MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 36446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_003028	GGT	2	6	242237	242242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900201
4002	NC_003028	TAT	2	6	242296	242301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900201
4003	NC_003028	TGG	2	6	242302	242307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900201
4004	NC_003028	GAAGC	2	10	242355	242364	40 %	0 %	40 %	20 %	15900201
4005	NC_003028	ATT	2	6	242445	242450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900201
4006	NC_003028	GTG	2	6	242468	242473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900201
4007	NC_003028	TGTT	2	8	242556	242563	0 %	75 %	25 %	0 %	15900201
4008	NC_003028	TAA	2	6	242744	242749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900201
4009	NC_003028	TAGTT	2	10	242842	242851	20 %	60 %	20 %	0 %	15900202
4010	NC_003028	T	6	6	242855	242860	0 %	100 %	0 %	0 %	15900202
4011	NC_003028	T	6	6	242862	242867	0 %	100 %	0 %	0 %	15900202
4012	NC_003028	AGG	2	6	242895	242900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15900202
4013	NC_003028	GTTT	2	8	242920	242927	0 %	75 %	25 %	0 %	15900202
4014	NC_003028	CTT	2	6	243025	243030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900202
4015	NC_003028	GAT	2	6	243036	243041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
4016	NC_003028	CTT	2	6	243049	243054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900202
4017	NC_003028	GTT	2	6	243061	243066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900202
4018	NC_003028	TAG	2	6	243133	243138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
4019	NC_003028	TCT	2	6	243231	243236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900202
4020	NC_003028	GA	3	6	243265	243270	50 %	0 %	50 %	0 %	15900202
4021	NC_003028	GAA	2	6	243274	243279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900202
4022	NC_003028	AAATT	2	10	243417	243426	60 %	40 %	0 %	0 %	15900202
4023	NC_003028	TGA	2	6	243541	243546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
4024	NC_003028	TTG	2	6	243693	243698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900202
4025	NC_003028	CAA	2	6	243770	243775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900202
4026	NC_003028	TTTG	2	8	243782	243789	0 %	75 %	25 %	0 %	15900202
4027	NC_003028	ACG	2	6	243920	243925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900202
4028	NC_003028	CTTG	2	8	243950	243957	0 %	50 %	25 %	25 %	15900202
4029	NC_003028	T	6	6	243962	243967	0 %	100 %	0 %	0 %	15900202
4030	NC_003028	ATG	2	6	243981	243986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
4031	NC_003028	AGTT	2	8	244054	244061	25 %	50 %	25 %	0 %	15900202
4032	NC_003028	GTT	2	6	244157	244162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900202
4033	NC_003028	CAG	2	6	244219	244224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900202
4034	NC_003028	TAG	2	6	244228	244233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
4035	NC_003028	TCA	2	6	244242	244247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900202
4036	NC_003028	ATG	2	6	244278	244283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
4037	NC_003028	CTT	2	6	244318	244323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900202
4038	NC_003028	GCG	2	6	244332	244337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15900202
4039	NC_003028	CAT	2	6	244349	244354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900202
4040	NC_003028	TGG	2	6	244431	244436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900202
4041	NC_003028	CCA	3	9	244452	244460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15900202
4042	NC_003028	GTA	2	6	244499	244504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
4043	NC_003028	TG	3	6	244541	244546	0 %	50 %	50 %	0 %	15900202
4044	NC_003028	TGA	2	6	244597	244602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
4045	NC_003028	AGT	2	6	244672	244677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
4046	NC_003028	GTTGCT	2	12	244703	244714	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15900202
4047	NC_003028	AGT	2	6	244762	244767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
4048	NC_003028	AAGAC	2	10	244768	244777	60 %	0 %	20 %	20 %	15900202
4049	NC_003028	AAGTC	2	10	244963	244972	40 %	20 %	20 %	20 %	15900202
4050	NC_003028	GGC	2	6	245003	245008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15900202
4051	NC_003028	TCG	2	6	245043	245048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900202
4052	NC_003028	AGC	2	6	245057	245062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900202
4053	NC_003028	ATA	2	6	245126	245131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900202
4054	NC_003028	GTTT	2	8	245158	245165	0 %	75 %	25 %	0 %	15900202
4055	NC_003028	GTTT	2	8	245178	245185	0 %	75 %	25 %	0 %	15900202
4056	NC_003028	ACT	2	6	245226	245231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900202
4057	NC_003028	ACA	3	9	245256	245264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900202
4058	NC_003028	CTT	3	9	245314	245322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900202
4059	NC_003028	CAT	2	6	245344	245349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900202
4060	NC_003028	TCT	2	6	245547	245552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900202
4061	NC_003028	T	6	6	245552	245557	0 %	100 %	0 %	0 %	15900202
4062	NC_003028	TCA	2	6	245664	245669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900202
4063	NC_003028	CGT	2	6	245740	245745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900202
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4065	NC_003028	AG	3	6	245902	245907	50 %	0 %	50 %	0 %	15900202
4066	NC_003028	GTA	2	6	245936	245941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
4067	NC_003028	T	6	6	246060	246065	0 %	100 %	0 %	0 %	15900202
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4069	NC_003028	TCTT	2	8	246147	246154	0 %	75 %	0 %	25 %	15900202
4070	NC_003028	TTC	2	6	246245	246250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900202
4071	NC_003028	T	6	6	246257	246262	0 %	100 %	0 %	0 %	15900202
4072	NC_003028	AGT	2	6	246277	246282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
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4074	NC_003028	TAG	2	6	246328	246333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
4075	NC_003028	AGT	2	6	246335	246340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900202
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4078	NC_003028	GAA	2	6	246444	246449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900202
4079	NC_003028	GCT	2	6	246477	246482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900202
4080	NC_003028	GGT	2	6	246506	246511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900202
4081	NC_003028	TGT	2	6	246520	246525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900202
4082	NC_003028	TGGT	2	8	246538	246545	0 %	50 %	50 %	0 %	15900202
4083	NC_003028	TCG	2	6	246552	246557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900202
4084	NC_003028	GCAA	2	8	246582	246589	50 %	0 %	25 %	25 %	15900202
4085	NC_003028	T	7	7	246655	246661	0 %	100 %	0 %	0 %	15900202
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4087	NC_003028	CAAG	2	8	246943	246950	50 %	0 %	25 %	25 %	15900203
4088	NC_003028	AAT	2	6	246966	246971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900203
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4090	NC_003028	GAT	2	6	247046	247051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900204
4091	NC_003028	ATC	2	6	247068	247073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900204
4092	NC_003028	A	7	7	247083	247089	100 %	0 %	0 %	0 %	15900204
4093	NC_003028	A	6	6	247198	247203	100 %	0 %	0 %	0 %	15900205
4094	NC_003028	CAAA	2	8	247207	247214	75 %	0 %	0 %	25 %	15900205
4095	NC_003028	CAC	2	6	247223	247228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15900205
4096	NC_003028	GTG	2	6	247235	247240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900205
4097	NC_003028	A	6	6	247270	247275	100 %	0 %	0 %	0 %	15900205
4098	NC_003028	GTG	2	6	247378	247383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900205
4099	NC_003028	CTT	2	6	247384	247389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900205
4100	NC_003028	GTG	2	6	247439	247444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900205
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4102	NC_003028	AAG	2	6	247689	247694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900206
4103	NC_003028	CAT	2	6	247741	247746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900206
4104	NC_003028	CGT	2	6	247769	247774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900206
4105	NC_003028	TGG	2	6	247777	247782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900206
4106	NC_003028	CGT	2	6	247820	247825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900206
4107	NC_003028	ACA	2	6	247826	247831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900206
4108	NC_003028	GTTG	2	8	247842	247849	0 %	50 %	50 %	0 %	15900206
4109	NC_003028	GTG	2	6	247869	247874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900206
4110	NC_003028	AC	3	6	247876	247881	50 %	0 %	0 %	50 %	15900206
4111	NC_003028	TGC	2	6	247915	247920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900206
4112	NC_003028	AAC	2	6	247922	247927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900206
4113	NC_003028	GCA	2	6	247934	247939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900206
4114	NC_003028	A	6	6	248455	248460	100 %	0 %	0 %	0 %	15900207
4115	NC_003028	ACA	2	6	248502	248507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900207
4116	NC_003028	ACT	2	6	248508	248513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900207
4117	NC_003028	TAC	2	6	248526	248531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900207
4118	NC_003028	TGGA	2	8	248586	248593	25 %	25 %	50 %	0 %	15900207
4119	NC_003028	GCAAGA	2	12	248594	248605	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15900207
4120	NC_003028	CTG	2	6	248626	248631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900207
4121	NC_003028	CGA	2	6	248632	248637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900207
4122	NC_003028	AAC	2	6	248649	248654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900207
4123	NC_003028	CAT	2	6	248666	248671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900207
4124	NC_003028	AC	3	6	248674	248679	50 %	0 %	0 %	50 %	15900207
4125	NC_003028	CGTAT	2	10	248820	248829	20 %	40 %	20 %	20 %	15900207
4126	NC_003028	CAA	2	6	248834	248839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900207
4127	NC_003028	CCAAT	2	10	248913	248922	40 %	20 %	0 %	40 %	15900207
4128	NC_003028	GAA	2	6	249018	249023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900207
4129	NC_003028	ATTG	2	8	249071	249078	25 %	50 %	25 %	0 %	15900207
4130	NC_003028	GAA	2	6	249099	249104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900207
4131	NC_003028	TGA	3	9	249106	249114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900207
4132	NC_003028	GAA	2	6	249129	249134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900207
4133	NC_003028	GAA	2	6	249144	249149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900207
4134	NC_003028	TTC	2	6	249189	249194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900207
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4136	NC_003028	GAA	2	6	249321	249326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900207
4137	NC_003028	TGAC	2	8	249379	249386	25 %	25 %	25 %	25 %	15900207
4138	NC_003028	TTC	2	6	249408	249413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900207
4139	NC_003028	TTC	2	6	249430	249435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900207
4140	NC_003028	GCT	2	6	249552	249557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900207
4141	NC_003028	TAC	2	6	249575	249580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900207
4142	NC_003028	ATC	2	6	249615	249620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900207
4143	NC_003028	TCAA	2	8	249627	249634	50 %	25 %	0 %	25 %	15900207
4144	NC_003028	CAAGA	2	10	249687	249696	60 %	0 %	20 %	20 %	15900207
4145	NC_003028	GAA	2	6	249723	249728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900207
4146	NC_003028	AAAC	2	8	249748	249755	75 %	0 %	0 %	25 %	15900207
4147	NC_003028	TTG	2	6	249811	249816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900207
4148	NC_003028	CGT	2	6	249825	249830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900207
4149	NC_003028	CTC	2	6	249859	249864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15900207
4150	NC_003028	TTC	2	6	249912	249917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900207
4151	NC_003028	TGG	2	6	249929	249934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900207
4152	NC_003028	GAA	2	6	249978	249983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900207
4153	NC_003028	ATTCGA	2	12	249992	250003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15900207
4154	NC_003028	TCG	2	6	250012	250017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900207
4155	NC_003028	GTG	2	6	250018	250023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900207
4156	NC_003028	ATG	2	6	250129	250134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900207
4157	NC_003028	GCT	2	6	250203	250208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900207
4158	NC_003028	ATG	2	6	250239	250244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900207
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4162	NC_003028	TTC	2	6	250399	250404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900207
4163	NC_003028	ATG	2	6	250434	250439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900207
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4166	NC_003028	AATG	2	8	250613	250620	50 %	25 %	25 %	0 %	15900208
4167	NC_003028	TGA	2	6	250640	250645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900208
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4173	NC_003028	AAG	2	6	251029	251034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900208
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4224	NC_003028	TTGG	2	8	254208	254215	0 %	50 %	50 %	0 %	15900208
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4229	NC_003028	TAA	2	6	254415	254420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900208
4230	NC_003028	ATG	2	6	254497	254502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900208
4231	NC_003028	TATT	2	8	254538	254545	25 %	75 %	0 %	0 %	15900208
4232	NC_003028	ACT	2	6	254546	254551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900208
4233	NC_003028	TCA	2	6	254615	254620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900208
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4235	NC_003028	GAA	2	6	254652	254657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900208
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4237	NC_003028	ATGG	2	8	254818	254825	25 %	25 %	50 %	0 %	15900208
4238	NC_003028	GA	3	6	254831	254836	50 %	0 %	50 %	0 %	15900208
4239	NC_003028	CT	3	6	254881	254886	0 %	50 %	0 %	50 %	15900208
4240	NC_003028	GTG	2	6	254906	254911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900208
4241	NC_003028	TCA	2	6	254917	254922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900208
4242	NC_003028	GATG	2	8	254937	254944	25 %	25 %	50 %	0 %	15900208
4243	NC_003028	GTTT	2	8	254987	254994	0 %	75 %	25 %	0 %	15900208
4244	NC_003028	GTT	2	6	255000	255005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900208
4245	NC_003028	A	6	6	255008	255013	100 %	0 %	0 %	0 %	15900208
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4247	NC_003028	TAGAC	2	10	255260	255269	40 %	20 %	20 %	20 %	15900209
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4371	NC_003028	GCT	2	6	262025	262030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900218
4372	NC_003028	GTC	2	6	262054	262059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900218
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4374	NC_003028	GT	3	6	262146	262151	0 %	50 %	50 %	0 %	15900218
4375	NC_003028	GATT	2	8	262164	262171	25 %	50 %	25 %	0 %	15900218
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4378	NC_003028	CTT	2	6	262299	262304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900218
4379	NC_003028	AGC	2	6	262315	262320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900218
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4479	NC_003028	AAGA	2	8	268198	268205	75 %	0 %	25 %	0 %	15900223
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4485	NC_003028	GAAA	2	8	268519	268526	75 %	0 %	25 %	0 %	15900224
4486	NC_003028	CGGA	2	8	268556	268563	25 %	0 %	50 %	25 %	15900224
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4488	NC_003028	TCC	2	6	268638	268643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15900224
4489	NC_003028	T	6	6	268681	268686	0 %	100 %	0 %	0 %	15900224
4490	NC_003028	TCAT	2	8	268743	268750	25 %	50 %	0 %	25 %	15900224
4491	NC_003028	GGAG	2	8	268834	268841	25 %	0 %	75 %	0 %	15900224
4492	NC_003028	ACT	2	6	268902	268907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900224
4493	NC_003028	CAT	2	6	268933	268938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900224
4494	NC_003028	TGTC	2	8	268975	268982	0 %	50 %	25 %	25 %	15900224
4495	NC_003028	AGCAG	2	10	269056	269065	40 %	0 %	40 %	20 %	15900224
4496	NC_003028	TAT	2	6	269074	269079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900224
4497	NC_003028	TCA	2	6	269200	269205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900224
4498	NC_003028	GTG	2	6	269213	269218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900224
4499	NC_003028	AAG	2	6	269340	269345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900224
4500	NC_003028	AGCA	2	8	269359	269366	50 %	0 %	25 %	25 %	15900224

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