MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NT_187147	TCA	2	6	169921	169926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NT_187147	TGC	2	6	170015	170020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NT_187147	CAG	2	6	170103	170108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NT_187147	AAC	2	6	170227	170232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NT_187147	GTT	2	6	170235	170240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NT_187147	CGG	2	6	170377	170382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995192
3507	NT_187147	GCGG	2	8	170406	170413	0 %	0 %	75 %	25 %	399995192
3508	NT_187147	ACC	2	6	170431	170436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995192
3509	NT_187147	CG	3	6	170455	170460	0 %	0 %	50 %	50 %	399995192
3510	NT_187147	CAC	2	6	170549	170554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995192
3511	NT_187147	CG	3	6	170594	170599	0 %	0 %	50 %	50 %	399995192
3512	NT_187147	AC	3	6	170688	170693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3513	NT_187147	ATC	2	6	170876	170881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NT_187147	CGA	2	6	170908	170913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NT_187147	GCC	2	6	170949	170954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995193
3516	NT_187147	TG	3	6	170959	170964	0 %	50 %	50 %	0 %	399995193
3517	NT_187147	CTT	2	6	170992	170997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995193
3518	NT_187147	GTTG	2	8	171006	171013	0 %	50 %	50 %	0 %	399995193
3519	NT_187147	TGGT	2	8	171017	171024	0 %	50 %	50 %	0 %	399995193
3520	NT_187147	AG	3	6	171071	171076	50 %	0 %	50 %	0 %	399995193
3521	NT_187147	CAAG	2	8	171102	171109	50 %	0 %	25 %	25 %	399995193
3522	NT_187147	ATC	2	6	171178	171183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995193
3523	NT_187147	ACC	2	6	171230	171235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995193
3524	NT_187147	GGC	2	6	171238	171243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995193
3525	NT_187147	GCCC	2	8	171266	171273	0 %	0 %	25 %	75 %	399995193
3526	NT_187147	CG	3	6	171319	171324	0 %	0 %	50 %	50 %	399995193
3527	NT_187147	GACC	2	8	171333	171340	25 %	0 %	25 %	50 %	399995193
3528	NT_187147	CG	4	8	171554	171561	0 %	0 %	50 %	50 %	399995193
3529	NT_187147	GGC	2	6	171586	171591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995193
3530	NT_187147	TTGCC	2	10	171613	171622	0 %	40 %	20 %	40 %	399995193
3531	NT_187147	CGC	2	6	171655	171660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995193
3532	NT_187147	TGA	2	6	171669	171674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995193
3533	NT_187147	CGCA	2	8	171687	171694	25 %	0 %	25 %	50 %	399995193
3534	NT_187147	GTC	2	6	171772	171777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995193
3535	NT_187147	CG	3	6	171800	171805	0 %	0 %	50 %	50 %	399995193
3536	NT_187147	CTC	2	6	171912	171917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995193
3537	NT_187147	CAC	3	9	171971	171979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995194
3538	NT_187147	CCTG	2	8	172011	172018	0 %	25 %	25 %	50 %	399995194
3539	NT_187147	TAT	2	6	172149	172154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995194
3540	NT_187147	CGC	2	6	172185	172190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995194
3541	NT_187147	TCG	2	6	172229	172234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3542	NT_187147	GCT	2	6	172242	172247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3543	NT_187147	CGA	2	6	172331	172336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3544	NT_187147	CTG	2	6	172375	172380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3545	NT_187147	CGA	2	6	172416	172421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3546	NT_187147	CGGG	2	8	172560	172567	0 %	0 %	75 %	25 %	399995194
3547	NT_187147	GGA	2	6	172593	172598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995194
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3549	NT_187147	TTTCC	2	10	172623	172632	0 %	60 %	0 %	40 %	399995194
3550	NT_187147	GAC	2	6	172633	172638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995194
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3552	NT_187147	CGG	2	6	172683	172688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995194
3553	NT_187147	CTG	2	6	172714	172719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995194
3554	NT_187147	CGG	2	6	172746	172751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995194
3555	NT_187147	TA	3	6	172846	172851	50 %	50 %	0 %	0 %	399995194
3556	NT_187147	TCG	3	9	173094	173102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995195
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3558	NT_187147	AGC	2	6	173289	173294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995195
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3560	NT_187147	GAC	2	6	173345	173350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995195
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3562	NT_187147	GAC	2	6	173452	173457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995195
3563	NT_187147	TGC	2	6	173479	173484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995195
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3565	NT_187147	TCA	2	6	173661	173666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995195
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3571	NT_187147	CAA	2	6	173995	174000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995195
3572	NT_187147	GGCGA	2	10	174053	174062	20 %	0 %	60 %	20 %	399995195
3573	NT_187147	CGC	2	6	174064	174069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995195
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3575	NT_187147	GCCC	2	8	174175	174182	0 %	0 %	25 %	75 %	399995195
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3578	NT_187147	TTA	2	6	174309	174314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995195
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3580	NT_187147	GGC	2	6	174455	174460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NT_187147	GCA	2	6	174477	174482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NT_187147	GTT	2	6	174517	174522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NT_187147	TGAA	2	8	174545	174552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3584	NT_187147	GGAT	2	8	174576	174583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3585	NT_187147	AG	3	6	174618	174623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3586	NT_187147	ATTG	2	8	174631	174638	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3587	NT_187147	GGC	2	6	174769	174774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NT_187147	ACG	2	6	174806	174811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NT_187147	CAGC	2	8	174936	174943	25 %	0 %	25 %	50 %	399995196
3590	NT_187147	GCG	2	6	174997	175002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995196
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3593	NT_187147	GC	4	8	175080	175087	0 %	0 %	50 %	50 %	399995196
3594	NT_187147	TGC	2	6	175093	175098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995196
3595	NT_187147	ATAG	2	8	175109	175116	50 %	25 %	25 %	0 %	399995196
3596	NT_187147	TCG	2	6	175119	175124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995196
3597	NT_187147	CCA	2	6	175296	175301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995196
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3599	NT_187147	AACC	2	8	175455	175462	50 %	0 %	0 %	50 %	399995196
3600	NT_187147	CTC	2	6	175565	175570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995196
3601	NT_187147	TTC	2	6	175598	175603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995196
3602	NT_187147	A	6	6	175636	175641	100 %	0 %	0 %	0 %	399995196
3603	NT_187147	TC	3	6	175734	175739	0 %	50 %	0 %	50 %	399995196
3604	NT_187147	GC	3	6	175741	175746	0 %	0 %	50 %	50 %	399995196
3605	NT_187147	CGA	2	6	175786	175791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995196
3606	NT_187147	AGGA	2	8	175842	175849	50 %	0 %	50 %	0 %	399995196
3607	NT_187147	GGC	2	6	175865	175870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995196
3608	NT_187147	CCA	2	6	175908	175913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995196
3609	NT_187147	CGG	2	6	175929	175934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995196
3610	NT_187147	TAT	2	6	175964	175969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995196
3611	NT_187147	CT	3	6	175986	175991	0 %	50 %	0 %	50 %	399995196
3612	NT_187147	GCC	2	6	175996	176001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995196
3613	NT_187147	CCG	2	6	176161	176166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995196
3614	NT_187147	CG	3	6	176179	176184	0 %	0 %	50 %	50 %	399995196
3615	NT_187147	TTC	2	6	176236	176241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995196
3616	NT_187147	CGGT	2	8	176328	176335	0 %	25 %	50 %	25 %	399995196
3617	NT_187147	TCA	2	6	176400	176405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995196
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3620	NT_187147	CAC	2	6	176929	176934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995197
3621	NT_187147	GTGTC	2	10	177032	177041	0 %	40 %	40 %	20 %	399995197
3622	NT_187147	CCA	2	6	177218	177223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995197
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3998	NT_187147	CGA	2	6	196517	196522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995221
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