MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NT_187148	GCAA	2	8	93279	93286	50 %	0 %	25 %	25 %	399995418
2003	NT_187148	GTGC	2	8	93299	93306	0 %	25 %	50 %	25 %	399995418
2004	NT_187148	ATC	2	6	93311	93316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995418
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2006	NT_187148	CGA	2	6	93430	93435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NT_187148	GAG	2	6	93439	93444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2008	NT_187148	GTG	2	6	93448	93453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995419
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2013	NT_187148	GC	3	6	93772	93777	0 %	0 %	50 %	50 %	399995419
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2125	NT_187148	GCA	2	6	99141	99146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2126	NT_187148	TCG	2	6	99207	99212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995423
2127	NT_187148	GGA	2	6	99215	99220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995423
2128	NT_187148	CCGA	2	8	99231	99238	25 %	0 %	25 %	50 %	399995423
2129	NT_187148	TGC	2	6	99254	99259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995423
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2131	NT_187148	GC	4	8	99325	99332	0 %	0 %	50 %	50 %	399995423
2132	NT_187148	CAG	2	6	99356	99361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995423
2133	NT_187148	TGGC	2	8	99417	99424	0 %	25 %	50 %	25 %	399995423
2134	NT_187148	TC	3	6	99477	99482	0 %	50 %	0 %	50 %	399995423
2135	NT_187148	ACCGC	2	10	99535	99544	20 %	0 %	20 %	60 %	399995423
2136	NT_187148	CGT	2	6	99581	99586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995423
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2139	NT_187148	CGA	2	6	99643	99648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995423
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2141	NT_187148	CG	3	6	99820	99825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2142	NT_187148	CTT	2	6	99833	99838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995424
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2146	NT_187148	GCG	2	6	99983	99988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995424
2147	NT_187148	TCG	2	6	100249	100254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995424
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2156	NT_187148	CGG	2	6	100537	100542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995424
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2162	NT_187148	AGGA	2	8	100664	100671	50 %	0 %	50 %	0 %	399995424
2163	NT_187148	TCGT	2	8	100741	100748	0 %	50 %	25 %	25 %	399995424
2164	NT_187148	TCG	2	6	100750	100755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995424
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2181	NT_187148	GCAA	2	8	101837	101844	50 %	0 %	25 %	25 %	399995425
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2201	NT_187148	TCA	2	6	102806	102811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2202	NT_187148	TGA	2	6	102835	102840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2230	NT_187148	ATG	2	6	104074	104079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995427
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2232	NT_187148	CG	3	6	104108	104113	0 %	0 %	50 %	50 %	399995427
2233	NT_187148	GCA	2	6	104138	104143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995427
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2236	NT_187148	TCCT	2	8	104229	104236	0 %	50 %	0 %	50 %	399995427
2237	NT_187148	GTC	2	6	104274	104279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995427
2238	NT_187148	C	6	6	104331	104336	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2239	NT_187148	AC	3	6	104337	104342	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2240	NT_187148	GCT	2	6	104343	104348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2241	NT_187148	TTC	2	6	104349	104354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2242	NT_187148	GC	3	6	104356	104361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2243	NT_187148	CGT	3	9	104403	104411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2244	NT_187148	CAT	2	6	104440	104445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2245	NT_187148	ATG	2	6	104448	104453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2246	NT_187148	CGG	2	6	104530	104535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995428
2247	NT_187148	TCTT	2	8	104537	104544	0 %	75 %	0 %	25 %	399995428
2248	NT_187148	TCGAAG	2	12	104626	104637	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995428
2249	NT_187148	TGC	2	6	104644	104649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995428
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2252	NT_187148	CGC	2	6	104778	104783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995428
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2370	NT_187148	GC	3	6	110686	110691	0 %	0 %	50 %	50 %	399995432
2371	NT_187148	CGACG	2	10	110771	110780	20 %	0 %	40 %	40 %	399995432
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2457	NT_187148	AAGG	2	8	114664	114671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2473	NT_187148	AGGA	2	8	115293	115300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2474	NT_187148	AC	3	6	115445	115450	50 %	0 %	0 %	50 %	399995436
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2478	NT_187148	GGCAT	2	10	115768	115777	20 %	20 %	40 %	20 %	399995436
2479	NT_187148	AG	3	6	115779	115784	50 %	0 %	50 %	0 %	399995436
2480	NT_187148	GAGC	2	8	115896	115903	25 %	0 %	50 %	25 %	399995436
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2485	NT_187148	CTG	2	6	116189	116194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2486	NT_187148	TC	3	6	116210	116215	0 %	50 %	0 %	50 %	399995437
2487	NT_187148	CAT	2	6	116272	116277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995437
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2489	NT_187148	GGCG	2	8	116422	116429	0 %	0 %	75 %	25 %	399995437
2490	NT_187148	GCCG	2	8	116437	116444	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2491	NT_187148	TCCGG	2	10	116522	116531	0 %	20 %	40 %	40 %	399995437
2492	NT_187148	GCT	2	6	116537	116542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2493	NT_187148	CGT	3	9	116608	116616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2494	NT_187148	GCC	2	6	116651	116656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995437
2495	NT_187148	TGA	2	6	116691	116696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995437
2496	NT_187148	TCG	2	6	116733	116738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995437
2497	NT_187148	TTG	2	6	116763	116768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995437
2498	NT_187148	GC	4	8	116774	116781	0 %	0 %	50 %	50 %	399995437
2499	NT_187148	ATG	2	6	116804	116809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995437
2500	NT_187148	CCG	2	6	117186	117191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995437

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