MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NT_187148	GTG	2	6	162329	162334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995484
3502	NT_187148	CTT	2	6	162370	162375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3503	NT_187148	GTCCTC	2	12	162391	162402	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	399995484
3504	NT_187148	CG	3	6	162466	162471	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3505	NT_187148	CGA	2	6	162522	162527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3506	NT_187148	CTC	2	6	162541	162546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995484
3507	NT_187148	TTC	2	6	162556	162561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3508	NT_187148	CGC	2	6	162570	162575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3509	NT_187148	TCG	3	9	162584	162592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3510	NT_187148	CGG	3	9	162612	162620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3511	NT_187148	CTT	2	6	162642	162647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3512	NT_187148	CGT	2	6	162696	162701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3513	NT_187148	CGA	2	6	162747	162752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3514	NT_187148	ACATG	2	10	162840	162849	40 %	20 %	20 %	20 %	399995484
3515	NT_187148	TCGACG	2	12	162863	162874	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3516	NT_187148	CTC	2	6	162910	162915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995484
3517	NT_187148	TCT	2	6	162924	162929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3518	NT_187148	CGG	2	6	162963	162968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3519	NT_187148	CGA	2	6	163005	163010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3520	NT_187148	CAG	2	6	163033	163038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3521	NT_187148	GCCG	2	8	163071	163078	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3522	NT_187148	TGG	2	6	163079	163084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995484
3523	NT_187148	AGGC	2	8	163103	163110	25 %	0 %	50 %	25 %	399995484
3524	NT_187148	CGG	2	6	163113	163118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3525	NT_187148	TCC	2	6	163178	163183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995484
3526	NT_187148	CAT	2	6	163401	163406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995484
3527	NT_187148	GTCGAG	2	12	163408	163419	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	399995484
3528	NT_187148	GC	3	6	163452	163457	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3529	NT_187148	TCG	2	6	163508	163513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3530	NT_187148	GA	3	6	163568	163573	50 %	0 %	50 %	0 %	399995484
3531	NT_187148	CGG	2	6	163583	163588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3532	NT_187148	CTG	2	6	163590	163595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3533	NT_187148	CCGC	2	8	163599	163606	0 %	0 %	25 %	75 %	399995484
3534	NT_187148	CGCT	2	8	163646	163653	0 %	25 %	25 %	50 %	399995484
3535	NT_187148	TCG	2	6	163673	163678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3536	NT_187148	CGT	2	6	163695	163700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3537	NT_187148	ATG	2	6	163754	163759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995484
3538	NT_187148	TCA	2	6	163784	163789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995484
3539	NT_187148	CCGA	2	8	163790	163797	25 %	0 %	25 %	50 %	399995484
3540	NT_187148	GAG	2	6	163820	163825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995484
3541	NT_187148	GC	3	6	163886	163891	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3542	NT_187148	GC	3	6	163915	163920	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3543	NT_187148	CGA	2	6	163921	163926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3544	NT_187148	CGA	2	6	163986	163991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3545	NT_187148	TCG	2	6	163997	164002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3546	NT_187148	GC	3	6	164068	164073	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3547	NT_187148	CGA	2	6	164080	164085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3548	NT_187148	CGGTT	2	10	164134	164143	0 %	40 %	40 %	20 %	399995484
3549	NT_187148	TGC	2	6	164165	164170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3550	NT_187148	GTC	2	6	164176	164181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3551	NT_187148	CCA	2	6	164209	164214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995484
3552	NT_187148	TCG	2	6	164355	164360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3553	NT_187148	TCG	2	6	164369	164374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3554	NT_187148	TTC	2	6	164383	164388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995484
3555	NT_187148	CGAA	2	8	164447	164454	50 %	0 %	25 %	25 %	399995484
3556	NT_187148	GTC	2	6	164524	164529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3557	NT_187148	GCC	2	6	164585	164590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3558	NT_187148	GCG	2	6	164591	164596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3559	NT_187148	GGC	2	6	164665	164670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995484
3560	NT_187148	GC	3	6	164669	164674	0 %	0 %	50 %	50 %	399995484
3561	NT_187148	CGA	2	6	164698	164703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995484
3562	NT_187148	CGC	2	6	164836	164841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995484
3563	NT_187148	CGGTCG	2	12	164877	164888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	399995484
3564	NT_187148	CCT	2	6	164932	164937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995485
3565	NT_187148	ACG	2	6	164985	164990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995485
3566	NT_187148	GGTT	2	8	165001	165008	0 %	50 %	50 %	0 %	399995485
3567	NT_187148	TCC	2	6	165024	165029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995485
3568	NT_187148	ACG	2	6	165034	165039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995485
3569	NT_187148	CAG	2	6	165164	165169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995485
3570	NT_187148	CAG	2	6	165185	165190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995485
3571	NT_187148	TTG	2	6	165267	165272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995485
3572	NT_187148	GTC	2	6	165338	165343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995485
3573	NT_187148	GGC	2	6	165382	165387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995485
3574	NT_187148	GGC	2	6	165500	165505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995485
3575	NT_187148	GTCG	2	8	165550	165557	0 %	25 %	50 %	25 %	399995485
3576	NT_187148	CGAA	2	8	165563	165570	50 %	0 %	25 %	25 %	399995485
3577	NT_187148	TCA	2	6	165585	165590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995485
3578	NT_187148	TCG	2	6	165597	165602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995485
3579	NT_187148	GCC	2	6	165605	165610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995485
3580	NT_187148	GGC	2	6	165659	165664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995485
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3582	NT_187148	AGC	2	6	165759	165764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995486
3583	NT_187148	AGC	2	6	165789	165794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995486
3584	NT_187148	CGG	2	6	165880	165885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995486
3585	NT_187148	TCG	2	6	165898	165903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995486
3586	NT_187148	GAA	2	6	165926	165931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995486
3587	NT_187148	ACG	2	6	166014	166019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995486
3588	NT_187148	GGCG	2	8	166030	166037	0 %	0 %	75 %	25 %	399995486
3589	NT_187148	GCAT	2	8	166113	166120	25 %	25 %	25 %	25 %	399995486
3590	NT_187148	GC	3	6	166130	166135	0 %	0 %	50 %	50 %	399995486
3591	NT_187148	CGC	2	6	166166	166171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995486
3592	NT_187148	ATCG	2	8	166334	166341	25 %	25 %	25 %	25 %	399995486
3593	NT_187148	CCGTC	2	10	166363	166372	0 %	20 %	20 %	60 %	399995486
3594	NT_187148	CCA	2	6	166459	166464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995486
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3596	NT_187148	GAC	2	6	166613	166618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995486
3597	NT_187148	GGGCG	2	10	166642	166651	0 %	0 %	80 %	20 %	399995486
3598	NT_187148	GATC	2	8	166656	166663	25 %	25 %	25 %	25 %	399995486
3599	NT_187148	GGC	2	6	166664	166669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995486
3600	NT_187148	TCG	2	6	166692	166697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995486
3601	NT_187148	CGA	2	6	166781	166786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995487
3602	NT_187148	CCAG	2	8	166856	166863	25 %	0 %	25 %	50 %	399995487
3603	NT_187148	GC	4	8	166868	166875	0 %	0 %	50 %	50 %	399995487
3604	NT_187148	GTGC	2	8	166922	166929	0 %	25 %	50 %	25 %	399995487
3605	NT_187148	CGA	2	6	166937	166942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995487
3606	NT_187148	CTG	2	6	166944	166949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995487
3607	NT_187148	GACC	2	8	166989	166996	25 %	0 %	25 %	50 %	399995487
3608	NT_187148	GCC	2	6	167032	167037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995487
3609	NT_187148	GC	3	6	167108	167113	0 %	0 %	50 %	50 %	399995487
3610	NT_187148	CGC	2	6	167150	167155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995487
3611	NT_187148	TGC	2	6	167244	167249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995487
3612	NT_187148	AT	3	6	167332	167337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3613	NT_187148	CTG	2	6	167363	167368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NT_187148	ACG	2	6	167381	167386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NT_187148	CTT	2	6	167421	167426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NT_187148	TGC	2	6	167444	167449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NT_187148	ATC	2	6	167499	167504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NT_187148	GCC	2	6	167668	167673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995488
3619	NT_187148	TGC	2	6	167688	167693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995488
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3621	NT_187148	GC	3	6	167949	167954	0 %	0 %	50 %	50 %	399995488
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3726	NT_187148	AG	3	6	172927	172932	50 %	0 %	50 %	0 %	399995490
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3728	NT_187148	GCAT	2	8	173023	173030	25 %	25 %	25 %	25 %	399995490
3729	NT_187148	AG	3	6	173097	173102	50 %	0 %	50 %	0 %	399995490
3730	NT_187148	CGATGG	2	12	173140	173151	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	399995490
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3733	NT_187148	TTC	2	6	173403	173408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995490
3734	NT_187148	CGA	2	6	173413	173418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995490
3735	NT_187148	GCG	2	6	173441	173446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995490
3736	NT_187148	CGTTT	2	10	173462	173471	0 %	60 %	20 %	20 %	399995490
3737	NT_187148	CGTG	2	8	173551	173558	0 %	25 %	50 %	25 %	399995490
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3863	NT_187148	GC	3	6	180599	180604	0 %	0 %	50 %	50 %	399995495
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3866	NT_187148	CTG	2	6	180764	180769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3875	NT_187148	GTC	2	6	181369	181374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3950	NT_187148	TGCAA	2	10	184553	184562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3951	NT_187148	ATC	2	6	184634	184639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3953	NT_187148	T	6	6	184650	184655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3954	NT_187148	CCGG	2	8	184661	184668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3955	NT_187148	GCAG	2	8	184700	184707	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3956	NT_187148	CCT	2	6	184783	184788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3962	NT_187148	TA	3	6	185177	185182	50 %	50 %	0 %	0 %	399995499
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3969	NT_187148	TGG	2	6	185551	185556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995500
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3985	NT_187148	CGA	2	6	186508	186513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995501
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3987	NT_187148	TTC	2	6	186525	186530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995501
3988	NT_187148	TTG	2	6	186558	186563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995501
3989	NT_187148	TGT	2	6	186592	186597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995501
3990	NT_187148	CGAG	2	8	186721	186728	25 %	0 %	50 %	25 %	399995501
3991	NT_187148	ATC	2	6	186738	186743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995501
3992	NT_187148	CG	3	6	186764	186769	0 %	0 %	50 %	50 %	399995501
3993	NT_187148	GGC	2	6	186896	186901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995501
3994	NT_187148	CCA	2	6	186904	186909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995501
3995	NT_187148	GGC	2	6	186917	186922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995501
3996	NT_187148	CGAC	2	8	186976	186983	25 %	0 %	25 %	50 %	399995501
3997	NT_187148	CGCT	2	8	187026	187033	0 %	25 %	25 %	50 %	399995501
3998	NT_187148	TCG	2	6	187038	187043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995501
3999	NT_187148	GC	3	6	187099	187104	0 %	0 %	50 %	50 %	399995502
4000	NT_187148	GCG	3	9	187154	187162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995502

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