MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NT_187147	CTG	2	6	196799	196804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995221
4002	NT_187147	GCGAC	2	10	196814	196823	20 %	0 %	40 %	40 %	399995221
4003	NT_187147	GC	3	6	196885	196890	0 %	0 %	50 %	50 %	399995221
4004	NT_187147	CGC	2	6	196940	196945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995221
4005	NT_187147	CAT	2	6	197068	197073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995221
4006	NT_187147	GGA	2	6	197087	197092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995221
4007	NT_187147	AAT	2	6	197112	197117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995221
4008	NT_187147	GCT	2	6	197118	197123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995221
4009	NT_187147	TTGGAA	2	12	197143	197154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995221
4010	NT_187147	ATC	2	6	197217	197222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995221
4011	NT_187147	CGA	2	6	197309	197314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995221
4012	NT_187147	GGC	2	6	197360	197365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995221
4013	NT_187147	ATC	2	6	197483	197488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995222
4014	NT_187147	GAC	2	6	197531	197536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995222
4015	NT_187147	GGA	2	6	197542	197547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995222
4016	NT_187147	CGC	2	6	197573	197578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995222
4017	NT_187147	CGA	3	9	197617	197625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995222
4018	NT_187147	GAA	2	6	197683	197688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NT_187147	GAA	2	6	197710	197715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995223
4020	NT_187147	CG	3	6	197718	197723	0 %	0 %	50 %	50 %	399995223
4021	NT_187147	GCT	2	6	197776	197781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995223
4022	NT_187147	GGC	2	6	197785	197790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995223
4023	NT_187147	GCC	2	6	197832	197837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995223
4024	NT_187147	CGG	2	6	197876	197881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995223
4025	NT_187147	CGA	2	6	197908	197913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995223
4026	NT_187147	GAAC	2	8	197980	197987	50 %	0 %	25 %	25 %	399995223
4027	NT_187147	CGT	2	6	198070	198075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995223
4028	NT_187147	CT	3	6	198123	198128	0 %	50 %	0 %	50 %	399995223
4029	NT_187147	CGG	2	6	198136	198141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995223
4030	NT_187147	CGC	2	6	198144	198149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995223
4031	NT_187147	CGG	2	6	198174	198179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995223
4032	NT_187147	CGATGC	2	12	198193	198204	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	399995223
4033	NT_187147	AGG	2	6	198207	198212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995223
4034	NT_187147	GC	3	6	198240	198245	0 %	0 %	50 %	50 %	399995223
4035	NT_187147	CAA	3	9	198268	198276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995223
4036	NT_187147	CTG	3	9	198347	198355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995223
4037	NT_187147	CGA	2	6	198373	198378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995223
4038	NT_187147	GCGG	2	8	198457	198464	0 %	0 %	75 %	25 %	399995223
4039	NT_187147	GAG	2	6	198503	198508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995223
4040	NT_187147	GCG	2	6	198531	198536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995223
4041	NT_187147	ACG	2	6	198609	198614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995223
4042	NT_187147	CGG	2	6	198634	198639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995223
4043	NT_187147	TGA	2	6	198648	198653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995223
4044	NT_187147	GGT	2	6	198697	198702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995223
4045	NT_187147	CAT	2	6	198949	198954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995223
4046	NT_187147	TTC	2	6	198968	198973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995223
4047	NT_187147	CCTC	2	8	199017	199024	0 %	25 %	0 %	75 %	399995223
4048	NT_187147	CG	3	6	199048	199053	0 %	0 %	50 %	50 %	399995223
4049	NT_187147	GGA	2	6	199060	199065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995223
4050	NT_187147	CGC	2	6	199066	199071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995223
4051	NT_187147	CGC	2	6	199095	199100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995224
4052	NT_187147	GCT	2	6	199113	199118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995224
4053	NT_187147	AAGG	2	8	199180	199187	50 %	0 %	50 %	0 %	399995224
4054	NT_187147	CGC	3	9	199246	199254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995224
4055	NT_187147	GCTTT	2	10	199307	199316	0 %	60 %	20 %	20 %	399995224
4056	NT_187147	CGC	2	6	199359	199364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995224
4057	NT_187147	GCCC	2	8	199409	199416	0 %	0 %	25 %	75 %	399995224
4058	NT_187147	GGC	2	6	199420	199425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995224
4059	NT_187147	CGC	3	9	199437	199445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995224
4060	NT_187147	CGT	2	6	199528	199533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995224
4061	NT_187147	CGA	2	6	199590	199595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995224
4062	NT_187147	CG	3	6	199653	199658	0 %	0 %	50 %	50 %	399995224
4063	NT_187147	GCG	2	6	199665	199670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995224
4064	NT_187147	CGC	2	6	199743	199748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995224
4065	NT_187147	TCGTC	2	10	199755	199764	0 %	40 %	20 %	40 %	399995224
4066	NT_187147	CAC	2	6	199765	199770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995224
4067	NT_187147	CTTC	2	8	199850	199857	0 %	50 %	0 %	50 %	399995224
4068	NT_187147	CGC	2	6	199872	199877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995224
4069	NT_187147	GAT	2	6	199936	199941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995224
4070	NT_187147	CAG	2	6	200019	200024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NT_187147	TGGA	2	8	200044	200051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4072	NT_187147	GAG	2	6	200059	200064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4073	NT_187147	CGCA	2	8	200078	200085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4074	NT_187147	TGCGGG	2	12	200118	200129	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4075	NT_187147	AG	3	6	200140	200145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4076	NT_187147	AGG	2	6	200181	200186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4077	NT_187147	TCG	2	6	200221	200226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NT_187147	CCA	2	6	200290	200295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NT_187147	CG	3	6	200319	200324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4080	NT_187147	CG	3	6	200344	200349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4081	NT_187147	TAG	2	6	200419	200424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4082	NT_187147	TGA	2	6	200462	200467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NT_187147	CA	3	6	200516	200521	50 %	0 %	0 %	50 %	399995225
4084	NT_187147	GC	3	6	200742	200747	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4085	NT_187147	CT	3	6	200752	200757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4086	NT_187147	ATC	2	6	200785	200790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NT_187147	TTGT	2	8	200793	200800	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4088	NT_187147	GGC	2	6	200814	200819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NT_187147	GAT	2	6	200919	200924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995226
4090	NT_187147	TTG	2	6	200935	200940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995226
4091	NT_187147	CGA	2	6	201050	201055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995226
4092	NT_187147	GCG	2	6	201151	201156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995226
4093	NT_187147	ACCC	2	8	201176	201183	25 %	0 %	0 %	75 %	399995226
4094	NT_187147	GCC	2	6	201248	201253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995226
4095	NT_187147	CTCG	2	8	201290	201297	0 %	25 %	25 %	50 %	399995226
4096	NT_187147	TTG	2	6	201301	201306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995226
4097	NT_187147	AAGCG	2	10	201350	201359	40 %	0 %	40 %	20 %	399995226
4098	NT_187147	TCA	2	6	201388	201393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995226
4099	NT_187147	CGC	3	9	201531	201539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995226
4100	NT_187147	CTG	2	6	201540	201545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995226
4101	NT_187147	CGT	2	6	201624	201629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995226
4102	NT_187147	CGG	2	6	201660	201665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995226
4103	NT_187147	AGT	2	6	201710	201715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995226
4104	NT_187147	ACCA	2	8	201738	201745	50 %	0 %	0 %	50 %	399995226
4105	NT_187147	TGCCG	2	10	201750	201759	0 %	20 %	40 %	40 %	399995226
4106	NT_187147	ACG	2	6	201797	201802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995227
4107	NT_187147	CGG	2	6	201822	201827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995227
4108	NT_187147	TGA	2	6	201836	201841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995227
4109	NT_187147	CCAT	3	12	201997	202008	25 %	25 %	0 %	50 %	399995228
4110	NT_187147	GAC	2	6	202022	202027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995228
4111	NT_187147	TTCA	2	8	202058	202065	25 %	50 %	0 %	25 %	399995228
4112	NT_187147	CGC	4	12	202119	202130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995228
4113	NT_187147	CGA	2	6	202228	202233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995228
4114	NT_187147	GGC	2	6	202237	202242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995228
4115	NT_187147	GCATTC	2	12	202284	202295	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	399995228
4116	NT_187147	GAT	2	6	202313	202318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995228
4117	NT_187147	CACG	2	8	202334	202341	25 %	0 %	25 %	50 %	399995228
4118	NT_187147	GC	3	6	202359	202364	0 %	0 %	50 %	50 %	399995228
4119	NT_187147	GCG	2	6	202367	202372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995228
4120	NT_187147	GGC	2	6	202375	202380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995228
4121	NT_187147	GCC	3	9	202384	202392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995228
4122	NT_187147	AAT	2	6	202397	202402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995228
4123	NT_187147	CGC	2	6	202413	202418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4233	NT_187147	GC	4	8	207626	207633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4245	NT_187147	CGG	2	6	208009	208014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995233
4246	NT_187147	GCAG	2	8	208064	208071	25 %	0 %	50 %	25 %	399995233
4247	NT_187147	GCG	2	6	208083	208088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995233
4248	NT_187147	GCG	2	6	208100	208105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995233
4249	NT_187147	TGC	2	6	208236	208241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4250	NT_187147	GC	3	6	208256	208261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4251	NT_187147	GC	4	8	208273	208280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4252	NT_187147	GCG	2	6	208285	208290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4253	NT_187147	GCG	3	9	208307	208315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4254	NT_187147	GCG	2	6	208458	208463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4255	NT_187147	GCCCGC	2	12	208491	208502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995234
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4291	NT_187147	GAC	2	6	209572	209577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4346	NT_187147	AGT	2	6	211834	211839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4353	NT_187147	GTCA	2	8	211984	211991	25 %	25 %	25 %	25 %	399995238
4354	NT_187147	CCGT	2	8	212032	212039	0 %	25 %	25 %	50 %	399995238
4355	NT_187147	CATT	2	8	212045	212052	25 %	50 %	0 %	25 %	399995238
4356	NT_187147	GTC	2	6	212062	212067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995238
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4365	NT_187147	CTGG	2	8	212261	212268	0 %	25 %	50 %	25 %	399995239
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4491	NT_187147	CAGCG	2	10	217988	217997	20 %	0 %	40 %	40 %	399995247
4492	NT_187147	AGG	2	6	218056	218061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995247
4493	NT_187147	GCT	2	6	218066	218071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995247
4494	NT_187147	TGC	2	6	218088	218093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995247
4495	NT_187147	AGC	2	6	218193	218198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995247
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