MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SF370 chromosome

Total Repeats: 620

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002737	TTACGT	2	12	4968	4979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15674255
2	NC_002737	GATTCA	2	12	6763	6774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15674256
3	NC_002737	ATTTTC	2	12	7009	7020	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15674256
4	NC_002737	CTTAAC	2	12	7522	7533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674256
5	NC_002737	TGCTTA	2	12	7996	8007	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15674256
6	NC_002737	TAGATA	2	12	10026	10037	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15674259
7	NC_002737	GTATTG	2	12	11099	11110	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15674260
8	NC_002737	ATCAGA	2	12	11133	11144	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15674260
9	NC_002737	AGATTT	2	12	11721	11732	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15674260
10	NC_002737	TAAAAT	2	12	14038	14049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674261
11	NC_002737	GAATCT	2	12	14765	14776	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15674261
12	NC_002737	CTGCAA	2	12	31129	31140	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15674263
13	NC_002737	ACTGAG	2	12	36852	36863	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15674269
14	NC_002737	CAGGCG	2	12	37306	37317	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	15674269
15	NC_002737	AAAGCC	2	12	46884	46895	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15674274
16	NC_002737	CTTTGC	2	12	47087	47098	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15674274
17	NC_002737	AGACAG	2	12	48942	48953	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15674276
18	NC_002737	ATAAAA	2	12	49856	49867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15674277
19	NC_002737	AAAAGT	2	12	52726	52737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15674279
20	NC_002737	CGAACA	2	12	54770	54781	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15674280
21	NC_002737	ATAACT	2	12	55189	55200	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15674281
22	NC_002737	AAGGAA	2	12	55695	55706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674282
23	NC_002737	GCCTTT	2	12	61697	61708	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15674284
24	NC_002737	GGCAAC	2	12	63046	63057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674285
25	NC_002737	AAAGGT	2	12	64604	64615	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15674287
26	NC_002737	CTTGTT	2	12	65374	65385	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15674288
27	NC_002737	AGCTGA	2	12	65822	65833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15674289
28	NC_002737	CGCAAT	2	12	67225	67236	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15674292
29	NC_002737	ATTGAA	2	12	67637	67648	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15674293
30	NC_002737	ACATCA	2	12	67773	67784	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15674293
31	NC_002737	CAAAGG	2	12	71816	71827	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15674302
32	NC_002737	AAATTA	2	12	72878	72889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674305
33	NC_002737	GCGGTG	2	12	73391	73402	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	15674306
34	NC_002737	TAAAGA	2	12	73752	73763	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15674307
35	NC_002737	ATTGAA	2	12	75952	75963	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15674309
36	NC_002737	CGAAGG	2	12	98772	98783	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15674322
37	NC_002737	CTGGTA	2	12	100769	100780	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15674322
38	NC_002737	ATATTT	2	12	101552	101563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674324
39	NC_002737	CTTTTT	2	12	102761	102772	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15674325
40	NC_002737	AACCTT	2	12	114382	114393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674340
41	NC_002737	CAGCAA	2	12	115136	115147	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15674341
42	NC_002737	TTTTTA	2	12	127334	127345	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15674350
43	NC_002737	AATAGC	2	12	130149	130160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15674352
44	NC_002737	ATCTTG	2	12	134652	134663	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15674358
45	NC_002737	AAAAGC	2	12	136226	136237	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15674358
46	NC_002737	TTTATT	2	12	136412	136423	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15674358
47	NC_002737	ATGTCA	2	12	136563	136574	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15674358
48	NC_002737	AAAGCT	2	12	138049	138060	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15674361
49	NC_002737	AAGGTA	2	12	145881	145892	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15674367
50	NC_002737	AAAACT	2	12	148496	148507	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15674368
51	NC_002737	TATTGA	2	12	150090	150101	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15674370
52	NC_002737	AAGGCT	2	12	154180	154191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15674374
53	NC_002737	CCAATC	2	12	158408	158419	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15674378
54	NC_002737	TGCTGT	2	12	161161	161172	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15674379
55	NC_002737	GGTGTT	2	12	164828	164839	0 %	50 %	50 %	0 %	15674385
56	NC_002737	GATGTT	2	12	165854	165865	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15674386
57	NC_002737	AGATCA	2	12	165878	165889	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15674386
58	NC_002737	GATGTT	2	12	175202	175213	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15674392
59	NC_002737	TCTTAT	2	12	176685	176696	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	15674394
60	NC_002737	GTGGAA	2	12	181554	181565	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15674399
61	NC_002737	TCTTTG	2	12	183636	183647	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15674402
62	NC_002737	TGGGAG	2	12	185381	185392	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	15674403
63	NC_002737	TGACTG	2	12	185550	185561	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15674403
64	NC_002737	TTGACC	2	12	186011	186022	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15674404
65	NC_002737	CCTATC	2	12	187017	187028	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15674406
66	NC_002737	ATCGGT	2	12	191923	191934	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15674409
67	NC_002737	TCAACA	2	12	194277	194288	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15674410
68	NC_002737	TGAAAA	2	12	201297	201308	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15674417
69	NC_002737	ATTAGC	2	12	207799	207810	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15674423
70	NC_002737	TCATGC	2	12	214726	214737	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15674429
71	NC_002737	TCCCAT	2	12	218663	218674	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15674433
72	NC_002737	AAGGCC	2	12	222423	222434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674437
73	NC_002737	TACCCA	2	12	228312	228323	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15674443
74	NC_002737	GATACG	2	12	229340	229351	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15674445
75	NC_002737	AGGCAA	2	12	233238	233249	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15674449
76	NC_002737	GCAAGA	2	12	237315	237326	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15674452
77	NC_002737	TTCGAA	2	12	238714	238725	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15674452
78	NC_002737	TGGCAA	2	12	241355	241366	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15674454
79	NC_002737	CCAGAA	2	12	241687	241698	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15674454
80	NC_002737	CAGCAA	2	12	242712	242723	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15674455
81	NC_002737	GGCTGT	2	12	248048	248059	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15674459
82	NC_002737	AGTGAC	2	12	249923	249934	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15674461
83	NC_002737	AGCCAA	2	12	252449	252460	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15674464
84	NC_002737	AAAATC	2	12	262668	262679	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15674469
85	NC_002737	TAAAAA	2	12	273787	273798	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15674473
86	NC_002737	TCAAGA	2	12	280037	280048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15674482
87	NC_002737	GGGTTA	2	12	285046	285057	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15674487
88	NC_002737	GACAAT	2	12	287082	287093	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15674489
89	NC_002737	CCAGCT	2	12	288907	288918	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15674490
90	NC_002737	CCAATT	2	12	297807	297818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674498
91	NC_002737	CCAACG	2	12	297973	297984	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15674498
92	NC_002737	ATAACC	2	12	300417	300428	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15674499
93	NC_002737	GCACCT	2	12	303005	303016	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	15674501
94	NC_002737	AGCAGG	2	12	304855	304866	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15674503
95	NC_002737	ATGATT	2	12	319406	319417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15674521
96	NC_002737	TATCGC	2	12	319639	319650	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15674521
97	NC_002737	AAGACC	2	12	320282	320293	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15674522
98	NC_002737	GATAAA	2	12	323310	323321	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15674525
99	NC_002737	AAATTA	2	12	323829	323840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674525
100	NC_002737	TGAGGT	2	12	325145	325156	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15674527
101	NC_002737	GCAGAG	2	12	344801	344812	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15674549
102	NC_002737	CATTAT	2	12	347090	347101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15674549
103	NC_002737	CAGCAA	2	12	348942	348953	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	15674549
104	NC_002737	CAGAAG	2	12	358688	358699	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	15674556
105	NC_002737	GAAAAC	2	12	364690	364701	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15674565
106	NC_002737	TTGTCT	2	12	366645	366656	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	15674566
107	NC_002737	TATTGA	2	12	370803	370814	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15674572
108	NC_002737	AAAAGT	2	12	377925	377936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15674578
109	NC_002737	GCTAAA	2	12	379415	379426	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15674580
110	NC_002737	GAAAAA	2	12	381124	381135	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	15674582
111	NC_002737	TTTACC	2	12	381343	381354	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15674583
112	NC_002737	TCATGT	2	12	384211	384222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15674586
113	NC_002737	GAGAAG	2	12	395592	395603	50 %	0 %	50 %	0 %	15674599
114	NC_002737	TCCTTT	2	12	396711	396722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674601
115	NC_002737	ACGCAT	2	12	398094	398105	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15674602
116	NC_002737	TTGATA	2	12	404427	404438	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15674608
117	NC_002737	TGATAA	2	12	410202	410213	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15674614
118	NC_002737	TAATTC	2	12	411316	411327	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15674615
119	NC_002737	TGCTGG	2	12	417837	417848	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15674621
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235	NC_002737	TTTAGG	2	12	748783	748794	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	15674926
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348	NC_002737	TCCCAT	2	12	1061242	1061253	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	15675237
349	NC_002737	TTATCC	2	12	1062023	1062034	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15675237
350	NC_002737	TTATCA	2	12	1063637	1063648	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15675240
351	NC_002737	ATTGTA	2	12	1063795	1063806	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15675240
352	NC_002737	TTAATA	2	12	1064054	1064065	50 %	50 %	0 %	0 %	15675240
353	NC_002737	ATTATC	2	12	1070982	1070993	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15675246
354	NC_002737	TTAAGT	2	12	1074905	1074916	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	15675249
355	NC_002737	AAATCA	2	12	1077758	1077769	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15675252
356	NC_002737	ATATAG	2	12	1078599	1078610	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15675253
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360	NC_002737	ACAGCC	2	12	1089505	1089516	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15675261
361	NC_002737	CTTGAC	2	12	1091779	1091790	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15675262
362	NC_002737	TAACTG	2	12	1092379	1092390	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15675262
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367	NC_002737	ATCCTT	2	12	1104943	1104954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15675272
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444	NC_002737	TTCCTC	2	12	1353187	1353198	0 %	50 %	0 %	50 %	15675506
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446	NC_002737	GATCTA	2	12	1363526	1363537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15675516
447	NC_002737	TAGCAA	2	12	1366046	1366057	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15675519
448	NC_002737	CAAAAT	2	12	1370480	1370491	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	15675522
449	NC_002737	ATAGGT	2	12	1372430	1372441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675524
450	NC_002737	ATCTCA	2	12	1372452	1372463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15675524
451	NC_002737	CATTAA	2	12	1372471	1372482	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15675524
452	NC_002737	AGCATG	2	12	1373021	1373032	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15675524
453	NC_002737	ACTGAC	2	12	1373263	1373274	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15675524
454	NC_002737	AAATTG	2	12	1373432	1373443	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15675524
455	NC_002737	CTTTTT	2	12	1378524	1378535	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15675529
456	NC_002737	TTGGTC	2	12	1384272	1384283	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15675533
457	NC_002737	CAATCA	2	12	1389046	1389057	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15675537
458	NC_002737	GTCACC	2	12	1391474	1391485	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	161378148
459	NC_002737	CAGAGC	2	12	1394559	1394570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675542
460	NC_002737	CAGAGC	2	12	1394835	1394846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15675542
461	NC_002737	CCCAAT	2	12	1396073	1396084	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	15675543
462	NC_002737	GTCCGT	2	12	1397520	1397531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15675544
463	NC_002737	TGGCTA	2	12	1400638	1400649	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	15675546
464	NC_002737	TGATGG	2	12	1404325	1404336	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	15675549
465	NC_002737	CTTCAG	2	12	1410307	1410318	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15675554
466	NC_002737	TGAGCA	2	12	1410681	1410692	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15675555
467	NC_002737	AAAGCT	2	12	1414814	1414825	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15675559
468	NC_002737	AAGCAA	2	12	1421974	1421985	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15675567
469	NC_002737	TAGCCA	2	12	1424569	1424580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15675570
470	NC_002737	ACCTTT	2	12	1425710	1425721	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15675571
471	NC_002737	CCTTAG	2	12	1426354	1426365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15675571
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474	NC_002737	TTGCTG	2	12	1441287	1441298	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	15675588
475	NC_002737	TGACTT	2	12	1443962	1443973	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15675591
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479	NC_002737	CCTTTG	2	12	1456107	1456118	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15675605
480	NC_002737	TGACAA	2	12	1458255	1458266	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15675606
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482	NC_002737	ACTGCT	2	12	1459108	1459119	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	15675606
483	NC_002737	ACTTCT	2	12	1459492	1459503	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15675607
484	NC_002737	TTCAGT	2	12	1459815	1459826	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15675607
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488	NC_002737	GGATAT	2	12	1470937	1470948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15675619
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490	NC_002737	GCAAAA	2	12	1480151	1480162	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15675626
491	NC_002737	AGACAA	2	12	1484789	1484800	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	15675630
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500	NC_002737	GTCAAT	2	12	1514561	1514572	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15675653

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