MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 chromosome

Total Repeats: 53870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002953	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
2	NC_002953	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484913
3	NC_002953	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484913
4	NC_002953	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484913
5	NC_002953	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
6	NC_002953	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484913
7	NC_002953	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484913
8	NC_002953	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484913
9	NC_002953	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	49484913
10	NC_002953	GCA	2	6	922	927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484913
11	NC_002953	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
12	NC_002953	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	49484913
13	NC_002953	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	49484913
14	NC_002953	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484913
15	NC_002953	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484913
16	NC_002953	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
17	NC_002953	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
18	NC_002953	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484913
19	NC_002953	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
20	NC_002953	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49484913
21	NC_002953	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
22	NC_002953	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484913
23	NC_002953	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49484913
24	NC_002953	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
25	NC_002953	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
26	NC_002953	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49484913
27	NC_002953	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	49484913
28	NC_002953	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	49484913
29	NC_002953	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484913
30	NC_002953	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484913
31	NC_002953	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	49484913
32	NC_002953	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	49484913
33	NC_002953	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	49484913
34	NC_002953	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
35	NC_002953	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484913
36	NC_002953	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	49484913
37	NC_002953	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	49484913
38	NC_002953	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
39	NC_002953	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484913
40	NC_002953	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	49484914
41	NC_002953	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
42	NC_002953	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
43	NC_002953	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484914
44	NC_002953	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484914
45	NC_002953	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484914
46	NC_002953	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	49484914
47	NC_002953	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	49484914
48	NC_002953	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	49484914
49	NC_002953	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
50	NC_002953	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	49484914
51	NC_002953	CAAA	2	8	2600	2607	75 %	0 %	0 %	25 %	49484914
52	NC_002953	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	49484914
53	NC_002953	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484914
54	NC_002953	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484914
55	NC_002953	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	49484914
56	NC_002953	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484914
57	NC_002953	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484914
58	NC_002953	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	49484914
59	NC_002953	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
60	NC_002953	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484914
61	NC_002953	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	49484914
62	NC_002953	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
63	NC_002953	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484914
64	NC_002953	AAC	2	6	3014	3019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484914
65	NC_002953	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484914
66	NC_002953	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484914
67	NC_002953	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484914
68	NC_002953	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484914
69	NC_002953	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484914
70	NC_002953	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484914
71	NC_002953	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	49484914
72	NC_002953	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	49484914
73	NC_002953	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	49484914
74	NC_002953	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484914
75	NC_002953	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484914
76	NC_002953	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484914
77	NC_002953	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484914
78	NC_002953	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	49484914
79	NC_002953	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484915
80	NC_002953	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484915
81	NC_002953	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484915
82	NC_002953	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484915
83	NC_002953	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484915
84	NC_002953	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	49484915
85	NC_002953	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	49484915
86	NC_002953	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	49484915
87	NC_002953	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484916
88	NC_002953	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	49484916
89	NC_002953	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484916
90	NC_002953	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	49484916
91	NC_002953	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484916
92	NC_002953	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49484916
93	NC_002953	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484916
94	NC_002953	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484916
95	NC_002953	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484916
96	NC_002953	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	49484916
97	NC_002953	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484916
98	NC_002953	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484916
99	NC_002953	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484916
100	NC_002953	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484916
101	NC_002953	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484916
102	NC_002953	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484916
103	NC_002953	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484916
104	NC_002953	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484916
105	NC_002953	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484916
106	NC_002953	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49484917
107	NC_002953	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	49484917
108	NC_002953	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	49484917
109	NC_002953	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49484917
110	NC_002953	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	49484917
111	NC_002953	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484917
112	NC_002953	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	49484917
113	NC_002953	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484917
114	NC_002953	TGGCGG	2	12	5369	5380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	49484917
115	NC_002953	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484917
116	NC_002953	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484917
117	NC_002953	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	49484917
118	NC_002953	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484917
119	NC_002953	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	49484917
120	NC_002953	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484917
121	NC_002953	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484917
122	NC_002953	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	49484917
123	NC_002953	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484917
124	NC_002953	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484917
125	NC_002953	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484917
126	NC_002953	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484917
127	NC_002953	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484917
128	NC_002953	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484917
129	NC_002953	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484917
130	NC_002953	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	49484917
131	NC_002953	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484917
132	NC_002953	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484917
133	NC_002953	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49484917
134	NC_002953	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484917
135	NC_002953	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	49484917
136	NC_002953	CGT	2	6	6243	6248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484917
137	NC_002953	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484917
138	NC_002953	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	49484917
139	NC_002953	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	49484917
140	NC_002953	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	49484917
141	NC_002953	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484917
142	NC_002953	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49484917
143	NC_002953	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484917
144	NC_002953	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	49484917
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147	NC_002953	TGT	2	6	6905	6910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484917
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150	NC_002953	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484918
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152	NC_002953	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	49484918
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154	NC_002953	ATGG	2	8	7341	7348	25 %	25 %	50 %	0 %	49484918
155	NC_002953	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484918
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159	NC_002953	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	49484918
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162	NC_002953	GGA	2	6	7634	7639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49484918
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164	NC_002953	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	49484918
165	NC_002953	GAA	2	6	7752	7757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484918
166	NC_002953	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484918
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168	NC_002953	TCGT	2	8	7843	7850	0 %	50 %	25 %	25 %	49484918
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173	NC_002953	AAG	2	6	8050	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484918
174	NC_002953	ATT	2	6	8065	8070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484918
175	NC_002953	GTT	2	6	8088	8093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49484918
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180	NC_002953	CAAGCT	2	12	8265	8276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	49484918
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186	NC_002953	TGA	2	6	8447	8452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484918
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244	NC_002953	TAT	2	6	11024	11029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484920
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249	NC_002953	ACAATT	2	12	11252	11263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	49484920
250	NC_002953	T	6	6	11262	11267	0 %	100 %	0 %	0 %	49484920
251	NC_002953	TAT	2	6	11279	11284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484920
252	NC_002953	CT	3	6	11306	11311	0 %	50 %	0 %	50 %	49484920
253	NC_002953	TAGCAT	2	12	11347	11358	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	49484920
254	NC_002953	GAA	2	6	11391	11396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484920
255	NC_002953	AAG	2	6	11455	11460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484920
256	NC_002953	TA	3	6	11514	11519	50 %	50 %	0 %	0 %	49484920
257	NC_002953	AGA	2	6	11525	11530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484920
258	NC_002953	TGC	2	6	11555	11560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484920
259	NC_002953	ATG	2	6	11605	11610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484920
260	NC_002953	ACG	2	6	11688	11693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49484920
261	NC_002953	CGTTG	2	10	11728	11737	0 %	40 %	40 %	20 %	49484920
262	NC_002953	AATG	2	8	11804	11811	50 %	25 %	25 %	0 %	49484920
263	NC_002953	GGT	2	6	11868	11873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49484920
264	NC_002953	ATC	2	6	11908	11913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49484920
265	NC_002953	CGT	2	6	11952	11957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484920
266	NC_002953	GAT	2	6	12038	12043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49484920
267	NC_002953	TGC	3	9	12053	12061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484920
268	NC_002953	AAG	2	6	12133	12138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484920
269	NC_002953	GCT	2	6	12162	12167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49484920
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392	NC_002953	TCAAT	2	10	18914	18923	40 %	40 %	0 %	20 %	49484926
393	NC_002953	TTA	2	6	18935	18940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49484926
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395	NC_002953	A	6	6	19013	19018	100 %	0 %	0 %	0 %	49484926
396	NC_002953	AGA	2	6	19032	19037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49484926
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