MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 33816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003098	ATG	2	6	209567	209572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902259
3502	NC_003098	ATT	2	6	209614	209619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902259
3503	NC_003098	AGA	2	6	209622	209627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902259
3504	NC_003098	TGA	2	6	209711	209716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902259
3505	NC_003098	AAG	2	6	209717	209722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902259
3506	NC_003098	GAC	2	6	209737	209742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902259
3507	NC_003098	GAT	2	6	209856	209861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902259
3508	NC_003098	GAA	2	6	209893	209898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902259
3509	NC_003098	AAACTC	2	12	209902	209913	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15902259
3510	NC_003098	ATAA	2	8	209939	209946	75 %	25 %	0 %	0 %	15902259
3511	NC_003098	AATC	2	8	210040	210047	50 %	25 %	0 %	25 %	15902260
3512	NC_003098	A	6	6	210091	210096	100 %	0 %	0 %	0 %	15902260
3513	NC_003098	GTG	2	6	210115	210120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902260
3514	NC_003098	TGCA	2	8	210124	210131	25 %	25 %	25 %	25 %	15902260
3515	NC_003098	CGT	2	6	210132	210137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902260
3516	NC_003098	AGC	2	6	210140	210145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902260
3517	NC_003098	CGTA	2	8	210152	210159	25 %	25 %	25 %	25 %	15902260
3518	NC_003098	ATG	2	6	210181	210186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902260
3519	NC_003098	CTA	2	6	210208	210213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902260
3520	NC_003098	CGT	2	6	210300	210305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902260
3521	NC_003098	ATC	2	6	210327	210332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902260
3522	NC_003098	TGT	2	6	210626	210631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161410756
3523	NC_003098	TTG	2	6	210652	210657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161410756
3524	NC_003098	TC	3	6	210706	210711	0 %	50 %	0 %	50 %	161410756
3525	NC_003098	GAT	2	6	210737	210742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161410756
3526	NC_003098	TGT	2	6	210746	210751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161410756
3527	NC_003098	TGA	2	6	210758	210763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161410756
3528	NC_003098	AGG	2	6	210874	210879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161410756
3529	NC_003098	TCA	2	6	210880	210885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902262
3530	NC_003098	GAG	2	6	210924	210929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902262
3531	NC_003098	TGC	2	6	211001	211006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902262
3532	NC_003098	A	6	6	211021	211026	100 %	0 %	0 %	0 %	15902262
3533	NC_003098	GGC	2	6	211037	211042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15902262
3534	NC_003098	TAG	2	6	211048	211053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902262
3535	NC_003098	TGA	2	6	211061	211066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902262
3536	NC_003098	TAA	2	6	211097	211102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902262
3537	NC_003098	TGG	2	6	211217	211222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902262
3538	NC_003098	GAGAT	2	10	211258	211267	40 %	20 %	40 %	0 %	15902262
3539	NC_003098	TCA	2	6	211270	211275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902262
3540	NC_003098	ATTCC	2	10	211276	211285	20 %	40 %	0 %	40 %	15902262
3541	NC_003098	GTCA	2	8	211319	211326	25 %	25 %	25 %	25 %	15902262
3542	NC_003098	GTTG	2	8	211427	211434	0 %	50 %	50 %	0 %	15902262
3543	NC_003098	ATC	2	6	211506	211511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902262
3544	NC_003098	TGGTG	2	10	211532	211541	0 %	40 %	60 %	0 %	15902262
3545	NC_003098	GTA	2	6	211581	211586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902262
3546	NC_003098	TTGG	2	8	211635	211642	0 %	50 %	50 %	0 %	15902262
3547	NC_003098	GA	3	6	211656	211661	50 %	0 %	50 %	0 %	15902262
3548	NC_003098	ACG	2	6	211776	211781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902262
3549	NC_003098	GGT	2	6	211845	211850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902262
3550	NC_003098	TGC	2	6	211895	211900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902262
3551	NC_003098	CT	3	6	211913	211918	0 %	50 %	0 %	50 %	15902262
3552	NC_003098	TCTGT	2	10	211951	211960	0 %	60 %	20 %	20 %	15902262
3553	NC_003098	TGGAT	2	10	211961	211970	20 %	40 %	40 %	0 %	15902262
3554	NC_003098	AGA	2	6	211985	211990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902262
3555	NC_003098	CTG	2	6	211996	212001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902262
3556	NC_003098	AGC	2	6	212030	212035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902262
3557	NC_003098	ACA	2	6	212058	212063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902262
3558	NC_003098	TGG	2	6	212111	212116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902262
3559	NC_003098	TC	3	6	212173	212178	0 %	50 %	0 %	50 %	15902262
3560	NC_003098	TTTTA	2	10	212418	212427	20 %	80 %	0 %	0 %	15902263
3561	NC_003098	TCAT	2	8	212428	212435	25 %	50 %	0 %	25 %	15902263
3562	NC_003098	ATA	2	6	212439	212444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902263
3563	NC_003098	GGA	2	6	212454	212459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902263
3564	NC_003098	CG	3	6	212526	212531	0 %	0 %	50 %	50 %	15902263
3565	NC_003098	CTG	2	6	212557	212562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902263
3566	NC_003098	GC	3	6	212624	212629	0 %	0 %	50 %	50 %	15902263
3567	NC_003098	GAA	2	6	212679	212684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902263
3568	NC_003098	ATG	2	6	212764	212769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902263
3569	NC_003098	ATT	2	6	212787	212792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902263
3570	NC_003098	AAGG	2	8	212913	212920	50 %	0 %	50 %	0 %	15902263
3571	NC_003098	TTG	2	6	212971	212976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902263
3572	NC_003098	GCAT	2	8	213022	213029	25 %	25 %	25 %	25 %	15902263
3573	NC_003098	GAA	2	6	213141	213146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902263
3574	NC_003098	AGG	2	6	213424	213429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902264
3575	NC_003098	AG	3	6	213438	213443	50 %	0 %	50 %	0 %	15902264
3576	NC_003098	ATA	2	6	213484	213489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902264
3577	NC_003098	CAT	2	6	213498	213503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902264
3578	NC_003098	GAC	2	6	213533	213538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902264
3579	NC_003098	CAG	2	6	213554	213559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902264
3580	NC_003098	CTT	2	6	213560	213565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902264
3581	NC_003098	TGT	2	6	213583	213588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902264
3582	NC_003098	GAAG	2	8	213705	213712	50 %	0 %	50 %	0 %	15902264
3583	NC_003098	TAGG	2	8	213810	213817	25 %	25 %	50 %	0 %	15902264
3584	NC_003098	AAC	2	6	213837	213842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902264
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3586	NC_003098	A	6	6	213939	213944	100 %	0 %	0 %	0 %	15902264
3587	NC_003098	AGATAA	2	12	214004	214015	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15902264
3588	NC_003098	T	7	7	214061	214067	0 %	100 %	0 %	0 %	15902264
3589	NC_003098	TGGA	2	8	214077	214084	25 %	25 %	50 %	0 %	15902264
3590	NC_003098	TCC	2	6	214182	214187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902264
3591	NC_003098	TAA	2	6	214196	214201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902264
3592	NC_003098	CAAG	2	8	214289	214296	50 %	0 %	25 %	25 %	15902264
3593	NC_003098	GCT	2	6	214299	214304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902265
3594	NC_003098	AGA	2	6	214320	214325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902265
3595	NC_003098	AAC	2	6	214331	214336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902265
3596	NC_003098	GCT	2	6	214377	214382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902265
3597	NC_003098	TGA	2	6	214531	214536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902265
3598	NC_003098	TTC	2	6	214626	214631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902265
3599	NC_003098	CATA	2	8	214642	214649	50 %	25 %	0 %	25 %	15902265
3600	NC_003098	AGT	2	6	214738	214743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902265
3601	NC_003098	AAAG	2	8	214754	214761	75 %	0 %	25 %	0 %	15902265
3602	NC_003098	TGCT	2	8	214802	214809	0 %	50 %	25 %	25 %	15902265
3603	NC_003098	AAGA	2	8	214853	214860	75 %	0 %	25 %	0 %	15902265
3604	NC_003098	GAA	2	6	214862	214867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902265
3605	NC_003098	AGG	2	6	214870	214875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902265
3606	NC_003098	T	6	6	214892	214897	0 %	100 %	0 %	0 %	15902265
3607	NC_003098	TTC	3	9	215004	215012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902266
3608	NC_003098	TTC	2	6	215022	215027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902266
3609	NC_003098	AAT	2	6	215066	215071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902266
3610	NC_003098	CTC	2	6	215175	215180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902266
3611	NC_003098	ATA	2	6	215269	215274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902266
3612	NC_003098	TTG	2	6	215346	215351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902266
3613	NC_003098	CTT	3	9	215399	215407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902266
3614	NC_003098	GAG	2	6	215520	215525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902266
3615	NC_003098	GTT	3	9	215567	215575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902266
3616	NC_003098	CCA	2	6	215578	215583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902266
3617	NC_003098	TTG	2	6	215641	215646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902266
3618	NC_003098	TTC	2	6	215661	215666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902266
3619	NC_003098	CTT	2	6	215676	215681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902266
3620	NC_003098	ATT	2	6	215781	215786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902266
3621	NC_003098	ATC	2	6	215796	215801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902266
3622	NC_003098	GAA	2	6	215849	215854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902266
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3624	NC_003098	T	7	7	215954	215960	0 %	100 %	0 %	0 %	15902266
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3998	NC_003098	AG	3	6	239659	239664	50 %	0 %	50 %	0 %	15902288
3999	NC_003098	GAA	2	6	239840	239845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902288
4000	NC_003098	GAT	2	6	239873	239878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902288

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