MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfolobus solfataricus P2 chromosome

Total Repeats: 54025

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002754	TCT	2	6	177942	177947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897156
3502	NC_002754	TCTA	2	8	177959	177966	25 %	50 %	0 %	25 %	15897156
3503	NC_002754	GCAA	2	8	178023	178030	50 %	0 %	25 %	25 %	15897156
3504	NC_002754	TCAC	2	8	178058	178065	25 %	25 %	0 %	50 %	15897157
3505	NC_002754	TTA	2	6	178131	178136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897157
3506	NC_002754	TCA	2	6	178244	178249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897157
3507	NC_002754	TCT	2	6	178254	178259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897157
3508	NC_002754	ATA	2	6	178303	178308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897157
3509	NC_002754	CAG	2	6	178332	178337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15897157
3510	NC_002754	CAT	2	6	178357	178362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897157
3511	NC_002754	TGA	2	6	178406	178411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897157
3512	NC_002754	CCA	2	6	178427	178432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15897157
3513	NC_002754	CTAC	2	8	178490	178497	25 %	25 %	0 %	50 %	15897157
3514	NC_002754	TAT	2	6	178518	178523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897157
3515	NC_002754	CTC	2	6	178537	178542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15897157
3516	NC_002754	AGCTAG	2	12	178548	178559	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15897157
3517	NC_002754	ATA	2	6	178617	178622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897157
3518	NC_002754	CAT	2	6	178692	178697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897157
3519	NC_002754	CAA	2	6	178842	178847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15897157
3520	NC_002754	T	6	6	178914	178919	0 %	100 %	0 %	0 %	15897157
3521	NC_002754	GA	4	8	178932	178939	50 %	0 %	50 %	0 %	15897157
3522	NC_002754	TCT	2	6	178970	178975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897157
3523	NC_002754	TA	3	6	179033	179038	50 %	50 %	0 %	0 %	15897157
3524	NC_002754	TCT	2	6	179039	179044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897157
3525	NC_002754	TCT	2	6	179057	179062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897157
3526	NC_002754	TTA	2	6	179133	179138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897157
3527	NC_002754	ACC	2	6	179143	179148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15897157
3528	NC_002754	ACT	2	6	179224	179229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897157
3529	NC_002754	TCC	2	6	179266	179271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15897157
3530	NC_002754	CCTA	2	8	179284	179291	25 %	25 %	0 %	50 %	15897157
3531	NC_002754	CTC	2	6	179379	179384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15897157
3532	NC_002754	AAC	2	6	179402	179407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15897157
3533	NC_002754	ATC	2	6	179603	179608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897158
3534	NC_002754	CTATAA	2	12	179699	179710	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897158
3535	NC_002754	TCT	2	6	179745	179750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897158
3536	NC_002754	ATT	2	6	179754	179759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897158
3537	NC_002754	CTC	2	6	179785	179790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15897158
3538	NC_002754	TCA	2	6	179821	179826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897158
3539	NC_002754	CTA	2	6	179852	179857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897158
3540	NC_002754	TTCT	2	8	179900	179907	0 %	75 %	0 %	25 %	15897158
3541	NC_002754	ATTT	2	8	179954	179961	25 %	75 %	0 %	0 %	15897158
3542	NC_002754	CAG	2	6	179975	179980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15897158
3543	NC_002754	ACA	2	6	179998	180003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15897158
3544	NC_002754	TACA	2	8	180063	180070	50 %	25 %	0 %	25 %	15897158
3545	NC_002754	CTC	2	6	180134	180139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15897158
3546	NC_002754	AAAT	2	8	180194	180201	75 %	25 %	0 %	0 %	15897158
3547	NC_002754	CAG	2	6	180233	180238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15897158
3548	NC_002754	AT	3	6	180245	180250	50 %	50 %	0 %	0 %	15897158
3549	NC_002754	CTG	2	6	180386	180391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15897158
3550	NC_002754	TCT	2	6	180568	180573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897158
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3552	NC_002754	TA	3	6	180737	180742	50 %	50 %	0 %	0 %	15897158
3553	NC_002754	TCT	2	6	180773	180778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897158
3554	NC_002754	TCT	2	6	180812	180817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897158
3555	NC_002754	ATGT	2	8	180832	180839	25 %	50 %	25 %	0 %	15897158
3556	NC_002754	AT	4	8	180844	180851	50 %	50 %	0 %	0 %	15897158
3557	NC_002754	TA	3	6	180861	180866	50 %	50 %	0 %	0 %	15897159
3558	NC_002754	GAT	2	6	180935	180940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897159
3559	NC_002754	ATA	2	6	180950	180955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897159
3560	NC_002754	AAAT	2	8	180957	180964	75 %	25 %	0 %	0 %	15897159
3561	NC_002754	ATT	2	6	180993	180998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897159
3562	NC_002754	T	7	7	180997	181003	0 %	100 %	0 %	0 %	15897159
3563	NC_002754	ATA	2	6	181053	181058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897159
3564	NC_002754	GTA	2	6	181061	181066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897159
3565	NC_002754	TAGAA	2	10	181081	181090	60 %	20 %	20 %	0 %	15897159
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3567	NC_002754	AGA	2	6	181172	181177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15897159
3568	NC_002754	CTA	2	6	181188	181193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897159
3569	NC_002754	ATT	2	6	181195	181200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897159
3570	NC_002754	AT	3	6	181247	181252	50 %	50 %	0 %	0 %	15897159
3571	NC_002754	A	6	6	181310	181315	100 %	0 %	0 %	0 %	15897159
3572	NC_002754	TTA	2	6	181333	181338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897159
3573	NC_002754	TACCA	2	10	181854	181863	40 %	20 %	0 %	40 %	15897160
3574	NC_002754	ATA	2	6	181873	181878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897160
3575	NC_002754	TA	3	6	181877	181882	50 %	50 %	0 %	0 %	15897160
3576	NC_002754	TTG	2	6	181928	181933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15897160
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3579	NC_002754	CTT	2	6	182041	182046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897160
3580	NC_002754	GTAT	2	8	182076	182083	25 %	50 %	25 %	0 %	15897160
3581	NC_002754	CCTT	2	8	182123	182130	0 %	50 %	0 %	50 %	15897160
3582	NC_002754	GCA	2	6	182144	182149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15897160
3583	NC_002754	AAT	2	6	182160	182165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897160
3584	NC_002754	CTA	2	6	182184	182189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897160
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3588	NC_002754	AGC	2	6	182389	182394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15897160
3589	NC_002754	AAC	2	6	182432	182437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15897160
3590	NC_002754	TTA	2	6	182456	182461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897160
3591	NC_002754	CTA	2	6	182478	182483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897160
3592	NC_002754	CTA	2	6	182498	182503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897160
3593	NC_002754	AGA	2	6	182545	182550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15897160
3594	NC_002754	TAT	2	6	182641	182646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897160
3595	NC_002754	CAT	2	6	182673	182678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897160
3596	NC_002754	TAA	2	6	182689	182694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897160
3597	NC_002754	TAA	2	6	182750	182755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897161
3598	NC_002754	CTCAAC	2	12	182759	182770	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15897161
3599	NC_002754	TGA	2	6	182792	182797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897161
3600	NC_002754	A	6	6	182797	182802	100 %	0 %	0 %	0 %	15897161
3601	NC_002754	ATT	2	6	182840	182845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897161
3602	NC_002754	TACCT	2	10	182915	182924	20 %	40 %	0 %	40 %	15897161
3603	NC_002754	T	7	7	182926	182932	0 %	100 %	0 %	0 %	15897161
3604	NC_002754	ATC	2	6	182963	182968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897161
3605	NC_002754	TA	3	6	182998	183003	50 %	50 %	0 %	0 %	15897161
3606	NC_002754	TAT	2	6	183016	183021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897161
3607	NC_002754	AT	3	6	183137	183142	50 %	50 %	0 %	0 %	15897161
3608	NC_002754	TAT	3	9	183140	183148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897161
3609	NC_002754	TTC	2	6	183224	183229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897161
3610	NC_002754	CTT	2	6	183272	183277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897161
3611	NC_002754	TC	3	6	183283	183288	0 %	50 %	0 %	50 %	15897161
3612	NC_002754	TCTT	2	8	183293	183300	0 %	75 %	0 %	25 %	15897161
3613	NC_002754	TAGA	2	8	183325	183332	50 %	25 %	25 %	0 %	15897161
3614	NC_002754	CAT	2	6	183352	183357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897161
3615	NC_002754	GATTA	2	10	183392	183401	40 %	40 %	20 %	0 %	15897161
3616	NC_002754	CTT	2	6	183413	183418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15897161
3617	NC_002754	AAT	2	6	183562	183567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15897161
3618	NC_002754	ACT	2	6	183610	183615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15897162
3619	NC_002754	CCA	2	6	183647	183652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15897162
3620	NC_002754	CTG	2	6	183684	183689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15897162
3621	NC_002754	CTTAAA	2	12	183694	183705	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15897162
3622	NC_002754	TTA	2	6	183737	183742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897162
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3624	NC_002754	TATC	2	8	183843	183850	25 %	50 %	0 %	25 %	15897162
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3998	NC_002754	ATT	2	6	201922	201927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15897180
3999	NC_002754	TAG	2	6	201928	201933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15897180
4000	NC_002754	GAA	2	6	201944	201949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15897180

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