MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187147	A	6	6	3508	3513	100 %	0 %	0 %	0 %	399995013
2	NT_187147	A	7	7	3957	3963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187147	T	6	6	6884	6889	0 %	100 %	0 %	0 %	399995018
4	NT_187147	T	6	6	6919	6924	0 %	100 %	0 %	0 %	399995018
5	NT_187147	G	6	6	7153	7158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NT_187147	T	7	7	16669	16675	0 %	100 %	0 %	0 %	399995034
7	NT_187147	A	8	8	21954	21961	100 %	0 %	0 %	0 %	399995040
8	NT_187147	T	6	6	22406	22411	0 %	100 %	0 %	0 %	399995042
9	NT_187147	A	6	6	24325	24330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NT_187147	A	7	7	26050	26056	100 %	0 %	0 %	0 %	399995048
11	NT_187147	A	6	6	27148	27153	100 %	0 %	0 %	0 %	399995049
12	NT_187147	A	6	6	28202	28207	100 %	0 %	0 %	0 %	399995050
13	NT_187147	A	7	7	30165	30171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187147	T	6	6	32076	32081	0 %	100 %	0 %	0 %	399995053
15	NT_187147	T	6	6	33301	33306	0 %	100 %	0 %	0 %	399995054
16	NT_187147	G	7	7	34914	34920	0 %	0 %	100 %	0 %	399995055
17	NT_187147	A	6	6	38441	38446	100 %	0 %	0 %	0 %	399995059
18	NT_187147	A	6	6	38598	38603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NT_187147	A	6	6	38811	38816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187147	A	6	6	41371	41376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NT_187147	A	6	6	44453	44458	100 %	0 %	0 %	0 %	399995064
22	NT_187147	A	6	6	46779	46784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NT_187147	A	6	6	46888	46893	100 %	0 %	0 %	0 %	399995067
24	NT_187147	A	6	6	47548	47553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187147	C	6	6	47796	47801	0 %	0 %	0 %	100 %	399995068
26	NT_187147	A	6	6	58635	58640	100 %	0 %	0 %	0 %	399995080
27	NT_187147	C	6	6	61261	61266	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
28	NT_187147	A	7	7	61402	61408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187147	A	7	7	61569	61575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187147	T	6	6	62856	62861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NT_187147	A	7	7	63186	63192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187147	T	6	6	64295	64300	0 %	100 %	0 %	0 %	399995084
33	NT_187147	C	6	6	65028	65033	0 %	0 %	0 %	100 %	399995085
34	NT_187147	C	6	6	71664	71669	0 %	0 %	0 %	100 %	399995094
35	NT_187147	C	7	7	73417	73423	0 %	0 %	0 %	100 %	399995096
36	NT_187147	T	6	6	73697	73702	0 %	100 %	0 %	0 %	399995096
37	NT_187147	T	6	6	76252	76257	0 %	100 %	0 %	0 %	399995099
38	NT_187147	A	6	6	78597	78602	100 %	0 %	0 %	0 %	399995102
39	NT_187147	C	6	6	78846	78851	0 %	0 %	0 %	100 %	399995102
40	NT_187147	A	7	7	88040	88046	100 %	0 %	0 %	0 %	399995109
41	NT_187147	T	6	6	90182	90187	0 %	100 %	0 %	0 %	399995111
42	NT_187147	C	6	6	97100	97105	0 %	0 %	0 %	100 %	399995120
43	NT_187147	T	6	6	98363	98368	0 %	100 %	0 %	0 %	399995122
44	NT_187147	A	6	6	98769	98774	100 %	0 %	0 %	0 %	399995123
45	NT_187147	T	6	6	102427	102432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187147	A	6	6	105343	105348	100 %	0 %	0 %	0 %	399995129
47	NT_187147	A	6	6	106735	106740	100 %	0 %	0 %	0 %	399995130
48	NT_187147	C	6	6	109604	109609	0 %	0 %	0 %	100 %	399995136
49	NT_187147	C	6	6	109663	109668	0 %	0 %	0 %	100 %	399995137
50	NT_187147	A	7	7	134287	134293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187147	C	6	6	141330	141335	0 %	0 %	0 %	100 %	399995165
52	NT_187147	A	6	6	142670	142675	100 %	0 %	0 %	0 %	399995167
53	NT_187147	A	6	6	144071	144076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NT_187147	C	6	6	150461	150466	0 %	0 %	0 %	100 %	399995175
55	NT_187147	A	6	6	151647	151652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187147	A	8	8	152241	152248	100 %	0 %	0 %	0 %	399995177
57	NT_187147	T	7	7	153240	153246	0 %	100 %	0 %	0 %	399995178
58	NT_187147	T	6	6	153274	153279	0 %	100 %	0 %	0 %	399995178
59	NT_187147	A	6	6	154095	154100	100 %	0 %	0 %	0 %	399995179
60	NT_187147	T	6	6	159861	159866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187147	A	6	6	162398	162403	100 %	0 %	0 %	0 %	399995184
62	NT_187147	G	6	6	165896	165901	0 %	0 %	100 %	0 %	399995187
63	NT_187147	C	6	6	166296	166301	0 %	0 %	0 %	100 %	399995188
64	NT_187147	C	6	6	168561	168566	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
65	NT_187147	T	6	6	169050	169055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187147	A	7	7	169082	169088	100 %	0 %	0 %	0 %	399995190
67	NT_187147	A	6	6	175636	175641	100 %	0 %	0 %	0 %	399995196
68	NT_187147	G	6	6	183551	183556	0 %	0 %	100 %	0 %	399995206
69	NT_187147	T	6	6	186380	186385	0 %	100 %	0 %	0 %	399995210
70	NT_187147	T	6	6	187932	187937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NT_187147	A	6	6	188934	188939	100 %	0 %	0 %	0 %	399995211
72	NT_187147	A	6	6	189558	189563	100 %	0 %	0 %	0 %	399995211
73	NT_187147	G	6	6	190474	190479	0 %	0 %	100 %	0 %	399995213
74	NT_187147	T	7	7	191230	191236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NT_187147	A	6	6	203158	203163	100 %	0 %	0 %	0 %	399995229
76	NT_187147	T	7	7	207081	207087	0 %	100 %	0 %	0 %	399995232
77	NT_187147	C	6	6	209560	209565	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
78	NT_187147	A	6	6	212548	212553	100 %	0 %	0 %	0 %	399995239
79	NT_187147	A	6	6	216772	216777	100 %	0 %	0 %	0 %	399995244
80	NT_187147	G	6	6	220555	220560	0 %	0 %	100 %	0 %	399995249
81	NT_187147	A	6	6	224725	224730	100 %	0 %	0 %	0 %	399995255
82	NT_187147	G	6	6	225083	225088	0 %	0 %	100 %	0 %	399995255
83	NT_187147	A	6	6	228773	228778	100 %	0 %	0 %	0 %	399995258
84	NT_187147	C	6	6	238458	238463	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
85	NT_187147	C	8	8	243667	243674	0 %	0 %	0 %	100 %	399995275
86	NT_187147	A	6	6	251494	251499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187147	T	6	6	252057	252062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NT_187147	A	6	6	252271	252276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187147	C	6	6	259732	259737	0 %	0 %	0 %	100 %	399995290
90	NT_187147	A	6	6	264184	264189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NT_187147	T	6	6	264856	264861	0 %	100 %	0 %	0 %	399995296
92	NT_187147	G	7	7	267231	267237	0 %	0 %	100 %	0 %	399995301
93	NT_187147	T	7	7	273016	273022	0 %	100 %	0 %	0 %	399995308

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.