MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 chromosome

Total Repeats: 1844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002953	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	49484913
2	NC_002953	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	49484914
3	NC_002953	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	49484914
4	NC_002953	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	49484914
5	NC_002953	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	49484917
6	NC_002953	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	49484917
7	NC_002953	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	49484918
8	NC_002953	GGTGT	2	10	10123	10132	0 %	40 %	60 %	0 %	49484919
9	NC_002953	ATCGC	2	10	10185	10194	20 %	20 %	20 %	40 %	49484919
10	NC_002953	CGTTG	2	10	11728	11737	0 %	40 %	40 %	20 %	49484920
11	NC_002953	TTATT	2	10	15444	15453	20 %	80 %	0 %	0 %	49484923
12	NC_002953	GCAAG	2	10	16618	16627	40 %	0 %	40 %	20 %	49484924
13	NC_002953	TTTGA	2	10	16777	16786	20 %	60 %	20 %	0 %	49484924
14	NC_002953	TCAAT	2	10	18914	18923	40 %	40 %	0 %	20 %	49484926
15	NC_002953	AGTTA	2	10	22092	22101	40 %	40 %	20 %	0 %	49484928
16	NC_002953	ATGTA	2	10	23651	23660	40 %	40 %	20 %	0 %	49484929
17	NC_002953	ACCAA	2	10	26262	26271	60 %	0 %	0 %	40 %	49484931
18	NC_002953	ATCAA	2	10	26974	26983	60 %	20 %	0 %	20 %	49484931
19	NC_002953	GAAAC	2	10	27595	27604	60 %	0 %	20 %	20 %	49484932
20	NC_002953	GAAGT	2	10	27745	27754	40 %	20 %	40 %	0 %	49484932
21	NC_002953	ATTAT	2	10	29388	29397	40 %	60 %	0 %	0 %	49484933
22	NC_002953	TGGCG	2	10	31993	32002	0 %	20 %	60 %	20 %	49484935
23	NC_002953	AAGGT	2	10	32480	32489	40 %	20 %	40 %	0 %	49484935
24	NC_002953	TATGA	2	10	32677	32686	40 %	40 %	20 %	0 %	49484935
25	NC_002953	TATGA	2	10	32905	32914	40 %	40 %	20 %	0 %	49484935
26	NC_002953	GTTGT	2	10	33070	33079	0 %	60 %	40 %	0 %	49484935
27	NC_002953	CATTA	2	10	33907	33916	40 %	40 %	0 %	20 %	49484936
28	NC_002953	ACTTT	2	10	35010	35019	20 %	60 %	0 %	20 %	49484937
29	NC_002953	TTTTG	2	10	35267	35276	0 %	80 %	20 %	0 %	49484937
30	NC_002953	TAAAT	2	10	35357	35366	60 %	40 %	0 %	0 %	49484937
31	NC_002953	TTGTT	2	10	36109	36118	0 %	80 %	20 %	0 %	49484937
32	NC_002953	TTCTG	2	10	37367	37376	0 %	60 %	20 %	20 %	49484937
33	NC_002953	CAATC	2	10	38217	38226	40 %	20 %	0 %	40 %	49484938
34	NC_002953	ATTTC	2	10	38880	38889	20 %	60 %	0 %	20 %	49484938
35	NC_002953	TATCT	2	10	39041	39050	20 %	60 %	0 %	20 %	49484939
36	NC_002953	ATATT	2	10	42828	42837	40 %	60 %	0 %	0 %	49484944
37	NC_002953	ATTGA	2	10	43792	43801	40 %	40 %	20 %	0 %	49484944
38	NC_002953	TCAGT	2	10	45647	45656	20 %	40 %	20 %	20 %	49484945
39	NC_002953	ACGCC	2	10	47725	47734	20 %	0 %	20 %	60 %	49484946
40	NC_002953	AAATG	2	10	48692	48701	60 %	20 %	20 %	0 %	49484948
41	NC_002953	AATAA	2	10	49474	49483	80 %	20 %	0 %	0 %	49484948
42	NC_002953	ATTTT	2	10	49487	49496	20 %	80 %	0 %	0 %	49484948
43	NC_002953	ATTGG	2	10	50172	50181	20 %	40 %	40 %	0 %	49484949
44	NC_002953	AAGAG	2	10	50469	50478	60 %	0 %	40 %	0 %	49484949
45	NC_002953	AAAAT	2	10	52014	52023	80 %	20 %	0 %	0 %	49484951
46	NC_002953	ATGAA	2	10	52815	52824	60 %	20 %	20 %	0 %	49484952
47	NC_002953	TAAAG	2	10	52849	52858	60 %	20 %	20 %	0 %	49484952
48	NC_002953	GTAAA	2	10	53109	53118	60 %	20 %	20 %	0 %	49484952
49	NC_002953	TAAAA	2	10	53446	53455	80 %	20 %	0 %	0 %	49484952
50	NC_002953	ATCAA	2	10	54365	54374	60 %	20 %	0 %	20 %	49484953
51	NC_002953	TTAAT	2	10	54514	54523	40 %	60 %	0 %	0 %	49484953
52	NC_002953	CCTTT	2	10	55456	55465	0 %	60 %	0 %	40 %	49484954
53	NC_002953	TAAAA	2	10	56547	56556	80 %	20 %	0 %	0 %	49484955
54	NC_002953	AATAG	2	10	57859	57868	60 %	20 %	20 %	0 %	49484956
55	NC_002953	AAATG	2	10	58281	58290	60 %	20 %	20 %	0 %	49484956
56	NC_002953	ATTTT	2	10	58362	58371	20 %	80 %	0 %	0 %	49484956
57	NC_002953	TACTA	2	10	63080	63089	40 %	40 %	0 %	20 %	49484959
58	NC_002953	ATCAA	2	10	65833	65842	60 %	20 %	0 %	20 %	49484962
59	NC_002953	TAATA	2	10	67665	67674	60 %	40 %	0 %	0 %	49484963
60	NC_002953	ATTTT	2	10	70274	70283	20 %	80 %	0 %	0 %	49484967
61	NC_002953	TATGG	2	10	72287	72296	20 %	40 %	40 %	0 %	49484969
62	NC_002953	TAACT	2	10	72592	72601	40 %	40 %	0 %	20 %	49484969
63	NC_002953	ATTGC	2	10	73864	73873	20 %	40 %	20 %	20 %	49484970
64	NC_002953	TATAT	2	10	75358	75367	40 %	60 %	0 %	0 %	49484972
65	NC_002953	CTAAA	2	10	76998	77007	60 %	20 %	0 %	20 %	49484973
66	NC_002953	CAAAA	2	10	77029	77038	80 %	0 %	0 %	20 %	49484973
67	NC_002953	GATAT	2	10	81719	81728	40 %	40 %	20 %	0 %	49484975
68	NC_002953	TACTA	2	10	82255	82264	40 %	40 %	0 %	20 %	49484976
69	NC_002953	TTTAC	2	10	82664	82673	20 %	60 %	0 %	20 %	49484976
70	NC_002953	GATAT	2	10	83584	83593	40 %	40 %	20 %	0 %	49484977
71	NC_002953	AAATC	2	10	84699	84708	60 %	20 %	0 %	20 %	49484978
72	NC_002953	ATTGC	2	10	86700	86709	20 %	40 %	20 %	20 %	49484981
73	NC_002953	TCATT	2	10	86888	86897	20 %	60 %	0 %	20 %	49484981
74	NC_002953	CATGG	2	10	88104	88113	20 %	20 %	40 %	20 %	49484981
75	NC_002953	TGAAA	2	10	88772	88781	60 %	20 %	20 %	0 %	49484982
76	NC_002953	TCAAT	2	10	89144	89153	40 %	40 %	0 %	20 %	49484982
77	NC_002953	GTATT	2	10	89633	89642	20 %	60 %	20 %	0 %	49484983
78	NC_002953	CAATT	2	10	95945	95954	40 %	40 %	0 %	20 %	49484986
79	NC_002953	TTGCG	2	10	97350	97359	0 %	40 %	40 %	20 %	49484987
80	NC_002953	AGTTA	2	10	98838	98847	40 %	40 %	20 %	0 %	49484988
81	NC_002953	TTGCG	2	10	99346	99355	0 %	40 %	40 %	20 %	49484988
82	NC_002953	AGATG	2	10	102211	102220	40 %	20 %	40 %	0 %	49484990
83	NC_002953	GGTGA	2	10	102807	102816	20 %	20 %	60 %	0 %	49484991
84	NC_002953	GAAAA	2	10	106244	106253	80 %	0 %	20 %	0 %	49484994
85	NC_002953	AATCA	2	10	109433	109442	60 %	20 %	0 %	20 %	49484996
86	NC_002953	ATTTT	2	10	110131	110140	20 %	80 %	0 %	0 %	49484997
87	NC_002953	ATCAA	2	10	110158	110167	60 %	20 %	0 %	20 %	49484997
88	NC_002953	ATCAC	2	10	111391	111400	40 %	20 %	0 %	40 %	49484998
89	NC_002953	AACGA	2	10	112068	112077	60 %	0 %	20 %	20 %	49484998
90	NC_002953	ACACA	2	10	114124	114133	60 %	0 %	0 %	40 %	49485000
91	NC_002953	GACAA	2	10	115275	115284	60 %	0 %	20 %	20 %	49485001
92	NC_002953	ATTAC	2	10	117916	117925	40 %	40 %	0 %	20 %	49485004
93	NC_002953	TATCT	2	10	118576	118585	20 %	60 %	0 %	20 %	49485006
94	NC_002953	ATACG	2	10	121009	121018	40 %	20 %	20 %	20 %	49485008
95	NC_002953	TTATA	2	10	121667	121676	40 %	60 %	0 %	0 %	49485009
96	NC_002953	TTTTA	2	10	122465	122474	20 %	80 %	0 %	0 %	49485009
97	NC_002953	GTATT	2	10	122978	122987	20 %	60 %	20 %	0 %	49485010
98	NC_002953	AATAA	2	10	123571	123580	80 %	20 %	0 %	0 %	49485010
99	NC_002953	TACGC	2	10	123838	123847	20 %	20 %	20 %	40 %	49485010
100	NC_002953	GACAA	2	10	125180	125189	60 %	0 %	20 %	20 %	49485012
101	NC_002953	TCCCT	2	10	126645	126654	0 %	40 %	0 %	60 %	49485013
102	NC_002953	GCTTT	2	10	128879	128888	0 %	60 %	20 %	20 %	49485015
103	NC_002953	TAATT	2	10	128964	128973	40 %	60 %	0 %	0 %	49485015
104	NC_002953	ATACT	2	10	130145	130154	40 %	40 %	0 %	20 %	49485017
105	NC_002953	TAATA	2	10	131311	131320	60 %	40 %	0 %	0 %	49485018
106	NC_002953	ATTTT	2	10	132302	132311	20 %	80 %	0 %	0 %	49485019
107	NC_002953	TAAAA	2	10	132501	132510	80 %	20 %	0 %	0 %	49485019
108	NC_002953	TTGTA	2	10	134526	134535	20 %	60 %	20 %	0 %	49485021
109	NC_002953	TGCAA	2	10	135531	135540	40 %	20 %	20 %	20 %	49485022
110	NC_002953	ATATG	2	10	137549	137558	40 %	40 %	20 %	0 %	49485023
111	NC_002953	TGGTA	2	10	142855	142864	20 %	40 %	40 %	0 %	49485024
112	NC_002953	CGAAC	2	10	142945	142954	40 %	0 %	20 %	40 %	49485024
113	NC_002953	TTCAA	2	10	144965	144974	40 %	40 %	0 %	20 %	49485025
114	NC_002953	ACATC	2	10	145808	145817	40 %	20 %	0 %	40 %	49485027
115	NC_002953	TAATT	2	10	148031	148040	40 %	60 %	0 %	0 %	49485028
116	NC_002953	AGAGA	2	10	151057	151066	60 %	0 %	40 %	0 %	49485031
117	NC_002953	AATCC	2	10	151413	151422	40 %	20 %	0 %	40 %	49485031
118	NC_002953	TTGGA	2	10	154442	154451	20 %	40 %	40 %	0 %	49485034
119	NC_002953	TTATT	2	10	154857	154866	20 %	80 %	0 %	0 %	49485035
120	NC_002953	ATTTT	2	10	154923	154932	20 %	80 %	0 %	0 %	49485035
121	NC_002953	TATGG	2	10	155324	155333	20 %	40 %	40 %	0 %	49485035
122	NC_002953	ATCGT	2	10	155765	155774	20 %	40 %	20 %	20 %	49485035
123	NC_002953	TGAAT	2	10	160351	160360	40 %	40 %	20 %	0 %	49485040
124	NC_002953	TGATT	2	10	161482	161491	20 %	60 %	20 %	0 %	49485042
125	NC_002953	CAAAA	2	10	161735	161744	80 %	0 %	0 %	20 %	49485042
126	NC_002953	TTCAT	2	10	164588	164597	20 %	60 %	0 %	20 %	49485044
127	NC_002953	TTTAC	2	10	164971	164980	20 %	60 %	0 %	20 %	49485044
128	NC_002953	TTATT	2	10	166183	166192	20 %	80 %	0 %	0 %	49485047
129	NC_002953	GGATT	2	10	167171	167180	20 %	40 %	40 %	0 %	49485048
130	NC_002953	TAACT	2	10	170211	170220	40 %	40 %	0 %	20 %	49485051
131	NC_002953	TTTAT	2	10	173119	173128	20 %	80 %	0 %	0 %	49485054
132	NC_002953	ATGCA	2	10	174722	174731	40 %	20 %	20 %	20 %	49485055
133	NC_002953	TATGA	2	10	181968	181977	40 %	40 %	20 %	0 %	49485056
134	NC_002953	GTGAA	2	10	182002	182011	40 %	20 %	40 %	0 %	49485056
135	NC_002953	TTAAT	2	10	182445	182454	40 %	60 %	0 %	0 %	49485057
136	NC_002953	ATATA	2	10	185275	185284	60 %	40 %	0 %	0 %	49485060
137	NC_002953	AAGAT	2	10	189004	189013	60 %	20 %	20 %	0 %	49485062
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