MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 36446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003028	ACC	2	6	62237	62242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15900002
1002	NC_003028	GAT	2	6	62258	62263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900002
1003	NC_003028	GTA	2	6	62300	62305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900002
1004	NC_003028	CGT	2	6	62311	62316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900002
1005	NC_003028	CGAG	2	8	62355	62362	25 %	0 %	50 %	25 %	15900002
1006	NC_003028	CAT	2	6	62467	62472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900002
1007	NC_003028	TCA	2	6	62481	62486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900002
1008	NC_003028	AGC	2	6	62525	62530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900002
1009	NC_003028	TTC	2	6	62601	62606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900002
1010	NC_003028	TAA	2	6	62781	62786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900002
1011	NC_003028	CAT	2	6	62884	62889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900002
1012	NC_003028	GAT	2	6	62939	62944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900002
1013	NC_003028	GCA	2	6	63030	63035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900002
1014	NC_003028	TTCCT	2	10	63038	63047	0 %	60 %	0 %	40 %	15900002
1015	NC_003028	T	6	6	63089	63094	0 %	100 %	0 %	0 %	15900002
1016	NC_003028	CTT	2	6	63154	63159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900002
1017	NC_003028	CTT	2	6	63175	63180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900002
1018	NC_003028	TTA	2	6	63189	63194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900002
1019	NC_003028	CAG	2	6	63208	63213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900002
1020	NC_003028	AACT	2	8	63253	63260	50 %	25 %	0 %	25 %	15900002
1021	NC_003028	TCT	2	6	63276	63281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900002
1022	NC_003028	GTTTCT	2	12	63318	63329	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15900002
1023	NC_003028	GAT	2	6	63390	63395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900002
1024	NC_003028	ATGG	2	8	63416	63423	25 %	25 %	50 %	0 %	15900002
1025	NC_003028	GGTT	2	8	63426	63433	0 %	50 %	50 %	0 %	15900002
1026	NC_003028	GTA	3	9	63438	63446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900002
1027	NC_003028	GCT	2	6	63507	63512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900002
1028	NC_003028	TGT	2	6	63543	63548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900002
1029	NC_003028	TCT	2	6	63885	63890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900003
1030	NC_003028	GTA	2	6	63926	63931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900003
1031	NC_003028	TTC	2	6	64082	64087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900003
1032	NC_003028	TCA	2	6	64095	64100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900003
1033	NC_003028	TAGA	2	8	64137	64144	50 %	25 %	25 %	0 %	15900003
1034	NC_003028	AT	3	6	64179	64184	50 %	50 %	0 %	0 %	15900003
1035	NC_003028	GTA	2	6	64253	64258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900003
1036	NC_003028	CGC	2	6	64267	64272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15900003
1037	NC_003028	ATC	2	6	64337	64342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900003
1038	NC_003028	TTCCTT	2	12	64411	64422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900003
1039	NC_003028	AAC	2	6	64469	64474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900003
1040	NC_003028	GAT	2	6	64553	64558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900003
1041	NC_003028	T	6	6	64563	64568	0 %	100 %	0 %	0 %	15900003
1042	NC_003028	CTT	2	6	64625	64630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900004
1043	NC_003028	A	7	7	64657	64663	100 %	0 %	0 %	0 %	15900004
1044	NC_003028	TAG	2	6	64664	64669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900004
1045	NC_003028	A	6	6	64680	64685	100 %	0 %	0 %	0 %	15900004
1046	NC_003028	AAT	2	6	64690	64695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900004
1047	NC_003028	GAT	2	6	64976	64981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900005
1048	NC_003028	CATT	2	8	65023	65030	25 %	50 %	0 %	25 %	15900005
1049	NC_003028	TCC	2	6	65041	65046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15900005
1050	NC_003028	CGTC	2	8	65222	65229	0 %	25 %	25 %	50 %	15900005
1051	NC_003028	AT	3	6	65317	65322	50 %	50 %	0 %	0 %	15900005
1052	NC_003028	CTA	2	6	65338	65343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900005
1053	NC_003028	TTG	2	6	65375	65380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900005
1054	NC_003028	TGG	2	6	65386	65391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900005
1055	NC_003028	ATG	2	6	65402	65407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900005
1056	NC_003028	TGA	2	6	65629	65634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900005
1057	NC_003028	TGGT	2	8	65677	65684	0 %	50 %	50 %	0 %	15900005
1058	NC_003028	GGT	2	6	65789	65794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900005
1059	NC_003028	GAA	2	6	65885	65890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900005
1060	NC_003028	AAG	2	6	65921	65926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900005
1061	NC_003028	ATG	2	6	65927	65932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900005
1062	NC_003028	AG	3	6	65977	65982	50 %	0 %	50 %	0 %	15900005
1063	NC_003028	TTTG	2	8	66022	66029	0 %	75 %	25 %	0 %	15900005
1064	NC_003028	GGA	2	6	66082	66087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15900005
1065	NC_003028	CTAC	2	8	66106	66113	25 %	25 %	0 %	50 %	15900005
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1067	NC_003028	AGA	3	9	66142	66150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900005
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1069	NC_003028	T	6	6	66246	66251	0 %	100 %	0 %	0 %	15900005
1070	NC_003028	AAAG	2	8	66262	66269	75 %	0 %	25 %	0 %	15900005
1071	NC_003028	CT	3	6	66600	66605	0 %	50 %	0 %	50 %	15900005
1072	NC_003028	AAGG	2	8	66632	66639	50 %	0 %	50 %	0 %	15900005
1073	NC_003028	CAT	2	6	66649	66654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900005
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1076	NC_003028	CAA	2	6	66852	66857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900006
1077	NC_003028	ACC	2	6	66891	66896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15900006
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1083	NC_003028	TGA	2	6	67299	67304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900007
1084	NC_003028	ACT	2	6	67378	67383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900007
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1088	NC_003028	TAC	2	6	67527	67532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900007
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1091	NC_003028	ACT	2	6	67588	67593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900007
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1093	NC_003028	TGC	2	6	67617	67622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900007
1094	NC_003028	ACT	2	6	67658	67663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900007
1095	NC_003028	TCT	2	6	67706	67711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900007
1096	NC_003028	TGG	2	6	67725	67730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900007
1097	NC_003028	AGT	2	6	67746	67751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900007
1098	NC_003028	TGG	2	6	67935	67940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900007
1099	NC_003028	CTG	2	6	67970	67975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900007
1100	NC_003028	A	6	6	67985	67990	100 %	0 %	0 %	0 %	15900007
1101	NC_003028	AAC	2	6	68002	68007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900007
1102	NC_003028	CTTCA	2	10	68062	68071	20 %	40 %	0 %	40 %	15900007
1103	NC_003028	AGC	2	6	68094	68099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900007
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1105	NC_003028	AATCA	2	10	68174	68183	60 %	20 %	0 %	20 %	15900008
1106	NC_003028	GAAA	2	8	68305	68312	75 %	0 %	25 %	0 %	15900008
1107	NC_003028	TGA	2	6	68313	68318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900008
1108	NC_003028	TTC	2	6	68333	68338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900008
1109	NC_003028	TTC	2	6	68351	68356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900008
1110	NC_003028	GAA	2	6	68390	68395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900008
1111	NC_003028	CTC	2	6	68460	68465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15900008
1112	NC_003028	GCA	2	6	68516	68521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900008
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1114	NC_003028	AAG	2	6	68622	68627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900008
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1116	NC_003028	TTGA	2	8	68669	68676	25 %	50 %	25 %	0 %	15900008
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1123	NC_003028	ACA	2	6	69042	69047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900009
1124	NC_003028	CTT	2	6	69062	69067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900009
1125	NC_003028	AGA	2	6	69070	69075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900009
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1127	NC_003028	GAT	2	6	69125	69130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900009
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1249	NC_003028	ATA	2	6	76996	77001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15900016
1250	NC_003028	AT	4	8	77081	77088	50 %	50 %	0 %	0 %	15900016
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1252	NC_003028	A	6	6	77181	77186	100 %	0 %	0 %	0 %	15900016
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