MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 33816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33502	NC_003098	CAT	2	6	2020890	2020895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15904071
33503	NC_003098	TAAA	2	8	2020955	2020962	75 %	25 %	0 %	0 %	15904071
33504	NC_003098	CCA	2	6	2021038	2021043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15904071
33505	NC_003098	CATT	2	8	2021051	2021058	25 %	50 %	0 %	25 %	15904071
33506	NC_003098	TCA	2	6	2021080	2021085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15904071
33507	NC_003098	TCA	2	6	2021386	2021391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15904071
33508	NC_003098	A	6	6	2021394	2021399	100 %	0 %	0 %	0 %	15904071
33509	NC_003098	ATC	2	6	2021436	2021441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15904071
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33512	NC_003098	ACT	2	6	2021515	2021520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15904071
33513	NC_003098	A	6	6	2021528	2021533	100 %	0 %	0 %	0 %	15904071
33514	NC_003098	TCA	2	6	2021593	2021598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15904071
33515	NC_003098	CTC	2	6	2021692	2021697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15904071
33516	NC_003098	TGTT	2	8	2021810	2021817	0 %	75 %	25 %	0 %	15904071
33517	NC_003098	T	6	6	2021824	2021829	0 %	100 %	0 %	0 %	15904071
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33533	NC_003098	TC	3	6	2022418	2022423	0 %	50 %	0 %	50 %	15904073
33534	NC_003098	AAAC	2	8	2022506	2022513	75 %	0 %	0 %	25 %	15904073
33535	NC_003098	CTAT	2	8	2022524	2022531	25 %	50 %	0 %	25 %	15904073
33536	NC_003098	T	6	6	2022531	2022536	0 %	100 %	0 %	0 %	15904073
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33539	NC_003098	TGA	2	6	2022588	2022593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15904073
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33550	NC_003098	A	6	6	2023127	2023132	100 %	0 %	0 %	0 %	15904073
33551	NC_003098	ATTT	2	8	2023145	2023152	25 %	75 %	0 %	0 %	15904073
33552	NC_003098	TA	3	6	2023198	2023203	50 %	50 %	0 %	0 %	15904073
33553	NC_003098	GATG	2	8	2023209	2023216	25 %	25 %	50 %	0 %	15904073
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33600	NC_003098	GAAC	2	8	2025701	2025708	50 %	0 %	25 %	25 %	15904075
33601	NC_003098	GCT	2	6	2025788	2025793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15904075
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33604	NC_003098	TTG	2	6	2026063	2026068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15904075
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33610	NC_003098	TC	3	6	2026603	2026608	0 %	50 %	0 %	50 %	15904076
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33615	NC_003098	TGC	2	6	2026753	2026758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15904076
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.