MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 33816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_003098	AAC	2	6	1995740	1995745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15904042
33002	NC_003098	CT	4	8	1995865	1995872	0 %	50 %	0 %	50 %	15904042
33003	NC_003098	ACCTTG	2	12	1995877	1995888	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15904042
33004	NC_003098	TAT	2	6	1995895	1995900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15904042
33005	NC_003098	CCT	2	6	1996127	1996132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15904043
33006	NC_003098	TGA	2	6	1996145	1996150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15904043
33007	NC_003098	GTT	2	6	1996156	1996161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15904043
33008	NC_003098	TCATC	2	10	1996214	1996223	20 %	40 %	0 %	40 %	15904043
33009	NC_003098	AGGT	2	8	1996270	1996277	25 %	25 %	50 %	0 %	15904043
33010	NC_003098	TTC	2	6	1996503	1996508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15904043
33011	NC_003098	CTGA	2	8	1996529	1996536	25 %	25 %	25 %	25 %	15904043
33012	NC_003098	GATTA	2	10	1996554	1996563	40 %	40 %	20 %	0 %	15904043
33013	NC_003098	GGT	2	6	1996569	1996574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15904043
33014	NC_003098	ATT	2	6	1996699	1996704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15904043
33015	NC_003098	TGTC	2	8	1996729	1996736	0 %	50 %	25 %	25 %	15904044
33016	NC_003098	TCT	2	6	1996740	1996745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15904044
33017	NC_003098	TGA	2	6	1996903	1996908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15904044
33018	NC_003098	CTT	2	6	1996921	1996926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15904044
33019	NC_003098	T	6	6	1996955	1996960	0 %	100 %	0 %	0 %	15904044
33020	NC_003098	CTT	3	9	1996984	1996992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15904044
33021	NC_003098	GTT	2	6	1997012	1997017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15904044
33022	NC_003098	GAT	2	6	1997021	1997026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15904044
33023	NC_003098	TAG	2	6	1997037	1997042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15904044
33024	NC_003098	GTA	2	6	1997123	1997128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15904044
33025	NC_003098	TTGAGT	2	12	1997170	1997181	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15904044
33026	NC_003098	ACCA	2	8	1997288	1997295	50 %	0 %	0 %	50 %	15904044
33027	NC_003098	GA	3	6	1997329	1997334	50 %	0 %	50 %	0 %	15904044
33028	NC_003098	CAA	2	6	1997356	1997361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15904044
33029	NC_003098	AGA	2	6	1997462	1997467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15904044
33030	NC_003098	TCT	2	6	1997472	1997477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15904044
33031	NC_003098	CTT	2	6	1997509	1997514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15904044
33032	NC_003098	TG	3	6	1997549	1997554	0 %	50 %	50 %	0 %	15904044
33033	NC_003098	CTT	2	6	1997591	1997596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15904044
33034	NC_003098	TGT	2	6	1997611	1997616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15904044
33035	NC_003098	TTC	2	6	1997700	1997705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15904044
33036	NC_003098	AAT	3	9	1997826	1997834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15904045
33037	NC_003098	T	6	6	1997862	1997867	0 %	100 %	0 %	0 %	15904045
33038	NC_003098	AGGC	2	8	1997976	1997983	25 %	0 %	50 %	25 %	15904045
33039	NC_003098	GAT	2	6	1998093	1998098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15904045
33040	NC_003098	GTT	3	9	1998106	1998114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15904045
33041	NC_003098	ACC	2	6	1998205	1998210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15904045
33042	NC_003098	GTC	2	6	1998473	1998478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15904045
33043	NC_003098	TCA	2	6	1998500	1998505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15904045
33044	NC_003098	TC	3	6	1998516	1998521	0 %	50 %	0 %	50 %	15904046
33045	NC_003098	ATTT	2	8	1998526	1998533	25 %	75 %	0 %	0 %	15904046
33046	NC_003098	CCT	2	6	1998558	1998563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15904046
33047	NC_003098	CTT	2	6	1998582	1998587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15904046
33048	NC_003098	TCA	2	6	1998605	1998610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15904046
33049	NC_003098	CTT	2	6	1998657	1998662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15904046
33050	NC_003098	TGCT	2	8	1998744	1998751	0 %	50 %	25 %	25 %	15904046
33051	NC_003098	CGT	2	6	1999054	1999059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15904047
33052	NC_003098	AAT	2	6	1999089	1999094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15904047
33053	NC_003098	ATA	2	6	1999150	1999155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15904047
33054	NC_003098	ATA	2	6	1999210	1999215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15904047
33055	NC_003098	ATTTG	2	10	1999258	1999267	20 %	60 %	20 %	0 %	15904047
33056	NC_003098	ATTT	2	8	1999285	1999292	25 %	75 %	0 %	0 %	15904047
33057	NC_003098	TAT	2	6	1999314	1999319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15904047
33058	NC_003098	TGAT	2	8	1999345	1999352	25 %	50 %	25 %	0 %	15904047
33059	NC_003098	GAA	2	6	1999367	1999372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15904047
33060	NC_003098	TA	3	6	1999390	1999395	50 %	50 %	0 %	0 %	15904047
33061	NC_003098	CGA	2	6	1999397	1999402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15904047
33062	NC_003098	TC	3	6	1999473	1999478	0 %	50 %	0 %	50 %	15904047
33063	NC_003098	ATA	2	6	1999483	1999488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15904047
33064	NC_003098	AATC	2	8	1999491	1999498	50 %	25 %	0 %	25 %	15904047
33065	NC_003098	ACTA	2	8	1999507	1999514	50 %	25 %	0 %	25 %	15904047
33066	NC_003098	AAT	2	6	1999548	1999553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15904047
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33069	NC_003098	ATA	2	6	1999711	1999716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15904047
33070	NC_003098	AATC	2	8	1999719	1999726	50 %	25 %	0 %	25 %	15904047
33071	NC_003098	ACTA	2	8	1999735	1999742	50 %	25 %	0 %	25 %	15904047
33072	NC_003098	AAT	2	6	1999776	1999781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15904047
33073	NC_003098	TAT	2	6	1999887	1999892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15904047
33074	NC_003098	CTCAAT	2	12	1999921	1999932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15904047
33075	NC_003098	TCG	2	6	2000007	2000012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15904047
33076	NC_003098	TAT	2	6	2000016	2000021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15904047
33077	NC_003098	CGA	2	6	2000039	2000044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15904047
33078	NC_003098	CATT	2	8	2000057	2000064	25 %	50 %	0 %	25 %	15904047
33079	NC_003098	AAG	2	6	2000127	2000132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15904047
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33084	NC_003098	A	6	6	2000282	2000287	100 %	0 %	0 %	0 %	15904047
33085	NC_003098	TAA	2	6	2000318	2000323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15904047
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33087	NC_003098	AGTA	2	8	2000491	2000498	50 %	25 %	25 %	0 %	15904048
33088	NC_003098	AATA	2	8	2000555	2000562	75 %	25 %	0 %	0 %	15904048
33089	NC_003098	GGAT	2	8	2000564	2000571	25 %	25 %	50 %	0 %	15904048
33090	NC_003098	T	7	7	2000598	2000604	0 %	100 %	0 %	0 %	15904048
33091	NC_003098	TCT	2	6	2000664	2000669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15904048
33092	NC_003098	T	7	7	2000674	2000680	0 %	100 %	0 %	0 %	15904048
33093	NC_003098	CCTC	2	8	2000720	2000727	0 %	25 %	0 %	75 %	15904049
33094	NC_003098	ATA	2	6	2000809	2000814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15904049
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33099	NC_003098	TAG	2	6	2000866	2000871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15904049
33100	NC_003098	GTT	2	6	2000963	2000968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15904049
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33102	NC_003098	ATCAAA	2	12	2001109	2001120	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15904049
33103	NC_003098	ACGAGA	2	12	2001150	2001161	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15904049
33104	NC_003098	ATC	2	6	2001192	2001197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15904049
33105	NC_003098	CTC	2	6	2001252	2001257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15904049
33106	NC_003098	CCA	2	6	2001293	2001298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15904049
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33108	NC_003098	CTG	2	6	2001428	2001433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15904049
33109	NC_003098	GCT	2	6	2001439	2001444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15904049
33110	NC_003098	CTC	3	9	2001456	2001464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15904049
33111	NC_003098	TGT	2	6	2001474	2001479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15904049
33112	NC_003098	GCGA	2	8	2001536	2001543	25 %	0 %	50 %	25 %	15904049
33113	NC_003098	ATCA	2	8	2001621	2001628	50 %	25 %	0 %	25 %	15904049
33114	NC_003098	AAT	2	6	2001648	2001653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15904049
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33117	NC_003098	CAA	2	6	2001740	2001745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15904049
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33119	NC_003098	CCA	2	6	2001814	2001819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15904049
33120	NC_003098	GTT	2	6	2001862	2001867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15904049
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33225	NC_003098	GAT	2	6	2006117	2006122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15904054
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33232	NC_003098	GTG	2	6	2006705	2006710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15904054
33233	NC_003098	CAAA	2	8	2006790	2006797	75 %	0 %	0 %	25 %	15904054
33234	NC_003098	AC	3	6	2006820	2006825	50 %	0 %	0 %	50 %	15904054
33235	NC_003098	CAC	2	6	2006828	2006833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15904054
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33477	NC_003098	ATG	2	6	2019787	2019792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15904070
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