MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 chromosome

Total Repeats: 58461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_000911	GGT	2	6	242641	242646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329388
4002	NC_000911	T	6	6	242710	242715	0 %	100 %	0 %	0 %	16329388
4003	NC_000911	TTA	2	6	242762	242767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329388
4004	NC_000911	CAC	2	6	242878	242883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329388
4005	NC_000911	TTTA	2	8	243019	243026	25 %	75 %	0 %	0 %	16329388
4006	NC_000911	GGCA	2	8	243345	243352	25 %	0 %	50 %	25 %	16329389
4007	NC_000911	TTAA	2	8	243353	243360	50 %	50 %	0 %	0 %	16329389
4008	NC_000911	AGAT	2	8	243369	243376	50 %	25 %	25 %	0 %	16329389
4009	NC_000911	CCA	2	6	243390	243395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329389
4010	NC_000911	GGC	2	6	243424	243429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329389
4011	NC_000911	A	6	6	243491	243496	100 %	0 %	0 %	0 %	16329389
4012	NC_000911	ACA	2	6	243499	243504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329389
4013	NC_000911	G	6	6	243556	243561	0 %	0 %	100 %	0 %	16329389
4014	NC_000911	T	6	6	243606	243611	0 %	100 %	0 %	0 %	16329389
4015	NC_000911	CAT	2	6	243628	243633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329389
4016	NC_000911	GGC	2	6	243697	243702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329389
4017	NC_000911	GTACA	2	10	243738	243747	40 %	20 %	20 %	20 %	16329389
4018	NC_000911	TAA	2	6	243832	243837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329389
4019	NC_000911	AGGT	2	8	243946	243953	25 %	25 %	50 %	0 %	16329389
4020	NC_000911	GTC	2	6	243993	243998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329389
4021	NC_000911	AGACA	2	10	244010	244019	60 %	0 %	20 %	20 %	16329389
4022	NC_000911	CAAA	2	8	244165	244172	75 %	0 %	0 %	25 %	16329390
4023	NC_000911	CTG	2	6	244189	244194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329390
4024	NC_000911	A	6	6	244195	244200	100 %	0 %	0 %	0 %	16329390
4025	NC_000911	T	7	7	244246	244252	0 %	100 %	0 %	0 %	16329390
4026	NC_000911	TGG	2	6	244315	244320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329390
4027	NC_000911	TGT	2	6	244353	244358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329390
4028	NC_000911	CAAA	2	8	244372	244379	75 %	0 %	0 %	25 %	16329390
4029	NC_000911	CGG	2	6	244433	244438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329390
4030	NC_000911	AGGAA	2	10	244536	244545	60 %	0 %	40 %	0 %	16329390
4031	NC_000911	T	6	6	244610	244615	0 %	100 %	0 %	0 %	16329390
4032	NC_000911	ACC	2	6	244617	244622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329390
4033	NC_000911	ATT	2	6	244707	244712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329390
4034	NC_000911	TTAA	2	8	244783	244790	50 %	50 %	0 %	0 %	16329391
4035	NC_000911	TTC	3	9	244792	244800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329391
4036	NC_000911	GCAAA	2	10	244818	244827	60 %	0 %	20 %	20 %	16329391
4037	NC_000911	AAT	2	6	244858	244863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329391
4038	NC_000911	AGT	2	6	244882	244887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329391
4039	NC_000911	TTG	2	6	244896	244901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329391
4040	NC_000911	A	7	7	244904	244910	100 %	0 %	0 %	0 %	16329391
4041	NC_000911	GCC	2	6	244919	244924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329391
4042	NC_000911	CAC	2	6	244939	244944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329391
4043	NC_000911	AATT	2	8	244957	244964	50 %	50 %	0 %	0 %	16329391
4044	NC_000911	GATT	2	8	245028	245035	25 %	50 %	25 %	0 %	16329391
4045	NC_000911	TCC	2	6	245036	245041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329391
4046	NC_000911	AATT	2	8	245194	245201	50 %	50 %	0 %	0 %	16329391
4047	NC_000911	CCA	2	6	245202	245207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329391
4048	NC_000911	GCCG	2	8	245209	245216	0 %	0 %	50 %	50 %	16329391
4049	NC_000911	TCA	2	6	245229	245234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329391
4050	NC_000911	GGC	2	6	245305	245310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329391
4051	NC_000911	AAT	2	6	245365	245370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329391
4052	NC_000911	TG	3	6	245508	245513	0 %	50 %	50 %	0 %	16329392
4053	NC_000911	CCGT	2	8	245523	245530	0 %	25 %	25 %	50 %	16329392
4054	NC_000911	CGC	2	6	245610	245615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329392
4055	NC_000911	GCC	2	6	245686	245691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329392
4056	NC_000911	CA	4	8	245740	245747	50 %	0 %	0 %	50 %	16329392
4057	NC_000911	ATC	2	6	245775	245780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329392
4058	NC_000911	GGT	2	6	245808	245813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329392
4059	NC_000911	ACC	2	6	245839	245844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329392
4060	NC_000911	CAG	2	6	246071	246076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329392
4061	NC_000911	T	6	6	246077	246082	0 %	100 %	0 %	0 %	16329392
4062	NC_000911	CCA	2	6	246177	246182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329392
4063	NC_000911	GGT	2	6	246262	246267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329392
4064	NC_000911	CAT	2	6	246276	246281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329392
4065	NC_000911	CTT	2	6	246560	246565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329392
4066	NC_000911	G	7	7	246742	246748	0 %	0 %	100 %	0 %	16329392
4067	NC_000911	TAA	2	6	246756	246761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329392
4068	NC_000911	CTT	2	6	246779	246784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329392
4069	NC_000911	A	6	6	246913	246918	100 %	0 %	0 %	0 %	16329392
4070	NC_000911	AGG	2	6	246974	246979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16329392
4071	NC_000911	AAAT	2	8	247172	247179	75 %	25 %	0 %	0 %	16329393
4072	NC_000911	TGG	2	6	247310	247315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329393
4073	NC_000911	TGA	2	6	247380	247385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329393
4074	NC_000911	CCA	2	6	247407	247412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329393
4075	NC_000911	TCT	2	6	247436	247441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329393
4076	NC_000911	AGA	2	6	247555	247560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329393
4077	NC_000911	CTTCT	2	10	247656	247665	0 %	60 %	0 %	40 %	16329394
4078	NC_000911	CGG	2	6	247776	247781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329394
4079	NC_000911	TGG	2	6	247854	247859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329394
4080	NC_000911	ACC	2	6	247883	247888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329394
4081	NC_000911	AGC	2	6	247915	247920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329394
4082	NC_000911	AGC	2	6	247939	247944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329394
4083	NC_000911	TGGCTT	2	12	247974	247985	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	16329394
4084	NC_000911	CCTC	2	8	247988	247995	0 %	25 %	0 %	75 %	16329394
4085	NC_000911	G	8	8	248071	248078	0 %	0 %	100 %	0 %	16329394
4086	NC_000911	CGC	2	6	248091	248096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329394
4087	NC_000911	ATT	2	6	248180	248185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329394
4088	NC_000911	ACC	2	6	248257	248262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329394
4089	NC_000911	CCCT	2	8	248324	248331	0 %	25 %	0 %	75 %	16329394
4090	NC_000911	CAG	2	6	248365	248370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329394
4091	NC_000911	GGTC	2	8	248473	248480	0 %	25 %	50 %	25 %	16329394
4092	NC_000911	CT	3	6	248502	248507	0 %	50 %	0 %	50 %	16329394
4093	NC_000911	TTA	2	6	248648	248653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329394
4094	NC_000911	GGA	3	9	248659	248667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16329394
4095	NC_000911	TCC	2	6	249079	249084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329395
4096	NC_000911	A	6	6	249100	249105	100 %	0 %	0 %	0 %	16329395
4097	NC_000911	TGG	2	6	249110	249115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329395
4098	NC_000911	AGTT	2	8	249195	249202	25 %	50 %	25 %	0 %	16329395
4099	NC_000911	GGA	2	6	249238	249243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16329395
4100	NC_000911	AAGA	2	8	249296	249303	75 %	0 %	25 %	0 %	16329395
4101	NC_000911	TAA	2	6	249367	249372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329395
4102	NC_000911	ACT	2	6	249382	249387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329395
4103	NC_000911	GGC	2	6	249391	249396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329395
4104	NC_000911	AAGC	2	8	249454	249461	50 %	0 %	25 %	25 %	16329395
4105	NC_000911	CGA	2	6	249484	249489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329395
4106	NC_000911	AGGA	2	8	249576	249583	50 %	0 %	50 %	0 %	16329395
4107	NC_000911	ATT	2	6	249684	249689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329395
4108	NC_000911	TTC	2	6	249693	249698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329395
4109	NC_000911	A	8	8	249773	249780	100 %	0 %	0 %	0 %	16329395
4110	NC_000911	A	6	6	249828	249833	100 %	0 %	0 %	0 %	16329395
4111	NC_000911	CCTTT	2	10	249892	249901	0 %	60 %	0 %	40 %	16329395
4112	NC_000911	TTG	2	6	249917	249922	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329395
4113	NC_000911	ATG	2	6	249926	249931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329395
4114	NC_000911	CAG	2	6	249989	249994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329395
4115	NC_000911	TTTA	2	8	250041	250048	25 %	75 %	0 %	0 %	16329395
4116	NC_000911	A	6	6	250073	250078	100 %	0 %	0 %	0 %	16329395
4117	NC_000911	GATT	3	12	250112	250123	25 %	50 %	25 %	0 %	16329395
4118	NC_000911	GCCTTC	2	12	250186	250197	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16329396
4119	NC_000911	ATCA	2	8	250215	250222	50 %	25 %	0 %	25 %	16329396
4120	NC_000911	ATT	2	6	250313	250318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329396
4121	NC_000911	AGA	2	6	250324	250329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329396
4122	NC_000911	CTG	2	6	250347	250352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329396
4123	NC_000911	CAA	2	6	250373	250378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329396
4124	NC_000911	CCGAA	2	10	250414	250423	40 %	0 %	20 %	40 %	16329396
4125	NC_000911	TGG	2	6	250471	250476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329396
4126	NC_000911	AGTGGT	2	12	250493	250504	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	16329396
4127	NC_000911	AGT	2	6	250517	250522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329396
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4237	NC_000911	ATAG	2	8	255528	255535	50 %	25 %	25 %	0 %	16329398
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4248	NC_000911	TCCC	2	8	256668	256675	0 %	25 %	0 %	75 %	16329400
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4498	NC_000911	ACTTT	2	10	272266	272275	20 %	60 %	0 %	20 %	16329416
4499	NC_000911	ATT	2	6	272284	272289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329416
4500	NC_000911	TGG	2	6	272323	272328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329416

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