MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 5679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NT_187147	TCG	2	6	99978	99983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995125
2002	NT_187147	GTT	2	6	100099	100104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995125
2003	NT_187147	GAT	2	6	100132	100137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995125
2004	NT_187147	GCCG	2	8	100147	100154	0 %	0 %	50 %	50 %	399995125
2005	NT_187147	TGCG	2	8	100157	100164	0 %	25 %	50 %	25 %	399995125
2006	NT_187147	CGA	2	6	100233	100238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995125
2007	NT_187147	GGCG	2	8	100240	100247	0 %	0 %	75 %	25 %	399995125
2008	NT_187147	CGGG	2	8	100272	100279	0 %	0 %	75 %	25 %	399995125
2009	NT_187147	GTC	2	6	100321	100326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995125
2010	NT_187147	GGT	2	6	100348	100353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995125
2011	NT_187147	ATC	2	6	100364	100369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995125
2012	NT_187147	TTC	2	6	100415	100420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995125
2013	NT_187147	GCC	2	6	100423	100428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995125
2014	NT_187147	CCG	2	6	100434	100439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995125
2015	NT_187147	GCGA	2	8	100500	100507	25 %	0 %	50 %	25 %	399995125
2016	NT_187147	ACGA	2	8	100538	100545	50 %	0 %	25 %	25 %	399995125
2017	NT_187147	CGG	2	6	100563	100568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995125
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2021	NT_187147	TCT	2	6	100782	100787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995125
2022	NT_187147	CTT	2	6	100815	100820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NT_187147	TTC	2	6	100936	100941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995126
2024	NT_187147	CGT	2	6	100949	100954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995126
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2043	NT_187147	GTC	2	6	101748	101753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995126
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2051	NT_187147	TCG	2	6	101974	101979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995126
2052	NT_187147	CTT	2	6	101994	101999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995126
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2063	NT_187147	AAG	2	6	102444	102449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2064	NT_187147	TGG	2	6	102459	102464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2065	NT_187147	GCG	3	9	102500	102508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2101	NT_187147	CGGC	2	8	103870	103877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2102	NT_187147	TCA	2	6	103949	103954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995128
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2107	NT_187147	GGC	2	6	104264	104269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995128
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2121	NT_187147	GCATT	2	10	105070	105079	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2123	NT_187147	GCA	2	6	105168	105173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2125	NT_187147	GC	3	6	105184	105189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2245	NT_187147	GAGCC	2	10	111224	111233	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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2353	NT_187147	CGC	2	6	116173	116178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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2355	NT_187147	ATCC	2	8	116260	116267	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2356	NT_187147	CAA	2	6	116322	116327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2357	NT_187147	GGCA	2	8	116346	116353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2358	NT_187147	TTC	2	6	116380	116385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2359	NT_187147	TGTT	2	8	116405	116412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2360	NT_187147	TGA	2	6	116442	116447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2362	NT_187147	CTC	2	6	116540	116545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2363	NT_187147	GCA	2	6	116733	116738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2365	NT_187147	CTG	2	6	116878	116883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2370	NT_187147	GAA	2	6	117156	117161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2371	NT_187147	GCA	2	6	117237	117242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2372	NT_187147	GGC	2	6	117254	117259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2373	NT_187147	GAA	3	9	117267	117275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2374	NT_187147	GCC	2	6	117285	117290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2375	NT_187147	CTTC	2	8	117306	117313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2376	NT_187147	GAC	2	6	117334	117339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2384	NT_187147	GCA	2	6	117644	117649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2487	NT_187147	AGG	2	6	121839	121844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2492	NT_187147	GGC	2	6	122020	122025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995146
2493	NT_187147	GAT	2	6	122045	122050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995146
2494	NT_187147	GCT	2	6	122181	122186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995146
2495	NT_187147	GC	3	6	122205	122210	0 %	0 %	50 %	50 %	399995146
2496	NT_187147	GAG	2	6	122259	122264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995146
2497	NT_187147	GC	3	6	122282	122287	0 %	0 %	50 %	50 %	399995146
2498	NT_187147	GGGC	2	8	122292	122299	0 %	0 %	75 %	25 %	399995146
2499	NT_187147	GGT	2	6	122384	122389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995146
2500	NT_187147	AAGG	2	8	122415	122422	50 %	0 %	50 %	0 %	399995146

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