MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 53990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003106	CCA	2	6	100141	100146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920256
1502	NC_003106	ATA	2	6	100150	100155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920256
1503	NC_003106	TTA	2	6	100216	100221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920256
1504	NC_003106	TCT	2	6	100236	100241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920256
1505	NC_003106	TTGA	2	8	100324	100331	25 %	50 %	25 %	0 %	15920256
1506	NC_003106	TAG	2	6	100332	100337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920256
1507	NC_003106	TAG	2	6	100371	100376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920256
1508	NC_003106	CTA	2	6	100379	100384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920256
1509	NC_003106	ACT	2	6	100402	100407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920256
1510	NC_003106	TTC	2	6	100448	100453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920256
1511	NC_003106	TAG	2	6	100472	100477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920256
1512	NC_003106	ACC	2	6	100485	100490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920256
1513	NC_003106	AAC	2	6	100500	100505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920256
1514	NC_003106	TGT	2	6	100574	100579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920256
1515	NC_003106	CTA	2	6	100673	100678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920256
1516	NC_003106	TAT	2	6	100679	100684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920256
1517	NC_003106	ACT	2	6	100715	100720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920256
1518	NC_003106	TTA	2	6	100745	100750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920256
1519	NC_003106	AAGG	2	8	100782	100789	50 %	0 %	50 %	0 %	15920256
1520	NC_003106	AAT	2	6	100809	100814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920256
1521	NC_003106	TTA	2	6	100860	100865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920256
1522	NC_003106	TAG	2	6	100874	100879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920256
1523	NC_003106	CTG	2	6	100919	100924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920256
1524	NC_003106	GAG	2	6	100975	100980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920256
1525	NC_003106	AAG	2	6	101013	101018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920256
1526	NC_003106	TAT	2	6	101038	101043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920256
1527	NC_003106	TGA	2	6	101112	101117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920256
1528	NC_003106	TAGA	2	8	101138	101145	50 %	25 %	25 %	0 %	15920256
1529	NC_003106	GA	3	6	101144	101149	50 %	0 %	50 %	0 %	15920256
1530	NC_003106	GTG	3	9	101165	101173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920256
1531	NC_003106	GTAG	2	8	101242	101249	25 %	25 %	50 %	0 %	15920256
1532	NC_003106	GAA	3	9	101311	101319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920256
1533	NC_003106	CTT	2	6	101328	101333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920256
1534	NC_003106	GTG	2	6	101367	101372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920256
1535	NC_003106	CAAT	2	8	101398	101405	50 %	25 %	0 %	25 %	15920256
1536	NC_003106	CAA	2	6	101417	101422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920256
1537	NC_003106	A	7	7	101434	101440	100 %	0 %	0 %	0 %	15920256
1538	NC_003106	TAA	2	6	101457	101462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920256
1539	NC_003106	AGA	2	6	101582	101587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920258
1540	NC_003106	TGT	2	6	101621	101626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920258
1541	NC_003106	GAA	2	6	101652	101657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920258
1542	NC_003106	CAG	2	6	101662	101667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920258
1543	NC_003106	TTG	2	6	101668	101673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920258
1544	NC_003106	GCA	2	6	101742	101747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920258
1545	NC_003106	GTT	2	6	101841	101846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920258
1546	NC_003106	ATT	2	6	101869	101874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920258
1547	NC_003106	TAT	2	6	101913	101918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920258
1548	NC_003106	AGA	3	9	101960	101968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920258
1549	NC_003106	CCA	2	6	101993	101998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920258
1550	NC_003106	ATT	2	6	102089	102094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920258
1551	NC_003106	GCC	2	6	102120	102125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15920258
1552	NC_003106	GAA	2	6	102144	102149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920258
1553	NC_003106	TAAG	2	8	102220	102227	50 %	25 %	25 %	0 %	15920258
1554	NC_003106	GCT	2	6	102252	102257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920258
1555	NC_003106	AGC	2	6	102263	102268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920258
1556	NC_003106	CAA	2	6	102270	102275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920258
1557	NC_003106	TGA	2	6	102302	102307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920258
1558	NC_003106	T	6	6	102318	102323	0 %	100 %	0 %	0 %	15920258
1559	NC_003106	AAT	2	6	102362	102367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920258
1560	NC_003106	AGA	2	6	102422	102427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920258
1561	NC_003106	TGG	2	6	102467	102472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920258
1562	NC_003106	GCATG	2	10	102581	102590	20 %	20 %	40 %	20 %	15920258
1563	NC_003106	CA	3	6	102598	102603	50 %	0 %	0 %	50 %	15920258
1564	NC_003106	GGA	2	6	102609	102614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920258
1565	NC_003106	AGG	2	6	102651	102656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920258
1566	NC_003106	CAT	3	9	102658	102666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920258
1567	NC_003106	ATG	2	6	102675	102680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920259
1568	NC_003106	ACA	3	9	102694	102702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920259
1569	NC_003106	AATT	2	8	102711	102718	50 %	50 %	0 %	0 %	15920259
1570	NC_003106	GTT	2	6	102734	102739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920259
1571	NC_003106	ATT	2	6	102758	102763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920259
1572	NC_003106	AAG	2	6	102833	102838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920259
1573	NC_003106	AAG	2	6	102864	102869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920259
1574	NC_003106	CAA	2	6	102882	102887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920259
1575	NC_003106	GTA	2	6	102891	102896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920259
1576	NC_003106	TAT	2	6	103003	103008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920259
1577	NC_003106	TTG	2	6	103050	103055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920259
1578	NC_003106	AAG	2	6	103107	103112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920259
1579	NC_003106	CTTA	2	8	103169	103176	25 %	50 %	0 %	25 %	15920259
1580	NC_003106	ATA	2	6	103192	103197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920259
1581	NC_003106	ATA	2	6	103640	103645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920260
1582	NC_003106	TA	3	6	103648	103653	50 %	50 %	0 %	0 %	15920260
1583	NC_003106	AT	3	6	103658	103663	50 %	50 %	0 %	0 %	15920260
1584	NC_003106	TAG	2	6	103709	103714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920260
1585	NC_003106	GTA	2	6	103742	103747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920260
1586	NC_003106	AAGA	2	8	103803	103810	75 %	0 %	25 %	0 %	15920260
1587	NC_003106	ATTGT	2	10	103842	103851	20 %	60 %	20 %	0 %	15920260
1588	NC_003106	ATA	2	6	103865	103870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920260
1589	NC_003106	AATTA	2	10	103899	103908	60 %	40 %	0 %	0 %	15920260
1590	NC_003106	TGA	2	6	103950	103955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920260
1591	NC_003106	TA	3	6	103973	103978	50 %	50 %	0 %	0 %	15920260
1592	NC_003106	CCA	2	6	104071	104076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15920260
1593	NC_003106	AGT	2	6	104079	104084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920260
1594	NC_003106	CTC	2	6	104112	104117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920260
1595	NC_003106	AGA	2	6	104225	104230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920260
1596	NC_003106	ATA	2	6	104233	104238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920260
1597	NC_003106	CTA	2	6	104272	104277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920260
1598	NC_003106	AAGCTA	2	12	104297	104308	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15920260
1599	NC_003106	TG	3	6	104337	104342	0 %	50 %	50 %	0 %	15920260
1600	NC_003106	GTTG	2	8	104356	104363	0 %	50 %	50 %	0 %	15920260
1601	NC_003106	AGGA	2	8	104385	104392	50 %	0 %	50 %	0 %	15920260
1602	NC_003106	GAA	2	6	104545	104550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920260
1603	NC_003106	AAG	2	6	104568	104573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920260
1604	NC_003106	AG	3	6	104587	104592	50 %	0 %	50 %	0 %	15920260
1605	NC_003106	GAA	2	6	104644	104649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920260
1606	NC_003106	TTAT	2	8	104652	104659	25 %	75 %	0 %	0 %	15920260
1607	NC_003106	CTAG	2	8	104668	104675	25 %	25 %	25 %	25 %	15920260
1608	NC_003106	TAA	2	6	104691	104696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920260
1609	NC_003106	ATA	2	6	104825	104830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920260
1610	NC_003106	AG	3	6	104867	104872	50 %	0 %	50 %	0 %	15920260
1611	NC_003106	AAG	2	6	104875	104880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920260
1612	NC_003106	TGC	2	6	104973	104978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920260
1613	NC_003106	GCT	2	6	104986	104991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920260
1614	NC_003106	TA	3	6	105001	105006	50 %	50 %	0 %	0 %	15920260
1615	NC_003106	GGA	2	6	105021	105026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920260
1616	NC_003106	TTA	2	6	105035	105040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920260
1617	NC_003106	AATTA	2	10	105138	105147	60 %	40 %	0 %	0 %	15920260
1618	NC_003106	TAA	2	6	105254	105259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920260
1619	NC_003106	AAT	2	6	105310	105315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920260
1620	NC_003106	ATT	2	6	105350	105355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920260
1621	NC_003106	TGA	2	6	105375	105380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920260
1622	NC_003106	GAA	2	6	105400	105405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920260
1623	NC_003106	GAT	2	6	105453	105458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920260
1624	NC_003106	TA	3	6	105491	105496	50 %	50 %	0 %	0 %	15920260
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2000	NC_003106	TGC	2	6	124453	124458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920278

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