MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 53990

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003106	GAT	2	6	41971	41976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920200
502	NC_003106	AAG	2	6	41995	42000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920200
503	NC_003106	ATA	2	6	42042	42047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920200
504	NC_003106	TGT	2	6	42142	42147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920201
505	NC_003106	CT	3	6	42184	42189	0 %	50 %	0 %	50 %	15920201
506	NC_003106	AT	3	6	42199	42204	50 %	50 %	0 %	0 %	15920201
507	NC_003106	AGA	2	6	42289	42294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920201
508	NC_003106	TTG	2	6	42390	42395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920201
509	NC_003106	TATGT	2	10	42412	42421	20 %	60 %	20 %	0 %	15920201
510	NC_003106	AAG	2	6	42449	42454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920201
511	NC_003106	AT	3	6	42457	42462	50 %	50 %	0 %	0 %	15920201
512	NC_003106	GGT	2	6	42548	42553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920201
513	NC_003106	TTTC	2	8	42568	42575	0 %	75 %	0 %	25 %	15920202
514	NC_003106	AAT	2	6	42609	42614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920202
515	NC_003106	AAG	2	6	42667	42672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920202
516	NC_003106	GAT	2	6	42716	42721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920202
517	NC_003106	GAG	2	6	42780	42785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920202
518	NC_003106	G	6	6	42814	42819	0 %	0 %	100 %	0 %	15920202
519	NC_003106	TTG	2	6	42898	42903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920202
520	NC_003106	CTA	2	6	43036	43041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920202
521	NC_003106	GATA	2	8	43049	43056	50 %	25 %	25 %	0 %	15920202
522	NC_003106	AAGA	2	8	43194	43201	75 %	0 %	25 %	0 %	15920202
523	NC_003106	TAG	2	6	43400	43405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920202
524	NC_003106	AGAT	2	8	43414	43421	50 %	25 %	25 %	0 %	15920202
525	NC_003106	TCA	2	6	43528	43533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920203
526	NC_003106	CAG	2	6	43566	43571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920203
527	NC_003106	CTA	2	6	43602	43607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920203
528	NC_003106	ATT	2	6	43702	43707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920203
529	NC_003106	CAT	2	6	43756	43761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920203
530	NC_003106	AGTT	2	8	43774	43781	25 %	50 %	25 %	0 %	15920203
531	NC_003106	A	7	7	43788	43794	100 %	0 %	0 %	0 %	15920203
532	NC_003106	GA	3	6	43816	43821	50 %	0 %	50 %	0 %	15920203
533	NC_003106	AGA	2	6	43903	43908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920203
534	NC_003106	TC	3	6	43935	43940	0 %	50 %	0 %	50 %	15920203
535	NC_003106	GTA	2	6	43944	43949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920203
536	NC_003106	GTT	2	6	43982	43987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920203
537	NC_003106	GAG	2	6	43994	43999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920203
538	NC_003106	GAG	3	9	44003	44011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920203
539	NC_003106	CAA	2	6	44019	44024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920203
540	NC_003106	CAA	2	6	44039	44044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920203
541	NC_003106	CTAA	2	8	44105	44112	50 %	25 %	0 %	25 %	15920203
542	NC_003106	TGA	2	6	44119	44124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920203
543	NC_003106	AAGA	2	8	44189	44196	75 %	0 %	25 %	0 %	15920203
544	NC_003106	TGT	2	6	44242	44247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920203
545	NC_003106	AGG	2	6	44256	44261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920203
546	NC_003106	TAAAA	2	10	44277	44286	80 %	20 %	0 %	0 %	15920203
547	NC_003106	TCC	2	6	44289	44294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15920204
548	NC_003106	CTAG	2	8	44305	44312	25 %	25 %	25 %	25 %	15920204
549	NC_003106	TTA	2	6	44321	44326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920204
550	NC_003106	TAA	2	6	44400	44405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920204
551	NC_003106	GA	3	6	44409	44414	50 %	0 %	50 %	0 %	15920204
552	NC_003106	TTA	2	6	44447	44452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920204
553	NC_003106	ATT	2	6	44524	44529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920204
554	NC_003106	AGA	2	6	44550	44555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920204
555	NC_003106	ATT	2	6	44574	44579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920204
556	NC_003106	T	6	6	44578	44583	0 %	100 %	0 %	0 %	15920204
557	NC_003106	GA	3	6	44602	44607	50 %	0 %	50 %	0 %	15920204
558	NC_003106	TGG	2	6	44613	44618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920204
559	NC_003106	CTT	2	6	44627	44632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920204
560	NC_003106	AAG	2	6	44665	44670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920204
561	NC_003106	AT	3	6	44718	44723	50 %	50 %	0 %	0 %	15920204
562	NC_003106	ACT	2	6	44750	44755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920204
563	NC_003106	TAA	2	6	44810	44815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920204
564	NC_003106	TAT	2	6	44887	44892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920204
565	NC_003106	TTA	2	6	44915	44920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920204
566	NC_003106	ATA	2	6	44950	44955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920204
567	NC_003106	TTAAAT	2	12	45052	45063	50 %	50 %	0 %	0 %	15920204
568	NC_003106	GTG	2	6	45125	45130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920204
569	NC_003106	GAT	2	6	45184	45189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920204
570	NC_003106	GCAGAA	2	12	45252	45263	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15920204
571	NC_003106	GGA	2	6	45265	45270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15920204
572	NC_003106	GA	3	6	45281	45286	50 %	0 %	50 %	0 %	15920204
573	NC_003106	AAG	2	6	45348	45353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920205
574	NC_003106	ATG	2	6	45367	45372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920205
575	NC_003106	TAC	2	6	45452	45457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920205
576	NC_003106	ACT	2	6	45609	45614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920205
577	NC_003106	T	6	6	45623	45628	0 %	100 %	0 %	0 %	15920205
578	NC_003106	TGA	2	6	45725	45730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920205
579	NC_003106	TGA	2	6	45739	45744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920205
580	NC_003106	TC	3	6	45788	45793	0 %	50 %	0 %	50 %	15920205
581	NC_003106	GTC	2	6	45818	45823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920205
582	NC_003106	GAA	2	6	45846	45851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920205
583	NC_003106	ATT	2	6	45855	45860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920205
584	NC_003106	GGT	2	6	45890	45895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15920205
585	NC_003106	GAA	2	6	45922	45927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920205
586	NC_003106	GAA	2	6	45976	45981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920205
587	NC_003106	AGT	2	6	45992	45997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920205
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591	NC_003106	TGA	2	6	46211	46216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920205
592	NC_003106	TTC	2	6	46265	46270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920205
593	NC_003106	AG	3	6	46315	46320	50 %	0 %	50 %	0 %	15920205
594	NC_003106	TA	3	6	46365	46370	50 %	50 %	0 %	0 %	15920205
595	NC_003106	ACG	2	6	46396	46401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920205
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597	NC_003106	AT	3	6	46444	46449	50 %	50 %	0 %	0 %	15920205
598	NC_003106	ATA	2	6	46474	46479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920205
599	NC_003106	A	6	6	46479	46484	100 %	0 %	0 %	0 %	15920205
600	NC_003106	AAT	2	6	46496	46501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920205
601	NC_003106	TAA	2	6	46510	46515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920205
602	NC_003106	CTT	2	6	46539	46544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15920205
603	NC_003106	A	6	6	46555	46560	100 %	0 %	0 %	0 %	15920205
604	NC_003106	GAA	2	6	46583	46588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920205
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608	NC_003106	AAGG	2	8	46724	46731	50 %	0 %	50 %	0 %	15920205
609	NC_003106	ACA	2	6	46732	46737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920205
610	NC_003106	TTG	2	6	46741	46746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15920205
611	NC_003106	CTA	2	6	46768	46773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920205
612	NC_003106	TA	3	6	46806	46811	50 %	50 %	0 %	0 %	15920205
613	NC_003106	GAA	2	6	46869	46874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920205
614	NC_003106	A	6	6	46873	46878	100 %	0 %	0 %	0 %	15920205
615	NC_003106	TAG	2	6	46904	46909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15920205
616	NC_003106	TTA	2	6	46910	46915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920205
617	NC_003106	AAC	2	6	47015	47020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15920206
618	NC_003106	TA	3	6	47027	47032	50 %	50 %	0 %	0 %	15920206
619	NC_003106	GA	3	6	47058	47063	50 %	0 %	50 %	0 %	15920206
620	NC_003106	A	7	7	47128	47134	100 %	0 %	0 %	0 %	15920206
621	NC_003106	TTATA	2	10	47173	47182	40 %	60 %	0 %	0 %	15920206
622	NC_003106	AGC	2	6	47236	47241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15920206
623	NC_003106	TCA	3	9	47248	47256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15920206
624	NC_003106	AG	4	8	47266	47273	50 %	0 %	50 %	0 %	15920206
625	NC_003106	AAT	2	6	47291	47296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920206
626	NC_003106	GAA	2	6	47330	47335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15920206
627	NC_003106	ACTTA	2	10	47391	47400	40 %	40 %	0 %	20 %	15920206
628	NC_003106	AAAC	2	8	47437	47444	75 %	0 %	0 %	25 %	15920206
629	NC_003106	TAT	2	6	47459	47464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15920206
630	NC_003106	TAA	2	6	47550	47555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920206
631	NC_003106	CTG	2	6	47606	47611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15920207
632	NC_003106	AAT	2	6	47622	47627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15920207
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758	NC_003106	CT	3	6	59087	59092	0 %	50 %	0 %	50 %	15920219
759	NC_003106	CCTT	2	8	59095	59102	0 %	50 %	0 %	50 %	15920219
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