MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 33816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003098	GGA	2	6	32517	32522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902076
502	NC_003098	ACTT	2	8	32560	32567	25 %	50 %	0 %	25 %	15902076
503	NC_003098	TGA	3	9	32571	32579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902076
504	NC_003098	CTT	2	6	32719	32724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902076
505	NC_003098	AAGA	2	8	32788	32795	75 %	0 %	25 %	0 %	15902076
506	NC_003098	CTTG	2	8	32799	32806	0 %	50 %	25 %	25 %	15902076
507	NC_003098	GCTG	2	8	32862	32869	0 %	25 %	50 %	25 %	15902076
508	NC_003098	GAG	2	6	32872	32877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902076
509	NC_003098	CAG	2	6	32975	32980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902076
510	NC_003098	GGA	2	6	33237	33242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902076
511	NC_003098	TAA	2	6	33474	33479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902076
512	NC_003098	GTG	2	6	33565	33570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902076
513	NC_003098	GCA	2	6	33706	33711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902076
514	NC_003098	GGT	2	6	33760	33765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902076
515	NC_003098	A	6	6	33841	33846	100 %	0 %	0 %	0 %	15902076
516	NC_003098	AAAC	2	8	33853	33860	75 %	0 %	0 %	25 %	15902076
517	NC_003098	GAA	2	6	33865	33870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902076
518	NC_003098	TAAA	2	8	33933	33940	75 %	25 %	0 %	0 %	15902076
519	NC_003098	TGG	2	6	34097	34102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902077
520	NC_003098	GAA	2	6	34117	34122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902077
521	NC_003098	ATC	2	6	34171	34176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902077
522	NC_003098	GGC	2	6	34191	34196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15902077
523	NC_003098	TCG	2	6	34275	34280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902077
524	NC_003098	T	6	6	34334	34339	0 %	100 %	0 %	0 %	15902077
525	NC_003098	TGG	2	6	34389	34394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902077
526	NC_003098	TGA	2	6	34398	34403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902077
527	NC_003098	TGA	2	6	34409	34414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902077
528	NC_003098	AG	3	6	34427	34432	50 %	0 %	50 %	0 %	15902077
529	NC_003098	TTGA	2	8	34444	34451	25 %	50 %	25 %	0 %	15902077
530	NC_003098	GTG	2	6	34686	34691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902078
531	NC_003098	GAT	2	6	34694	34699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902078
532	NC_003098	CAG	2	6	34707	34712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902078
533	NC_003098	AAG	2	6	34721	34726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902078
534	NC_003098	AG	3	6	34811	34816	50 %	0 %	50 %	0 %	15902078
535	NC_003098	ACT	2	6	34838	34843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902078
536	NC_003098	AC	3	6	34846	34851	50 %	0 %	0 %	50 %	15902078
537	NC_003098	AG	3	6	34854	34859	50 %	0 %	50 %	0 %	15902078
538	NC_003098	AGT	2	6	34863	34868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902078
539	NC_003098	GAG	2	6	34874	34879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902078
540	NC_003098	AG	3	6	34878	34883	50 %	0 %	50 %	0 %	15902078
541	NC_003098	TAAAG	2	10	34891	34900	60 %	20 %	20 %	0 %	15902078
542	NC_003098	T	6	6	34919	34924	0 %	100 %	0 %	0 %	15902078
543	NC_003098	TTG	2	6	34949	34954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902078
544	NC_003098	GGC	2	6	35072	35077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15902078
545	NC_003098	GAA	2	6	35192	35197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902078
546	NC_003098	TTCCTT	2	12	35225	35236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902078
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548	NC_003098	CCAA	2	8	35298	35305	50 %	0 %	0 %	50 %	15902078
549	NC_003098	AAT	2	6	35354	35359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902078
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553	NC_003098	GA	3	6	35517	35522	50 %	0 %	50 %	0 %	15902078
554	NC_003098	GC	3	6	35563	35568	0 %	0 %	50 %	50 %	15902078
555	NC_003098	GAA	2	6	35579	35584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902078
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557	NC_003098	AGGC	2	8	35619	35626	25 %	0 %	50 %	25 %	15902078
558	NC_003098	T	6	6	35643	35648	0 %	100 %	0 %	0 %	15902078
559	NC_003098	TAA	2	6	35831	35836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902079
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562	NC_003098	CTA	2	6	35993	35998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902079
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564	NC_003098	TTG	2	6	36226	36231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902079
565	NC_003098	TGT	2	6	36413	36418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902079
566	NC_003098	TGA	2	6	36422	36427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902079
567	NC_003098	GA	3	6	36485	36490	50 %	0 %	50 %	0 %	15902079
568	NC_003098	TAT	3	9	36497	36505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902079
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571	NC_003098	AT	3	6	36695	36700	50 %	50 %	0 %	0 %	15902079
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579	NC_003098	T	6	6	37082	37087	0 %	100 %	0 %	0 %	15902080
580	NC_003098	ATG	2	6	37164	37169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902080
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597	NC_003098	AAC	2	6	38272	38277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902081
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611	NC_003098	TGCT	2	8	39560	39567	0 %	50 %	25 %	25 %	15902084
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615	NC_003098	GAG	2	6	39695	39700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902084
616	NC_003098	TGG	2	6	39736	39741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15902084
617	NC_003098	CTTT	2	8	40252	40259	0 %	75 %	0 %	25 %	15902085
618	NC_003098	T	6	6	40257	40262	0 %	100 %	0 %	0 %	15902085
619	NC_003098	T	6	6	40287	40292	0 %	100 %	0 %	0 %	15902085
620	NC_003098	TGA	2	6	40340	40345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902085
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623	NC_003098	TGT	2	6	40765	40770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902085
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626	NC_003098	TGA	2	6	40943	40948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902085
627	NC_003098	CATCTC	2	12	40983	40994	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15902085
628	NC_003098	AGTTGA	2	12	41102	41113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902086
629	NC_003098	TGA	2	6	41182	41187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902086
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