MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 33816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_003098	CAA	2	6	295483	295488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902338
5003	NC_003098	GTT	2	6	295493	295498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902338
5004	NC_003098	TTG	2	6	295551	295556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902338
5005	NC_003098	GAT	2	6	295637	295642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902338
5006	NC_003098	AAGA	2	8	295659	295666	75 %	0 %	25 %	0 %	15902338
5007	NC_003098	TTG	2	6	295683	295688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902338
5008	NC_003098	CAA	2	6	295720	295725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902338
5009	NC_003098	CTTTG	2	10	295751	295760	0 %	60 %	20 %	20 %	15902338
5010	NC_003098	AGG	2	6	295804	295809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902338
5011	NC_003098	A	6	6	295951	295956	100 %	0 %	0 %	0 %	15902339
5012	NC_003098	GAA	2	6	295996	296001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902339
5013	NC_003098	TTA	2	6	296042	296047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902339
5014	NC_003098	CAA	2	6	296084	296089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902339
5015	NC_003098	AAG	2	6	296204	296209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902339
5016	NC_003098	TTC	2	6	296233	296238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902339
5017	NC_003098	AAC	2	6	296304	296309	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902339
5018	NC_003098	TGAT	2	8	296312	296319	25 %	50 %	25 %	0 %	15902339
5019	NC_003098	TGC	2	6	296430	296435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902339
5020	NC_003098	TAC	2	6	296539	296544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902339
5021	NC_003098	AAAGA	2	10	296551	296560	80 %	0 %	20 %	0 %	15902339
5022	NC_003098	ACA	2	6	296566	296571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902339
5023	NC_003098	ATC	2	6	296596	296601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902339
5024	NC_003098	ACA	2	6	296643	296648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902340
5025	NC_003098	CTT	2	6	296767	296772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902340
5026	NC_003098	TGA	2	6	296783	296788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902340
5027	NC_003098	GTT	2	6	296792	296797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15902340
5028	NC_003098	AGT	2	6	296926	296931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902340
5029	NC_003098	AGA	2	6	296957	296962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902341
5030	NC_003098	AAG	2	6	296963	296968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902341
5031	NC_003098	T	6	6	296973	296978	0 %	100 %	0 %	0 %	15902341
5032	NC_003098	GAT	2	6	297165	297170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902341
5033	NC_003098	TTCT	2	8	297270	297277	0 %	75 %	0 %	25 %	15902341
5034	NC_003098	GATTG	2	10	297282	297291	20 %	40 %	40 %	0 %	15902341
5035	NC_003098	GA	3	6	297299	297304	50 %	0 %	50 %	0 %	15902341
5036	NC_003098	TGA	2	6	297322	297327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902341
5037	NC_003098	ACT	2	6	297371	297376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902341
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5039	NC_003098	CTA	2	6	297467	297472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902341
5040	NC_003098	ACAA	2	8	297509	297516	75 %	0 %	0 %	25 %	15902341
5041	NC_003098	TGCT	2	8	297523	297530	0 %	50 %	25 %	25 %	15902341
5042	NC_003098	AGA	2	6	297563	297568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902341
5043	NC_003098	ATG	2	6	297762	297767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902341
5044	NC_003098	GGAC	2	8	297780	297787	25 %	0 %	50 %	25 %	15902341
5045	NC_003098	CTG	2	6	297841	297846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15902341
5046	NC_003098	CTT	2	6	297867	297872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15902341
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5049	NC_003098	AAAG	2	8	298278	298285	75 %	0 %	25 %	0 %	15902341
5050	NC_003098	CAG	2	6	298321	298326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15902341
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5052	NC_003098	TTGATT	2	12	298504	298515	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15902341
5053	NC_003098	CAT	2	6	298526	298531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902341
5054	NC_003098	AAG	2	6	298556	298561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902341
5055	NC_003098	CAT	2	6	298613	298618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902341
5056	NC_003098	ATC	2	6	298638	298643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902341
5057	NC_003098	CAGA	2	8	298659	298666	50 %	0 %	25 %	25 %	15902341
5058	NC_003098	TTA	2	6	298734	298739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902341
5059	NC_003098	ATAAA	2	10	298816	298825	80 %	20 %	0 %	0 %	15902341
5060	NC_003098	GA	3	6	298827	298832	50 %	0 %	50 %	0 %	15902341
5061	NC_003098	TAA	2	6	298884	298889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902342
5062	NC_003098	TAG	2	6	298894	298899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902342
5063	NC_003098	GAA	2	6	298918	298923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902342
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5068	NC_003098	AG	3	6	299227	299232	50 %	0 %	50 %	0 %	15902342
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5070	NC_003098	ATC	2	6	299321	299326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902342
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5075	NC_003098	A	6	6	299634	299639	100 %	0 %	0 %	0 %	15902342
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5079	NC_003098	TTGA	2	8	299828	299835	25 %	50 %	25 %	0 %	15902342
5080	NC_003098	AAG	2	6	299856	299861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902342
5081	NC_003098	CAA	2	6	299867	299872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15902342
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5089	NC_003098	T	6	6	300594	300599	0 %	100 %	0 %	0 %	15902344
5090	NC_003098	T	6	6	300614	300619	0 %	100 %	0 %	0 %	15902345
5091	NC_003098	TCC	2	6	300628	300633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15902345
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5093	NC_003098	AGATA	2	10	300969	300978	60 %	20 %	20 %	0 %	15902346
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5095	NC_003098	TATT	2	8	301095	301102	25 %	75 %	0 %	0 %	15902346
5096	NC_003098	AGCGTG	2	12	301321	301332	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15902346
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5098	NC_003098	GTGAA	2	10	301504	301513	40 %	20 %	40 %	0 %	15902346
5099	NC_003098	AAG	3	9	301578	301586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902346
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5101	NC_003098	TCCA	2	8	301659	301666	25 %	25 %	0 %	50 %	15902346
5102	NC_003098	AGA	2	6	301727	301732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902346
5103	NC_003098	GAT	2	6	301803	301808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902346
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5105	NC_003098	A	6	6	301956	301961	100 %	0 %	0 %	0 %	15902347
5106	NC_003098	TAC	2	6	301971	301976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902347
5107	NC_003098	TAT	2	6	302059	302064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902347
5108	NC_003098	GAAAA	2	10	302129	302138	80 %	0 %	20 %	0 %	15902347
5109	NC_003098	CAAG	2	8	302155	302162	50 %	0 %	25 %	25 %	15902347
5110	NC_003098	GAAA	2	8	302194	302201	75 %	0 %	25 %	0 %	15902347
5111	NC_003098	TAT	2	6	302352	302357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902348
5112	NC_003098	T	7	7	302376	302382	0 %	100 %	0 %	0 %	15902348
5113	NC_003098	ATT	2	6	302399	302404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15902348
5114	NC_003098	GAAG	2	8	302437	302444	50 %	0 %	50 %	0 %	15902348
5115	NC_003098	AAG	2	6	302447	302452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902348
5116	NC_003098	TCA	2	6	302455	302460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15902348
5117	NC_003098	ACC	2	6	302462	302467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15902348
5118	NC_003098	TGA	2	6	302560	302565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902348
5119	NC_003098	A	6	6	302604	302609	100 %	0 %	0 %	0 %	15902348
5120	NC_003098	GAA	2	6	302657	302662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902348
5121	NC_003098	AG	3	6	302672	302677	50 %	0 %	50 %	0 %	15902348
5122	NC_003098	CAAG	2	8	302698	302705	50 %	0 %	25 %	25 %	15902348
5123	NC_003098	ATG	2	6	302747	302752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902348
5124	NC_003098	A	6	6	302759	302764	100 %	0 %	0 %	0 %	15902348
5125	NC_003098	GATT	2	8	302791	302798	25 %	50 %	25 %	0 %	15902348
5126	NC_003098	AGCTC	2	10	302860	302869	20 %	20 %	20 %	40 %	15902348
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5129	NC_003098	AACG	2	8	303018	303025	50 %	0 %	25 %	25 %	15902348
5130	NC_003098	GATG	2	8	303088	303095	25 %	25 %	50 %	0 %	15902348
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5133	NC_003098	AAG	2	6	303204	303209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902348
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5135	NC_003098	TGA	2	6	303282	303287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902348
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5143	NC_003098	ATA	2	6	303579	303584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15902348
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5159	NC_003098	AGG	2	6	304341	304346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15902348
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5166	NC_003098	TAG	2	6	304727	304732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902349
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5240	NC_003098	GAT	2	6	309263	309268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15902353
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5500	NC_003098	GAA	2	6	322510	322515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15902366

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