MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 chromosome

Total Repeats: 58461

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000911	AAG	2	6	30597	30602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329194
502	NC_000911	GGT	2	6	30613	30618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329194
503	NC_000911	GATA	2	8	30654	30661	50 %	25 %	25 %	0 %	16329194
504	NC_000911	TTC	2	6	30703	30708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329194
505	NC_000911	CCA	2	6	30768	30773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329194
506	NC_000911	AAAT	2	8	30790	30797	75 %	25 %	0 %	0 %	16329194
507	NC_000911	ATC	2	6	30838	30843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329194
508	NC_000911	TCCAA	2	10	30962	30971	40 %	20 %	0 %	40 %	16329194
509	NC_000911	A	6	6	31031	31036	100 %	0 %	0 %	0 %	16329194
510	NC_000911	TCC	2	6	31048	31053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329194
511	NC_000911	ATA	2	6	31057	31062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329194
512	NC_000911	A	6	6	31096	31101	100 %	0 %	0 %	0 %	16329194
513	NC_000911	GCATG	2	10	31146	31155	20 %	20 %	40 %	20 %	16329194
514	NC_000911	TCGAT	2	10	31249	31258	20 %	40 %	20 %	20 %	16329194
515	NC_000911	AGG	2	6	31475	31480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16329194
516	NC_000911	T	6	6	31564	31569	0 %	100 %	0 %	0 %	16329194
517	NC_000911	TTGA	2	8	31580	31587	25 %	50 %	25 %	0 %	16329194
518	NC_000911	CGG	2	6	31773	31778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329194
519	NC_000911	TAGC	2	8	31928	31935	25 %	25 %	25 %	25 %	16329194
520	NC_000911	CTT	2	6	31947	31952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329194
521	NC_000911	GGA	2	6	32005	32010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16329194
522	NC_000911	TAAGC	2	10	32017	32026	40 %	20 %	20 %	20 %	16329194
523	NC_000911	ATT	2	6	32068	32073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329194
524	NC_000911	TGT	2	6	32103	32108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329194
525	NC_000911	CGC	2	6	32131	32136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329194
526	NC_000911	TCC	2	6	32170	32175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329194
527	NC_000911	AAT	2	6	32206	32211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329194
528	NC_000911	TTG	2	6	32261	32266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329194
529	NC_000911	TTTGG	2	10	32347	32356	0 %	60 %	40 %	0 %	16329194
530	NC_000911	ATT	2	6	32365	32370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329194
531	NC_000911	CTA	2	6	32397	32402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329194
532	NC_000911	T	7	7	32519	32525	0 %	100 %	0 %	0 %	16329195
533	NC_000911	GGC	2	6	32539	32544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329195
534	NC_000911	CCAT	2	8	32579	32586	25 %	25 %	0 %	50 %	16329195
535	NC_000911	ACC	2	6	32633	32638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329195
536	NC_000911	TTAGCC	2	12	32657	32668	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16329195
537	NC_000911	TTTG	2	8	32675	32682	0 %	75 %	25 %	0 %	16329195
538	NC_000911	AAAT	2	8	32745	32752	75 %	25 %	0 %	0 %	16329195
539	NC_000911	GCTT	2	8	32763	32770	0 %	50 %	25 %	25 %	16329195
540	NC_000911	GAT	2	6	32836	32841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329195
541	NC_000911	A	6	6	32859	32864	100 %	0 %	0 %	0 %	16329195
542	NC_000911	ATC	2	6	32873	32878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329195
543	NC_000911	TCC	2	6	32937	32942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329195
544	NC_000911	GGAAC	2	10	33023	33032	40 %	0 %	40 %	20 %	16329196
545	NC_000911	TGGCAA	2	12	33052	33063	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16329196
546	NC_000911	C	6	6	33104	33109	0 %	0 %	0 %	100 %	16329196
547	NC_000911	GGC	2	6	33128	33133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329196
548	NC_000911	GGT	2	6	33134	33139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329196
549	NC_000911	GAA	2	6	33156	33161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329196
550	NC_000911	CAT	2	6	33421	33426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329196
551	NC_000911	GAG	2	6	33512	33517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16329196
552	NC_000911	ATC	2	6	33951	33956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329197
553	NC_000911	CCG	2	6	34036	34041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329197
554	NC_000911	TGG	2	6	34063	34068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329197
555	NC_000911	TCCCA	2	10	34076	34085	20 %	20 %	0 %	60 %	16329197
556	NC_000911	CCA	2	6	34098	34103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329197
557	NC_000911	A	6	6	34125	34130	100 %	0 %	0 %	0 %	16329197
558	NC_000911	CAC	2	6	34156	34161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329197
559	NC_000911	ATT	2	6	34209	34214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329197
560	NC_000911	C	6	6	34215	34220	0 %	0 %	0 %	100 %	16329197
561	NC_000911	GGT	2	6	34250	34255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329197
562	NC_000911	TC	3	6	34323	34328	0 %	50 %	0 %	50 %	16329197
563	NC_000911	CTC	2	6	34348	34353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329197
564	NC_000911	CCCT	2	8	34372	34379	0 %	25 %	0 %	75 %	16329197
565	NC_000911	CTT	2	6	34402	34407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329197
566	NC_000911	TTC	2	6	34445	34450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329197
567	NC_000911	AACC	2	8	34607	34614	50 %	0 %	0 %	50 %	16329197
568	NC_000911	CCG	2	6	34665	34670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329197
569	NC_000911	CTA	2	6	34687	34692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329197
570	NC_000911	GTG	3	9	34705	34713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329197
571	NC_000911	GGC	2	6	34767	34772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329197
572	NC_000911	TAG	2	6	34817	34822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329197
573	NC_000911	TCC	2	6	34915	34920	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329197
574	NC_000911	GAA	2	6	34926	34931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329197
575	NC_000911	GTG	3	9	34966	34974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329197
576	NC_000911	TTCAC	2	10	35101	35110	20 %	40 %	0 %	40 %	16329197
577	NC_000911	CAG	2	6	35157	35162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329197
578	NC_000911	GCC	2	6	35178	35183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329197
579	NC_000911	GCAGA	2	10	35185	35194	40 %	0 %	40 %	20 %	16329197
580	NC_000911	AGAA	2	8	35266	35273	75 %	0 %	25 %	0 %	16329197
581	NC_000911	GAA	2	6	35277	35282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329197
582	NC_000911	CCCAG	2	10	35308	35317	20 %	0 %	20 %	60 %	16329197
583	NC_000911	CGG	2	6	35362	35367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329197
584	NC_000911	CAG	2	6	35434	35439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329197
585	NC_000911	TAA	2	6	35561	35566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329198
586	NC_000911	ATT	2	6	35584	35589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329198
587	NC_000911	TCA	2	6	35628	35633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329198
588	NC_000911	TTG	2	6	35756	35761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329198
589	NC_000911	A	7	7	35768	35774	100 %	0 %	0 %	0 %	16329198
590	NC_000911	AT	3	6	35787	35792	50 %	50 %	0 %	0 %	16329198
591	NC_000911	GAT	2	6	35830	35835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329198
592	NC_000911	GTA	2	6	35843	35848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329198
593	NC_000911	TTG	2	6	35894	35899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329198
594	NC_000911	CGG	3	9	35933	35941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329198
595	NC_000911	TTG	2	6	35963	35968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329198
596	NC_000911	TTTA	2	8	35995	36002	25 %	75 %	0 %	0 %	16329198
597	NC_000911	TGT	2	6	36030	36035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329198
598	NC_000911	ACA	2	6	36071	36076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329198
599	NC_000911	GGA	2	6	36148	36153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16329198
600	NC_000911	ACAAT	2	10	36267	36276	60 %	20 %	0 %	20 %	16329198
601	NC_000911	GGAC	2	8	36312	36319	25 %	0 %	50 %	25 %	16329198
602	NC_000911	TTG	2	6	36377	36382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329198
603	NC_000911	ATTT	2	8	36408	36415	25 %	75 %	0 %	0 %	16329198
604	NC_000911	AAT	2	6	36451	36456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329198
605	NC_000911	TTAACC	2	12	36612	36623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329198
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609	NC_000911	TAG	2	6	37235	37240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329199
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611	NC_000911	CTA	2	6	37456	37461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329199
612	NC_000911	GCA	2	6	37466	37471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329199
613	NC_000911	TCT	2	6	37584	37589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329199
614	NC_000911	GAA	2	6	37615	37620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329199
615	NC_000911	A	6	6	37743	37748	100 %	0 %	0 %	0 %	16329199
616	NC_000911	TG	3	6	37749	37754	0 %	50 %	50 %	0 %	16329199
617	NC_000911	CAC	3	9	37828	37836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329199
618	NC_000911	TTG	2	6	37945	37950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329199
619	NC_000911	CAG	2	6	37966	37971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329199
620	NC_000911	GGC	2	6	37987	37992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329199
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622	NC_000911	T	6	6	38095	38100	0 %	100 %	0 %	0 %	16329199
623	NC_000911	GATT	2	8	38120	38127	25 %	50 %	25 %	0 %	16329199
624	NC_000911	TTGG	2	8	38160	38167	0 %	50 %	50 %	0 %	16329199
625	NC_000911	GGA	2	6	38212	38217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16329199
626	NC_000911	CGG	2	6	38222	38227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329199
627	NC_000911	T	7	7	38653	38659	0 %	100 %	0 %	0 %	16329200
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629	NC_000911	TAT	2	6	38740	38745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329200
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