MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SF370 chromosome

Total Repeats: 32412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002737	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	15674251
2	NC_002737	T	6	6	310	315	0 %	100 %	0 %	0 %	15674251
3	NC_002737	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674251
4	NC_002737	A	7	7	395	401	100 %	0 %	0 %	0 %	15674251
5	NC_002737	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674251
6	NC_002737	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674251
7	NC_002737	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674251
8	NC_002737	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674251
9	NC_002737	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674251
10	NC_002737	AT	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	15674251
11	NC_002737	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674251
12	NC_002737	GAAA	2	8	837	844	75 %	0 %	25 %	0 %	15674251
13	NC_002737	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674251
14	NC_002737	A	7	7	895	901	100 %	0 %	0 %	0 %	15674251
15	NC_002737	CT	3	6	904	909	0 %	50 %	0 %	50 %	15674251
16	NC_002737	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674251
17	NC_002737	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674251
18	NC_002737	ACAA	2	8	959	966	75 %	0 %	0 %	25 %	15674251
19	NC_002737	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674251
20	NC_002737	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674251
21	NC_002737	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15674251
22	NC_002737	CAAA	2	8	1224	1231	75 %	0 %	0 %	25 %	15674251
23	NC_002737	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674251
24	NC_002737	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674251
25	NC_002737	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674251
26	NC_002737	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15674251
27	NC_002737	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674251
28	NC_002737	A	6	6	1569	1574	100 %	0 %	0 %	0 %	15674251
29	NC_002737	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674252
30	NC_002737	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674252
31	NC_002737	GTAA	2	8	1919	1926	50 %	25 %	25 %	0 %	15674252
32	NC_002737	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674252
33	NC_002737	T	7	7	1981	1987	0 %	100 %	0 %	0 %	15674252
34	NC_002737	ATT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674252
35	NC_002737	AAC	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674252
36	NC_002737	GTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674252
37	NC_002737	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674252
38	NC_002737	ATT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674252
39	NC_002737	TAT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674252
40	NC_002737	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674252
41	NC_002737	GACT	2	8	2278	2285	25 %	25 %	25 %	25 %	15674252
42	NC_002737	CAG	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674252
43	NC_002737	GA	3	6	2365	2370	50 %	0 %	50 %	0 %	15674252
44	NC_002737	CAG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674252
45	NC_002737	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674252
46	NC_002737	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674252
47	NC_002737	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674252
48	NC_002737	CTT	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674252
49	NC_002737	GGTAA	2	10	2666	2675	40 %	20 %	40 %	0 %	15674252
50	NC_002737	AGTC	2	8	2696	2703	25 %	25 %	25 %	25 %	15674252
51	NC_002737	GAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674252
52	NC_002737	AATT	2	8	2850	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	15674252
53	NC_002737	TAAG	2	8	2876	2883	50 %	25 %	25 %	0 %	15674252
54	NC_002737	TGAAA	2	10	2976	2985	60 %	20 %	20 %	0 %	15674253
55	NC_002737	A	6	6	2983	2988	100 %	0 %	0 %	0 %	15674253
56	NC_002737	ATG	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674253
57	NC_002737	A	7	7	3129	3135	100 %	0 %	0 %	0 %	15674253
58	NC_002737	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674254
59	NC_002737	GCT	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674254
60	NC_002737	TGGTA	2	10	3602	3611	20 %	40 %	40 %	0 %	15674254
61	NC_002737	A	7	7	3660	3666	100 %	0 %	0 %	0 %	15674254
62	NC_002737	AAAT	2	8	3740	3747	75 %	25 %	0 %	0 %	15674254
63	NC_002737	TGA	3	9	3800	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674254
64	NC_002737	TCAA	2	8	3906	3913	50 %	25 %	0 %	25 %	15674254
65	NC_002737	A	6	6	3934	3939	100 %	0 %	0 %	0 %	15674254
66	NC_002737	AGA	2	6	4046	4051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674254
67	NC_002737	GTT	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674254
68	NC_002737	AAC	2	6	4085	4090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674254
69	NC_002737	CAAA	2	8	4160	4167	75 %	0 %	0 %	25 %	15674254
70	NC_002737	AGT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674254
71	NC_002737	AGA	3	9	4223	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674254
72	NC_002737	AGA	2	6	4259	4264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674254
73	NC_002737	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674254
74	NC_002737	ATC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674254
75	NC_002737	CAG	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674254
76	NC_002737	GCT	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674254
77	NC_002737	TAT	2	6	4421	4426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674254
78	NC_002737	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674254
79	NC_002737	AAG	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674254
80	NC_002737	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674254
81	NC_002737	TGT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674254
82	NC_002737	CAT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674254
83	NC_002737	TTG	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15674255
84	NC_002737	A	6	6	4711	4716	100 %	0 %	0 %	0 %	15674255
85	NC_002737	GAT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674255
86	NC_002737	TTA	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674255
87	NC_002737	CTA	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674255
88	NC_002737	AAT	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674255
89	NC_002737	CTA	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674255
90	NC_002737	ATG	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674255
91	NC_002737	TTACGT	2	12	4968	4979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15674255
92	NC_002737	CAG	2	6	4990	4995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674255
93	NC_002737	GAC	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674255
94	NC_002737	TTA	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674255
95	NC_002737	ATA	2	6	5131	5136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674255
96	NC_002737	TTTA	2	8	5182	5189	25 %	75 %	0 %	0 %	15674255
97	NC_002737	A	6	6	5206	5211	100 %	0 %	0 %	0 %	15674255
98	NC_002737	ATT	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674256
99	NC_002737	ACC	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15674256
100	NC_002737	GAT	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674256
101	NC_002737	A	9	9	5379	5387	100 %	0 %	0 %	0 %	15674256
102	NC_002737	TGA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674256
103	NC_002737	T	6	6	5474	5479	0 %	100 %	0 %	0 %	15674256
104	NC_002737	TGA	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674256
105	NC_002737	TTA	2	6	5736	5741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674256
106	NC_002737	T	6	6	5819	5824	0 %	100 %	0 %	0 %	15674256
107	NC_002737	GAT	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674256
108	NC_002737	AAC	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674256
109	NC_002737	TTA	2	6	5898	5903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674256
110	NC_002737	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674256
111	NC_002737	A	6	6	5993	5998	100 %	0 %	0 %	0 %	15674256
112	NC_002737	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674256
113	NC_002737	A	6	6	6028	6033	100 %	0 %	0 %	0 %	15674256
114	NC_002737	ATT	2	6	6070	6075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674256
115	NC_002737	ATT	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15674256
116	NC_002737	T	6	6	6128	6133	0 %	100 %	0 %	0 %	15674256
117	NC_002737	GAT	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674256
118	NC_002737	GATTT	2	10	6168	6177	20 %	60 %	20 %	0 %	15674256
119	NC_002737	AGA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674256
120	NC_002737	ACT	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15674256
121	NC_002737	CTT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15674256
122	NC_002737	T	6	6	6368	6373	0 %	100 %	0 %	0 %	15674256
123	NC_002737	TTGA	2	8	6389	6396	25 %	50 %	25 %	0 %	15674256
124	NC_002737	A	7	7	6414	6420	100 %	0 %	0 %	0 %	15674256
125	NC_002737	AAC	2	6	6424	6429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15674256
126	NC_002737	ACGA	2	8	6462	6469	50 %	0 %	25 %	25 %	15674256
127	NC_002737	CCTT	2	8	6502	6509	0 %	50 %	0 %	50 %	15674256
128	NC_002737	AGTG	2	8	6511	6518	25 %	25 %	50 %	0 %	15674256
129	NC_002737	TGA	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674256
130	NC_002737	ACG	2	6	6640	6645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15674256
131	NC_002737	GATTCA	2	12	6763	6774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	15674256
132	NC_002737	TAG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674256
133	NC_002737	CTG	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15674256
134	NC_002737	TAA	2	6	6895	6900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15674256
135	NC_002737	ATG	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15674256
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137	NC_002737	AAG	2	6	6991	6996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15674256
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