MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NT_187148	CA	3	6	46777	46782	50 %	0 %	0 %	50 %	399995371
1002	NT_187148	CGT	2	6	46801	46806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1003	NT_187148	AG	3	6	46808	46813	50 %	0 %	50 %	0 %	399995371
1004	NT_187148	CGT	2	6	46824	46829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1005	NT_187148	CAGC	2	8	46830	46837	25 %	0 %	25 %	50 %	399995371
1006	NT_187148	CGAC	2	8	46847	46854	25 %	0 %	25 %	50 %	399995371
1007	NT_187148	GCT	2	6	46900	46905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1008	NT_187148	GC	3	6	46954	46959	0 %	0 %	50 %	50 %	399995371
1009	NT_187148	GTC	2	6	46996	47001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1010	NT_187148	CGA	2	6	47019	47024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1011	NT_187148	CGA	2	6	47031	47036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1012	NT_187148	CGT	2	6	47037	47042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995371
1013	NT_187148	AGG	2	6	47076	47081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995371
1014	NT_187148	CG	3	6	47091	47096	0 %	0 %	50 %	50 %	399995371
1015	NT_187148	ATG	2	6	47141	47146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995371
1016	NT_187148	CTG	2	6	47179	47184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NT_187148	CTT	2	6	47217	47222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NT_187148	CGAG	2	8	47231	47238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1019	NT_187148	TCG	2	6	47261	47266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NT_187148	ACG	2	6	47267	47272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NT_187148	GGC	2	6	47285	47290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NT_187148	CGAA	2	8	47349	47356	50 %	0 %	25 %	25 %	399995372
1023	NT_187148	CGC	2	6	47372	47377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995372
1024	NT_187148	TTC	2	6	47390	47395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995372
1025	NT_187148	CCAG	2	8	47432	47439	25 %	0 %	25 %	50 %	399995372
1026	NT_187148	GC	3	6	47453	47458	0 %	0 %	50 %	50 %	399995372
1027	NT_187148	CGG	2	6	47477	47482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995372
1028	NT_187148	CA	3	6	47483	47488	50 %	0 %	0 %	50 %	399995372
1029	NT_187148	CGA	2	6	47511	47516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NT_187148	TAC	2	6	47532	47537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NT_187148	GAG	2	6	47570	47575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NT_187148	ATG	2	6	47576	47581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995373
1033	NT_187148	GAAC	2	8	47614	47621	50 %	0 %	25 %	25 %	399995373
1034	NT_187148	TGC	2	6	47644	47649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995373
1035	NT_187148	CGC	2	6	47722	47727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995373
1036	NT_187148	GGA	2	6	47770	47775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995373
1037	NT_187148	GC	3	6	47853	47858	0 %	0 %	50 %	50 %	399995374
1038	NT_187148	GTG	2	6	47908	47913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995374
1039	NT_187148	CGG	3	9	47938	47946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995374
1040	NT_187148	CGGCA	2	10	48033	48042	20 %	0 %	40 %	40 %	399995374
1041	NT_187148	AACGC	2	10	48058	48067	40 %	0 %	20 %	40 %	399995374
1042	NT_187148	TCGACG	2	12	48088	48099	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995374
1043	NT_187148	CGG	2	6	48104	48109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995374
1044	NT_187148	TGG	2	6	48157	48162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995374
1045	NT_187148	CGC	2	6	48167	48172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995374
1046	NT_187148	CCG	2	6	48193	48198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995374
1047	NT_187148	ATC	2	6	48205	48210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995374
1048	NT_187148	CG	3	6	48256	48261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1049	NT_187148	GCA	2	6	48339	48344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NT_187148	CGCA	2	8	48424	48431	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1051	NT_187148	ATG	2	6	48465	48470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NT_187148	TCCA	2	8	48474	48481	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NT_187148	TGAG	2	8	48602	48609	25 %	25 %	50 %	0 %	399995375
1054	NT_187148	TCA	3	9	48650	48658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995375
1055	NT_187148	CGA	2	6	48720	48725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995375
1056	NT_187148	ATG	2	6	48727	48732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995375
1057	NT_187148	GAC	2	6	48757	48762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995375
1058	NT_187148	CGA	2	6	48864	48869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995375
1059	NT_187148	GCT	2	6	48895	48900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995375
1060	NT_187148	GGA	2	6	48960	48965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995375
1061	NT_187148	TCG	2	6	49186	49191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995376
1062	NT_187148	CGG	2	6	49207	49212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995376
1063	NT_187148	AAG	2	6	49213	49218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995376
1064	NT_187148	TGA	2	6	49241	49246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995376
1065	NT_187148	CG	3	6	49273	49278	0 %	0 %	50 %	50 %	399995376
1066	NT_187148	GCC	2	6	49349	49354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995376
1067	NT_187148	TCC	2	6	49414	49419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995376
1068	NT_187148	CGA	3	9	49430	49438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995376
1069	NT_187148	CGA	2	6	49514	49519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995376
1070	NT_187148	AGG	2	6	49529	49534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995376
1071	NT_187148	CG	3	6	49561	49566	0 %	0 %	50 %	50 %	399995376
1072	NT_187148	GAT	2	6	49632	49637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995376
1073	NT_187148	GCCT	2	8	49677	49684	0 %	25 %	25 %	50 %	399995377
1074	NT_187148	AAT	2	6	49740	49745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995377
1075	NT_187148	CGG	2	6	49754	49759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995377
1076	NT_187148	CCTG	2	8	49801	49808	0 %	25 %	25 %	50 %	399995377
1077	NT_187148	CGTG	2	8	49909	49916	0 %	25 %	50 %	25 %	399995377
1078	NT_187148	CCGCT	2	10	49980	49989	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1079	NT_187148	TG	3	6	49997	50002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NT_187148	GAA	2	6	50027	50032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NT_187148	CG	3	6	50039	50044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1082	NT_187148	TC	3	6	50154	50159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1083	NT_187148	CCG	2	6	50175	50180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NT_187148	TGAC	2	8	50197	50204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1085	NT_187148	GGA	2	6	50209	50214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NT_187148	ATG	2	6	50273	50278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NT_187148	CGC	2	6	50279	50284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NT_187148	TCCGGC	2	12	50333	50344	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1089	NT_187148	TTC	2	6	50360	50365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995378
1090	NT_187148	CCG	2	6	50403	50408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995378
1091	NT_187148	TTC	2	6	50427	50432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995378
1092	NT_187148	CAC	2	6	50446	50451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995378
1093	NT_187148	CGC	2	6	50498	50503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NT_187148	GCT	2	6	50516	50521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NT_187148	CCGA	2	8	50537	50544	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1096	NT_187148	GC	3	6	50630	50635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NT_187148	TGAGA	2	10	50637	50646	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1098	NT_187148	CGC	2	6	50647	50652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NT_187148	AAG	2	6	50737	50742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NT_187148	GGGC	2	8	50786	50793	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1101	NT_187148	GCA	2	6	50798	50803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NT_187148	TGC	2	6	50920	50925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NT_187148	GCCA	2	8	50954	50961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1104	NT_187148	AGAT	2	8	51029	51036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1105	NT_187148	TCT	2	6	51044	51049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NT_187148	CTG	2	6	51088	51093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NT_187148	GAT	2	6	51100	51105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NT_187148	T	6	6	51123	51128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NT_187148	AGC	2	6	51209	51214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NT_187148	ACG	2	6	51239	51244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NT_187148	GCT	2	6	51272	51277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NT_187148	CTC	2	6	51316	51321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NT_187148	GCC	2	6	51491	51496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NT_187148	AGAA	2	8	51506	51513	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1115	NT_187148	GC	3	6	51553	51558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1116	NT_187148	CG	3	6	51634	51639	0 %	0 %	50 %	50 %	399995379
1117	NT_187148	CGA	2	6	51823	51828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995380
1118	NT_187148	CGC	3	9	51923	51931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995380
1119	NT_187148	GCT	2	6	51948	51953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995380
1120	NT_187148	CTG	2	6	51959	51964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995380
1121	NT_187148	GAC	2	6	52016	52021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995380
1122	NT_187148	GTCA	2	8	52022	52029	25 %	25 %	25 %	25 %	399995380
1123	NT_187148	TTC	3	9	52091	52099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995380
1124	NT_187148	CTT	2	6	52132	52137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995380
1125	NT_187148	GCC	3	9	52140	52148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995380
1126	NT_187148	GCC	2	6	52157	52162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995380
1127	NT_187148	GGC	2	6	52256	52261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NT_187148	CAT	2	6	52276	52281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NT_187148	CCG	2	6	52323	52328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NT_187148	CGTG	2	8	52372	52379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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