MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 plasmid VRSAp

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002774	AATTAA	2	12	2801	2812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14141826
2	NC_002774	GAAAAA	2	12	3760	3771	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	14141826
3	NC_002774	AAAAAT	2	12	4690	4701	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	14141827
4	NC_002774	TTTTAT	2	12	5593	5604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	14141829
5	NC_002774	TTGTTA	2	12	7182	7193	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	14141833
6	NC_002774	CTCTTG	2	12	8657	8668	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	14141835
7	NC_002774	GTTTAA	2	12	9026	9037	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	14141837
8	NC_002774	TAAATC	2	12	10331	10342	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	14141839
9	NC_002774	GCTTTT	2	12	10737	10748	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	14141839
10	NC_002774	TTTTAC	2	12	13019	13030	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	14141842
11	NC_002774	ATCTAT	2	12	13350	13361	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	14141842
12	NC_002774	TTTATT	2	12	13663	13674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	14141843
13	NC_002774	GTTTAA	2	12	14999	15010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	14141846
14	NC_002774	GATAAT	2	12	18399	18410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	14141849
15	NC_002774	CATATA	2	12	18687	18698	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	14141850
16	NC_002774	TATCAA	2	12	19011	19022	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	14141850
17	NC_002774	GTTTAA	2	12	19766	19777	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	14141852
18	NC_002774	TTTATT	2	12	22165	22176	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	14141855
19	NC_002774	GGAATT	2	12	22628	22639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14141855
20	NC_002774	AAAATC	2	12	23558	23569	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	14141856
21	NC_002774	TAATGA	2	12	23814	23825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	14141856

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.