MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NT_187148	AGC	2	6	69825	69830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995392
1502	NT_187148	GTGA	2	8	69831	69838	25 %	25 %	50 %	0 %	399995392
1503	NT_187148	CCG	2	6	69921	69926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995392
1504	NT_187148	CGA	2	6	69960	69965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995392
1505	NT_187148	GTCA	2	8	70095	70102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1506	NT_187148	TAT	2	6	70134	70139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NT_187148	TCC	2	6	70212	70217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NT_187148	CTT	2	6	70327	70332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995393
1509	NT_187148	CTG	2	6	70334	70339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995393
1510	NT_187148	CTG	2	6	70393	70398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995393
1511	NT_187148	CCG	2	6	70405	70410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995393
1512	NT_187148	TCA	2	6	70415	70420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995393
1513	NT_187148	GCC	2	6	70477	70482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995393
1514	NT_187148	AGC	2	6	70575	70580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995394
1515	NT_187148	ACA	2	6	70669	70674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995394
1516	NT_187148	TCG	2	6	70702	70707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995394
1517	NT_187148	GCA	2	6	70711	70716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995394
1518	NT_187148	TGA	2	6	70793	70798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995394
1519	NT_187148	ACC	2	6	70845	70850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995395
1520	NT_187148	GCT	2	6	70855	70860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995395
1521	NT_187148	CTG	2	6	70894	70899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995395
1522	NT_187148	ATG	2	6	71067	71072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995395
1523	NT_187148	CGG	2	6	71084	71089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995395
1524	NT_187148	ATC	2	6	71100	71105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995395
1525	NT_187148	CCG	2	6	71182	71187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995395
1526	NT_187148	CGT	2	6	71242	71247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995395
1527	NT_187148	TGA	2	6	71395	71400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995395
1528	NT_187148	TCT	2	6	71464	71469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995395
1529	NT_187148	CGG	2	6	71481	71486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995395
1530	NT_187148	GAG	2	6	71487	71492	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995395
1531	NT_187148	CAG	2	6	71509	71514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995395
1532	NT_187148	GCC	2	6	71540	71545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995395
1533	NT_187148	GATCG	2	10	71579	71588	20 %	20 %	40 %	20 %	399995395
1534	NT_187148	CAG	2	6	71645	71650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995395
1535	NT_187148	ACC	2	6	71710	71715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995395
1536	NT_187148	TCC	2	6	71721	71726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995395
1537	NT_187148	GTT	2	6	71741	71746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995395
1538	NT_187148	TCG	2	6	71772	71777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995395
1539	NT_187148	GC	3	6	71796	71801	0 %	0 %	50 %	50 %	399995395
1540	NT_187148	GCT	2	6	71809	71814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995395
1541	NT_187148	CAT	2	6	71816	71821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995395
1542	NT_187148	GCG	2	6	71826	71831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995395
1543	NT_187148	GAT	2	6	71846	71851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995395
1544	NT_187148	CAT	2	6	71879	71884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995395
1545	NT_187148	GCT	2	6	71913	71918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995396
1546	NT_187148	TGC	2	6	71930	71935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995396
1547	NT_187148	ATC	2	6	71942	71947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995396
1548	NT_187148	GCC	2	6	71963	71968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995396
1549	NT_187148	TG	3	6	71987	71992	0 %	50 %	50 %	0 %	399995396
1550	NT_187148	GCG	2	6	72009	72014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995396
1551	NT_187148	GAG	2	6	72032	72037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995396
1552	NT_187148	CAT	2	6	72051	72056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995396
1553	NT_187148	GGCATA	2	12	72073	72084	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	399995396
1554	NT_187148	CAC	2	6	72181	72186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995396
1555	NT_187148	GCTG	2	8	72226	72233	0 %	25 %	50 %	25 %	399995396
1556	NT_187148	TCT	2	6	72237	72242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995396
1557	NT_187148	GAT	2	6	72286	72291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995396
1558	NT_187148	ATG	2	6	72341	72346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995396
1559	NT_187148	GGAT	2	8	72357	72364	25 %	25 %	50 %	0 %	399995396
1560	NT_187148	GTGCC	2	10	72410	72419	0 %	20 %	40 %	40 %	399995396
1561	NT_187148	TTG	2	6	72428	72433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995396
1562	NT_187148	CCG	2	6	72446	72451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995396
1563	NT_187148	GAA	2	6	72457	72462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995396
1564	NT_187148	TC	3	6	72496	72501	0 %	50 %	0 %	50 %	399995396
1565	NT_187148	AACGGA	2	12	72550	72561	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	399995396
1566	NT_187148	GAA	2	6	72589	72594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995396
1567	NT_187148	GACC	2	8	72609	72616	25 %	0 %	25 %	50 %	399995396
1568	NT_187148	CCG	2	6	72641	72646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995396
1569	NT_187148	GGC	2	6	72670	72675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995396
1570	NT_187148	GGC	2	6	72713	72718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995396
1571	NT_187148	CGTG	2	8	72737	72744	0 %	25 %	50 %	25 %	399995396
1572	NT_187148	GC	4	8	72755	72762	0 %	0 %	50 %	50 %	399995396
1573	NT_187148	GTG	2	6	72808	72813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995396
1574	NT_187148	GTC	2	6	72842	72847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995396
1575	NT_187148	GCG	2	6	72896	72901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995396
1576	NT_187148	GGC	2	6	72996	73001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995396
1577	NT_187148	CGA	2	6	73026	73031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995396
1578	NT_187148	CCCCG	2	10	73076	73085	0 %	0 %	20 %	80 %	399995396
1579	NT_187148	TCG	2	6	73109	73114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995396
1580	NT_187148	GAC	2	6	73117	73122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995396
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1582	NT_187148	GTT	2	6	73222	73227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NT_187148	TTG	2	6	73228	73233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NT_187148	CTG	2	6	73331	73336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995397
1585	NT_187148	GCG	2	6	73360	73365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995397
1586	NT_187148	CCG	2	6	73456	73461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995397
1587	NT_187148	T	6	6	73470	73475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NT_187148	TGT	2	6	73493	73498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NT_187148	GGCC	2	8	73531	73538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1590	NT_187148	ACG	2	6	73545	73550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NT_187148	CTAT	2	8	73580	73587	25 %	50 %	0 %	25 %	399995398
1592	NT_187148	GTT	2	6	73588	73593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995398
1593	NT_187148	TGA	2	6	73594	73599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995398
1594	NT_187148	AG	3	6	73601	73606	50 %	0 %	50 %	0 %	399995398
1595	NT_187148	GAA	2	6	73616	73621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995398
1596	NT_187148	CTG	2	6	73628	73633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995398
1597	NT_187148	CGG	2	6	73640	73645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995398
1598	NT_187148	GCA	2	6	73721	73726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995398
1599	NT_187148	GCA	2	6	73764	73769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995398
1600	NT_187148	TCG	2	6	73888	73893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NT_187148	GCC	2	6	73910	73915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NT_187148	AAC	2	6	73945	73950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NT_187148	CAG	2	6	74042	74047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995399
1604	NT_187148	GTC	2	6	74053	74058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995399
1605	NT_187148	AT	4	8	74132	74139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NT_187148	ATC	2	6	74141	74146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NT_187148	TTG	2	6	74332	74337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995400
1608	NT_187148	GGT	2	6	74368	74373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995400
1609	NT_187148	GCT	2	6	74431	74436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995400
1610	NT_187148	ATCA	2	8	74560	74567	50 %	25 %	0 %	25 %	399995400
1611	NT_187148	CGA	2	6	74592	74597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995400
1612	NT_187148	CCT	2	6	74655	74660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995400
1613	NT_187148	GCA	2	6	74666	74671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995400
1614	NT_187148	GGTC	2	8	74709	74716	0 %	25 %	50 %	25 %	399995400
1615	NT_187148	CGT	2	6	74772	74777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995400
1616	NT_187148	ATC	2	6	74800	74805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995400
1617	NT_187148	TCGA	2	8	74832	74839	25 %	25 %	25 %	25 %	399995400
1618	NT_187148	TA	3	6	74840	74845	50 %	50 %	0 %	0 %	399995400
1619	NT_187148	TGGA	2	8	74892	74899	25 %	25 %	50 %	0 %	399995400
1620	NT_187148	CAG	2	6	75016	75021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995400
1621	NT_187148	TGGCCG	2	12	75032	75043	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	399995400
1622	NT_187148	TTG	2	6	75052	75057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995400
1623	NT_187148	GAT	2	6	75077	75082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995400
1624	NT_187148	TGCC	2	8	75188	75195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1626	NT_187148	GACT	2	8	75228	75235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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