MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TIGR4 chromosome

Total Repeats: 36446

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_003028	TTG	2	6	296992	296997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900255
5003	NC_003028	CAA	2	6	297027	297032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900255
5004	NC_003028	TGA	2	6	297037	297042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900255
5005	NC_003028	TTC	2	6	297075	297080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900255
5006	NC_003028	TGAT	2	8	297094	297101	25 %	50 %	25 %	0 %	15900255
5007	NC_003028	GGT	2	6	297180	297185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900255
5008	NC_003028	GGC	2	6	297278	297283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15900255
5009	NC_003028	TCA	2	6	297305	297310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900255
5010	NC_003028	AAC	2	6	297329	297334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900255
5011	NC_003028	ATG	2	6	297346	297351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900255
5012	NC_003028	ATT	2	6	297518	297523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900256
5013	NC_003028	CCA	2	6	297611	297616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15900256
5014	NC_003028	AGTC	2	8	297673	297680	25 %	25 %	25 %	25 %	15900256
5015	NC_003028	CT	3	6	297698	297703	0 %	50 %	0 %	50 %	15900256
5016	NC_003028	GAA	2	6	297805	297810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900256
5017	NC_003028	CAA	2	6	297831	297836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900256
5018	NC_003028	GTT	2	6	297841	297846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900256
5019	NC_003028	TTG	2	6	297899	297904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900256
5020	NC_003028	TTAC	2	8	297932	297939	25 %	50 %	0 %	25 %	15900256
5021	NC_003028	GAT	2	6	297985	297990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900256
5022	NC_003028	AAGA	2	8	298007	298014	75 %	0 %	25 %	0 %	15900256
5023	NC_003028	TTG	2	6	298031	298036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900256
5024	NC_003028	CAA	2	6	298068	298073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900256
5025	NC_003028	CTTTG	2	10	298099	298108	0 %	60 %	20 %	20 %	15900256
5026	NC_003028	AGG	2	6	298152	298157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15900256
5027	NC_003028	A	6	6	298299	298304	100 %	0 %	0 %	0 %	15900257
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5029	NC_003028	TTA	2	6	298390	298395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900257
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5031	NC_003028	TTC	2	6	298581	298586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900257
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5033	NC_003028	TGAT	2	8	298660	298667	25 %	50 %	25 %	0 %	15900257
5034	NC_003028	TGC	2	6	298778	298783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900257
5035	NC_003028	TAC	2	6	298887	298892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900257
5036	NC_003028	AAAGA	2	10	298899	298908	80 %	0 %	20 %	0 %	15900257
5037	NC_003028	ACA	2	6	298914	298919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900257
5038	NC_003028	ATC	2	6	298944	298949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900257
5039	NC_003028	ACA	2	6	298991	298996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900258
5040	NC_003028	CTT	2	6	299115	299120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900258
5041	NC_003028	TGA	2	6	299131	299136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900258
5042	NC_003028	GTT	2	6	299140	299145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900258
5043	NC_003028	AGT	2	6	299274	299279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900258
5044	NC_003028	AGA	2	6	299305	299310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900259
5045	NC_003028	AAG	2	6	299311	299316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900259
5046	NC_003028	T	6	6	299321	299326	0 %	100 %	0 %	0 %	15900259
5047	NC_003028	GAT	2	6	299513	299518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900259
5048	NC_003028	TTCT	2	8	299618	299625	0 %	75 %	0 %	25 %	15900259
5049	NC_003028	GATTG	2	10	299630	299639	20 %	40 %	40 %	0 %	15900259
5050	NC_003028	GA	3	6	299647	299652	50 %	0 %	50 %	0 %	15900259
5051	NC_003028	TGA	2	6	299670	299675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900259
5052	NC_003028	ACT	2	6	299719	299724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900259
5053	NC_003028	CTC	2	6	299729	299734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15900259
5054	NC_003028	CTA	2	6	299815	299820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900259
5055	NC_003028	ACAA	2	8	299857	299864	75 %	0 %	0 %	25 %	15900259
5056	NC_003028	TGCT	2	8	299871	299878	0 %	50 %	25 %	25 %	15900259
5057	NC_003028	AGA	2	6	299911	299916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900259
5058	NC_003028	ATG	2	6	300110	300115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900259
5059	NC_003028	GGAC	2	8	300128	300135	25 %	0 %	50 %	25 %	15900259
5060	NC_003028	CTG	2	6	300189	300194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900259
5061	NC_003028	CTT	2	6	300215	300220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900259
5062	NC_003028	AG	3	6	300303	300308	50 %	0 %	50 %	0 %	15900259
5063	NC_003028	CATAGT	2	12	300410	300421	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15900259
5064	NC_003028	AT	3	6	300497	300502	50 %	50 %	0 %	0 %	15900259
5065	NC_003028	AAAG	2	8	300626	300633	75 %	0 %	25 %	0 %	15900259
5066	NC_003028	GGAG	2	8	300634	300641	25 %	0 %	75 %	0 %	15900259
5067	NC_003028	CAG	2	6	300669	300674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900259
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5069	NC_003028	TTGATT	2	12	300852	300863	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	15900259
5070	NC_003028	CAT	2	6	300874	300879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900259
5071	NC_003028	ATT	2	6	300896	300901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900259
5072	NC_003028	CTTAG	2	10	300936	300945	20 %	40 %	20 %	20 %	15900259
5073	NC_003028	ATC	2	6	301072	301077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900260
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5076	NC_003028	T	6	6	301162	301167	0 %	100 %	0 %	0 %	15900260
5077	NC_003028	CGC	2	6	301221	301226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15900260
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5081	NC_003028	TTTC	2	8	301386	301393	0 %	75 %	0 %	25 %	15900260
5082	NC_003028	GCAA	2	8	301522	301529	50 %	0 %	25 %	25 %	15900260
5083	NC_003028	ATC	2	6	301570	301575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900260
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5085	NC_003028	TAC	2	6	301767	301772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900260
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5088	NC_003028	CGT	2	6	301914	301919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900260
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5090	NC_003028	TC	3	6	301971	301976	0 %	50 %	0 %	50 %	15900260
5091	NC_003028	TCA	2	6	302050	302055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900260
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5094	NC_003028	ATG	3	9	302124	302132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900260
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5099	NC_003028	CGT	2	6	302383	302388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900260
5100	NC_003028	ATG	2	6	302391	302396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900260
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5102	NC_003028	AAG	2	6	302612	302617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900261
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5105	NC_003028	CAGA	2	8	302715	302722	50 %	0 %	25 %	25 %	15900261
5106	NC_003028	ATG	2	6	302764	302769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900261
5107	NC_003028	TTA	2	6	302790	302795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900261
5108	NC_003028	ATAAA	2	10	302872	302881	80 %	20 %	0 %	0 %	15900261
5109	NC_003028	GA	3	6	302883	302888	50 %	0 %	50 %	0 %	15900261
5110	NC_003028	GAA	2	6	302974	302979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900262
5111	NC_003028	AAC	2	6	303022	303027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900262
5112	NC_003028	A	6	6	303057	303062	100 %	0 %	0 %	0 %	15900262
5113	NC_003028	TTG	2	6	303126	303131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15900262
5114	NC_003028	GCCA	2	8	303233	303240	25 %	0 %	25 %	50 %	15900262
5115	NC_003028	AG	3	6	303283	303288	50 %	0 %	50 %	0 %	15900262
5116	NC_003028	TAT	2	6	303337	303342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900262
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5119	NC_003028	T	6	6	303407	303412	0 %	100 %	0 %	0 %	15900262
5120	NC_003028	ATG	2	6	303462	303467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900262
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5122	NC_003028	A	6	6	303690	303695	100 %	0 %	0 %	0 %	15900262
5123	NC_003028	TCT	2	6	303818	303823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900262
5124	NC_003028	CCT	2	6	303849	303854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15900262
5125	NC_003028	AGGA	2	8	303858	303865	50 %	0 %	50 %	0 %	15900262
5126	NC_003028	TTGA	2	8	303884	303891	25 %	50 %	25 %	0 %	15900262
5127	NC_003028	AAG	2	6	303912	303917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900262
5128	NC_003028	CAA	2	6	303923	303928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900262
5129	NC_003028	TCC	2	6	304674	304679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15900263
5130	NC_003028	GCTC	2	8	304739	304746	0 %	25 %	25 %	50 %	15900263
5131	NC_003028	GAA	2	6	304748	304753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900263
5132	NC_003028	GAGAA	2	10	304793	304802	60 %	0 %	40 %	0 %	15900263
5133	NC_003028	A	6	6	304853	304858	100 %	0 %	0 %	0 %	15900263
5134	NC_003028	GTAGT	2	10	304898	304907	20 %	40 %	40 %	0 %	15900263
5135	NC_003028	TGCT	2	8	304908	304915	0 %	50 %	25 %	25 %	15900263
5136	NC_003028	TTCT	2	8	304916	304923	0 %	75 %	0 %	25 %	15900263
5137	NC_003028	T	7	7	304960	304966	0 %	100 %	0 %	0 %	15900263
5138	NC_003028	AGG	2	6	305018	305023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15900263
5139	NC_003028	CTT	2	6	305038	305043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900263
5140	NC_003028	ATC	2	6	305088	305093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900263
5141	NC_003028	GAT	2	6	305105	305110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900263
5142	NC_003028	T	6	6	305213	305218	0 %	100 %	0 %	0 %	15900263
5143	NC_003028	T	6	6	305233	305238	0 %	100 %	0 %	0 %	15900264
5144	NC_003028	TCC	2	6	305247	305252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15900264
5145	NC_003028	GTCT	2	8	305349	305356	0 %	50 %	25 %	25 %	15900264
5146	NC_003028	AGATA	2	10	305588	305597	60 %	20 %	20 %	0 %	15900265
5147	NC_003028	TCA	2	6	305611	305616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900265
5148	NC_003028	TATT	2	8	305714	305721	25 %	75 %	0 %	0 %	15900265
5149	NC_003028	AGCGTG	2	12	305940	305951	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15900265
5150	NC_003028	GTG	2	6	306023	306028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15900265
5151	NC_003028	TTC	2	6	306062	306067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15900265
5152	NC_003028	GTGAA	2	10	306123	306132	40 %	20 %	40 %	0 %	15900265
5153	NC_003028	AAG	3	9	306197	306205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900265
5154	NC_003028	ATG	2	6	306252	306257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900265
5155	NC_003028	TCCA	2	8	306278	306285	25 %	25 %	0 %	50 %	15900265
5156	NC_003028	AGA	2	6	306346	306351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900265
5157	NC_003028	GAT	2	6	306422	306427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900265
5158	NC_003028	A	6	6	306566	306571	100 %	0 %	0 %	0 %	15900266
5159	NC_003028	A	6	6	306575	306580	100 %	0 %	0 %	0 %	15900266
5160	NC_003028	TAC	2	6	306590	306595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15900266
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5163	NC_003028	CAAG	2	8	306774	306781	50 %	0 %	25 %	25 %	15900266
5164	NC_003028	GAAA	2	8	306813	306820	75 %	0 %	25 %	0 %	15900266
5165	NC_003028	TAT	2	6	306971	306976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900267
5166	NC_003028	T	7	7	306995	307001	0 %	100 %	0 %	0 %	15900267
5167	NC_003028	ATT	2	6	307018	307023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15900267
5168	NC_003028	GAAG	2	8	307056	307063	50 %	0 %	50 %	0 %	15900267
5169	NC_003028	AAG	2	6	307066	307071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900267
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5180	NC_003028	GATT	2	8	307410	307417	25 %	50 %	25 %	0 %	15900267
5181	NC_003028	AGCTC	2	10	307479	307488	20 %	20 %	20 %	40 %	15900267
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5185	NC_003028	GATG	2	8	307707	307714	25 %	25 %	50 %	0 %	15900267
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5220	NC_003028	TAG	2	6	309346	309351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900268
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5240	NC_003028	CAG	2	6	310973	310978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15900269
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5250	NC_003028	CT	4	8	311378	311385	0 %	50 %	0 %	50 %	15900269
5251	NC_003028	CAA	2	6	311411	311416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900269
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5253	NC_003028	TGC	2	6	311451	311456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15900269
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5363	NC_003028	GTA	2	6	317985	317990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15900273
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5369	NC_003028	CAA	2	6	318411	318416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15900273
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5372	NC_003028	A	6	6	318603	318608	100 %	0 %	0 %	0 %	15900273
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5500	NC_003028	GAA	2	6	325939	325944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15900281

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