGC	2	6	31474	31479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763418
615	NC_003197	CAG	2	6	31502	31507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763418
616	NC_003197	CAA	2	6	31514	31519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16763418
617	NC_003197	AGC	2	6	31568	31573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763418
618	NC_003197	GCG	2	6	31604	31609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763418
619	NC_003197	GTG	2	6	31610	31615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763418
620	NC_003197	GTG	2	6	31639	31644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16763418
621	NC_003197	T	6	6	31722	31727	0 %	100 %	0 %	0 %	16763418
622	NC_003197	GGC	2	6	31753	31758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16763418
623	NC_003197	GGGCG	2	10	31789	31798	0 %	0 %	80 %	20 %	16763418
624	NC_003197	GCC	2	6	31910	31915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16763418
625	NC_003197	AAG	2	6	31920	31925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16763418
626	NC_003197	AGC	2	6	31931	31936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16763418
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628	NC_003197	CTC	2	6	31955	31960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16763418
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630	NC_003197	GTC	2	6	32012	32017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16763418
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