MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 plasmid pN315

Total Repeats: 288

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003140	TGA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119201
2	NC_003140	ACG	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119201
3	NC_003140	AGA	2	6	606	611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119201
4	NC_003140	AAT	2	6	772	777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119201
5	NC_003140	TGA	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119201
6	NC_003140	AAC	2	6	896	901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119201
7	NC_003140	ATT	2	6	908	913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119201
8	NC_003140	CTT	2	6	1040	1045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119201
9	NC_003140	GAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119201
10	NC_003140	AAT	2	6	1211	1216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119201
11	NC_003140	ATC	2	6	1264	1269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119202
12	NC_003140	TGA	2	6	1282	1287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119202
13	NC_003140	CGA	2	6	1288	1293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119202
14	NC_003140	TGG	2	6	1357	1362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119202
15	NC_003140	TGA	2	6	1432	1437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119202
16	NC_003140	GAA	2	6	1454	1459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119202
17	NC_003140	ATT	3	9	1505	1513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119202
18	NC_003140	CCG	2	6	2443	2448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119203
19	NC_003140	AGT	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119203
20	NC_003140	TAC	2	6	2510	2515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119203
21	NC_003140	TAA	2	6	2609	2614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119203
22	NC_003140	CTT	2	6	2644	2649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119203
23	NC_003140	TTA	2	6	2743	2748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119203
24	NC_003140	TCT	2	6	2815	2820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119203
25	NC_003140	CTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119203
26	NC_003140	TTC	2	6	2994	2999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119203
27	NC_003140	ATT	2	6	3052	3057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119203
28	NC_003140	AAT	2	6	3061	3066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119203
29	NC_003140	TGA	2	6	3288	3293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119204
30	NC_003140	TAT	2	6	4497	4502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
31	NC_003140	GTT	2	6	4513	4518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119205
32	NC_003140	GCT	3	9	4519	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119205
33	NC_003140	CAG	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119205
34	NC_003140	TTA	2	6	4555	4560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
35	NC_003140	TTA	2	6	4567	4572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
36	NC_003140	TAT	2	6	4641	4646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
37	NC_003140	ATG	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119205
38	NC_003140	ATA	2	6	4868	4873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119205
39	NC_003140	TCT	2	6	4955	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119205
40	NC_003140	TTG	2	6	5009	5014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119205
41	NC_003140	TAT	2	6	5040	5045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
42	NC_003140	TTA	3	9	5066	5074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119205
43	NC_003140	AGA	2	6	5208	5213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119206
44	NC_003140	TGA	2	6	5256	5261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119206
45	NC_003140	GAA	2	6	5262	5267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119206
46	NC_003140	AGA	2	6	5295	5300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119206
47	NC_003140	CAT	2	6	5359	5364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119206
48	NC_003140	ATT	2	6	5423	5428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119206
49	NC_003140	TTA	2	6	5429	5434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119206
50	NC_003140	TAA	2	6	5582	5587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119207
51	NC_003140	CAT	2	6	5661	5666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119207
52	NC_003140	TCA	2	6	5675	5680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119207
53	NC_003140	TAT	2	6	5698	5703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119207
54	NC_003140	CAA	2	6	5724	5729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119207
55	NC_003140	TTC	2	6	5922	5927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119208
56	NC_003140	TGT	2	6	5933	5938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119208
57	NC_003140	TTC	2	6	5971	5976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119208
58	NC_003140	AAT	2	6	6231	6236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119208
59	NC_003140	TAT	2	6	6261	6266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119208
60	NC_003140	ATT	3	9	6275	6283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119208
61	NC_003140	CAC	2	6	6396	6401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119208
62	NC_003140	TGC	2	6	6478	6483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119208
63	NC_003140	CAT	2	6	6606	6611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119208
64	NC_003140	CTT	2	6	6636	6641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119208
65	NC_003140	CAA	2	6	6666	6671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119208
66	NC_003140	TCA	2	6	6809	6814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119208
67	NC_003140	ACT	2	6	6857	6862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119208
68	NC_003140	ATT	2	6	7022	7027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119209
69	NC_003140	TTA	2	6	7072	7077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119209
70	NC_003140	CAG	2	6	7097	7102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119209
71	NC_003140	CAA	2	6	7184	7189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119209
72	NC_003140	TAA	2	6	7226	7231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119209
73	NC_003140	AGA	2	6	7255	7260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119209
74	NC_003140	TAA	2	6	7268	7273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119209
75	NC_003140	TAA	2	6	7332	7337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119209
76	NC_003140	GAA	2	6	7363	7368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119209
77	NC_003140	CAT	2	6	8079	8084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119210
78	NC_003140	TAT	2	6	8175	8180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119210
79	NC_003140	AGC	2	6	8263	8268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119210
80	NC_003140	GTT	2	6	8367	8372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119210
81	NC_003140	TAT	2	6	8421	8426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119210
82	NC_003140	ATC	2	6	8515	8520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119210
83	NC_003140	TTA	2	6	8549	8554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119210
84	NC_003140	TAA	2	6	8910	8915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119211
85	NC_003140	GTA	2	6	8921	8926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119211
86	NC_003140	TAA	2	6	9076	9081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119211
87	NC_003140	AAT	2	6	9086	9091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119211
88	NC_003140	ACC	2	6	9143	9148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119211
89	NC_003140	ATA	2	6	9204	9209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119211
90	NC_003140	TTA	2	6	9237	9242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119211
91	NC_003140	TTA	2	6	9269	9274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119211
92	NC_003140	TCT	2	6	9552	9557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119211
93	NC_003140	TAT	3	9	9559	9567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119211
94	NC_003140	TAA	2	6	9646	9651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119211
95	NC_003140	TAT	2	6	9688	9693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119211
96	NC_003140	CAA	2	6	9721	9726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119211
97	NC_003140	AAG	2	6	9792	9797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119211
98	NC_003140	GAA	2	6	10000	10005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119211
99	NC_003140	ATG	2	6	10376	10381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119211
100	NC_003140	TCT	2	6	10424	10429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119211
101	NC_003140	ATT	2	6	10432	10437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119211
102	NC_003140	TAA	2	6	10504	10509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119211
103	NC_003140	GGT	2	6	10512	10517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119211
104	NC_003140	TAT	2	6	10550	10555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119211
105	NC_003140	TAA	2	6	10605	10610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119211
106	NC_003140	AAG	2	6	10756	10761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119212
107	NC_003140	TCA	2	6	10851	10856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119212
108	NC_003140	AGA	2	6	10865	10870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119212
109	NC_003140	TAA	2	6	10904	10909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119212
110	NC_003140	GAA	2	6	10959	10964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119212
111	NC_003140	GAA	2	6	10983	10988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119212
112	NC_003140	AGG	2	6	11340	11345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119213
113	NC_003140	TTG	2	6	11460	11465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119213
114	NC_003140	GGA	2	6	11497	11502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119213
115	NC_003140	AGA	2	6	11557	11562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119213
116	NC_003140	ATT	3	9	11599	11607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119213
117	NC_003140	GCA	2	6	11618	11623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119213
118	NC_003140	TTC	2	6	11659	11664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119213
119	NC_003140	GCA	2	6	11678	11683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119213
120	NC_003140	ACA	2	6	11810	11815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119213
121	NC_003140	GGA	2	6	11839	11844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119213
122	NC_003140	TGA	2	6	12101	12106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119214
123	NC_003140	AAT	2	6	12186	12191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119214
124	NC_003140	TTA	2	6	12226	12231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119214
125	NC_003140	TAT	3	9	12413	12421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119214
126	NC_003140	CAT	2	6	12594	12599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119214
127	NC_003140	AAC	2	6	12715	12720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119214
128	NC_003140	AAT	2	6	12738	12743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119214
129	NC_003140	TAA	2	6	12760	12765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119214
130	NC_003140	GAA	2	6	12780	12785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119214
131	NC_003140	AAC	2	6	12904	12909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119214
132	NC_003140	TAT	2	6	12916	12921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119214
133	NC_003140	AGC	2	6	13001	13006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119214
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138	NC_003140	TTG	2	6	13625	13630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119215
139	NC_003140	GAA	2	6	13649	13654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119215
140	NC_003140	AAT	2	6	13665	13670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119215
141	NC_003140	AAG	2	6	13697	13702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119215
142	NC_003140	ATG	2	6	13729	13734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119215
143	NC_003140	ACT	2	6	13755	13760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119215
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145	NC_003140	GTT	2	6	13948	13953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119215
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163	NC_003140	TAT	2	6	15182	15187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119217
164	NC_003140	TTG	2	6	15295	15300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119217
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234	NC_003140	TGA	2	6	20160	20165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119223
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239	NC_003140	TAA	2	6	20492	20497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119224
240	NC_003140	AGC	2	6	20819	20824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119225
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242	NC_003140	GAT	2	6	20838	20843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119225
243	NC_003140	GAA	2	6	20949	20954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119225
244	NC_003140	ATT	2	6	20980	20985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119225
245	NC_003140	TGT	2	6	20986	20991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119225
246	NC_003140	ATG	2	6	21069	21074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119225
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248	NC_003140	TAA	2	6	21097	21102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119225
249	NC_003140	ATG	2	6	21163	21168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119225
250	NC_003140	AAG	2	6	21180	21185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119225
251	NC_003140	CAA	2	6	21387	21392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119226
252	NC_003140	ATA	2	6	21476	21481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119226
253	NC_003140	AGT	2	6	21483	21488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119226
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258	NC_003140	TAA	2	6	21941	21946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16119227
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269	NC_003140	TAT	2	6	23405	23410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16119230
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.