MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 33816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003098	ATA	2	6	61758	61763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902101
1002	NC_003098	TGCT	2	8	61799	61806	0 %	50 %	25 %	25 %	15902101
1003	NC_003098	CCA	2	6	61836	61841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902101
1004	NC_003098	TAG	2	6	61903	61908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902101
1005	NC_003098	CTTT	2	8	61942	61949	0 %	75 %	0 %	25 %	15902101
1006	NC_003098	GTA	2	6	62013	62018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902101
1007	NC_003098	AAG	2	6	62092	62097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902101
1008	NC_003098	CTT	2	6	62138	62143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902101
1009	NC_003098	GTT	2	6	62161	62166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902101
1010	NC_003098	AGCAT	2	10	62227	62236	40 %	20 %	20 %	20 %	15902101
1011	NC_003098	TCG	2	6	62344	62349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902101
1012	NC_003098	ATA	2	6	62371	62376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902101
1013	NC_003098	T	6	6	62379	62384	0 %	100 %	0 %	0 %	15902101
1014	NC_003098	TCA	2	6	62389	62394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902101
1015	NC_003098	CTT	4	12	62603	62614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902101
1016	NC_003098	GTT	2	6	62640	62645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902101
1017	NC_003098	TTG	2	6	62688	62693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902101
1018	NC_003098	GA	3	6	62715	62720	50 %	0 %	50 %	0 %	15902101
1019	NC_003098	CTT	2	6	62738	62743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902101
1020	NC_003098	TGCT	2	8	62802	62809	0 %	50 %	25 %	25 %	15902101
1021	NC_003098	AGC	2	6	62919	62924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902101
1022	NC_003098	TACCA	2	10	62925	62934	40 %	20 %	0 %	40 %	15902101
1023	NC_003098	GAT	2	6	62937	62942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902101
1024	NC_003098	GT	3	6	62984	62989	0 %	50 %	50 %	0 %	15902101
1025	NC_003098	CAT	2	6	63068	63073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902101
1026	NC_003098	TAG	2	6	63105	63110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902101
1027	NC_003098	AGA	2	6	63114	63119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902101
1028	NC_003098	ACC	2	6	63141	63146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902101
1029	NC_003098	GAT	2	6	63162	63167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902101
1030	NC_003098	GTA	2	6	63204	63209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902101
1031	NC_003098	CGT	2	6	63215	63220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902101
1032	NC_003098	CGAG	2	8	63259	63266	25 %	0 %	50 %	25 %	15902101
1033	NC_003098	CAT	2	6	63371	63376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902101
1034	NC_003098	TCA	2	6	63385	63390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902101
1035	NC_003098	AGC	2	6	63429	63434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902101
1036	NC_003098	TTC	2	6	63505	63510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902101
1037	NC_003098	TAA	2	6	63685	63690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902101
1038	NC_003098	CAT	2	6	63788	63793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902101
1039	NC_003098	GAT	2	6	63843	63848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902101
1040	NC_003098	GCA	2	6	63934	63939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902101
1041	NC_003098	TTCCT	2	10	63942	63951	0 %	60 %	0 %	40 %	15902101
1042	NC_003098	T	6	6	63993	63998	0 %	100 %	0 %	0 %	15902101
1043	NC_003098	CTT	2	6	64058	64063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902101
1044	NC_003098	CTT	3	9	64079	64087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902101
1045	NC_003098	TTA	2	6	64093	64098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902101
1046	NC_003098	CAG	2	6	64112	64117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902101
1047	NC_003098	ACC	2	6	64129	64134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902101
1048	NC_003098	AACT	2	8	64157	64164	50 %	25 %	0 %	25 %	15902101
1049	NC_003098	TCT	2	6	64180	64185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902101
1050	NC_003098	GTTTCT	2	12	64222	64233	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15902101
1051	NC_003098	GAT	2	6	64294	64299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902101
1052	NC_003098	ATGG	2	8	64320	64327	25 %	25 %	50 %	0 %	15902101
1053	NC_003098	GGTT	2	8	64330	64337	0 %	50 %	50 %	0 %	15902101
1054	NC_003098	GTA	3	9	64342	64350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902101
1055	NC_003098	GCT	2	6	64411	64416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902101
1056	NC_003098	TGT	2	6	64447	64452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902101
1057	NC_003098	TCT	2	6	64776	64781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902102
1058	NC_003098	GTA	2	6	64817	64822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902102
1059	NC_003098	TTC	2	6	64973	64978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902102
1060	NC_003098	TCA	2	6	64986	64991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902102
1061	NC_003098	TAGA	2	8	65028	65035	50 %	25 %	25 %	0 %	15902102
1062	NC_003098	AT	3	6	65070	65075	50 %	50 %	0 %	0 %	15902102
1063	NC_003098	GTA	2	6	65144	65149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902102
1064	NC_003098	CGC	2	6	65158	65163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15902102
1065	NC_003098	ATC	2	6	65228	65233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902102
1066	NC_003098	TTCCTT	2	12	65302	65313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902102
1067	NC_003098	AAC	2	6	65360	65365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902102
1068	NC_003098	GAT	2	6	65444	65449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902102
1069	NC_003098	T	6	6	65454	65459	0 %	100 %	0 %	0 %	15902102
1070	NC_003098	GAT	2	6	65866	65871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902103
1071	NC_003098	CATT	2	8	65913	65920	25 %	50 %	0 %	25 %	15902103
1072	NC_003098	TCC	2	6	65931	65936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902103
1073	NC_003098	CGTC	2	8	66112	66119	0 %	25 %	25 %	50 %	15902103
1074	NC_003098	AT	3	6	66207	66212	50 %	50 %	0 %	0 %	15902103
1075	NC_003098	CTA	2	6	66228	66233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902103
1076	NC_003098	TTG	2	6	66265	66270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902103
1077	NC_003098	TGG	2	6	66276	66281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902103
1078	NC_003098	ATG	2	6	66292	66297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902103
1079	NC_003098	TGA	2	6	66519	66524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902103
1080	NC_003098	TGGT	2	8	66567	66574	0 %	50 %	50 %	0 %	15902103
1081	NC_003098	GGT	2	6	66679	66684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902103
1082	NC_003098	GAA	2	6	66775	66780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902103
1083	NC_003098	AAG	2	6	66811	66816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902103
1084	NC_003098	ATG	2	6	66817	66822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902103
1085	NC_003098	AG	3	6	66867	66872	50 %	0 %	50 %	0 %	15902103
1086	NC_003098	TTTG	2	8	66912	66919	0 %	75 %	25 %	0 %	15902103
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1091	NC_003098	CAGA	2	8	67114	67121	50 %	0 %	25 %	25 %	15902103
1092	NC_003098	T	6	6	67136	67141	0 %	100 %	0 %	0 %	15902103
1093	NC_003098	AAAG	2	8	67152	67159	75 %	0 %	25 %	0 %	15902103
1094	NC_003098	CT	3	6	67490	67495	0 %	50 %	0 %	50 %	15902103
1095	NC_003098	AAGG	2	8	67522	67529	50 %	0 %	50 %	0 %	15902103
1096	NC_003098	AGA	2	6	67572	67577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902103
1097	NC_003098	GAC	2	6	67728	67733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902104
1098	NC_003098	CAA	2	6	67742	67747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902104
1099	NC_003098	ACC	2	6	67781	67786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902104
1100	NC_003098	TTGGT	2	10	67897	67906	0 %	60 %	40 %	0 %	15902104
1101	NC_003098	GTA	2	6	67992	67997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902104
1102	NC_003098	TTA	2	6	68094	68099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902104
1103	NC_003098	TGG	2	6	68142	68147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902105
1104	NC_003098	TGA	2	6	68189	68194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902105
1105	NC_003098	ACT	2	6	68268	68273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902105
1106	NC_003098	GGT	2	6	68286	68291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902105
1107	NC_003098	GTTC	2	8	68303	68310	0 %	50 %	25 %	25 %	15902105
1108	NC_003098	GGT	2	6	68328	68333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902105
1109	NC_003098	TAC	2	6	68417	68422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902105
1110	NC_003098	AGC	2	6	68438	68443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902105
1111	NC_003098	ACTT	2	8	68451	68458	25 %	50 %	0 %	25 %	15902105
1112	NC_003098	ACT	2	6	68478	68483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902105
1113	NC_003098	CTT	2	6	68486	68491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902105
1114	NC_003098	TGC	2	6	68507	68512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902105
1115	NC_003098	ACT	2	6	68548	68553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902105
1116	NC_003098	TCT	2	6	68596	68601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902105
1117	NC_003098	TGG	2	6	68615	68620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902105
1118	NC_003098	AGT	2	6	68636	68641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902105
1119	NC_003098	TGG	2	6	68825	68830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902105
1120	NC_003098	CTG	2	6	68860	68865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902105
1121	NC_003098	A	6	6	68875	68880	100 %	0 %	0 %	0 %	15902105
1122	NC_003098	AAC	2	6	68892	68897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902105
1123	NC_003098	CTTCA	2	10	68952	68961	20 %	40 %	0 %	40 %	15902105
1124	NC_003098	AGC	2	6	68984	68989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902105
1125	NC_003098	AGA	2	6	69054	69059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902106
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1127	NC_003098	GTT	2	6	69084	69089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902106
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