MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 33816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003098	CTG	2	6	239977	239982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902288
4002	NC_003098	CGT	2	6	240047	240052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902288
4003	NC_003098	GAA	2	6	240055	240060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902288
4004	NC_003098	ATA	2	6	240090	240095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902288
4005	NC_003098	TG	3	6	240299	240304	0 %	50 %	50 %	0 %	15902289
4006	NC_003098	TTG	2	6	240308	240313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902289
4007	NC_003098	GTT	2	6	240316	240321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902289
4008	NC_003098	AAC	2	6	240486	240491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902289
4009	NC_003098	AGA	2	6	240621	240626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902289
4010	NC_003098	CAC	2	6	240640	240645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902289
4011	NC_003098	GAA	2	6	240700	240705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902289
4012	NC_003098	TC	3	6	240711	240716	0 %	50 %	0 %	50 %	15902289
4013	NC_003098	A	6	6	240733	240738	100 %	0 %	0 %	0 %	15902289
4014	NC_003098	TGCCTT	2	12	240765	240776	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15902289
4015	NC_003098	GCTATG	2	12	240874	240885	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15902289
4016	NC_003098	ACCA	2	8	240895	240902	50 %	0 %	0 %	50 %	15902289
4017	NC_003098	ATG	2	6	240968	240973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902289
4018	NC_003098	GCTA	2	8	240991	240998	25 %	25 %	25 %	25 %	15902289
4019	NC_003098	ACTTG	2	10	241008	241017	20 %	40 %	20 %	20 %	15902289
4020	NC_003098	TAC	2	6	241045	241050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902289
4021	NC_003098	TGA	2	6	241065	241070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902289
4022	NC_003098	CAAC	2	8	241072	241079	50 %	0 %	0 %	50 %	15902289
4023	NC_003098	GAT	2	6	241111	241116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902289
4024	NC_003098	AGT	2	6	241125	241130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902289
4025	NC_003098	GAA	2	6	241234	241239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902289
4026	NC_003098	CATCT	2	10	241266	241275	20 %	40 %	0 %	40 %	15902289
4027	NC_003098	GTC	2	6	241355	241360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902289
4028	NC_003098	CCTT	2	8	241526	241533	0 %	50 %	0 %	50 %	15902289
4029	NC_003098	AGAA	2	8	241637	241644	75 %	0 %	25 %	0 %	15902289
4030	NC_003098	CTT	2	6	241669	241674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902289
4031	NC_003098	AAC	2	6	241677	241682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902289
4032	NC_003098	TAC	2	6	241717	241722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902289
4033	NC_003098	TTGA	2	8	241816	241823	25 %	50 %	25 %	0 %	15902289
4034	NC_003098	CT	3	6	241844	241849	0 %	50 %	0 %	50 %	15902289
4035	NC_003098	GTG	2	6	241907	241912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902289
4036	NC_003098	AGA	2	6	241932	241937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902289
4037	NC_003098	CGA	2	6	241956	241961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902289
4038	NC_003098	TGG	2	6	242316	242321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902290
4039	NC_003098	GCTG	2	8	242332	242339	0 %	25 %	50 %	25 %	15902290
4040	NC_003098	GGTT	2	8	242344	242351	0 %	50 %	50 %	0 %	15902290
4041	NC_003098	CT	3	6	242617	242622	0 %	50 %	0 %	50 %	15902290
4042	NC_003098	TGA	2	6	242626	242631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902290
4043	NC_003098	AAG	2	6	242712	242717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902290
4044	NC_003098	GGT	2	6	242765	242770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902290
4045	NC_003098	TAT	2	6	242824	242829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902290
4046	NC_003098	TGG	2	6	242830	242835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902290
4047	NC_003098	GAAGC	2	10	242883	242892	40 %	0 %	40 %	20 %	15902290
4048	NC_003098	ATT	2	6	242973	242978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902290
4049	NC_003098	GTG	2	6	242996	243001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902290
4050	NC_003098	TGTT	2	8	243084	243091	0 %	75 %	25 %	0 %	15902290
4051	NC_003098	TAA	2	6	243272	243277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902290
4052	NC_003098	TAGTT	2	10	243370	243379	20 %	60 %	20 %	0 %	15902291
4053	NC_003098	T	6	6	243383	243388	0 %	100 %	0 %	0 %	15902291
4054	NC_003098	T	6	6	243390	243395	0 %	100 %	0 %	0 %	15902291
4055	NC_003098	AGG	2	6	243423	243428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902291
4056	NC_003098	GTTT	2	8	243448	243455	0 %	75 %	25 %	0 %	15902291
4057	NC_003098	CTT	2	6	243553	243558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902291
4058	NC_003098	GAT	2	6	243564	243569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902291
4059	NC_003098	CTT	2	6	243577	243582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902291
4060	NC_003098	GTT	2	6	243589	243594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902291
4061	NC_003098	TAG	2	6	243661	243666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902291
4062	NC_003098	TCT	2	6	243732	243737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902291
4063	NC_003098	GA	3	6	243766	243771	50 %	0 %	50 %	0 %	15902291
4064	NC_003098	GAA	2	6	243775	243780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902291
4065	NC_003098	AAATT	2	10	243918	243927	60 %	40 %	0 %	0 %	15902291
4066	NC_003098	TGA	2	6	244042	244047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902291
4067	NC_003098	TTG	2	6	244194	244199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902291
4068	NC_003098	CAA	2	6	244271	244276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902291
4069	NC_003098	TTTG	2	8	244283	244290	0 %	75 %	25 %	0 %	15902291
4070	NC_003098	ACG	2	6	244421	244426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902291
4071	NC_003098	CTTG	2	8	244451	244458	0 %	50 %	25 %	25 %	15902291
4072	NC_003098	T	6	6	244463	244468	0 %	100 %	0 %	0 %	15902291
4073	NC_003098	ATG	2	6	244482	244487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902291
4074	NC_003098	GCT	2	6	244512	244517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902291
4075	NC_003098	AGTT	2	8	244555	244562	25 %	50 %	25 %	0 %	15902291
4076	NC_003098	GTT	2	6	244658	244663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902291
4077	NC_003098	CAG	2	6	244720	244725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902291
4078	NC_003098	TAG	2	6	244729	244734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902291
4079	NC_003098	TCA	2	6	244743	244748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902291
4080	NC_003098	ATG	2	6	244779	244784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902291
4081	NC_003098	CTT	2	6	244819	244824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902291
4082	NC_003098	GCG	2	6	244833	244838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15902291
4083	NC_003098	CAT	2	6	244850	244855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902291
4084	NC_003098	ATCC	2	8	244867	244874	25 %	25 %	0 %	50 %	15902291
4085	NC_003098	TGG	2	6	244932	244937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902291
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4088	NC_003098	GTA	2	6	245000	245005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902291
4089	NC_003098	TG	3	6	245042	245047	0 %	50 %	50 %	0 %	15902291
4090	NC_003098	TGA	2	6	245098	245103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902291
4091	NC_003098	AGT	2	6	245173	245178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902291
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4094	NC_003098	AAGAC	2	10	245269	245278	60 %	0 %	20 %	20 %	15902291
4095	NC_003098	TGAAG	2	10	245390	245399	40 %	20 %	40 %	0 %	15902291
4096	NC_003098	AAGTC	2	10	245464	245473	40 %	20 %	20 %	20 %	15902291
4097	NC_003098	GGC	2	6	245504	245509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15902291
4098	NC_003098	TCG	2	6	245544	245549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902291
4099	NC_003098	AGC	2	6	245558	245563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902291
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4102	NC_003098	GTTT	2	8	245679	245686	0 %	75 %	25 %	0 %	15902291
4103	NC_003098	ACT	2	6	245727	245732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902291
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4105	NC_003098	CTT	3	9	245815	245823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902291
4106	NC_003098	CAT	2	6	245845	245850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902291
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4108	NC_003098	T	6	6	246053	246058	0 %	100 %	0 %	0 %	15902291
4109	NC_003098	TCA	2	6	246165	246170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902291
4110	NC_003098	CGT	2	6	246241	246246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902291
4111	NC_003098	TAA	2	6	246269	246274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902291
4112	NC_003098	AG	3	6	246403	246408	50 %	0 %	50 %	0 %	15902291
4113	NC_003098	GTA	2	6	246437	246442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902291
4114	NC_003098	T	6	6	246561	246566	0 %	100 %	0 %	0 %	15902291
4115	NC_003098	TTG	2	6	246576	246581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902291
4116	NC_003098	TCTT	2	8	246648	246655	0 %	75 %	0 %	25 %	15902291
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4119	NC_003098	AGT	2	6	246778	246783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902291
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4122	NC_003098	AGT	2	6	246836	246841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902291
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4124	NC_003098	GAA	2	6	246900	246905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902291
4125	NC_003098	GCT	2	6	246933	246938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902291
4126	NC_003098	GGT	2	6	246962	246967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902291
4127	NC_003098	TGT	2	6	246976	246981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902291
4128	NC_003098	TGGT	2	8	246994	247001	0 %	50 %	50 %	0 %	15902291
4129	NC_003098	TCG	2	6	247008	247013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902291
4130	NC_003098	GCAA	2	8	247038	247045	50 %	0 %	25 %	25 %	15902291
4131	NC_003098	T	7	7	247111	247117	0 %	100 %	0 %	0 %	15902291
4132	NC_003098	A	6	6	247654	247659	100 %	0 %	0 %	0 %	15902292
4133	NC_003098	CAAA	2	8	247663	247670	75 %	0 %	0 %	25 %	15902292
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4137	NC_003098	GTG	2	6	247834	247839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902292
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4139	NC_003098	GTG	2	6	247895	247900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902292
4140	NC_003098	CTG	2	6	248106	248111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902293
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4145	NC_003098	CGT	2	6	248276	248281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902293
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4153	NC_003098	ACA	2	6	248958	248963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902294
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4157	NC_003098	GCAAGA	2	12	249050	249061	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15902294
4158	NC_003098	CTG	2	6	249082	249087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902294
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4161	NC_003098	CAT	2	6	249122	249127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902294
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4163	NC_003098	CGTAT	2	10	249276	249285	20 %	40 %	20 %	20 %	15902294
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4182	NC_003098	CAAGA	2	10	250143	250152	60 %	0 %	20 %	20 %	15902294
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4229	NC_003098	TGA	2	6	252450	252455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902295
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4234	NC_003098	A	6	6	252904	252909	100 %	0 %	0 %	0 %	15902295
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4236	NC_003098	A	6	6	252957	252962	100 %	0 %	0 %	0 %	15902295
4237	NC_003098	GCG	2	6	253120	253125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15902295
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4240	NC_003098	GGA	2	6	253215	253220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902295
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4243	NC_003098	CAC	2	6	253406	253411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902295
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4247	NC_003098	CT	4	8	253829	253836	0 %	50 %	0 %	50 %	15902295
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4495	NC_003098	T	7	7	267420	267426	0 %	100 %	0 %	0 %	15902309
4496	NC_003098	TTG	2	6	267499	267504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902309
4497	NC_003098	GAC	2	6	267519	267524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902309
4498	NC_003098	TCT	2	6	267584	267589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902309
4499	NC_003098	CTTG	2	8	267597	267604	0 %	50 %	25 %	25 %	15902309
4500	NC_003098	ATT	2	6	267637	267642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902309

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