MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 chromosome

Total Repeats: 53870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002953	AAT	2	6	250286	250291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485111
5002	NC_002953	GTT	2	6	250319	250324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49485111
5003	NC_002953	TGTT	2	8	250338	250345	0 %	75 %	25 %	0 %	49485111
5004	NC_002953	TCA	2	6	250372	250377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49485111
5005	NC_002953	ATTG	2	8	250454	250461	25 %	50 %	25 %	0 %	49485112
5006	NC_002953	AATT	2	8	250501	250508	50 %	50 %	0 %	0 %	49485112
5007	NC_002953	AAT	2	6	250522	250527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485112
5008	NC_002953	CTT	2	6	250647	250652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49485112
5009	NC_002953	TTTA	2	8	250801	250808	25 %	75 %	0 %	0 %	49485112
5010	NC_002953	CCA	2	6	250832	250837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49485112
5011	NC_002953	TAAA	2	8	250934	250941	75 %	25 %	0 %	0 %	49485112
5012	NC_002953	CAT	2	6	251052	251057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49485112
5013	NC_002953	TTC	2	6	251068	251073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49485112
5014	NC_002953	AG	3	6	251086	251091	50 %	0 %	50 %	0 %	49485112
5015	NC_002953	ATT	2	6	251095	251100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485112
5016	NC_002953	AGC	2	6	251146	251151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49485112
5017	NC_002953	TTC	2	6	251215	251220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49485112
5018	NC_002953	AAT	2	6	251238	251243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485112
5019	NC_002953	TCT	2	6	251276	251281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49485112
5020	NC_002953	AAC	2	6	251317	251322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49485112
5021	NC_002953	CTT	2	6	251433	251438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49485112
5022	NC_002953	TAAA	2	8	251443	251450	75 %	25 %	0 %	0 %	49485112
5023	NC_002953	TTG	2	6	251458	251463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49485112
5024	NC_002953	AGT	2	6	251483	251488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49485112
5025	NC_002953	TGTAA	2	10	251511	251520	40 %	40 %	20 %	0 %	49485112
5026	NC_002953	ATC	2	6	251557	251562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49485112
5027	NC_002953	GTT	2	6	251564	251569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49485112
5028	NC_002953	TTTAC	2	10	251576	251585	20 %	60 %	0 %	20 %	49485112
5029	NC_002953	TAA	2	6	251631	251636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485112
5030	NC_002953	TAA	2	6	251644	251649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485112
5031	NC_002953	A	6	6	251693	251698	100 %	0 %	0 %	0 %	49485112
5032	NC_002953	ATT	2	6	251713	251718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485112
5033	NC_002953	GAA	2	6	251741	251746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49485112
5034	NC_002953	ATC	2	6	251797	251802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49485112
5035	NC_002953	CGG	2	6	251910	251915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49485112
5036	NC_002953	ATCAC	2	10	251948	251957	40 %	20 %	0 %	40 %	49485112
5037	NC_002953	TGT	2	6	251972	251977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49485112
5038	NC_002953	CAAG	2	8	252001	252008	50 %	0 %	25 %	25 %	49485112
5039	NC_002953	TCA	2	6	252462	252467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49485113
5040	NC_002953	ACAT	2	8	252496	252503	50 %	25 %	0 %	25 %	49485113
5041	NC_002953	AAG	2	6	252578	252583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49485113
5042	NC_002953	AATC	2	8	252604	252611	50 %	25 %	0 %	25 %	49485113
5043	NC_002953	ATG	2	6	252628	252633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49485113
5044	NC_002953	AGA	2	6	252758	252763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49485113
5045	NC_002953	TAA	2	6	252848	252853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485113
5046	NC_002953	TTC	2	6	252915	252920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49485113
5047	NC_002953	TTA	2	6	252964	252969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485113
5048	NC_002953	GGC	2	6	252984	252989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49485113
5049	NC_002953	TTA	2	6	253014	253019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485113
5050	NC_002953	TA	3	6	253018	253023	50 %	50 %	0 %	0 %	49485113
5051	NC_002953	TAG	2	6	253087	253092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49485113
5052	NC_002953	GAA	2	6	253101	253106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49485113
5053	NC_002953	ATT	2	6	253122	253127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485113
5054	NC_002953	ATT	2	6	253172	253177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485113
5055	NC_002953	TGC	2	6	253184	253189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49485113
5056	NC_002953	CAG	2	6	253219	253224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49485113
5057	NC_002953	ATT	2	6	253262	253267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485113
5058	NC_002953	CGTG	2	8	253284	253291	0 %	25 %	50 %	25 %	49485113
5059	NC_002953	TGG	2	6	253301	253306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49485113
5060	NC_002953	TTG	2	6	253327	253332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49485113
5061	NC_002953	TGC	2	6	253334	253339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49485113
5062	NC_002953	ATTT	2	8	253484	253491	25 %	75 %	0 %	0 %	49485113
5063	NC_002953	TG	3	6	253502	253507	0 %	50 %	50 %	0 %	49485113
5064	NC_002953	AGAA	2	8	253561	253568	75 %	0 %	25 %	0 %	49485113
5065	NC_002953	AAC	2	6	253576	253581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49485113
5066	NC_002953	A	6	6	253584	253589	100 %	0 %	0 %	0 %	49485113
5067	NC_002953	AAT	3	9	253597	253605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485113
5068	NC_002953	GTT	2	6	253928	253933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49485114
5069	NC_002953	AGC	2	6	253993	253998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49485114
5070	NC_002953	TAA	2	6	254055	254060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485114
5071	NC_002953	ATTA	2	8	254113	254120	50 %	50 %	0 %	0 %	49485114
5072	NC_002953	ATC	2	6	254122	254127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49485114
5073	NC_002953	TAT	2	6	254136	254141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485114
5074	NC_002953	TTA	2	6	254153	254158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485114
5075	NC_002953	T	6	6	254170	254175	0 %	100 %	0 %	0 %	49485114
5076	NC_002953	TCA	2	6	254279	254284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49485114
5077	NC_002953	T	6	6	254314	254319	0 %	100 %	0 %	0 %	49485114
5078	NC_002953	GAC	2	6	254361	254366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49485114
5079	NC_002953	TAA	2	6	254425	254430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485114
5080	NC_002953	TTTG	2	8	254451	254458	0 %	75 %	25 %	0 %	49485114
5081	NC_002953	AT	3	6	254477	254482	50 %	50 %	0 %	0 %	49485114
5082	NC_002953	ATGAT	2	10	254561	254570	40 %	40 %	20 %	0 %	49485114
5083	NC_002953	T	7	7	254598	254604	0 %	100 %	0 %	0 %	49485114
5084	NC_002953	AAG	2	6	254628	254633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49485114
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5086	NC_002953	TTA	2	6	254693	254698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485114
5087	NC_002953	TTA	2	6	254712	254717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485114
5088	NC_002953	ATC	2	6	254719	254724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49485114
5089	NC_002953	ATT	2	6	254752	254757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485114
5090	NC_002953	TCT	2	6	254762	254767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49485114
5091	NC_002953	TGA	2	6	255016	255021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49485114
5092	NC_002953	T	7	7	255051	255057	0 %	100 %	0 %	0 %	49485114
5093	NC_002953	TGA	2	6	255164	255169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49485114
5094	NC_002953	AAT	2	6	255218	255223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485114
5095	NC_002953	GCA	2	6	255230	255235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49485114
5096	NC_002953	CTG	2	6	255354	255359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49485114
5097	NC_002953	TTCAT	2	10	255386	255395	20 %	60 %	0 %	20 %	49485114
5098	NC_002953	CTG	2	6	255603	255608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49485115
5099	NC_002953	TAC	2	6	255612	255617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49485115
5100	NC_002953	TGC	2	6	255642	255647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49485115
5101	NC_002953	AAT	2	6	255827	255832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485115
5102	NC_002953	TAT	2	6	255902	255907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49485115
5103	NC_002953	TTAT	2	8	256101	256108	25 %	75 %	0 %	0 %	49485116
5104	NC_002953	AATTA	2	10	256182	256191	60 %	40 %	0 %	0 %	49485116
5105	NC_002953	AAT	2	6	256203	256208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485116
5106	NC_002953	ACC	2	6	256405	256410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49485117
5107	NC_002953	TTC	2	6	256453	256458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49485117
5108	NC_002953	GT	3	6	256489	256494	0 %	50 %	50 %	0 %	49485117
5109	NC_002953	ATG	2	6	256513	256518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49485117
5110	NC_002953	TGT	2	6	256556	256561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49485117
5111	NC_002953	CATA	2	8	256617	256624	50 %	25 %	0 %	25 %	49485117
5112	NC_002953	CTA	2	6	256626	256631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49485117
5113	NC_002953	CTT	2	6	256731	256736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49485117
5114	NC_002953	TTG	2	6	256755	256760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49485117
5115	NC_002953	TGT	2	6	256780	256785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49485117
5116	NC_002953	T	7	7	256817	256823	0 %	100 %	0 %	0 %	49485117
5117	NC_002953	TTC	2	6	256927	256932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49485117
5118	NC_002953	CAT	2	6	257011	257016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49485117
5119	NC_002953	TCT	2	6	257105	257110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49485117
5120	NC_002953	TAA	2	6	257137	257142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485117
5121	NC_002953	TAA	2	6	257223	257228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49485117
5122	NC_002953	TGTT	2	8	257407	257414	0 %	75 %	25 %	0 %	49485117
5123	NC_002953	TTG	2	6	258106	258111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49485118
5124	NC_002953	TCA	2	6	258121	258126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49485118
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5374	NC_002953	ATG	2	6	272058	272063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49485131
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5495	NC_002953	ATTA	2	8	278685	278692	50 %	50 %	0 %	0 %	49485137
5496	NC_002953	AT	3	6	278710	278715	50 %	50 %	0 %	0 %	49485137
5497	NC_002953	AGA	2	6	278763	278768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49485137
5498	NC_002953	ACG	2	6	278776	278781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49485137
5499	NC_002953	CATTC	2	10	278889	278898	20 %	40 %	0 %	40 %	49485137
5500	NC_002953	ATTT	2	8	278954	278961	25 %	75 %	0 %	0 %	49485137

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