MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 2002

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003106	GGTGA	2	10	4425	4434	20 %	20 %	60 %	0 %	15920171
2	NC_003106	ATAAC	2	10	4612	4621	60 %	20 %	0 %	20 %	15920171
3	NC_003106	TGTCG	2	10	5450	5459	0 %	40 %	40 %	20 %	15920171
4	NC_003106	TCCCT	2	10	7577	7586	0 %	40 %	0 %	60 %	15920172
5	NC_003106	CTTCT	2	10	9398	9407	0 %	60 %	0 %	40 %	15920173
6	NC_003106	TCTTT	2	10	10423	10432	0 %	80 %	0 %	20 %	15920175
7	NC_003106	GAATA	2	10	12293	12302	60 %	20 %	20 %	0 %	15920177
8	NC_003106	ACTTT	2	10	15630	15639	20 %	60 %	0 %	20 %	15920182
9	NC_003106	ACTTC	2	10	15704	15713	20 %	40 %	0 %	40 %	15920182
10	NC_003106	GAAGA	2	10	16687	16696	60 %	0 %	40 %	0 %	15920182
11	NC_003106	TAGAT	2	10	17052	17061	40 %	40 %	20 %	0 %	15920182
12	NC_003106	AACTT	2	10	17892	17901	40 %	40 %	0 %	20 %	15920183
13	NC_003106	GTTAA	2	10	18384	18393	40 %	40 %	20 %	0 %	15920183
14	NC_003106	GAAAG	2	10	19699	19708	60 %	0 %	40 %	0 %	15920185
15	NC_003106	AAAGG	2	10	21055	21064	60 %	0 %	40 %	0 %	15920186
16	NC_003106	AGGAA	2	10	21795	21804	60 %	0 %	40 %	0 %	15920188
17	NC_003106	GTTTA	2	10	22415	22424	20 %	60 %	20 %	0 %	15920190
18	NC_003106	TTCTA	2	10	23368	23377	20 %	60 %	0 %	20 %	15920190
19	NC_003106	TTATC	2	10	39961	39970	20 %	60 %	0 %	20 %	15920198
20	NC_003106	AAGCG	2	10	40085	40094	40 %	0 %	40 %	20 %	15920198
21	NC_003106	TGTTA	2	10	41854	41863	20 %	60 %	20 %	0 %	15920200
22	NC_003106	TATGT	2	10	42412	42421	20 %	60 %	20 %	0 %	15920201
23	NC_003106	TAAAA	2	10	44277	44286	80 %	20 %	0 %	0 %	15920203
24	NC_003106	TTATA	2	10	47173	47182	40 %	60 %	0 %	0 %	15920206
25	NC_003106	ACTTA	2	10	47391	47400	40 %	40 %	0 %	20 %	15920206
26	NC_003106	CTAAG	2	10	52477	52486	40 %	20 %	20 %	20 %	15920211
27	NC_003106	ATCCT	2	10	56493	56502	20 %	40 %	0 %	40 %	15920215
28	NC_003106	TCCTC	2	10	57114	57123	0 %	40 %	0 %	60 %	15920217
29	NC_003106	ATTTC	2	10	59879	59888	20 %	60 %	0 %	20 %	15920221
30	NC_003106	ATAGT	2	10	61984	61993	40 %	40 %	20 %	0 %	15920223
31	NC_003106	GGGTA	2	10	62166	62175	20 %	20 %	60 %	0 %	15920223
32	NC_003106	TCCTT	2	10	62483	62492	0 %	60 %	0 %	40 %	15920223
33	NC_003106	TTTCT	2	10	65311	65320	0 %	80 %	0 %	20 %	15920225
34	NC_003106	ACCTA	2	10	66633	66642	40 %	20 %	0 %	40 %	15920227
35	NC_003106	GTTCT	2	10	67941	67950	0 %	60 %	20 %	20 %	15920228
36	NC_003106	CTTTC	2	10	68576	68585	0 %	60 %	0 %	40 %	15920229
37	NC_003106	ACCTC	2	10	69139	69148	20 %	20 %	0 %	60 %	15920229
38	NC_003106	GTCCG	2	10	73216	73225	0 %	20 %	40 %	40 %	15920233
39	NC_003106	GGGAT	2	10	73883	73892	20 %	20 %	60 %	0 %	15920233
40	NC_003106	ATAAA	2	10	74479	74488	80 %	20 %	0 %	0 %	15920234
41	NC_003106	AAGGT	2	10	81252	81261	40 %	20 %	40 %	0 %	15920240
42	NC_003106	ATAAA	2	10	86970	86979	80 %	20 %	0 %	0 %	15920244
43	NC_003106	AATTA	2	10	89445	89454	60 %	40 %	0 %	0 %	15920246
44	NC_003106	GGAAG	2	10	92975	92984	40 %	0 %	60 %	0 %	15920248
45	NC_003106	TGATA	2	10	93009	93018	40 %	40 %	20 %	0 %	15920248
46	NC_003106	AAGGG	2	10	93718	93727	40 %	0 %	60 %	0 %	15920249
47	NC_003106	AACGA	2	10	94171	94180	60 %	0 %	20 %	20 %	15920250
48	NC_003106	GTAAA	2	10	96119	96128	60 %	20 %	20 %	0 %	15920252
49	NC_003106	GAAAA	2	10	97885	97894	80 %	0 %	20 %	0 %	15920254
50	NC_003106	AAAGT	2	10	98080	98089	60 %	20 %	20 %	0 %	15920254
51	NC_003106	AGTTA	2	10	98438	98447	40 %	40 %	20 %	0 %	15920254
52	NC_003106	AGATA	2	10	98562	98571	60 %	20 %	20 %	0 %	15920254
53	NC_003106	GCATG	2	10	102581	102590	20 %	20 %	40 %	20 %	15920258
54	NC_003106	ATTGT	2	10	103842	103851	20 %	60 %	20 %	0 %	15920260
55	NC_003106	AATTA	2	10	103899	103908	60 %	40 %	0 %	0 %	15920260
56	NC_003106	AATTA	2	10	105138	105147	60 %	40 %	0 %	0 %	15920260
57	NC_003106	GGAAT	2	10	107667	107676	40 %	20 %	40 %	0 %	15920263
58	NC_003106	CAATT	2	10	110970	110979	40 %	40 %	0 %	20 %	15920267
59	NC_003106	GATGT	2	10	112770	112779	20 %	40 %	40 %	0 %	15920268
60	NC_003106	TGGGA	2	10	112791	112800	20 %	20 %	60 %	0 %	15920268
61	NC_003106	TTACA	2	10	113188	113197	40 %	40 %	0 %	20 %	15920268
62	NC_003106	AAAAT	2	10	113520	113529	80 %	20 %	0 %	0 %	15920269
63	NC_003106	AAGTA	2	10	113713	113722	60 %	20 %	20 %	0 %	15920269
64	NC_003106	TTTTC	2	10	114028	114037	0 %	80 %	0 %	20 %	15920269
65	NC_003106	ATTTT	2	10	117069	117078	20 %	80 %	0 %	0 %	15920271
66	NC_003106	AAGTG	2	10	118275	118284	40 %	20 %	40 %	0 %	15920271
67	NC_003106	TGATA	2	10	119147	119156	40 %	40 %	20 %	0 %	15920272
68	NC_003106	TGCAA	2	10	119441	119450	40 %	20 %	20 %	20 %	15920272
69	NC_003106	GAAAA	3	15	120839	120853	80 %	0 %	20 %	0 %	15920275
70	NC_003106	CATAA	2	10	122403	122412	60 %	20 %	0 %	20 %	15920276
71	NC_003106	CAAGA	2	10	123263	123272	60 %	0 %	20 %	20 %	15920277
72	NC_003106	TCCTT	2	10	124212	124221	0 %	60 %	0 %	40 %	15920278
73	NC_003106	AAGAT	2	10	124824	124833	60 %	20 %	20 %	0 %	15920279
74	NC_003106	ACTAT	2	10	130031	130040	40 %	40 %	0 %	20 %	15920284
75	NC_003106	TTTAG	2	10	130840	130849	20 %	60 %	20 %	0 %	15920286
76	NC_003106	CCATG	2	10	131885	131894	20 %	20 %	20 %	40 %	15920287
77	NC_003106	TAATG	2	10	134062	134071	40 %	40 %	20 %	0 %	15920290
78	NC_003106	GATAA	2	10	135412	135421	60 %	20 %	20 %	0 %	15920293
79	NC_003106	TAAGT	2	10	136802	136811	40 %	40 %	20 %	0 %	15920294
80	NC_003106	ATTAT	2	10	137209	137218	40 %	60 %	0 %	0 %	15920294
81	NC_003106	GTAGA	2	10	137946	137955	40 %	20 %	40 %	0 %	15920295
82	NC_003106	TCTAG	2	10	139127	139136	20 %	40 %	20 %	20 %	15920296
83	NC_003106	ATTTC	2	10	140781	140790	20 %	60 %	0 %	20 %	15920298
84	NC_003106	AAGTA	2	10	141842	141851	60 %	20 %	20 %	0 %	15920300
85	NC_003106	ATCTA	2	10	141866	141875	40 %	40 %	0 %	20 %	15920300
86	NC_003106	TTATT	2	10	141952	141961	20 %	80 %	0 %	0 %	15920300
87	NC_003106	TTTAT	2	10	142185	142194	20 %	80 %	0 %	0 %	15920300
88	NC_003106	GAAAA	2	10	144174	144183	80 %	0 %	20 %	0 %	15920301
89	NC_003106	ATGTT	2	10	144881	144890	20 %	60 %	20 %	0 %	15920301
90	NC_003106	TTACT	2	10	151286	151295	20 %	60 %	0 %	20 %	15920307
91	NC_003106	CATAA	2	10	152252	152261	60 %	20 %	0 %	20 %	15920309
92	NC_003106	AAAAT	2	10	152776	152785	80 %	20 %	0 %	0 %	15920310
93	NC_003106	CCATG	2	10	153734	153743	20 %	20 %	20 %	40 %	15920312
94	NC_003106	AAAAG	2	10	157475	157484	80 %	0 %	20 %	0 %	15920315
95	NC_003106	AGCTG	2	10	160897	160906	20 %	20 %	40 %	20 %	15920318
96	NC_003106	GAAAC	2	10	161809	161818	60 %	0 %	20 %	20 %	15920318
97	NC_003106	CTAGG	2	10	163192	163201	20 %	20 %	40 %	20 %	15920320
98	NC_003106	ATATA	2	10	165599	165608	60 %	40 %	0 %	0 %	15920323
99	NC_003106	TAAGG	2	10	167229	167238	40 %	20 %	40 %	0 %	15920324
100	NC_003106	CTTTT	2	10	167461	167470	0 %	80 %	0 %	20 %	15920324
101	NC_003106	TCTTT	2	10	170310	170319	0 %	80 %	0 %	20 %	15920326
102	NC_003106	AGATA	2	10	171686	171695	60 %	20 %	20 %	0 %	15920327
103	NC_003106	ACTAG	2	10	172034	172043	40 %	20 %	20 %	20 %	15920327
104	NC_003106	TAACC	2	10	172511	172520	40 %	20 %	0 %	40 %	15920328
105	NC_003106	TCTTT	2	10	176823	176832	0 %	80 %	0 %	20 %	15920330
106	NC_003106	AATTA	2	10	177086	177095	60 %	40 %	0 %	0 %	15920330
107	NC_003106	CCAAG	2	10	179217	179226	40 %	0 %	20 %	40 %	15920332
108	NC_003106	GTAAG	2	10	179457	179466	40 %	20 %	40 %	0 %	15920332
109	NC_003106	AATAT	2	10	182022	182031	60 %	40 %	0 %	0 %	15920334
110	NC_003106	TTACC	2	10	189691	189700	20 %	40 %	0 %	40 %	15920340
111	NC_003106	CAAGA	2	10	192094	192103	60 %	0 %	20 %	20 %	15920343
112	NC_003106	TATTT	2	10	193392	193401	20 %	80 %	0 %	0 %	15920345
113	NC_003106	TATTT	2	10	194241	194250	20 %	80 %	0 %	0 %	15920346
114	NC_003106	CAGAA	2	10	195323	195332	60 %	0 %	20 %	20 %	15920347
115	NC_003106	TTTTC	2	10	195600	195609	0 %	80 %	0 %	20 %	161751105
116	NC_003106	AATTG	2	10	196303	196312	40 %	40 %	20 %	0 %	161751105
117	NC_003106	GATTT	2	10	201036	201045	20 %	60 %	20 %	0 %	15920355
118	NC_003106	GTTGA	2	10	202415	202424	20 %	40 %	40 %	0 %	15920357
119	NC_003106	CTATT	2	10	203747	203756	20 %	60 %	0 %	20 %	15920358
120	NC_003106	AGTAC	2	10	203928	203937	40 %	20 %	20 %	20 %	15920359
121	NC_003106	AAAAT	2	10	203993	204002	80 %	20 %	0 %	0 %	15920359
122	NC_003106	ACAAA	2	10	205360	205369	80 %	0 %	0 %	20 %	15920360
123	NC_003106	ACAAA	2	10	205904	205913	80 %	0 %	0 %	20 %	15920360
124	NC_003106	CAAAA	2	10	206585	206594	80 %	0 %	0 %	20 %	15920361
125	NC_003106	TTAAA	2	10	206869	206878	60 %	40 %	0 %	0 %	15920361
126	NC_003106	ATAGC	2	10	207370	207379	40 %	20 %	20 %	20 %	15920362
127	NC_003106	AAGAG	2	10	210215	210224	60 %	0 %	40 %	0 %	15920364
128	NC_003106	AAGAA	2	10	210440	210449	80 %	0 %	20 %	0 %	15920364
129	NC_003106	ACCAT	2	10	218439	218448	40 %	20 %	0 %	40 %	161751104
130	NC_003106	AAATA	2	10	219134	219143	80 %	20 %	0 %	0 %	15920375
131	NC_003106	TAAAA	2	10	220962	220971	80 %	20 %	0 %	0 %	15920376
132	NC_003106	AATTA	2	10	223439	223448	60 %	40 %	0 %	0 %	15920380
133	NC_003106	CTTAA	2	10	223545	223554	40 %	40 %	0 %	20 %	15920380
134	NC_003106	TTTAT	2	10	225151	225160	20 %	80 %	0 %	0 %	15920382
135	NC_003106	TTTTC	2	10	225638	225647	0 %	80 %	0 %	20 %	15920382
136	NC_003106	CTTTT	2	10	226205	226214	0 %	80 %	0 %	20 %	15920382
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