MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NT_187148	CGGC	3	12	209406	209417	0 %	0 %	50 %	50 %	399995521
4502	NT_187148	GCC	2	6	209436	209441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995521
4503	NT_187148	GC	3	6	209442	209447	0 %	0 %	50 %	50 %	399995521
4504	NT_187148	TGC	2	6	209594	209599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NT_187148	GC	3	6	209621	209626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4506	NT_187148	GC	4	8	209670	209677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4507	NT_187148	GTCG	2	8	209732	209739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4508	NT_187148	TTC	2	6	209743	209748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NT_187148	CTC	2	6	209827	209832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4510	NT_187148	CCCT	2	8	209846	209853	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4511	NT_187148	GCC	2	6	209856	209861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4512	NT_187148	CGC	2	6	209892	209897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4513	NT_187148	CGC	2	6	209912	209917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NT_187148	CAT	2	6	209971	209976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995522
4515	NT_187148	CGA	2	6	209995	210000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995522
4516	NT_187148	CAC	2	6	210014	210019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995522
4517	NT_187148	CGAC	2	8	210030	210037	25 %	0 %	25 %	50 %	399995522
4518	NT_187148	GAG	2	6	210110	210115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995522
4519	NT_187148	TCGAGC	2	12	210327	210338	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995522
4520	NT_187148	CTC	2	6	210362	210367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995522
4521	NT_187148	GCC	2	6	210404	210409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995522
4522	NT_187148	GAT	2	6	210490	210495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995522
4523	NT_187148	CCGC	2	8	210516	210523	0 %	0 %	25 %	75 %	399995522
4524	NT_187148	CGC	3	9	210521	210529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995522
4525	NT_187148	CGGC	2	8	210552	210559	0 %	0 %	50 %	50 %	399995522
4526	NT_187148	CGG	3	9	210574	210582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995522
4527	NT_187148	GGC	2	6	210665	210670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995522
4528	NT_187148	CGC	2	6	210694	210699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995522
4529	NT_187148	CTG	2	6	210700	210705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995522
4530	NT_187148	GGC	2	6	210766	210771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995522
4531	NT_187148	CCG	2	6	210778	210783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995522
4532	NT_187148	ACG	2	6	210786	210791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995522
4533	NT_187148	TCA	2	6	210819	210824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995522
4534	NT_187148	GCA	2	6	211015	211020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995523
4535	NT_187148	CGC	2	6	211034	211039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995523
4536	NT_187148	TCCT	2	8	211073	211080	0 %	50 %	0 %	50 %	399995523
4537	NT_187148	CAT	2	6	211121	211126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995523
4538	NT_187148	CCG	2	6	211148	211153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995523
4539	NT_187148	CGT	2	6	211162	211167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995523
4540	NT_187148	GGA	2	6	211231	211236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995523
4541	NT_187148	GCT	3	9	211269	211277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995524
4542	NT_187148	TTG	2	6	211291	211296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995524
4543	NT_187148	TGG	2	6	211297	211302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995524
4544	NT_187148	ACG	3	9	211307	211315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995524
4545	NT_187148	ACG	2	6	211361	211366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995524
4546	NT_187148	AGA	2	6	211437	211442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995524
4547	NT_187148	TCA	2	6	211527	211532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995524
4548	NT_187148	ATC	2	6	211547	211552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995524
4549	NT_187148	GGAG	2	8	211575	211582	25 %	0 %	75 %	0 %	399995524
4550	NT_187148	GC	3	6	211714	211719	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4551	NT_187148	CGGA	2	8	211771	211778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4552	NT_187148	GGC	2	6	211850	211855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995525
4553	NT_187148	CAA	2	6	211884	211889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995525
4554	NT_187148	GAT	2	6	211893	211898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NT_187148	CTG	2	6	211918	211923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NT_187148	ATG	2	6	212021	212026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NT_187148	GAC	2	6	212082	212087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NT_187148	TC	3	6	212163	212168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4559	NT_187148	GCA	2	6	212211	212216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NT_187148	CG	3	6	212232	212237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4561	NT_187148	CCA	2	6	212282	212287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995526
4562	NT_187148	AGA	2	6	212306	212311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995526
4563	NT_187148	CCA	2	6	212339	212344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995526
4564	NT_187148	GCAA	2	8	212380	212387	50 %	0 %	25 %	25 %	399995526
4565	NT_187148	GAA	2	6	212395	212400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995526
4566	NT_187148	CGCC	2	8	212466	212473	0 %	0 %	25 %	75 %	399995526
4567	NT_187148	GGCACC	2	12	212541	212552	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	399995526
4568	NT_187148	CGG	2	6	212553	212558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995526
4569	NT_187148	AAG	2	6	212569	212574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995526
4570	NT_187148	AGCG	2	8	212609	212616	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4571	NT_187148	GCA	2	6	212652	212657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4572	NT_187148	CTC	2	6	212692	212697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NT_187148	CGC	2	6	212760	212765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4574	NT_187148	TCC	2	6	212832	212837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4575	NT_187148	CGC	2	6	212841	212846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4576	NT_187148	CGG	2	6	212850	212855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4577	NT_187148	GAC	2	6	212929	212934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NT_187148	GAA	2	6	212963	212968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995527
4579	NT_187148	GC	3	6	212971	212976	0 %	0 %	50 %	50 %	399995527
4580	NT_187148	CGC	2	6	213005	213010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995527
4581	NT_187148	CTGG	2	8	213032	213039	0 %	25 %	50 %	25 %	399995527
4582	NT_187148	GGC	3	9	213049	213057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995527
4583	NT_187148	AGG	2	6	213069	213074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995527
4584	NT_187148	CGC	2	6	213085	213090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995527
4585	NT_187148	G	6	6	213104	213109	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4586	NT_187148	CGC	2	6	213209	213214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995528
4587	NT_187148	GT	3	6	213250	213255	0 %	50 %	50 %	0 %	399995528
4588	NT_187148	CG	3	6	213268	213273	0 %	0 %	50 %	50 %	399995528
4589	NT_187148	GCA	2	6	213286	213291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995528
4590	NT_187148	CGC	2	6	213375	213380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995528
4591	NT_187148	GC	3	6	213431	213436	0 %	0 %	50 %	50 %	399995528
4592	NT_187148	TCG	2	6	213445	213450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995528
4593	NT_187148	TGAG	2	8	213483	213490	25 %	25 %	50 %	0 %	399995528
4594	NT_187148	TCGG	2	8	213543	213550	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4595	NT_187148	CCT	2	6	213551	213556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4596	NT_187148	GATC	2	8	213572	213579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4597	NT_187148	GTT	2	6	213596	213601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NT_187148	GCCG	2	8	213609	213616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4599	NT_187148	TTCGC	2	10	213635	213644	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4600	NT_187148	AAT	2	6	213696	213701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NT_187148	CCGG	2	8	213702	213709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4602	NT_187148	GCC	2	6	213718	213723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4603	NT_187148	TC	3	6	213832	213837	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4604	NT_187148	GAG	2	6	213841	213846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4605	NT_187148	CGA	2	6	213893	213898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995529
4606	NT_187148	CG	3	6	213916	213921	0 %	0 %	50 %	50 %	399995529
4607	NT_187148	CGT	2	6	213963	213968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995529
4608	NT_187148	GCG	2	6	213973	213978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995529
4609	NT_187148	ATG	2	6	214042	214047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995529
4610	NT_187148	TCG	2	6	214079	214084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995529
4611	NT_187148	GCG	2	6	214102	214107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995529
4612	NT_187148	CGC	2	6	214196	214201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995529
4613	NT_187148	GGA	2	6	214209	214214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995529
4614	NT_187148	CGAT	2	8	214239	214246	25 %	25 %	25 %	25 %	399995529
4615	NT_187148	GGC	2	6	214270	214275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NT_187148	TCA	2	6	214276	214281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995530
4617	NT_187148	CCG	2	6	214333	214338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995530
4618	NT_187148	GAT	3	9	214384	214392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995530
4619	NT_187148	CGGC	2	8	214441	214448	0 %	0 %	50 %	50 %	399995530
4620	NT_187148	TTC	2	6	214487	214492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995530
4621	NT_187148	CGC	2	6	214542	214547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995530
4622	NT_187148	GC	3	6	214564	214569	0 %	0 %	50 %	50 %	399995530
4623	NT_187148	AGG	2	6	214596	214601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995530
4624	NT_187148	ACG	2	6	214623	214628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995530
4625	NT_187148	CCGA	2	8	214664	214671	25 %	0 %	25 %	50 %	399995530
4626	NT_187148	CAT	2	6	214684	214689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995530
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4746	NT_187148	CG	3	6	219764	219769	0 %	0 %	50 %	50 %	399995534
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4852	NT_187148	CGT	2	6	224190	224195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995536
4853	NT_187148	GC	3	6	224245	224250	0 %	0 %	50 %	50 %	399995536
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4856	NT_187148	GCG	2	6	224581	224586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995537
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4862	NT_187148	TCT	2	6	224975	224980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4863	NT_187148	TGTCC	2	10	224984	224993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4864	NT_187148	GAA	2	6	225068	225073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4865	NT_187148	CAG	2	6	225202	225207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995539
4866	NT_187148	AGCGA	2	10	225298	225307	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4867	NT_187148	T	6	6	225350	225355	0 %	100 %	0 %	0 %	399995540
4868	NT_187148	TCC	2	6	225358	225363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995540
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4871	NT_187148	CTT	2	6	225473	225478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995540
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4996	NT_187148	CGG	2	6	231375	231380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995546
4997	NT_187148	GA	3	6	231423	231428	50 %	0 %	50 %	0 %	399995546
4998	NT_187148	ATC	2	6	231466	231471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4999	NT_187148	AGC	3	9	231490	231498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5000	NT_187148	CGC	2	6	231552	231557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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